README.md
breseqparser
setup.py
isolateparser/__init__.py
isolateparser/commandline.py
isolateparser/datatools.py
isolateparser/tableformat.py
isolateparser/workflow.py
isolateparser.egg-info/PKG-INFO
isolateparser.egg-info/SOURCES.txt
isolateparser.egg-info/dependency_links.txt
isolateparser.egg-info/requires.txt
isolateparser.egg-info/top_level.txt
isolateparser/generate/__init__.py
isolateparser/generate/generate_basic_statistics.py
isolateparser/generate/generate_comparison_table.py
isolateparser/generate/generate_fasta.py
isolateparser/generate/generate_isolate_table.py
isolateparser/resultparser/__init__.py
isolateparser/resultparser/breseq_folder_parser.py
isolateparser/resultparser/parsers/__init__.py
isolateparser/resultparser/parsers/gdtotable.py
isolateparser/resultparser/parsers/locations.py
isolateparser/resultparser/parsers/parse_gd.py
isolateparser/resultparser/parsers/parse_index.py
isolateparser/resultparser/parsers/parse_summary.py
isolateparser/resultparser/parsers/parse_vcf.py