Gene Name	Accession-1	Left-End-Position	Right-End-Position	Product	Genes in same transcription unit	Accession-1
asnV	b1989	2062260	2062335	tRNA-Asn(GUU)	asnV	b1989
ybaE	b0445	465612	467312	uncharacterized protein YbaE	ybaE	b0445
frwC	b3949	4142530	4143609	putative PTS enzyme IIC component FrwC	frwB // frwC	b3950 // b3949
fdnH	b1475	1550461	1551345	formate dehydrogenase N subunit &beta;	fdnG // fdnH // fdnI	b1474 // b1475 // b1476
fmt	b3288	3434214	3435161	10-formyltetrahydrofolate:L-methionyl-tRNA<sup>fMet</sup> <i>N</i>-formyltransferase	def // fmt	b3287 // b3288
yadS	b0157	177001	177624	PF03458 family protein YadS	mtn // btuF // yadS	b0159 // b0158 // b0157
agaC	b3139	3284685	3285488	galactosamine-specific PTS enzyme IIC component	agaI // agaD // agaC // agaB // kbaY // agaS	b3141 // b3140 // b3139 // b3138 // b3137 // b3136
glcA	b2975	3119597	3121279	glycolate/lactate:H<sup>+</sup> symporter GlcA	glcA // glcB // glcG // glcF // glcE // glcD	b2975 // b2976 // b2977 // b4467 // b4468 // b2979
ileY	b2652	2785762	2785837	tRNA-Ile(CAU)	ileY	b2652
yggI	b2944	3089755	3090252	protein YggI	yggI	b2944
abgB	b1337	1401810	1403255	<i>p</i>-aminobenzoyl-glutamate hydrolase subunit B	abgA // abgB // abgT // ogt	b1338 // b1337 // b1336 // b1335
frvB	b3899	4090915	4092366	putative PTS enzyme IIBC component FrvB	frvA // frvB // frvX // frvR	b3900 // b3899 // b3898 // b3897
uhpC	b3667	3847305	3848624	UhpC-glucose-6-P // inner membrane protein sensing glucose-6-phosphate	ilvN // ilvB // ivbL // uhpC // uhpB // uhpA	b3670 // b3671 // b3672 // b3667 // b3668 // b3669
valT	b0744	780765	780840	tRNA-Val(UAC)	lysT // valT // lysW	b0743 // b0744 // b0745
yihG	b3862	4045670	4046602	1-acylglycerol-3-phosphate <i>O</i>-acyltransferase YihG	yihG	b3862
pldB	b3825	4009170	4010192	lysophospholipase L2	yigL // pldB	b3826 // b3825
sgcA	b4302	4527549	4527980	putative PTS enzyme IIA component SgcA	sgcX // sgcB // sgcC // sgcQ // sgcA // sgcE // sgcR	b4305 // b4565 // b4304 // b4303 // b4302 // b4301 // b4300
hyfF	b2486	2606917	2608497	hydrogenase 4 component F	focB // hyfR // hyfJ // hyfI // hyfH // hyfG // hyfF // hyfE // hyfD // hyfC // hyfB // hyfA	b2492 // b2491 // b2490 // b2489 // b2488 // b2487 // b2486 // b2485 // b2484 // b2483 // b2482 // b2481
proL	b2189	2286211	2286287	tRNA-Pro(GGG)	proL	b2189
yhhI	b3484	3624378	3625514	putative transposase	yhhI	b3484
yqfB	b2900	3043312	3043623	<i>N</i><sup>4</sup>-acetylcytidine amidohydrolase	yqfB	b2900
glvC	b3683	3862497	3863603	putative PTS enzyme II component GlvC	glvC // glvB // glvG // ysdC	b3683 // b3682 // b3681 // b4556
tap	b1885	1969383	1970984	methyl-accepting chemotaxis protein Tap	cheZ // cheY // cheB // cheR // tap // tar	b1881 // b1882 // b1883 // b1884 // b1885 // b1886
leuU	b3174	3322072	3322158	tRNA-Leu(GAG)	leuU // secG	b3174 // b3175
yjgM	b4256	4479034	4479537	putative acetyltransferase YjgM	yjgM	b4256
ynfG	b1589	1662990	1663607	putative oxidoreductase YnfG	dmsD // ynfH // ynfG // ynfF // ynfE	b1591 // b1590 // b1589 // b1588 // b1587
ulaA	b4193	4419980	4421377	L-ascorbate specific PTS enzyme IIC component	ulaF // ulaE // ulaD // ulaC // ulaB // ulaA	b4198 // b4197 // b4196 // b4195 // b4194 // b4193
mdtC	b2076	2158386	2161463	multidrug efflux pump RND permease subunit MdtC	mdtD // mdtC // mdtB // mdtA // baeS // baeR	b2077 // b2076 // b2075 // b2074 // b2078 // b2079
gltV	b4008	4209774	4209849	tRNA-Glu(UUC)	gltV // rrsE // rrfE // rrlE	b4008 // b4007 // b4010 // b4009
yfiB	b2605	2743625	2744107	lipoprotein YfiB	yfiB // dgcN // yfiR	b2605 // b2604 // b2603
abgA	b1338	1403255	1404565	<i>p</i>-aminobenzoyl-glutamate hydrolase subunit A	abgA // abgB // abgT // ogt	b1338 // b1337 // b1336 // b1335
agaV	b3133	3280217	3280690	<i>N</i>-acetyl-D-galactosamine specific PTS enzyme IIB component	agaA // agaW // agaV // kbaZ	b3135 // b3134 // b3133 // b3132
pstA	b3726	3908549	3909439	phosphate ABC transporter membrane subunit PstA	pstS // pstA // pstC // phoU // pstB	b3728 // b3726 // b3727 // b3724 // b3725
argZ	b2692	2818059	2818135	tRNA-Arg(ACG)	argZ // argY // argV // serV // argQ	b2692 // b2693 // b2694 // b2695 // b2691
yhdV	b3267	3418390	3418611	lipoprotein YhdV	yhdV	b3267
yibF	b3592	3761347	3761955	glutathione transferase-like protein YibF	yibF	b3592
yadI	b0129	144577	145017	putative PTS enzyme IIA component YadI	yadI	b0129
ynjC	b1755	1837212	1838747	putative ABC transporter membrane subunit YnjC	ynjD // ynjC // ynjB // ynjA // ydjZ // ydjY // ydjX	b1756 // b1755 // b1754 // b1753 // b1752 // b1751 // b1750
asnW	b1984	2058027	2058102	tRNA-Asn(GUU)	asnW	b1984
yghT	b2986	3134131	3134823	putative ATP-binding protein YghT	yghT	b2986
ynfH	b1590	1663609	1664463	putative menaquinol dehydrogenase	dmsD // ynfH // ynfG // ynfF // ynfE	b1591 // b1590 // b1589 // b1588 // b1587
pheP	b0576	601959	603335	phenylalanine:H+ symporter PheP	pheP	b0576
tyrT	b1231	1287538	1287622	tRNA-Tyr(GUA)	tyrT // tpr // tyrV	b1231 // b1229 // b1230
ygeI	b2853	2993638	2993856	protein YgeI	ygeI	b2853
ynfE	b1587	1658069	1660495	putative selenate reductase YnfE	dmsD // ynfH // ynfG // ynfF // ynfE	b1591 // b1590 // b1589 // b1588 // b1587
ynfM	b1596	1669699	1670952	putative transporter YnfM	ynfM	b1596
pheU	b4134	4362551	4362626	tRNA-Phe(GAA)	pheU	b4134
yphG	b2549	2679464	2682745	DUF5107 domain-containing protein YphG	yphG	b2549
ybcF	b0521	550439	551332	putative carbamate kinase	ybcF // ylbF // ylbE // fdrA	b0521 // b0520 // b4572 // b0518
narI	b1227	1285849	1286526	nitrate reductase A subunit &gamma;	narG // narH // narJ // narI	b1224 // b1225 // b1226 // b1227
leuP	b4369	4606200	4606286	tRNA-Leu(CAG)	leuP // leuQ // leuV	b4369 // b4370 // b4368
yfbP	b2275	2389116	2389964	uncharacterized protein YfbP	yfbP	b2275
appA	b0980	1040617	1041915	periplasmic phosphoanhydride phosphatase/multiple inositol-polyphosphate phosphatase	appX // appC // appB // appA	b4592 // b0978 // b0979 // b0980
emtA	b1193	1243180	1243791	lytic murein transglycosylase E	emtA	b1193
glnX	b0664	696430	696504	tRNA-Gln(CUG)	glnX // glnV // metU // glnW // glnU // leuW // metT	b0664 // b0665 // b0666 // b0668 // b0670 // b0672 // b0673
yecH	b1906	1989251	1989490	DUF2492 domain-containing protein YecH	yecH	b1906
frc	b2374	2492004	2493254	formyl-CoA transferase	yfdX // oxc // yfdV // frc // yfdE	b2375 // b2373 // b2372 // b2374 // b2371
melB	b4120	4343369	4344790	melibiose:H<sup>+</sup>/Na<sup>+</sup>/Li<sup>+</sup> symporter	melA // melB	b4119 // b4120
argW	b2348	2466309	2466383	tRNA-Arg(CCU)	argW	b2348
ydiJ	b1687	1765629	1768685	putative FAD-linked oxidoreductase YdiJ	ydiJ // menI // ydiH	b1687 // b1686 // b1685
ynfF	b1588	1660556	1662979	putative selenate reductase YnfF	dmsD // ynfH // ynfG // ynfF // ynfE	b1591 // b1590 // b1589 // b1588 // b1587
tcyP	b1729	1810934	1812325	cystine/sulfocysteine:cation symporter	tcyP	b1729
ycaM	b0899	947229	948659	putative transporter YcaM	ycaM	b0899
lysQ	b0749	781577	781652	tRNA-Lys(UUU)	lysQ	b0749
yncJ	b1436	1508834	1509064	protein YncJ	yncJ	b1436
yjeH	b4141	4369156	4370412	L-methionine/branched chain amino acid exporter	yjeH	b4141
kdpB	b0697	724988	727036	K<sup>+</sup> transporting P-type ATPase subunit KdpB	kdpF // kdpC // kdpB // kdpA	b4513 // b0696 // b0697 // b0698
thrV	b3273	3423580	3423655	tRNA-Thr(GGU)	rrfF // thrV // rrfD // rrlD // alaU // ileU // rrsD	b3272 // b3273 // b3274 // b3275 // b3276 // b3277 // b3278
ycgM	b1180	1228079	1228738	putative isomerase/hydrolase	ycgM	b1180
eamB	b2578	2715423	2716010	cysteine/<i>O</i>-acetylserine exporter EamB	eamB	b2578
ybeX	b0658	690906	691784	CorC-HlyC family protein YbeX	ybeZ // ybeY // ybeX // lnt	b0660 // b0659 // b0658 // b0657
metV	b2816	2947607	2947683	tRNA-initiator Met(CAU)	metZ // metW // metV	b2814 // b2815 // b2816
ybjD	b0876	916473	918131	DUF2813 domain-containing protein YbjD	ybjD	b0876
satP	b0010	9928	10494	acetate/succinate:H<sup>+</sup> symporter	satP	b0010
glnP	b0810	846460	847119	L-glutamine ABC transporter membrane subunit	glnP // glnH // glnQ	b0810 // b0811 // b0809
ileU	b3277	3427076	3427152	tRNA-Ile(GAU)	rrfF // thrV // rrfD // rrlD // alaU // ileU // rrsD	b3272 // b3273 // b3274 // b3275 // b3276 // b3277 // b3278
yahJ	b0324	341125	342507	amidohydrolase family protein YahJ	yahJ // yahI	b0324 // b0323
yjbB	b4020	4227731	4229362	putative inorganic phosphate export protein YjbB	yjbB	b4020
mhpT	b0353	375459	376670	3-hydroxyphenylpropionate/3-hydroxycinnamate:H<sup>+</sup> symporter	mhpT	b0353
argQ	b2691	2817784	2817860	tRNA-Arg(ACG)	argQ // argZ // argY // argV // serV	b2691 // b2692 // b2693 // b2694 // b2695
dinQ	b4613	3647705	3647788	membrane toxin DinQ	dinQ	b4613
argO	b2923	3068173	3068808	L-arginine exporter	argO	b2923
exbD	b3005	3150818	3151243	Ton complex subunit ExbD	exbD // exbB	b3005 // b3006
valZ	b0746	781068	781143	tRNA-Val(UAC)	lysY // valZ	b0747 // b0746
yhiY	b4790	3630665	3630778	protein YhiY		
yiaO	b3579	3746094	3747080	2,3-diketo-L-gulonate:Na<sup>+</sup> symporter - periplasmic binding protein	yiaM // sgbE // sgbU // sgbH // lyxK // yiaO // yiaN // yiaL // yiaK	b3577 // b3583 // b3582 // b3581 // b3580 // b3579 // b3578 // b3576 // b3575
aqpZ	b0875	915352	916047	water channel AqpZ	aqpZ	b0875
serX	b1032	1097565	1097652	tRNA-Ser(GGA)	serX	b1032
ynaN	b4773	1407989	1408036	protein YnaN		
eamA	b1533	1620238	1621137	cysteine/<i>O</i>-acetylserine exporter EamA	eamA	b1533
cyoE	b0428	446815	447705	heme O synthase	cyoE // cyoD // cyoC // cyoB // cyoA	b0428 // b0429 // b0430 // b0431 // b0432
lysW	b0745	780843	780918	tRNA-Lys(UUU)	lysT // valT // lysW	b0743 // b0744 // b0745
ynfT	b4748	1632890	1633003	Qin prophage; protein YnfT	ynfT // ydfK	b4748 // b1544
chiA	b3338	3467160	3469853	endochitinase	chiA	b3338
yqcE	b2775	2900592	2901869	putative transport protein YqcE	ygcE // yqcE	b2776 // b2775
yddG	b1473	1546288	1547169	amino acid exporter YddG	yddG	b1473
glyY	b4165	4392583	4392658	tRNA-Gly(GCC)	glyV // glyX // glyY	b4163 // b4164 // b4165
yldA	b4734	643330	643419	protein YldA		
psuG	b2165	2257429	2258367	pseudouridine-5'-phosphate glycosidase	psuK // psuG	b2166 // b2165
yfdV	b2372	2489242	2490186	putative transport protein YfdV	yfdX // oxc // yfdV // frc // yfdE	b2375 // b2373 // b2372 // b2374 // b2371
