LICENSE
README.md
pyproject.toml
setup.cfg
src/phammseqs/SequenceDB.py
src/phammseqs/__init__.py
src/phammseqs/__main__.py
src/phammseqs/cli.py
src/phammseqs/clustalo.py
src/phammseqs/mmseqs.py
src/phammseqs/multiprocess.py
src/phammseqs/pangenome.py
src/phammseqs/subprocess.py
src/phammseqs.egg-info/PKG-INFO
src/phammseqs.egg-info/SOURCES.txt
src/phammseqs.egg-info/dependency_links.txt
src/phammseqs.egg-info/entry_points.txt
src/phammseqs.egg-info/requires.txt
src/phammseqs.egg-info/top_level.txt
src/phammseqs/fileio/__init__.py
src/phammseqs/fileio/fasta.py
src/phammseqs/fileio/genbank.py