btuC	b1711	1794172	1795152	vitamin B<sub>12</sub> ABC transporter membrane subunit	btuC // btuE // btuD	b1711 // b1710 // b1709
glnU	b0670	696865	696939	tRNA-Gln(UUG)	glnU // leuW // metT // glnX // glnV // metU // glnW	b0670 // b0672 // b0673 // b0664 // b0665 // b0666 // b0668
ynbG	b4674	1465165	1465230	uncharacterized protein YnbG		
adeP	b3714	3895272	3896609	adenine:H<sup>+</sup> symporter	adeP	b3714
ytfT	b4230	4452571	4453596	galactofuranose ABC transporter putative membrane subunit YtfT	yjfF // ytfT // ytfR // ytfQ	b4231 // b4230 // b4485 // b4227
alaV	b0203	225500	225575	tRNA-Ala(UGC)	alaV // ileV // rrsH // rrfH // rrlH	b0203 // b0202 // b0201 // b0205 // b0204
ylcI	b4589	580251	580445	DLP12 prophage; DUF3950 domain-containing protein YlcI		
ghxQ	b4464	3027121	3028488	guanine/hypoxanthine transporter GhxQ	ghxQ // guaD // xanQ	b4464 // b2883 // b2882
araJ	b0396	411297	412481	putative transport protein AraJ	araJ	b0396
valX	b2402	2521051	2521126	tRNA-Val(UAC)	valU // valX // valY // lysV	b2401 // b2402 // b2403 // b2404
ygbE	b2749	2873014	2873337	DUF3561 domain-containing inner membrane protein YgbE	ygbE	b2749
yagG	b0270	285395	286777	CP4-6 prophage; putative D-xylonate transporter YagG	yagH // yagG	b0271 // b0270
yadH	b0128	143702	144472	putative ABC transporter membrane subunit YadH	yadH // yadG	b0128 // b0127
serU	b1975	2043468	2043557	tRNA-Ser(CGA)	serU	b1975
yibN	b3611	3784584	3785015	putative sulfurtransferase YibN	yibN // secB // gpsA // grxC	b3611 // b3609 // b3608 // b3610
dmsD	b1591	1664506	1665120	redox enzyme maturation protein DmsD	dmsD // ynfH // ynfG // ynfF // ynfE	b1591 // b1590 // b1589 // b1588 // b1587
zntA	b3469	3606451	3608649	Zn<sup>2+</sup>/Cd<sup>2+</sup>/Pb<sup>2+</sup> exporting P-type ATPase	zntA	b3469
leuZ	b1909	1991815	1991901	tRNA-Leu(UAA)	3'ETS-<i>leuZ</i> // leuZ // cysT // glyW	b4759 // b1909 // b1910 // b1911
yeiQ	b2172	2266245	2267711	putative oxidoreductase YeiQ	yeiQ	b2172
ydcS	b1440	1511654	1512799	putative ABC transporter periplasmic binding protein / polyhydroxybutyrate synthase	patD // ydcT // ydcU // ydcV // ydcS	b1444 // b1441 // b1442 // b1443 // b1440
fldB	b2895	3039855	3040376	oxidized flavodoxin 2 // flavodoxin 2	fldB	b2895
hisQ	b2308	2425230	2425916	lysine/arginine/ornithine ABC transporter / histidine ABC transporter, membrane subunit HisQ	hisP // hisM // hisQ // hisJ // argT	b2306 // b2307 // b2308 // b2309 // b2310
glyV	b4163	4392360	4392435	tRNA-Gly(GCC)	glyV // glyX // glyY	b4163 // b4164 // b4165
yfiF	b2581	2717491	2718528	putative methyltransferase YfiF	yfiF	b2581
pgaD	b1021	1086106	1086519	poly-<i>N</i>-acetyl-D-glucosamine synthase subunit PgaD	pgaD // pgaC // pgaB // pgaA	b1021 // b1022 // b1023 // b1024
fre	b3844	4026527	4027228	NAD(P)H-flavin reductase	fre	b3844
ccmH	b2194	2291358	2292410	holocytochrome <I>c</I> synthase CcmH component	ccmH // ccmG // ccmF // ccmE // ccmD // ccmC // ccmB // ccmA // napC // napB // napH // napG // napA // napD // napF	b2194 // b2195 // b2196 // b2197 // b2198 // b2199 // b2200 // b2201 // b2202 // b2203 // b2204 // b2205 // b2206 // b2207 // b2208
aspT	b3760	3946872	3946948	tRNA-Asp(GUC)	aspT	b3760
yhhH	b3483	3623399	3623782	PF15631 family protein YhhH	yhhH	b3483
yjbH	b4029	4237634	4239730	YjbH family protein	yjbH // yjbG // yjbF // yjbE	b4029 // b4028 // b4027 // b4026
norV	b2710	2832476	2833915	anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin	norW // norV	b2711 // b2710
actP	b4067	4283253	4284902	acetate/glycolate:cation symporter	yjcH // acs // actP	b4068 // b4069 // b4067
cysT	b1910	1991914	1991987	tRNA-Cys(GCA)	3'ETS-<i>leuZ</i> // leuZ // cysT // glyW	b4759 // b1909 // b1910 // b1911
yjgH	b4248	4472814	4473209	RutC family protein YjgH	yjgH	b4248
pgaC	b1022	1086521	1087846	poly-<i>N</i>-acetyl-D-glucosamine synthase subunit PgaC	pgaD // pgaC // pgaB // pgaA	b1021 // b1022 // b1023 // b1024
fdx	b2525	2656748	2657083	oxidized ferredoxin // reduced ferredoxin	iscX // fdx // hscA // hscB	b2524 // b2525 // b2526 // b2527
yihN	b3874	4062247	4063512	putative transporter YihN	yihN	b3874
valU	b2401	2520931	2521006	tRNA-Val(UAC)	valU // valX // valY // lysV	b2401 // b2402 // b2403 // b2404
yceD	b1088	1146794	1147315	DUF177 domain-containing protein YceD	fabF // acpP // yceD // fabG // fabD // fabH // plsX // rpmF	b1095 // b1094 // b1088 // b1093 // b1092 // b1091 // b1090 // b1089
bcsB	b3532	3690268	3692607	cellulose synthase periplasmic subunit	bcsC // bcsA // bcsZ // bcsB	b3530 // b3533 // b3531 // b3532
qorA	b4051	4263248	4264231	putative quinone oxidoreductase 1	qorA	b4051
acrA	b0463	484426	485619	multidrug efflux pump membrane fusion lipoprotein AcrA	acrA // acrB	b0463 // b0462
proM	b3799	3982735	3982811	tRNA-Pro(UGG)	argX // hisR // leuT // proM	b3796 // b3797 // b3798 // b3799
yhcF	b3219	3366926	3367642	DUF1120 domain-containing protein YhcF	yhcF	b3219
yjbF	b4027	4236262	4236900	lipoprotein YjbF	yjbH // yjbG // yjbF // yjbE	b4029 // b4028 // b4027 // b4026
cybB	b1418	1490902	1491432	superoxide oxidase	cybB	b1418
potI	b0857	897084	897929	putrescine ABC transporter membrane subunit PotI	potF // potG // potH // potI	b0854 // b0855 // b0856 // b0857
leuV	b4368	4606079	4606165	tRNA-Leu(CAG)	leuV // leuP // leuQ	b4368 // b4369 // b4370
yghG	b2971	3113067	3113477	lipoprotein YghG	yghG	b2971
mreC	b3250	3398875	3399978	cell shape determining protein MreC	mreD // mreC // mreB	b3249 // b3250 // b3251
fldA	b0684	710935	711465	oxidized flavodoxin 1 // flavodoxin 1	fldA // uof // fur	b0684 // b4637 // b0683
yaaJ	b0007	6529	7959	putative transporter YaaJ	yaaJ	b0007
gltW	b2590	2729369	2729444	tRNA-Glu(UUC)	rrlG // gltW // rrsG // rrfG	b2589 // b2590 // b2591 // b2588
tas	b2834	2971597	2972637	putative NADP(H)-dependent aldo-keto reductase Tas	tas	b2834
pgaB	b1023	1087839	1089857	poly-&beta;-1,6-<i>N</i>-acetyl-D-glucosamine <i>N</i>-deacetylase and &beta;-1,6 glycoside hydrolase	pgaD // pgaC // pgaB // pgaA	b1021 // b1022 // b1023 // b1024
hybA	b2996	3144154	3145140	hydrogenase 2 iron-sulfur protein	hybO // hybG // hybF // hybE // hybD // hybC // hybB // hybA	b2997 // b2990 // b2991 // b2992 // b2993 // b2994 // b2995 // b2996
waaL	b3622	3796948	3798207	O-antigen ligase	waaL // waaC // waaF // rfaD	b3622 // b3621 // b3620 // b3619
asnT	b1977	2044549	2044624	tRNA-Asn(GUU)	asnT	b1977
yfhR	b2534	2664390	2665244	putative peptidase	yfhR	b2534
bcsA	b3533	3692618	3695236	cellulose synthase catalytic subunit	bcsC // bcsA // bcsZ // bcsB	b3530 // b3533 // b3531 // b3532
ugpQ	b3449	3587370	3588113	glycerophosphodiester phosphodiesterase UgpQ	ugpQ // ugpC // ugpE // ugpA // ugpB	b3449 // b3450 // b3451 // b3452 // b3453
gabP	b2663	2794253	2795653	4-aminobutanoate:H<sup>+</sup> symporter	lhgD // glaH // gabP // gabT // gabD	b2660 // b2659 // b2663 // b2662 // b2661
trhP	b2081	2165668	2167029	tRNA wobble base hydroxylation protein TrhP	trhP	b2081
yfbL	b2271	2385860	2386831	putative peptidase YfbL	yfbL	b2271
yjbG	b4028	4236897	4237634	capsule biosynthesis GfcC family protein YjbG	yjbH // yjbG // yjbF // yjbE	b4029 // b4028 // b4027 // b4026
glpK	b3926	4115714	4117222	glycerol kinase	glpX // glpK // glpF	b3925 // b3926 // b3927
dcuD	b3227	3374869	3376236	putative transporter DcuD	dcuD	b3227
tyrU	b3977	4175472	4175556	tRNA-Tyr(GUA)	tufB // thrU // tyrU // glyT // thrT	b3980 // b3976 // b3977 // b3978 // b3979
yebW	b1837	1922121	1922312	DUF1482 domain-containing protein YebW	yebW	b1837
gldA	b3945	4137932	4139035	L-1,2-propanediol dehydrogenase / glycerol dehydrogenase	ptsA // fsaB // gldA	b3947 // b3946 // b3945
xanQ	b2882	3024351	3025751	xanthine:H+ symporter XanQ	ghxQ // guaD // xanQ	b4464 // b2883 // b2882
pheV	b2967	3110366	3110441	tRNA-Phe(GAA)	pheV	b2967
ydhV	b1673	1751728	1753830	putative oxidoreductase YdhV	ydhY // ydhV // ydhW // ydhX // ydhU // ydhT	b1674 // b1673 // b1672 // b1671 // b1670 // b1669
glpQ	b2239	2349935	2351011	glycerophosphoryl diester phosphodiesterase GlpQ	glpQ // glpT	b2239 // b2240
cydC	b0886	927474	929195	glutathione/L-cysteine ABC exporter subunit CydC	cydC // cydD	b0886 // b0887
leuQ	b4370	4606315	4606401	tRNA-Leu(CAG)	leuP // leuQ // leuV	b4369 // b4370 // b4368
mokB	b1420	1491962	1492129	putative regulatory protein MokB	mokB	b1420
metK	b2942	3086706	3087860	methionine adenosyltransferase	metK	b2942
ugpA	b3452	3590024	3590911	<i>sn</i>-glycerol 3-phosphate ABC transporter membrane subunit UgpA	ugpQ // ugpC // ugpE // ugpA // ugpB	b3449 // b3450 // b3451 // b3452 // b3453
gltT	b3969	4168372	4168447	tRNA-Glu(UUC)	gltT // rrsB // rrfB // rrlB	b3969 // b3968 // b3971 // b3970
ymgC	b1167	1216748	1216996	protein YmgC	ymgC // ariR // ymgA // ycgZ	b1167 // b1166 // b1165 // b1164
talB	b0008	8238	9191	transaldolase B	talB	b0008
hyfC	b2483	2603847	2604794	hydrogenase 4 component C	focB // hyfR // hyfJ // hyfI // hyfH // hyfG // hyfF // hyfE // hyfD // hyfC // hyfB // hyfA	b2492 // b2491 // b2490 // b2489 // b2488 // b2487 // b2486 // b2485 // b2484 // b2483 // b2482 // b2481
argX	b3796	3982375	3982451	tRNA-Arg(CCG)	argX // hisR // leuT // proM	b3796 // b3797 // b3798 // b3799
ybjO	b0858	897989	898477	putative inner membrane protein	rlmC // ybjO	b0859 // b0858
talA	b2464	2578666	2579616	transaldolase A	tktB // talA	b2465 // b2464
secE	b3981	4177358	4177741	Sec translocon subunit SecE	secE // nusG	b3981 // b3982
thrW	b0244	262871	262946	tRNA-Thr(CGU)	thrW	b0244
yahC	b0317	334525	335022	uncharacterized protein YahC	yahC	b0317
speA	b2938	3083935	3085911	arginine decarboxylase, biosynthetic	speA // speB	b2938 // b2937
wzxC	b2046	2118680	2120158	M-antigen undecaprenyl disphosphate flippase	wcaC // wcaD // wcaE // wcaF // gmd // fcl // gmm // wcaI // cpsB // cpsG // wcaJ // wzxC	b2057 // b2056 // b2055 // b2054 // b2053 // b2052 // b2051 // b2050 // b2049 // b2048 // b2047 // b2046
metY	b3171	3318213	3318289	tRNA-initiator Met(CAU)	pnp // rpsO // truB // rbfA // infB // nusA // rimP // metY	b3164 // b3165 // b3166 // b3167 // b3168 // b3169 // b3170 // b3171
ypfM	b4606	2590807	2590866	uncharacterized protein YpfM	ypfM	b4606
speG	b1584	1656184	1656744	spermidine <i>N</i>-acetyltransferase	speG // ynfB	b1584 // b1583
proW	b2678	2806010	2807074	glycine betaine ABC transporter membrane subunit ProW	proX // proW // proV	b2679 // b2678 // b2677
ileV	b0202	225381	225457	tRNA-Ile(GAU)	alaV // ileV // rrsH // rrfH // rrlH	b0203 // b0202 // b0201 // b0205 // b0204
yqiM	b4787	3247668	3247751	protein YqiM		
speE	b0121	135598	136464	spermidine synthase	yacC // speD // speE	b0122 // b0120 // b0121
ydhP	b1657	1736121	1737290	putative transporter YdhP	ydhP	b1657
glnV	b0665	696542	696616	tRNA-Gln(CUG)	glnX // glnV // metU // glnW // glnU // leuW // metT	b0664 // b0665 // b0666 // b0668 // b0670 // b0672 // b0673
yljB	b4770	922740	922814	protein YljB		
speB	b2937	3082877	3083797	agmatinase	speB // speA	b2937 // b2938
pgpA	b0418	436589	437107	phosphatidylglycerophosphatase A	pgpA // thiL // nusB // ribE // ribD // nrdR	b0418 // b0417 // b0416 // b0415 // b0414 // b0413
argU	b0536	564723	564799	tRNA-Arg(UCU)	argU	b0536
ykiC	b4731	383960	384079	protein YkiC		
speC	b2965	3107020	3109155	constitutive ornithine decarboxylase	speC	b2965
lsrC	b1514	1603019	1604047	Autoinducer-2 ABC transporter membrane subunit LsrC	lsrG // lsrF // lsrB // lsrD // lsrC // lsrA // tam	b1518 // b1517 // b1516 // b1515 // b1514 // b1513 // b1519
lysY	b0747	781147	781222	tRNA-Lys(UUU)	lysY // valZ	b0747 // b0746
ilvX	b4669	3950507	3950557	uncharacterized protein IlvX	ilvX // ilvG // ilvA // ilvD // ilvE // ilvM // ilvL	b4669 // b4488 // b3772 // b3771 // b3770 // b3769 // b3766
gss	b2988	3136663	3138522	fused glutathionylspermidine amidase / glutathionylspermidine synthetase	gss	b2988
murG	b0090	99644	100711	N-acetylglucosaminyl transferase	mraZ // rsmH // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL // lpxC	b0081 // b0082 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083 // b0096
thrT	b3979	4175754	4175829	tRNA-Thr(GGU)	tufB // thrU // tyrU // glyT // thrT	b3980 // b3976 // b3977 // b3978 // b3979
yciX	b4523	1335291	1335458	uncharacterized protein YciX	yciX // ymiA	b4523 // b4522
speD	b0120	134788	135582	<i>S</i>-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme // &beta; cleavage product of SpeD // &alpha; cleavage product of SpeD	yacC // speD // speE	b0122 // b0120 // b0121
lolC	b1116	1175427	1176626	lipoprotein release complex - inner membrane subunit	lolE // lolD // lolC	b1118 // b1117 // b1116
metT	b0673	697057	697133	tRNA-Met(CAU)	glnU // leuW // metT // glnX // glnV // metU // glnW	b0670 // b0672 // b0673 // b0664 // b0665 // b0666 // b0668
yceK	b1050	1113579	1113806	DUF1375 domain-containing lipoprotein YceK	yceK	b1050
pdxH	b1638	1717351	1718007	pyridoxine/pyridoxamine 5'-phosphate oxidase	pdxH // pdxY // tyrS	b1638 // b1636 // b1637
manX	b1817	1902048	1903019	mannose-specific PTS enzyme IIAB component	manX // manY // manZ	b1817 // b1818 // b1819
hisR	b3797	3982509	3982585	tRNA-His(GUG)	argX // hisR // leuT // proM	b3796 // b3797 // b3798 // b3799
yiaD	b3552	3716547	3717206	PF13488 family lipoprotein YiaD	yiaD	b3552
fumD	b1675	1754932	1755141	fumarase D	fumD	b1675
pdxY	b1636	1715026	1715889	pyridoxal kinase 2	pdxH // tyrS // pdxY	b1638 // b1637 // b1636
macA	b0878	919235	920350	ABC-type tripartite efflux pump membrane fusion protein	macA // macB	b0878 // b0879
alaW	b2397	2518156	2518231	tRNA-Ala(GGC)	alaX // alaW	b2396 // b2397
yeiH	b2158	2249717	2250766	PF03601 family inner membrane protein YeiH	yeiH	b2158
fruK	b2168	2261427	2262365	1-phosphofructokinase	fruA // fruK // fruB	b2167 // b2168 // b2169
pdxK	b2418	2536386	2537237	pyridoxal kinase I	pdxK	b2418
hycD	b2722	2846489	2847412	formate hydrogenlyase subunit HycD	hycI // hycH // hycG // hycF // hycE // hycD // hycC // hycB // hycA	b2717 // b2718 // b2719 // b2720 // b2721 // b2722 // b2723 // b2724 // b2725
valY	b2403	2521173	2521248	tRNA-Val(UAC)	valU // valX // valY // lysV	b2401 // b2402 // b2403 // b2404
ydcD	b1457	1529922	1530404	uncharacterized protein YdcD	ydcD // rhsE	b1457 // b1456
sthA	b3962	4159390	4160790	soluble pyridine nucleotide transhydrogenase	sthA	b3962
citT	b0612	645117	646580	citrate:succinate antiporter	citT	b0612
serV	b2695	2818553	2818645	tRNA-Ser(GCU)	argZ // argY // argV // serV // argQ	b2692 // b2693 // b2694 // b2695 // b2691
yigE	b4482	4000292	4001056	DUF2233 domain-containing protein YigE	yigE	b4482
galF	b2042	2113434	2114327	UTP:glucose-1-phosphate uridylyltransferase, low activity	galF	b2042
ftsY	b3464	3602750	3604243	signal recognition particle receptor	ftsX // ftsE // ftsY	b3462 // b3463 // b3464
lysT	b0743	780554	780629	tRNA-Lys(UUU)	lysT // valT // lysW	b0743 // b0744 // b0745
yjdJ	b4127	4352085	4352357	putative <i>N</i>-acetyltransferase YjdJ	yjdJ // yjdI	b4127 // b4126
ppnN	b2795	2926308	2927672	nucleotide 5'-monophosphate nucleosidase	ppnN	b2795
nanT	b3224	3371084	3372574	<i>N</i>-acetylneuraminate:H<sup>+</sup> symporter	yhcH // nanK // nanE // nanT // nanA	b3221 // b3222 // b3223 // b3224 // b3225
glyW	b1911	1992042	1992117	tRNA-Gly(GCC)	3'ETS-<i>leuZ</i> // leuZ // cysT // glyW	b4759 // b1909 // b1910 // b1911
usg	b2319	2435636	2436649	putative semialdehyde dehydrogenase Usg	dedA // truA // usg // pdxB	b2317 // b2318 // b2319 // b2320
ushA	b0480	504914	506566	5'-nucleotidase / UDP-sugar hydrolase	ushA	b0480
acrF	b3266	3415033	3418137	multidrug efflux pump RND permease AcrF	acrE // acrF	b3265 // b3266
aspU	b0206	228928	229004	tRNA-Asp(GUC)	aspU	b0206
yhbW	b3160	3303448	3304455	putative luciferase-like monooxygenase YhbW	yhbW	b3160
dcd	b2065	2141634	2142215	dCTP deaminase	dcd // udk	b2065 // b2066
frlA	b3370	3499910	3501247	fructoselysine/psicoselysine transporter	frlD // frlC // frlB // frlA // frlR	b3374 // b4474 // b3371 // b3370 // b3375
alaT	b3853	4037260	4037335	L-alanyl-tRNA<SUP>alaT</SUP> // tRNA-Ala(UGC)	alaT // ileT // rrsA // rrfA // rrlA	b3853 // b3852 // b3851 // b3855 // b3854
yggS	b2951	3095098	3095802	PLP homeostasis protein	yggU // yggT // yggS // hemW // rdgB	b2953 // b2952 // b2951 // b2955 // b2954
pyrF	b1281	1341921	1342658	orotidine-5'-phosphate decarboxylase	yciH // pyrF // lapB // lapA	b1282 // b1281 // b1280 // b1279
cyoB	b0431	448650	450641	cytochrome <i>bo</i><sub>3</sub> ubiquinol oxidase subunit 1	cyoE // cyoD // cyoC // cyoB // cyoA	b0428 // b0429 // b0430 // b0431 // b0432
iscR	b2531	2661643	2662131	DNA-binding transcriptional dual regulator IscR	iscA // iscU // iscS // iscR	b2528 // b2529 // b2530 // b2531
yqcA	b2790	2922535	2922984	putative flavodoxin YqcA	yqcC // truC // yqcA	b2792 // b2791 // b2790
codA	b0337	356171	357454	cytosine/isoguanine deaminase	codB // codA	b0336 // b0337
gltJ	b0654	685929	686669	glutamate/aspartate ABC transporter membrane subunit GltJ	sroC // gltL // gltK // gltJ // gltI	b4763 // b0652 // b0653 // b0654 // b0655
ydiP	b1696	1778390	1779301	putative DNA-binding transcriptional regulator YdiP	ydiP	b1696
hyfJ	b2490	2611457	2611870	putative hydrogenase 4 assembly protein	focB // hyfR // hyfJ // hyfI // hyfH // hyfG // hyfF // hyfE // hyfD // hyfC // hyfB // hyfA	b2492 // b2491 // b2490 // b2489 // b2488 // b2487 // b2486 // b2485 // b2484 // b2483 // b2482 // b2481
purA	b4177	4404687	4405985	adenylosuccinate synthetase	purA	b4177
betA	b0311	325577	327247	choline dehydrogenase	betA // betB // betI	b0311 // b0312 // b0313
pgrR	b1328	1391991	1392890	DNA-binding transcriptional repressor PgrR	pgrR	b1328
yeiS	b2145	2233600	2233839	DUF2542 domain-containing protein YeiS	yeiS // sanA	b2145 // b2144
deoA	b4382	4618229	4619551	thymidine phosphorylase	deoC // deoA // deoD // deoB	b4381 // b4382 // b4384 // b4383
dtpC	b4130	4354954	4356411	dipeptide/tripeptide:H<sup>+</sup> symporter DtpC	dtpC	b4130
cueR	b0487	513993	514400	DNA-binding transcriptional dual regulator CueR	cueR	b0487
yoaG	b1796	1879403	1879585	DUF1869 domain-containing protein YoaG	yeaR // yoaG	b1797 // b1796
glpX	b3925	4114569	4115579	fructose-1,6-bisphosphatase 2	glpX // glpK // glpF	b3925 // b3926 // b3927
nrdE	b2675	2801348	2803492	ribonucleoside-diphosphate reductase 2 subunit &alpha;	nrdH // nrdI // nrdF // nrdE	b2673 // b2674 // b2676 // b2675
yiaM	b3577	3744328	3744801	2,3-diketo-L-gulonate:Na<sup>+</sup> symporter - membrane subunit	yiaM // sgbE // sgbU // sgbH // lyxK // yiaO // yiaN // yiaL // yiaK	b3577 // b3583 // b3582 // b3581 // b3580 // b3579 // b3578 // b3576 // b3575
dsdC	b2364	2476694	2477629	DNA-binding transcriptional dual regulator DsdC	dsdC	b2364
ydhS	b1668	1747131	1748735	FAD/NAD(P) binding domain-containing protein YdhS	ydhS	b1668
ybhA	b0766	797613	798431	pyridoxal phosphate/fructose-1,6-bisphosphate phosphatase	ybhA	b0766
mtn	b0159	178455	179153	5'-methylthioadenosine/S-adenosylhomocysteine nucleosidase	mtn // btuF // yadS	b0159 // b0158 // b0157
ccmD	b2198	2295377	2295586	cytochrome <i>c</i> maturation protein D	ccmH // ccmG // ccmF // ccmE // ccmD // ccmC // ccmB // ccmA // napC // napB // napH // napG // napA // napD // napF	b2194 // b2195 // b2196 // b2197 // b2198 // b2199 // b2200 // b2201 // b2202 // b2203 // b2204 // b2205 // b2206 // b2207 // b2208
plaR	b3574	3741684	3742532	DNA-binding transcriptional repressor PlaR	plaR	b3574
ynbE	b1382	1445687	1445872	lipoprotein YnbE	ydbL // ynbE // ydbH	b1383 // b1382 // b1381
pgk	b2926	3071459	3072622	phosphoglycerate kinase	fbaA // pgk // epd	b2925 // b2926 // b2927
nrdA	b2234	2344865	2347150	ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit &alpha;	nrdA // nrdB // yfaE	b2234 // b2235 // b2236
nuoN	b2276	2390048	2391505	NADH:quinone oxidoreductase subunit N	nuoN // nuoM // nuoL // nuoK // nuoJ // nuoI // nuoH // nuoG // nuoF // nuoE // nuoC // nuoB // nuoA	b2276 // b2277 // b2278 // b2279 // b2280 // b2281 // b2282 // b2283 // b2284 // b2285 // b2286 // b2287 // b2288
yeiE	b2157	2248737	2249618	LysR-type transcriptional regulator YeiE	yeiE	b2157
ycgX	b1161	1212703	1213107	DUF1398 domain-containing protein YcgX	ycgX	b1161
mdh	b3236	3383330	3384268	malate dehydrogenase	mdh	b3236
cdd	b2143	2231844	2232728	cytidine/deoxycytidine deaminase	cdd	b2143
setB	b2170	2263863	2265044	sugar exporter SetB	setB	b2170
envR	b3264	3412803	3413465	DNA-binding transcriptional repressor EnvR	envR	b3264
ybhQ	b0791	824630	825040	putative inner membrane protein	ybhQ	b0791
yedL	b1932	2010600	2011079	putative acetyltransferase YedL	yedL	b1932
tmk	b1098	1155124	1155765	Tmk	ycfH // holB // tmk // mltG // pabC	b1100 // b1099 // b1098 // b1097 // b1096
eptC	b3955	4148532	4150265	phosphoethanolamine transferase EptC	eptC	b3955
marR	b1530	1619120	1619554	DNA-binding transcriptional repressor MarR	marR // marA // marB	b1530 // b1531 // b1532
ykgL	b0295	312112	312339	uncharacterized protein YkgL	ykgL	b0295
gapA	b1779	1862771	1863766	glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase A	yeaD // gapA	b1780 // b1779
guaB	b2508	2632604	2634070	inosine 5'-monophosphate dehydrogenase	guaA // guaB	b2507 // b2508
amtB	b0451	472966	474252	ammonium transporter	amtB // glnK	b0451 // b0450
soxR	b4063	4277469	4277933	DNA-binding transcriptional dual regulator SoxR	soxR	b4063
ykiE	b4801	4518372	4518440	protein YkiE		
yicI	b3656	3832219	3834537	&alpha;-D-xyloside xylohydrolase	yicI // yicJ	b3656 // b3657
amn	b1982	2055061	2056515	AMP nucleosidase	amn	b1982
adeQ	b3664	3842455	3843789	adenine transporter	adeQ	b3664
rbsR	b3753	3938227	3939219	DNA-binding transcriptional dual regulator RbsR	rbsR // rbsD // rbsA // rbsC // rbsB // rbsK	b3753 // b3748 // b3749 // b3750 // b3751 // b3752
yqgG	b4784	3086145	3086288	protein YqgG		
yggF	b2930	3075217	3076182	fructose 1,6-bisphosphatase YggF	cmtB // cmtA // yggP // yggF // yggC // fumE	b2934 // b2933 // b4465 // b2930 // b2928 // b2929
aphA	b4055	4269414	4270127	acid phosphatase / phosphotransferase	aphA	b4055
artQ	b0862	901534	902250	L-arginine ABC transporter membrane subunit ArtQ	artM // artQ // artI // artP	b0861 // b0862 // b0863 // b0864
metR	b3828	4011863	4012816	DNA-binding transcriptional dual regulator MetR	metR	b3828
ytiB	b4767	391592	391648	protein YtiB		
ppsA	b1702	1784734	1787112	phosphoenolpyruvate synthetase	ppsA	b1702
pyrH	b0171	191855	192580	UMP kinase	pyrH	b0171
cydD	b0887	929196	930962	glutathione/L-cysteine ABC exporter subunit CydD	cydC // cydD	b0886 // b0887
bglJ	b4366	4604160	4604837	DNA-binding transcriptional regulator BglJ	bglJ // yjjQ	b4366 // b4365
yncO	b4745	1530319	1530504	protein YncO		
pck	b3403	3532818	3534440	phosphoenolpyruvate carboxykinase (ATP)	pck	b3403
pyrG	b2780	2908029	2909666	CTP synthetase	pyrG // eno	b2780 // b2779
btsT	b4354	4589129	4591279	pyruvate:H<sup>+</sup> symporter	btsT	b4354
yhaJ	b3105	3253318	3254214	DNA-binding transcriptional activator YhaJ	yhaJ	b3105
yadW	b4728	176552	176617	protein YadW		
maeB	b2463	2576098	2578377	NADP<sup>+</sup>-dependent malate dehydrogenase	maeB	b2463
purH	b4006	4205943	4207532	bifunctional AICAR transformylase/IMP cyclohydrolase	purD // purH	b4005 // b4006
tatE	b0627	658947	659150	twin arginine protein translocation system - TatE protein	tatE	b0627
yfeR	b2409	2525930	2526856	putative LysR-type DNA-binding transcriptional regulator YfeR	yfeR	b2409
yjbS	b4621	4268809	4269012	uncharacterized protein YjbS		
epd	b2927	3072672	3073691	D-erythrose-4-phosphate dehydrogenase	fbaA // pgk // epd	b2925 // b2926 // b2927
deoB	b4383	4619603	4620826	phosphopentomutase	deoC // deoA // deoD // deoB	b4381 // b4382 // b4384 // b4383
yhbX	b3173	3319988	3321613	putative hydrolase YhbX	yhbX	b3173
rstA	b1608	1682159	1682878	Phosphorylated DNA-binding transcriptional regulator RstA // DNA-binding transcriptional regulator RstA	rstB // rstA	b1609 // b1608
yibT	b4554	3776171	3776380	protein YibT	yibT	b4554
gpmA	b0755	786843	787595	2,3-bisphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase	gpmA	b0755
rihA	b0651	683477	684412	pyrimidine-specific ribonucleoside hydrolase RihA	rihA	b0651
damX	b3388	3516020	3517306	cell division protein DamX	damX // aroB // aroK // dam // gph // rpe // trpS	b3388 // b3389 // b3390 // b3387 // b3385 // b3386 // b3384
yciT	b1284	1343597	1344346	putative DNA-binding transcriptional regulator YciT	yciZ // yciT	b4596 // b1284
sgcX	b4305	4530530	4531651	KpLE2 phage-like element; putative endoglucanase with Zn-dependent exopeptidase domain	sgcX // sgcB // sgcC // sgcQ // sgcA // sgcE // sgcR	b4305 // b4565 // b4304 // b4303 // b4302 // b4301 // b4300
eno	b2779	2906643	2907941	enolase	pyrG // eno	b2780 // b2779
gsk	b0477	500125	501429	inosine/guanosine kinase	gsk	b0477
ygcS	b2771	2896533	2897870	putative transporter YgcS	ygcS	b2771
ttdR	b3060	3205324	3206256	Dan transcriptional activator // DNA-binding transcriptional activator Dan	ttdR	b3060
yhjJ	b3527	3680444	3681940	peptidase M16 family protein YhjJ	yhjJ	b3527
csrA	b2696	2818961	2819146	carbon storage regulator	csrA	b2696
nrdB	b2235	2347384	2348514	ribonucleoside-diphosphate reductase 1 subunit &beta;	nrdA // nrdB // yfaE	b2234 // b2235 // b2236
dcuB	b4123	4347404	4348744	anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuB	fumB // dcuB	b4122 // b4123
gadX	b3516	3664986	3665810	DNA-binding transcriptional dual regulator GadX	gadA // gadW // gadX	b3517 // b3515 // b3516
yehQ	b2122	2209100	2210944	SWIM zinc finger domains-containing protein YehQ	yehQ // yehP // yehM // yehL	b2122 // b2121 // b2120 // b2119
maeA	b1479	1553972	1555669	NAD<sup>+</sup>-dependent malate dehydrogenase	maeA	b1479
cpdB	b4213	4434622	4436565	2'3' cyclic nucleotide phosphodiesterase/3' nucleotidase	cpdB	b4213
trkH	b3849	4033145	4034596	K+ transporter TrkH	hemG // trkH // yigZ // pepQ	b3850 // b3849 // b3848 // b3847
zntR	b3292	3438705	3439130	DNA-binding transcriptional activator ZntR	yhdN // zntR	b3293 // b3292
yidI	b3677	3856415	3856864	putative inner membrane protein YidI	yidI	b3677
pgi	b4025	4233758	4235407	glucose-6-phosphate isomerase	pgi	b4025
nrdF	b2676	2803502	2804461	ribonucleoside-diphosphate reductase 2 subunit &beta;	nrdH // nrdI // nrdF // nrdE	b2673 // b2674 // b2676 // b2675
mntH	b2392	2511468	2512706	Mn<sup>2+</sup>/Fe<sup>2+</sup>: H<sup>+</sup> symporter MntH	mntH	b2392
yidP	b3684	3863899	3864615	putative DNA-binding transcriptional regulator YidP	yidP	b3684
yjjV	b4378	4613481	4614260	putative DNase YjjV	yjjV // yjjU	b4378 // b4377
guaD	b2883	3025766	3027085	guanine deaminase	ghxQ // guaD // xanQ	b4464 // b2883 // b2882
udp	b3831	4016431	4017192	uridine phosphorylase	udp	b3831
sdhC	b0721	755177	755566	succinate:quinone oxidoreductase, membrane protein SdhC	sdhX // sdhC // sucA // sucB // sucC // sucD // sdhB // sdhA // sdhD	b4764 // b0721 // b0726 // b0727 // b0728 // b0729 // b0724 // b0723 // b0722
fabR	b3963	4161067	4161771	DNA-binding transcriptional repressor FabR	yijD // fabR	b3964 // b3963
ychE	b1242	1298598	1299245	MarC family putative inner membrane protein YchE	ychE	b1242
ggt	b3447	3585081	3586823	glutathione hydrolase, small subunit // glutathione hydrolase, large subunit // glutathione hydrolase proenzyme	ggt	b3447
guaC	b0104	113444	114487	GMP reductase	guaC	b0104
tcyL	b1918	1997811	1998479	cystine ABC transporter membrane subunit	dcyD // tcyL // tcyN	b1919 // b1918 // b1917
nhaR	b0020	18715	19620	DNA-binding transcriptional activator NhaR	nhaR // nhaA	b0020 // b0019
yrhB	b3446	3584759	3585043	putative heat shock chaperone	yrhB	b3446
ytjC	b4395	4633797	4634444	putative phosphatase	ytjC	b4395
tdk	b1238	1293527	1294144	thymidine/deoxyuridine kinase	tdk	b1238
potE	b0692	716946	718265	putrescine transporter PotE	speFL // potE // speF	b4803 // b0692 // b0693
phoP	b1130	1189776	1190447	Phosphorylated DNA-binding transcriptional dual regulator PhoP // DNA-binding transcriptional dual regulator PhoP	phoP // phoQ	b1130 // b1129
hemY	b3802	3986686	3987882	protein HemY	hemY // hemX // hemD // hemC	b3802 // b3803 // b3804 // b3805
fbp	b4232	4454611	4455609	fructose-1,6-bisphosphatase 1	fbp	b4232
gpt	b0238	255977	256435	xanthine-guanine phsophoribosyltransferase	gpt	b0238
rsxE	b1632	1710828	1711523	SoxR [2Fe-2S] reducing system protein RsxE	nth // rsxE // rsxG // rsxD // rsxC // rsxB // rsxA // ydgK	b1633 // b1632 // b1631 // b1630 // b1629 // b1628 // b1627 // b1626
malI	b1620	1698152	1699180	DNA-binding transcriptional repressor MalI	malI	b1620
tdcF	b3113	3259721	3260110	putative enamine/imine deaminase	tdcG // tdcF // tdcE // tdcD // tdcC // tdcB // tdcA	b4471 // b3113 // b3114 // b3115 // b3116 // b3117 // b3118
add	b1623	1702233	1703234	adenosine deaminase	add	b1623
oppB	b1244	1302899	1303819	murein tripeptide ABC transporter / oligopeptide ABC transporter inner membrane subunit OppB	oppA // oppB // oppC // oppD // oppF	b1243 // b1244 // b1245 // b1246 // b1247
fecI	b4293	4517714	4518235	RNA polymerase sigma factor FecI	fecR // fecI	b4292 // b4293
ygfF	b2902	3045158	3045901	putative oxidoreductase YgfF	ygfF	b2902
dgt	b0160	179237	180754	dGTP triphosphohydrolase	dgt	b0160
ddpB	b1486	1559907	1560929	putative D,D-dipeptide ABC transporter membrane subunit DdpB	ddpF // ddpD // ddpC // ddpB // ddpA // ddpX	b1483 // b1484 // b1485 // b1486 // b1487 // b1488
betI	b0313	328747	329334	DNA-binding transcriptional repressor BetI	betA // betB // betI	b0311 // b0312 // b0313
ygcW	b2774	2899488	2900273	putative deoxygluconate dehydrogenase	ygcW	b2774
upp	b2498	2620246	2620872	uracil phosphoribosyltransferase	uraA // upp	b2497 // b2498
lpxM	b1855	1939222	1940193	Lipid A biosynthesis myristoyltransferase	lpxM	b1855
sgcR	b4300	4526106	4526888	KpLE2 phage-like element; putative DNA-binding transcriptional regulator SgcR	sgcX // sgcB // sgcC // sgcQ // sgcA // sgcE // sgcR	b4305 // b4565 // b4304 // b4303 // b4302 // b4301 // b4300
yfeN	b2408	2525127	2525891	putative outer membrane porin YfeN	yfeN	b2408
deoC	b4381	4617323	4618102	deoxyribose-phosphate aldolase	deoC // deoA // deoB // deoD	b4381 // b4382 // b4383 // b4384
mdtH	b1065	1124118	1125326	multidrug efflux pump MdtH	mdtH	b1065
ygiV	b3023	3168749	3169231	DNA-binding transcriptional repressor YgiV	ygiV	b3023
yegU	b2099	2180095	2181099	putative ADP-ribosylglycohydrolase YegU	yegV // yegU // yegT	b2100 // b2099 // b2098
xapA	b2407	2524045	2524878	xanthosine phosphorylase	xapA // xapB	b2407 // b2406
lspA	b0027	25207	25701	lipoprotein signal peptidase	ribF // ispH // fkpB // lspA // ileS	b0025 // b0029 // b0028 // b0027 // b0026
yfaX	b2248	2361429	2362211	putative DNA-binding transcriptional regulator YfaX	yfaX // rhmD // yfaV // yfaU	b2248 // b2247 // b2246 // b2245
ydjJ	b1774	1857790	1858833	putative zinc-binding dehydrogenase YdjJ	ydjL // ydjK // ydjJ // ydjI // ydjH // ydjG	b1776 // b1775 // b1774 // b1773 // b1772 // b1771
cmk	b0910	961201	961884	cytidylate kinase	cmk // ihfB // rpsA	b0910 // b0912 // b0911
ybjG	b0841	882792	883388	undecaprenyl pyrophosphate phosphatase	ybjG	b0841
yneJ	b1526	1614804	1615685	putative LysR-type DNA-binding transcriptional regulator YneJ	yneJ	b1526
ydgD	b1598	1671960	1672781	putative serine protease YdgD	ydgD	b1598
hpt	b0125	141431	141967	hypoxanthine phosphoribosyltransferase	hpt	b0125
lpxL	b1054	1115662	1116582	lauroyl acyltransferase	lpxL	b1054
csgD	b1040	1102546	1103196	DNA-binding transcriptional dual regulator CsgD	csgG // csgF // csgE // csgD	b1037 // b1038 // b1039 // b1040
ycjY	b1327	1390933	1391853	putative hydrolase YcjY	ymjD // ycjY // ymjC // mpaA	b4673 // b1327 // b4525 // b1326
rihC	b0030	27293	28207	ribonucleoside hydrolase RihC	rihC	b0030
ybbW	b0511	537633	539087	putative allantoin transporter	ybbW // glxR // hyi // gcl // allB // glxK // ybbY	b0511 // b0509 // b0508 // b0507 // b0512 // b0514 // b0513
prpR	b0330	346857	348443	DNA-binding transcriptional dual regulator PrpR	prpR	b0330
ymdA	b1044	1105414	1105725	uncharacterized protein YmdA	clsC // ymdA // ymdB	b1046 // b1044 // b1045
ndk	b2518	2644433	2644864	nucleoside diphosphate kinase	ndk	b2518
ftsA	b0094	103982	105244	cell division protein FtsA	mraZ // rsmH // lpxC // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL	b0081 // b0082 // b0096 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083
rhoL	b3782	3966231	3966332	<i>rho</i> operon leader peptide	rhoL // rho	b3782 // b3783
ybfP	b0689	715412	715906	lipoprotein YbfP	ybfP	b0689
apt	b0469	491412	491963	adenine phosphoribosyltransferase	apt	b0469
sapC	b1292	1353628	1354518	putrescine ABC exporter membrane protein SapC	sapA // sapB // sapC // sapD // sapF	b1294 // b1293 // b1292 // b1291 // b1290
lldR	b3604	3779054	3779830	DNA-binding transcriptional dual regulator LldR	lldD // lldR // lldP	b3605 // b3604 // b3603
yafL	b0227	246712	247461	NlpC/P60 family protein YafL	yafL	b0227
rihB	b2162	2254245	2255186	pyrimidine-specific ribonucleoside hydrolase RihB	rihB	b2162
entD	b0583	609459	610079	phosphopantetheinyl transferase EntD	entD // fepA	b0583 // b0584
yafC	b0208	229967	230881	LysR family transcriptional regulator YafC	yafC	b0208
ysdE	b4798	3853766	3853840	protein YsdE		
guaA	b2507	2630958	2632535	GMP synthetase	guaA // guaB	b2507 // b2508
yhdY	b3270	3421325	3422428	putative ABC transporter membrane subunit YhdY	yhdZ // yhdY // yhdX // yhdW	b3271 // b3270 // b3269 // b3268
nadR	b4390	4627315	4628547	DNA-binding transcriptional repressor/NMN adenylyltransferase NadR	nadR // radA // serB	b4390 // b4389 // b4388
evgL	b4781	2483729	2483758	protein EvgL		
adk	b0474	497175	497819	adenylate kinase	adk	b0474
cydB	b0734	773042	774181	cytochrome <i>bd</i>-I ubiquinol oxidase subunit II	cydB // cydA	b0734 // b0733
tyrR	b1323	1386720	1388261	DNA-binding transcriptional dual regulator TyrR	ycjF // ycjX // tyrR	b1322 // b1321 // b1323
yqiD	b4756	3183381	3183551	protein YqiD		
udk	b2066	2142307	2142948	uridine/cytidine kinase	udk // dcd	b2066 // b2065
dppB	b3543	3704771	3705790	dipeptide ABC transporter membrane subunit DppB	dppF // dppD // dppC // dppB // dppA	b3540 // b3541 // b3542 // b3543 // b3544
rpoC	b3988	4185350	4189573	RNA polymerase subunit &beta;'	rplA // rplK // rplJ // rplL // rpoC // rpoB	b3984 // b3983 // b3985 // b3986 // b3988 // b3987
ymiC	b4741	1335572	1335667	protein YmiC	ymiC // acnA	b4741 // b1276
gmk	b3648	3821428	3822051	guanylate kinase	gmk	b3648
atpG	b3733	3917402	3918265	ATP synthase F<sub>1</sub> complex subunit &gamma;	atpI // atpC // atpD // atpG // atpA // atpH // atpF // atpE // atpB	b3739 // b3731 // b3732 // b3733 // b3734 // b3735 // b3736 // b3737 // b3738
ebgR	b3075	3221466	3222449	DNA-binding transcriptional repressor EbgR	ebgR	b3075
rzoQ	b4689	1639080	1639334	Qin prophage; putative lipoprotein RzoQ		
dut	b3640	3813929	3814387	dUTP diphosphatase	slmA // dut	b3641 // b3640
yjfF	b4231	4453583	4454578	galactofuranose ABC transporter putative membrane subunit YjtF	yjfF // ytfT // ytfR // ytfQ	b4231 // b4230 // b4485 // b4227
argR	b3237	3384703	3385173	DNA-binding transcriptional dual regulator ArgR	argR	b3237
ygdT	b4610	2969330	2969476	hypothetical protein YgdT		
cyaY	b3807	3993739	3994059	frataxin CyaY	cyaY	b3807
yhjV	b3539	3700563	3701834	putative transporter YhjV	yhjV	b3539
bdcR	b4251	4474124	4474717	putative transcriptional regulator BdcR	bdcR	b4251
ypdJ	b4545	2476094	2476234	CPS-53 (KpLE1) prophage; putative uncharacterized protein YpdJ	ypdJ	b4545
ftp	b2214	2310479	2311534	FAD:protein FMN transferase	ftp	b2214
narU	b1469	1542672	1544060	nitrate/nitrite transporter NarU	narU	b1469
glcC	b2980	3128272	3129036	DNA-binding transcriptional dual regulator GlcC	glcC	b2980
ychO	b1220	1273784	1275178	putative invasin YchO	ychO	b1220
tdcD	b3115	3262452	3263660	propionate kinase	tdcG // tdcF // tdcE // tdcD // tdcC // tdcB // tdcA	b4471 // b3113 // b3114 // b3115 // b3116 // b3117 // b3118
nuoJ	b2280	2395342	2395896	NADH:quinone oxidoreductase subunit J	nuoL // nuoK // nuoJ // nuoI // nuoH // nuoG // nuoF // nuoE // nuoC // nuoB // nuoA // nuoN // nuoM	b2278 // b2279 // b2280 // b2281 // b2282 // b2283 // b2284 // b2285 // b2286 // b2287 // b2288 // b2276 // b2277
nac	b1988	2061016	2061933	DNA-binding transcriptional dual regulator Nac	nac	b1988
yhhM	b3467	3605251	3605610	DUF2500 domain-containing protein YhhM	yhhM	b3467
nrdD	b4238	4460522	4462660	anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase	nrdD // nrdG	b4238 // b4237
yohD	b2136	2225801	2226379	DedA family protein YohD	yohD	b2136
mcbR	b1450	1520262	1520927	DNA-binding transcriptional dual regulator McbR	mcbR	b1450
wbbJ	b2033	2104494	2105084	putative lipopolysaccharide biosynthesis O-acetyl transferase WbbJ	wbbK // wbbJ // wbbI	b2032 // b2033 // b2034
mutT	b0099	111044	111433	8-oxo-dGTP diphosphatase	mutT // secA // secM	b0099 // b0098 // b0097
yeeA	b2008	2079533	2080591	putative transporter YeeA	yeeA	b2008
ybhD	b0768	799622	800575	putative DNA-binding transcriptional regulator YbhD	ybhD	b0768
modF	b0760	792316	793788	ABC family protein ModF	modE // modF	b0761 // b0760
nanK	b3222	3369475	3370350	<i>N</i>-acetylmannosamine kinase	yhcH // nanK // nanE // nanT // nanA	b3221 // b3222 // b3223 // b3224 // b3225
hofC	b0106	114522	115724	inner membrane protein HofC	ppdD // hofB // hofC	b0108 // b0107 // b0106
rtcR	b3422	3558268	3559866	DNA-binding transcriptional activator RtcR	rtcR	b3422
yjiL	b4334	4563922	4564689	putative ATPase, activator of (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehdratase	yjiM // yjiL	b4335 // b4334
nagA	b0677	701603	702751	<i>N</i>-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase	umpH // nagC // nagA // nagB	b0675 // b0676 // b0677 // b0678
setA	b0070	77621	78799	sugar exporter SetA	sgrT // setA // sgrS	b4662 // b0070 // b4577
yjdC	b4135	4362733	4363308	putative DNA-binding transcriptional regulator YjdC	dsbD // yjdC	b4136 // b4135
ydcA	b1419	1491677	1491850	protein YdcA	ydcA	b1419
nanE	b3223	3370347	3371036	putative <i>N</i>-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase	yhcH // nanK // nanE // nanT // nanA	b3221 // b3222 // b3223 // b3224 // b3225
setC	b3659	3836953	3838137	putative arabinose exporter	setC	b3659
rpoE	b2573	2709437	2710012	RNA polymerase sigma E factor	rseD // rseC // rseB // rseA // rpoE	b4725 // b2570 // b2571 // b2572 // b2573
yhfZ	b3383	3511439	3512344	putative DNA-binding transcriptional regulator YhfZ	yhfZ // yhfY	b3383 // b3382
nanA	b3225	3372683	3373576	<i>N</i>-acetylneuraminate lyase	yhcH // nanK // nanE // nanT // nanA	b3221 // b3222 // b3223 // b3224 // b3225
gdx	b4148	4376875	4377192	guanidinium exporter	gdx	b4148
evgA	b2369	2483755	2484369	Phosphorylated DNA-binding transcriptional activator EvgA // DNA-binding transcriptional activator EvgA	evgS // evgA	b2370 // b2369
apaG	b0050	51229	51606	DUF525 domain-containing protein ApaG	lptD // surA // apaH // apaG // rsmA // pdxA	b0054 // b0053 // b0049 // b0050 // b0051 // b0052
nagB	b0678	702811	703611	glucosamine-6-phosphate deaminase	nagB // nagC // nagA // umpH	b0678 // b0676 // b0677 // b0675
appC	b0978	1037740	1039284	cytochrome <i>bd</i>-II ubiquinol oxidase subunit I	appX // appC // appB // appA	b4592 // b0978 // b0979 // b0980
creB	b4398	4636007	4636696	Phosphorylated DNA-binding transcriptional regulator CreB // DNA-binding transcriptional regulator CreB	creA // creB // creC // creD	b4397 // b4398 // b4399 // b4400
ygjJ	b3079	3227801	3228871	protein YgjJ	ygjK // ygjJ	b3080 // b3079
glcE	b4468	3125470	3126522	glycolate dehydrogenase, putative FAD-binding subunit	glcG // glcF // glcE // glcD // glcA // glcB	b2977 // b4467 // b4468 // b2979 // b2975 // b2976
waaH	b3615	3789047	3790081	UDP-glucuronate:LPS(HepIII) glycosyltransferase	waaH	b3615
rho	b3783	3966417	3967676	transcription termination factor Rho	rho // rhoL	b3783 // b3782
yqeB	b2875	3012614	3014239	XdhC-CoxI family protein YqeB	yqeB	b2875
gcl	b0507	533916	535697	glyoxylate carboligase	ybbW // glxR // hyi // gcl // allB // glxK // ybbY	b0511 // b0509 // b0508 // b0507 // b0512 // b0514 // b0513
yhaH	b3103	3252304	3252669	putative inner membrane protein	yhaH	b3103
nusG	b3982	4177743	4178288	transcription termination factor NusG	secE // nusG	b3981 // b3982
ygbM	b2739	2864236	2865012	putative 2-oxo-tetronate isomerase YgbM	ygbM // ygbL	b2739 // b2738
glcD	b2979	3126522	3128021	glycolate dehydrogenase, putative FAD-linked subunit	glcG // glcF // glcE // glcD // glcA // glcB	b2977 // b4467 // b4468 // b2979 // b2975 // b2976
yedA	b1959	2029539	2030459	putative transporter YedA	yedA	b1959
kdpE	b0694	721056	721733	KdpE-Phosphorylated // DNA-binding transcriptional activator KdpE	kdpE // kdpD	b0694 // b0695
yfdC	b2347	2465301	2466233	inner membrane protein YfdC	yfdC	b2347
glcF	b4467	3124236	3125459	glycolate dehydrogenase, putative iron-sulfur subunit	glcG // glcF // glcE // glcD // glcA // glcB	b2977 // b4467 // b4468 // b2979 // b2975 // b2976
rseC	b2570	2707322	2707801	protein RseC	rseD // rseC // rseB // rseA // rpoE	b4725 // b2570 // b2571 // b2572 // b2573
galR	b2837	2976599	2977630	DNA-binding transcriptional dual regulator GalR	galR	b2837
yeeZ	b2016	2088304	2089128	putative epimerase YeeZ	yeeZ	b2016
fixB	b0042	43188	44129	putative electron transfer flavoprotein FixB	fixX // fixC // fixB // fixA	b0044 // b0043 // b0042 // b0041
caiA	b0039	39244	40386	crotonobetainyl-CoA reductase	caiB // caiA // caiT // caiE // caiD // caiC	b0038 // b0039 // b0040 // b0035 // b0036 // b0037
tonB	b1252	1311089	1311808	Ton complex subunit TonB	tonB	b1252
deoR	b0840	881976	882734	DNA-binding transcriptional repressor DeoR	deoR	b0840
ydjY	b1751	1834116	1834793	4Fe-4S ferredoxin-type domain-containing protein YdjY	ynjD // ynjC // ynjB // ynjA // ydjZ // ydjY // ydjX	b1756 // b1755 // b1754 // b1753 // b1752 // b1751 // b1750
ydiO	b1695	1777196	1778347	putative acyl-CoA dehydrogenase YdiO	ydiO // ydiF	b1695 // b1694
fixC	b0043	44180	45466	putative oxidoreductase FixC	fixX // fixC // fixB // fixA	b0044 // b0043 // b0042 // b0041
lpxP	b2378	2495645	2496565	palmitoleoyl acyltransferase	lpxP	b2378
dcuR	b4124	4349315	4350034	DcuR // DNA-binding transcriptional activator DcuR	dcuR // dcuS	b4124 // b4125
ydeT	b1505	1588853	1590001	fimbrial usher domain-containing protein YdeT	ydeT // ydeS // ydeR	b1505 // b1504 // b1503
ccp	b3518	3667791	3669188	cytochrome <I>c</i> peroxidase	ccp	b3518
caiD	b0036	35377	36162	crotonobetainyl-CoA hydratase	caiE // caiD // caiC // caiB // caiA // caiT	b0035 // b0036 // b0037 // b0038 // b0039 // b0040
sbmA	b0377	396639	397859	peptide antibiotic/peptide nucleic acid transporter	yaiW // sbmA	b0378 // b0377
ygbI	b2735	2860467	2861234	putative DeoR-type DNA-binding transcriptional regulator YgbI	ygbI	b2735
yddK	b1471	1544758	1545714	leucine-rich repeat domain-containing protein YddK	yddL // yddK // yddJ	b1472 // b1471 // b1470
fixA	b0041	42403	43173	putative electron transfer flavoprotein FixA	fixX // fixC // fixB // fixA	b0044 // b0043 // b0042 // b0041
fixX	b0044	45463	45750	putative ferredoxin FixX	fixX // fixC // fixB // fixA	b0044 // b0043 // b0042 // b0041
pntB	b1602	1674972	1676360	pyridine nucleotide transhydrogenase subunit &beta;	pntB // pntA	b1602 // b1603
kdgR	b1827	1909308	1910099	DNA-binding transcriptional repressor KdgR	kdgR	b1827
yciW	b1287	1348980	1350107	putative oxidoreductase	yciW	b1287
caiB	b0038	37898	39115	&gamma;-butyrobetainyl-CoA:carnitine CoA transferase	caiB // caiA // caiT // caiE // caiD // caiC	b0038 // b0039 // b0040 // b0035 // b0036 // b0037
rsxC	b1629	1706919	1709141	SoxR [2Fe-2S] reducing system protein RsxC	nth // rsxE // rsxG // rsxD // rsxC // rsxB // rsxA // ydgK	b1633 // b1632 // b1631 // b1630 // b1629 // b1628 // b1627 // b1626
paaX	b1399	1463539	1464489	DNA-binding transcriptional repressor PaaX	paaY // paaX	b1400 // b1399
ymcE	b0991	1051847	1052077	protein YmcE	ymcE // gnsA	b0991 // b4517
anmK	b1640	1718493	1719602	anhydro-<i>N</i>-acetylmuramic acid kinase	anmK	b1640
nupG	b2964	3105714	3106970	nucleoside:H<sup>+</sup> symporter NupG	nupG // mltC // yggX // mutY	b2964 // b2963 // b2962 // b2961
ybdO	b0603	636716	637618	putative LysR family DNA-binding transcriptional regulator YbdO	ybdO	b0603
ylaC	b0458	478781	479251	putative inner membrane protein	ylaC	b0458
nagZ	b1107	1164095	1165120	&beta;-N-acetylhexosaminidase	ycfP // nagZ // thiK // lpoB // ycfL // hinT	b1108 // b1107 // b1106 // b1105 // b1104 // b1103
ydcV	b1443	1514762	1515556	putative ABC transporter membrane subunit YdcV	patD // ydcT // ydcU // ydcV // ydcS	b1444 // b1441 // b1442 // b1443 // b1440
caiF	b0034	34300	34695	DNA-binding transcriptional activator CaiF	caiF	b0034
yafS	b0213	234816	235538	putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase	yafS	b0213
ptsA	b3947	4139720	4142221	putative PTS multiphosphoryl transfer protein PtsA	ptsA // fsaB // gldA	b3947 // b3946 // b3945
murQ	b2428	2545773	2546669	<i>N</i>-acetylmuramic acid 6-phosphate etherase	yfeW // murP // murQ	b2430 // b2429 // b2428
mrdB	b0634	665201	666313	SEDS family protein MrdB	rsfS // rlmH // mrdA // mrdB // rlpA	b0637 // b0636 // b0635 // b0634 // b0633
cdaR	b0162	182463	183620	DNA-binding transcriptional activator CdaR	cdaR	b0162
yibX	b4795	3797772	3798014	protein YibX-S // protein YibX		
ptsH	b2415	2533764	2534021	phosphocarrier HPr-<i>N</i><sup>&pi;</sup>-phospho-L-histidine // phosphocarrier protein HPr	ptsH // ptsI // crr	b2415 // b2416 // b2417
nagK	b1119	1178593	1179504	<i>N</i>-acetyl-D-glucosamine kinase	cobB // nagK	b1120 // b1119
rutG	b1006	1068511	1069839	pyrimidine:H<sup>+</sup> symporter	rutA // rutB // rutC // rutD // rutE // rutF // rutG	b1012 // b1011 // b1010 // b1009 // b1008 // b1007 // b1006
lrhA	b2289	2405703	2406641	DNA-binding transcriptional dual regulator LrhA	lrhA	b2289
ydgV	b4777	1673608	1673709	protein YdgV		
csgE	b1039	1102152	1102541	curli assembly component CsgE	csgG // csgF // csgE // csgD	b1037 // b1038 // b1039 // b1040
aceA	b4015	4217109	4218413	isocitrate lyase	aceB // aceA // aceK	b4014 // b4015 // b4016
livH	b3457	3595477	3596403	branched chain amino acid/phenylalanine ABC transporter membrane subunit LivH	livF // livG // livM // livH // livK	b3454 // b3455 // b3456 // b3457 // b3458
csqR	b3884	4074669	4075454	DNA-binding transcriptional dual regulator CsqR	csqR // yihV	b3884 // b3883
yqfH	b4753	3032939	3033010	protein YqfH		
mdtE	b3513	3659232	3660389	multidrug efflux pump membrane fusion protein MdtE	gadF // mdtF // mdtE // gadE	b4718 // b3514 // b3513 // b3512
aceB	b4014	4215478	4217079	malate synthase A	aceB // aceA // aceK	b4014 // b4015 // b4016
ybhS	b0793	826119	827252	ABC exporter membrane subunit YbhS	cecR // ybhG // ybhF // ybhS // ybhR	b0796 // b0795 // b0794 // b0793 // b0792
gadE	b3512	3658366	3658893	DNA-binding transcriptional activator GadE	gadF // mdtF // mdtE // gadE	b4718 // b3514 // b3513 // b3512
ymgK	b4738	1212260	1212304	protein YmgK		
ptsI	b2416	2534066	2535793	PTS enzyme I	ptsH // ptsI // crr	b2415 // b2416 // b2417
gabT	b2662	2792735	2794015	4-aminobutyrate aminotransferase GabT	lhgD // glaH // gabP // gabT // gabD	b2660 // b2659 // b2663 // b2662 // b2661
gltP	b4077	4294481	4295794	glutamate/aspartate : H<sup>+</sup> symporter GltP	gltP	b4077
xapR	b2405	2521593	2522477	DNA-binding transcriptional activator XapR	xapR	b2405
yqfG	b4684	3032817	3032942	uncharacterized protein YqfG		
cusB	b0574	597479	598702	copper/silver export system membrane fusion protein	cusA // cusB // cusF // cusC	b0575 // b0574 // b0573 // b0572
gabD	b2661	2791273	2792721	succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP<sup>+</sup>) GabD	lhgD // glaH // gabP // gabT // gabD	b2660 // b2659 // b2663 // b2662 // b2661
fsr	b0479	503476	504696	fosmidomycin efflux pump	fsr	b0479
sspA	b3229	3376782	3377420	stringent starvation protein A	sspB // sspA	b3228 // b3229
yciZ	b4596	1344436	1344609	UPF0509 protein YciZ	yciZ // yciT	b4596 // b1284
trkA	b3290	3436518	3437894	NAD-binding component of Trk potassium transporters	trkA	b3290
metF	b3941	4132616	4133506	5,10-methylenetetrahydrofolate reductase	metF	b3941
frdC	b4152	4379377	4379772	fumarate reductase membrane protein FrdC	frdD // frdC // frdB // frdA	b4151 // b4152 // b4153 // b4154
rfaH	b3842	4024333	4024821	transcription antiterminator RfaH	rfaH	b3842
ykfH	b4504	264026	264247	DUF987 domain-containing protein YkfH	yafY // ykfI // yafW // ykfH // ykfG // yafX // ykfF // ykfB	b0251 // b0245 // b0246 // b4504 // b0247 // b0248 // b0249 // b0250
folA	b0048	49823	50302	dihydrofolate reductase	folA	b0048
cydH	b4602	1737456	1737545	cytochrome <i>bd</i>-I ubiquinol oxidase accessory subunit CydH		
sfsB	b3188	3334909	3335187	putative transcriptional regulator SfsB	sfsB	b3188
ygdG	b2798	2931055	2931810	flap endonuclease	ygdG	b2798
purU	b1232	1287782	1288624	formyltetrahydrofolate deformylase	purU	b1232
dmsC	b0896	944033	944896	dimethyl sulfoxide reductase subunit C	dmsC // dmsB // dmsA	b0896 // b0895 // b0894
cra	b0080	88028	89032	DNA-binding transcriptional dual regulator Cra	cra	b0080
yaeF	b0193	216179	217003	peptidase C92 family protein YaeF	yaeF	b0193
zupT	b3040	3182550	3183323	heavy metal divalent cation transporter ZupT	zupT	b3040
folC	b2315	2431674	2432942	bifunctional folylpolyglutamate synthetase / dihydrofolate synthetase	folC // dedD	b2315 // b2314
mlaE	b3194	3338466	3339248	intermembrane phospholipid transport system, integral membrane subunit MlaE	mlaB // mlaC // mlaD // mlaE // mlaF	b3191 // b3192 // b3193 // b3194 // b3195
cspA	b3556	3720049	3720261	cold shock protein CspA	cspA	b3556
yiiR	b3921	4112315	4112755	DUF805 domain-containing protein YiiR	yiiR	b3921
tamB	b4221	4444112	4447891	translocation and assembly module subunit TamB	ytfP // tamB // tamA	b4222 // b4221 // b4220
folM	b1606	1680976	1681698	dihydromonapterin reductase	folM // ydgI	b1606 // b1605
lnt	b0657	689343	690881	apolipoprotein <i>N</i>-acyltransferase	ybeZ // ybeY // ybeX // lnt	b0660 // b0659 // b0658 // b0657
frlR	b3375	3504052	3504783	putative DNA-binding transcriptional regulator FrlR	frlD // frlC // frlB // frlA // frlR	b3374 // b4474 // b3371 // b3370 // b3375
ybiB	b0800	835248	836210	nonspecific DNA-binding protein YbiB	dinG // ybiB	b0799 // b0800
feoA	b3408	3540163	3540390	ferrous iron transport protein A	feoC // feoA // feoB	b3410 // b3408 // b3409
thyA	b2827	2964361	2965155	thymidylate synthase	thyA // lgt	b2827 // b2828
lgoT	b4356	4593361	4594722	galactonate:H+ symporter	lgoT	b4356
hcaR	b2537	2668006	2668896	DNA-binding transcriptional dual regulator HcaR	hcaR	b2537
yjgR	b4263	4488561	4490063	DUF853 domain-containing protein YjgR	yjgR	b4263
tamA	b4220	4442382	4444115	translocation and assembly module subunit TamA	ytfP // tamB // tamA	b4222 // b4221 // b4220
folD	b0529	556875	557741	bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase / methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase	folD // ybcJ	b0529 // b0528
atpD	b3732	3915993	3917375	ATP synthase F<sub>1</sub> complex subunit &beta;	atpI // atpC // atpD // atpG // atpA // atpH // atpF // atpE // atpB	b3739 // b3731 // b3732 // b3733 // b3734 // b3735 // b3736 // b3737 // b3738
ydjF	b1770	1854096	1854854	putative DNA-binding transcriptional regulator YdjF	ydjF	b1770
ppdC	b2823	2962441	2962764	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein PpdC	ppdA // ppdB // ygdB // ppdC // recC	b2826 // b2825 // b2824 // b2823 // b2822
aspA	b4139	4366891	4368327	aspartate ammonia-lyase	aspA // dcuA	b4139 // b4138
mdtK	b1663	1743457	1744830	multidrug efflux pump MdtK	mdtK	b1663
abgR	b1339	1404741	1405649	putative LysR-type DNA-binding transcriptional regulator AbgR	abgR	b1339
yheT	b3353	3483202	3484224	putative hydrolase YheT	yheU // yheT // yheS	b3354 // b3353 // b3352
ulaE	b4197	4422846	4423700	L-ribulose-5-phosphate 3-epimerase UlaE	ulaF // ulaE // ulaD // ulaC // ulaB // ulaA	b4198 // b4197 // b4196 // b4195 // b4194 // b4193
arsB	b3502	3648935	3650224	arsenite/antimonite:H<sup>+</sup> antiporter	arsR // arsB // arsC	b3501 // b3502 // b3503
allS	b0504	531295	532221	DNA-binding transcriptional activator AllS	allS	b0504
yqhG	b3013	3157650	3158576	DUF3828 domain-containing protein YqhG	yqhG	b3013
gspA	b3323	3453929	3455398	Type II secretion system protein GspA	gspB // gspA	b3322 // b3323
scpB	b2919	3063993	3064778	methylmalonyl-CoA decarboxylase	scpC // scpB // argK // scpA	b2920 // b2919 // b2918 // b2917
ydhC	b1660	1739911	1741122	putative transporter YdhC	ydhC	b1660
uxuR	b4324	4554576	4555349	DNA-binding transcriptional repressor UxuR	uxuR	b4324
ygeQ	b2863	2998034	2998828	putative lipoprotein YgeQ	ygeQ	b2863
ytfF	b4210	4432091	4433056	inner membrane protein YtfF	ytfF	b4210
sgbH	b3581	3748577	3749239	3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase SgbH	yiaM // sgbE // sgbU // sgbH // lyxK // yiaO // yiaN // yiaL // yiaK	b3577 // b3583 // b3582 // b3581 // b3580 // b3579 // b3578 // b3576 // b3575
nikC	b3478	3616182	3617015	Ni(2+) ABC transporter membrane subunit NikC	nikR // nikA // nikB // nikC // nikD // nikE	b3481 // b3476 // b3477 // b3478 // b3479 // b3480
yiaU	b3585	3751992	3752966	putative LysR-type DNA-binding transcriptional regulator YiaU	yiaU	b3585
ypjD	b2611	2747962	2748753	cytochrome <i>c</i> assembly family protein	ypjD	b2611
yqgA	b2966	3109553	3110260	DUF554 domain-containing protein YqgA	yqgA	b2966
yfdE	b2371	2488023	2489168	acetyl-CoA:oxalate CoA-transferase	yfdX // oxc // yfdV // frc // yfdE	b2375 // b2373 // b2372 // b2374 // b2371
rfbX	b2037	2108337	2109584	polyisoprenol-linked <i>O</i>-antigen repeat unit flippase	rfbX // rfbC // rfbA // rfbD // rfbB	b2037 // b2038 // b2039 // b2040 // b2041
norR	b2709	2830775	2832289	DNA-binding transcriptional dual regulator NorR	norR	b2709
yfcD	b2299	2418634	2419176	putative Nudix hydrolase YfcD	yfcD	b2299
lysO	b0874	913958	914857	L-lysine exporter	lysO	b0874
scpA	b2917	3060850	3062994	methylmalonyl-CoA mutase	scpC // scpB // argK // scpA	b2920 // b2919 // b2918 // b2917
menA	b3930	4119423	4120349	1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase	menA // rraA	b3930 // b3929
yfiE	b2577	2714439	2715320	putative LysR-type DNA-binding transcriptional regulator YfiE	yfiE	b2577
dsrB	b1952	2024635	2024823	protein DsrB	dsrB	b1952
gspL	b3333	3463922	3465085	Type II secretion system protein GspL	gspO // gspM // gspL // gspK // gspJ // gspI // gspH // gspG // gspF // gspE // gspD // gspC	b3335 // b3334 // b3333 // b3332 // b3331 // b3330 // b3329 // b3328 // b3327 // b3326 // b3325 // b3324
kptA	b4331	4560930	4561484	RNA 2'-phosphotransferase	kptA	b4331
yddA	b1496	1577657	1579342	ABC transporter family protein YddA	yddA // yddB	b1496 // b1495
hdfR	b4480	3947128	3947967	DNA-binding transcriptional dual regulator HdfR	hdfR	b4480
yniA	b1725	1807796	1808656	putative kinase YniA	yniA	b1725
gsiC	b0831	870967	871887	glutathione ABC transporter membrane subunit GsiC	gsiD // gsiC // gsiB // gsiA // iaaA	b0832 // b0831 // b0830 // b0829 // b0828
citE	b0616	649582	650490	citrate lyase &beta; subunit	citC // citD // citE // citF // citX // citG	b0618 // b0617 // b0616 // b0615 // b0614 // b0613
atoB	b2224	2326109	2327293	acetyl-CoA acetyltransferase	atoB // atoD // atoA // atoE	b2224 // b2221 // b2222 // b2223
fimZ	b0535	563848	564480	putative LuxR family transcriptional regulator FimZ	fimZ	b0535
ydcY	b1446	1517648	1517881	DUF2526 domain-containing protein YdcY	ydcY	b1446
atoE	b2223	2324756	2326078	short chain fatty acid transporter	atoB // atoD // atoA // atoE	b2224 // b2221 // b2222 // b2223
hmp	b2552	2685835	2687025	nitric oxide dioxygenase	hmp	b2552
proP	b4111	4330502	4332004	osmolyte:H<sup>+</sup> symporter ProP	proP	b4111
soxS	b4062	4277060	4277383	DNA-binding transcriptional dual regulator SoxS	soxS	b4062
ycgY	b1196	1245160	1245600	uncharacterized protein YcgY	ycgY	b1196
gspI	b3330	3461974	3462351	Type II secretion system protein GspI	gspO // gspM // gspL // gspK // gspJ // gspI // gspH // gspG // gspF // gspE // gspD // gspC	b3335 // b3334 // b3333 // b3332 // b3331 // b3330 // b3329 // b3328 // b3327 // b3326 // b3325 // b3324
ulaF	b4198	4423700	4424386	L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase UlaF	ulaF // ulaE // ulaD // ulaC // ulaB // ulaA	b4198 // b4197 // b4196 // b4195 // b4194 // b4193
rhtB	b3824	4008439	4009059	L-homoserine/L-homoserine lactone/L-threonine exporter	rhtB	b3824
cadC	b4133	4360396	4361934	DNA-binding transcriptional activator CadC	cadC	b4133
yccS	b0960	1021730	1023883	putative transporter YccS	yccF // yccS	b0961 // b0960
yfbS	b2292	2409520	2411352	putative transporter YfbS	yfbS	b2292
scpC	b2920	3064802	3066280	propionyl-CoA:succinate CoA transferase	scpC // scpB // argK // scpA	b2920 // b2919 // b2918 // b2917
pgpC	b2560	2697915	2698550	phosphatidylglycerophosphatase C	pgpC // tadA	b2560 // b2559
agaR	b3131	3277856	3278665	DNA-binding transcriptional repressor AgaR	agaR	b3131
yahM	b0327	345404	345649	uncharacterized protein YahM	yahM	b0327
yidE	b3685	3864612	3866273	putative transport protein YidE	yidE	b3685
can	b0126	142008	142670	carbonic anhydrase 2	can	b0126
fxsA	b4140	4368664	4369140	protein FxsA	fxsA	b4140
murR	b2427	2544752	2545609	DNA-binding transcriptional dual regulator MurR	murR	b2427
yaeP	b4406	213925	214125	UPF0253 family protein YaeP	yaeP // rof	b4406 // b0189
wza	b2062	2136104	2137243	outer membrane polysaccharide export protein Wza	wcaB // wcaA // wzc // wzb // wza	b2058 // b2059 // b2060 // b2061 // b2062
ygbL	b2738	2863593	2864231	putative 3-oxo-tetronate 4-phosphate decarboxylase YgbL	ygbM // ygbL	b2739 // b2738
dgcC	b0385	403703	404818	diguanylate cyclase DgcC	dgcC	b0385
uidR	b1618	1696462	1697052	DNA-binding transcriptional repressor UidR	uidR	b1618
yriA	b4791	3640612	3640686	protein YriA		
yfeH	b2410	2526946	2527944	putative solute:Na<sup>+</sup> symporter	yfeH	b2410
trxB	b0888	931085	932050	thioredoxin reductase	trxB	b0888
yqiK	b3051	3192864	3194525	flotillin family inner membrane protein YqiK	yqiK // yqiJ	b3051 // b3050
decR	b0447	468383	468841	DNA-binding transcriptional activator DecR	decR	b0447
yncP	b4774	1491876	1491944	protein YncP		
gspC	b3324	3455578	3456393	Type II secretion system protein GspC	gspO // gspM // gspL // gspK // gspJ // gspI // gspH // gspG // gspF // gspE // gspD // gspC	b3335 // b3334 // b3333 // b3332 // b3331 // b3330 // b3329 // b3328 // b3327 // b3326 // b3325 // b3324
yjiM	b4335	4564699	4565850	putative dehydratase subunit	yjiM // yjiL	b4335 // b4334
entS	b0591	622300	623550	enterobactin exporter EntS	entS	b0591
exuR	b3094	3246652	3247428	DNA-binding transcriptional repressor ExuR	exuR	b3094
ynfR	b4749	1638188	1638253	Qin prophage; protein YnfR		
ydiQ	b1697	1779617	1780381	putative electron transfer flavoprotein subunit YdiQ	fadK // ydiT // ydiS // ydiR // ydiQ	b1701 // b1700 // b1699 // b1698 // b1697
citD	b0617	650487	650783	citrate lyase acyl carrier protein	citC // citD // citE // citF // citX // citG	b0618 // b0617 // b0616 // b0615 // b0614 // b0613
hcaT	b2536	2666707	2667846	putative 3-phenylpropionate transporter	hcaT	b2536
yhjB	b3520	3671292	3671894	putative DNA-binding transcriptional regulator YhjB	yhjB	b3520
ybgU	b4735	754674	754781	protein YbgU		
yohK	b2142	2231019	2231714	PF04712 family membrane protein YohK	yohK // yohJ	b2142 // b2141
yjhH	b4298	4524105	4525010	KpLE2 phage-like element; putative 2-dehydro-3-deoxy-D-pentonate aldolase	yjhI // yjhH // yjhG	b4299 // b4298 // b4297
tolA	b0739	776342	777607	Tol-Pal system protein TolA	ybgC // tolQ // tolR // tolA	b0736 // b0737 // b0738 // b0739
mlrA	b2127	2214866	2215597	DNA-binding transcriptional activator MlrA	mlrA	b2127
yqeL	b4683	2989819	2989899	uncharacterized protein YqeL		
yjiJ	b4332	4561497	4562675	putative transporter YjiJ	yjiJ	b4332
hyi	b0508	535710	536486	hydroxypyruvate isomerase	ybbW // glxR // hyi // gcl // allB // glxK // ybbY	b0511 // b0509 // b0508 // b0507 // b0512 // b0514 // b0513
arnF	b2258	2372892	2373278	undecaprenyl-phosphate-&alpha;-L-Ara4N flippase - ArnF subunit	arnF // arnE // arnT // arnD // arnA // arnC // arnB	b2258 // b4544 // b2257 // b2256 // b2255 // b2254 // b2253
yidZ	b3711	3892765	3893724	putative LysR-type transcriptional regulator YidZ	yidZ	b3711
appX	b4592	1040445	1040537	small protein AppX	appX // appC // appB // appA	b4592 // b0978 // b0979 // b0980
ycfT	b1115	1174092	1175165	inner membrane protein YcfT	ycfT	b1115
yghU	b2989	3138727	3139593	disulfide reductase / organic hydroperoxide reductase	yghU	b2989
pyrD	b0945	1004768	1005778	dihydroorotate dehydrogenase, type 2	pyrD	b0945
cynR	b0338	357791	358690	DNA-binding transcriptional dual regulator CynR	cynR	b0338
yecF	b1915	1995818	1996042	DUF2594 domain-containing protein YecF	yecF	b1915
yeeE	b2013	2084467	2085525	inner membrane protein YeeE	yeeE // yeeD	b2013 // b2012
kduD	b2842	2982497	2983258	putative 2-keto-3-deoxy-D-gluconate dehydrogenase	kduD	b2842
yeaV	b1801	1883188	1884633	putative transporter YeaV	yeaW // yeaV	b1802 // b1801
rpoZ	b3649	3822106	3822381	RNA polymerase subunit &omega;	rpoZ // spoT // trmH // recG	b3649 // b3650 // b3651 // b3652
ycfH	b1100	1156777	1157574	putative metal-dependent hydrolase YcfH	ycfH // holB // tmk // mltG // pabC	b1100 // b1099 // b1098 // b1097 // b1096
yhfT	b3377	3506032	3507336	uncharacterized protein YhfT	yhfX // yhfW // php // yhfU // yhfT // yhfS	b3381 // b3380 // b3379 // b3378 // b3377 // b3376
yqeA	b2874	3011461	3012393	putative amino acid kinase YqeA	yqeA	b2874
phoR	b0400	417889	419184	sensor histidine kinase PhoR	phoB // phoR	b0399 // b0400
malT	b3418	3553085	3555790	DNA-binding transcriptional activator MalT	malT	b3418
yejM	b2188	2284376	2286136	LPS homeostasis protein YejM	yejM // yejL	b2188 // b2187
ybjJ	b0845	886131	887339	inner membrane protein YbjJ	ybjJ // ybjI	b0845 // b0844
yihR	b3879	4069475	4070401	putative sulfoquinovose mutarotase YihR	yihR	b3879
ydgC	b1607	1681695	1682030	GlpM family protein	ydgC	b1607
fecR	b4292	4516764	4517717	ferric citrate regulator FecR	fecR // fecI	b4292 // b4293
yjfC	b4186	4413028	4414191	putative acid&mdash;amine ligase YjfC	yjfC // yjfM // yjfL // yjfK	b4186 // b4185 // b4184 // b4183
gspJ	b3331	3462344	3462931	Type II secretion system protein GspJ	gspO // gspM // gspL // gspK // gspJ // gspI // gspH // gspG // gspF // gspE // gspD // gspC	b3335 // b3334 // b3333 // b3332 // b3331 // b3330 // b3329 // b3328 // b3327 // b3326 // b3325 // b3324
folX	b2303	2421325	2421687	dihydroneopterin triphosphate 2'-epimerase	yfcH // folX	b2304 // b2303
nhaA	b0019	17489	18655	Na<sup>+</sup>:H<sup>+</sup> antiporter NhaA	nhaR // nhaA	b0020 // b0019
bglG	b3723	3905731	3906567	transcriptional antiterminator BglG	bglB // bglF // bglG	b3721 // b3722 // b3723
ybfA	b0699	729134	729340	DUF2517 domain-containing protein YbfA	ybfA	b0699
ybbY	b0513	540565	541866	putative purine transporter	ybbY // allB // ybbW // glxR // hyi // gcl // glxK	b0513 // b0512 // b0511 // b0509 // b0508 // b0507 // b0514
ycjG	b1325	1388930	1389895	L-Ala-D/L-Glu epimerase	ycjG	b1325
ynaI	b1330	1394891	1395922	small conductance mechanosensitive channel YnaI	ynaI	b1330
hypT	b4327	4557378	4558289	DNA-binding transcriptional dual regulator HypT	hypT	b4327
bdcA	b4249	4473340	4474053	c-di-GMP-binding biofilm dispersal mediator protein	bdcA	b4249
marB	b1532	1619989	1620207	multiple antibiotic resistance protein MarB	marR // marA // marB	b1530 // b1531 // b1532
sgcE	b4301	4526905	4527537	KpLE2 phage-like element; putative epimerase SgcE	sgcX // sgcB // sgcC // sgcQ // sgcA // sgcE // sgcR	b4305 // b4565 // b4304 // b4303 // b4302 // b4301 // b4300
motA	b1890	1976252	1977139	motility protein A	cheW // cheA // motB // motA	b1887 // b1888 // b1889 // b1890
qseB	b3025	3169828	3170487	Phosphorylated DNA-binding transcriptional activator QseB // DNA-binding transcriptional activator QseB	qseC // qseB	b3026 // b3025
pdeA	b2395	2515643	2517832	putative c-di-GMP phosphodiesterase PdeA	pdeA	b2395
gspG	b3328	3461023	3461460	Type II secretion system protein GspG	gspO // gspM // gspL // gspK // gspJ // gspI // gspH // gspG // gspF // gspE // gspD // gspC	b3335 // b3334 // b3333 // b3332 // b3331 // b3330 // b3329 // b3328 // b3327 // b3326 // b3325 // b3324
citF	b0615	648039	649571	citrate lyase &alpha; subunit	citC // citD // citE // citF // citX // citG	b0618 // b0617 // b0616 // b0615 // b0614 // b0613
kgtP	b2587	2724448	2725746	&alpha;-ketoglutarate:H<sup>+</sup> symporter	kgtP	b2587
pyrR	b2381	2500383	2501117	phosphorylated DNA-binding transcriptional dual regulator PyrR // DNA-binding transcriptional activator PyrR	ypdC // pyrR // pyrS	b2382 // b2381 // b2380
aaeX	b3242	3389134	3389337	DUF1656 domain-containing protein AaeX	aaeX // aaeA // aaeB	b3242 // b3241 // b3240
yegH	b2063	2137902	2139485	inner membrane protein YegH	yegH	b2063
hdhA	b1619	1697273	1698040	7-&alpha;-hydroxysteroid dehydrogenase	hdhA	b1619
ybhI	b0770	801887	803320	putative tricarboxylate transporter	ybhI	b0770
ydfH	b1540	1628352	1629038	DNA-binding transcriptional repressor YdfH	ydfH	b1540
yghJ	b4466	3114550	3119112	putative lipoprotein YghJ	yghJ	b4466
ykgG	b0308	323758	324453	DUF162 domain-containing lactate utilization protein YkgG	ykgG // ykgF // ykgE	b0308 // b0307 // b0306
agp	b1002	1065585	1066826	glucose-1-phosphatase	agp	b1002
glpF	b3927	4117245	4118090	glycerol facilitator	glpX // glpK // glpF	b3925 // b3926 // b3927
bluR	b1162	1213328	1214059	DNA-binding transcriptional repressor BluR	bluR	b1162
yqeF	b2844	2984411	2985592	putative acyltransferase	yqeF	b2844
gspD	b3325	3456377	3458329	Type II secretion system protein GspD	gspO // gspM // gspL // gspK // gspJ // gspI // gspH // gspG // gspF // gspE // gspD // gspC	b3335 // b3334 // b3333 // b3332 // b3331 // b3330 // b3329 // b3328 // b3327 // b3326 // b3325 // b3324
gntK	b3437	3577065	3577592	D-gluconate kinase, thermostable	gntU // gntK // gntR	b4476 // b3437 // b3438
ppiD	b0441	461915	463786	periplasmic folding chaperone	ppiD	b0441
mhpR	b0346	367587	368420	DNA-binding transcriptional activator MhpR	lacI // mhpR	b0345 // b0346
csiE	b2535	2665435	2666715	stationary phase inducible protein CsiE	csiE	b2535
leuE	b1798	1880121	1880759	leucine exporter	leuE	b1798
ycjU	b1317	1380148	1380807	&beta;-phosphoglucomutase	ymjB // ycjV // ycjU // ycjT // ycjS // ycjR // ycjQ // ycjP // ycjO // ycjN // ycjM // ompG	b4524 // b1318 // b1317 // b1316 // b1315 // b1314 // b1313 // b1312 // b1311 // b1310 // b1309 // b1319
kefB	b3350	3478802	3480607	K+ : H+ antiporter KefB	kefG // kefB // yheV	b3351 // b3350 // b4551
torR	b0995	1057262	1057954	DNA-binding transcriptional dual regulator TorR	torR	b0995
yfbM	b2272	2386934	2387437	DUF1877 domain-containing protein YfbM	yfbM	b2272
gspM	b3334	3465082	3465543	Type II secretion system protein GspM	gspO // gspM // gspL // gspK // gspJ // gspI // gspH // gspG // gspF // gspE // gspD // gspC	b3335 // b3334 // b3333 // b3332 // b3331 // b3330 // b3329 // b3328 // b3327 // b3326 // b3325 // b3324
gloA	b1651	1727837	1728244	glyoxalase I	nemA // nemR // gloA	b1650 // b1649 // b1651
dld	b2133	2222185	2223900	quinone-dependent D-lactate dehydrogenase	dld	b2133
arsR	b3501	3648528	3648881	DNA-binding transcriptional repressor ArsR	arsR // arsB // arsC	b3501 // b3502 // b3503
yecN	b1869	1952266	1952661	MAPEG family inner membrane protein YecN	cmoB // cmoA // yecN	b1871 // b1870 // b1869
tqsA	b1601	1673913	1674947	autoinducer 2 exporter	tqsA	b1601
gloB	b0212	234027	234782	hydroxyacylglutathione hydrolase GloB	gloB	b0212
cyuP	b3110	3256679	3258010	cysteine detoxification protein CyuP	cyuP // cyuA	b3110 // b4470
mtlR	b3601	3775572	3776159	transcriptional repressor MtlR	mtlA // mtlD // mtlR	b3599 // b3600 // b3601
ydhY	b1674	1753851	1754477	putative 4Fe-4S ferredoxin-like protein YdhY	ydhY // ydhV // ydhW // ydhX // ydhU // ydhT	b1674 // b1673 // b1672 // b1671 // b1670 // b1669
yhgE	b3402	3530715	3532439	putative transport protein YhgE	yhgE	b3402
ydjG	b1771	1854991	1855971	NADH-dependent methylglyoxal reductase	ydjL // ydjK // ydjJ // ydjI // ydjH // ydjG	b1776 // b1775 // b1774 // b1773 // b1772 // b1771
yjhF	b4296	4520671	4522020	KpLE2 phage-like element; putative transporter YjhF	yjhF	b4296
atoC	b2220	2321866	2323251	phosphorylated DNA-binding transcriptional activator AtoC // DNA-binding transcriptional activator/ornithine decarboxylase inhibitor AtoC	atoC // atoS	b2220 // b2219
ydcK	b1428	1499469	1500449	putative enzyme YdcK	ydcK	b1428
yggR	b2950	3094100	3095080	Type II/IV secretion system family protein	yggR	b2950
gloC	b0927	983650	984297	hydroxyacylglutathione hydrolase GloC	gloC // mepK	b0927 // b0926
atpA	b3734	3918316	3919857	ATP synthase F<sub>1</sub> complex subunit &alpha;	atpI // atpC // atpD // atpG // atpA // atpH // atpF // atpE // atpB	b3739 // b3731 // b3732 // b3733 // b3734 // b3735 // b3736 // b3737 // b3738
uhpA	b3669	3850136	3850726	UhpA-Phosphorylated // DNA-binding transcriptional activator UhpA	ilvN // ilvB // ivbL // uhpC // uhpB // uhpA	b3670 // b3671 // b3672 // b3667 // b3668 // b3669
ymgD	b1171	1222305	1222634	PF16456 family protein YmgD	ymgG // ymgD	b1172 // b1171
ybjL	b0847	888134	889819	putative transport protein YbjL	ybjL	b0847
mgsA	b0963	1026557	1027015	methylglyoxal synthase	mgsA	b0963
gntT	b3415	3546559	3547875	high-affinity gluconate transporter	gntT	b3415
rpoD	b3067	3213047	3214888	RNA polymerase, sigma 70 (sigma D) factor	rpsU // dnaG // rpoD	b3065 // b3066 // b3067
ybjP	b0865	903952	904467	DUF3828 domain-containing lipoprotein YbjP	ybjP	b0865
gspK	b3332	3462924	3463907	Type II secretion system protein GspK	gspO // gspM // gspL // gspK // gspJ // gspI // gspH // gspG // gspF // gspE // gspD // gspC	b3335 // b3334 // b3333 // b3332 // b3331 // b3330 // b3329 // b3328 // b3327 // b3326 // b3325 // b3324
pgl	b0767	798586	799581	6-phosphogluconolactonase	pgl	b0767
pitA	b3493	3637642	3639141	metal phosphate:H<sup>+</sup> symporter PitA	pitA	b3493
phnF	b4102	4321697	4322422	putative transcriptional regulator PhnF	phnK // phnJ // phnI // phnH // phnG // phnF // phnE // phnD // phnC // phnP // phnO // phnN // phnM // phnL	b4097 // b4098 // b4099 // b4100 // b4101 // b4102 // b4583 // b4105 // b4106 // b4092 // b4093 // b4094 // b4095 // b4096
yahE	b0319	335925	336788	DUF2877 domain-containing protein YahE	yahG // yahF // yahE // yahD	b0321 // b0320 // b0319 // b0318
emrK	b2368	2482176	2483339	tripartite efflux pump membrane fusion protein EmrK	emrY // emrK	b2367 // b2368
edd	b1851	1932793	1934604	phosphogluconate dehydratase	edd // eda	b1851 // b1850
rhtA	b0813	849210	850097	L-threonine/L-homoserine exporter	rhtA	b0813
greA	b3181	3328239	3328715	transcription elongation factor GreA	greA	b3181
ynaL	b4743	1409308	1409481	protein YnaL		
gspH	b3329	3461468	3461977	Type II secretion system protein GspH	gspO // gspM // gspL // gspK // gspJ // gspI // gspH // gspG // gspF // gspE // gspD // gspC	b3335 // b3334 // b3333 // b3332 // b3331 // b3330 // b3329 // b3328 // b3327 // b3326 // b3325 // b3324
ndh	b1109	1166085	1167389	NADH:quinone oxidoreductase II	ndh	b1109
ccmB	b2200	2296362	2297024	cytochrome <i>c</i> maturation protein B	ccmH // ccmG // ccmF // ccmE // ccmD // ccmC // ccmB // ccmA // napC // napB // napH // napG // napA // napD // napF	b2194 // b2195 // b2196 // b2197 // b2198 // b2199 // b2200 // b2201 // b2202 // b2203 // b2204 // b2205 // b2206 // b2207 // b2208
envY	b0566	586147	586908	DNA-binding transcriptional activator EnvY	envY // ompT	b0566 // b0565
yhgO	b4788	3573660	3573701	protein YhgO		
ybaT	b0486	512576	513868	putative transporter YbaT	ybaT // glsA	b0486 // b0485
ubiG	b2232	2339567	2340289	bifunctional 3-demethylubiquinone-<i>8</i> 3-<i>O</i>-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxyphenol methylase	ubiG	b2232
alsC	b4086	4308489	4309469	D-allose ABC transporter membrane subunit	alsE // alsC // alsA // alsB // alsR	b4085 // b4086 // b4087 // b4088 // b4089
ascG	b2714	2838254	2839264	DNA-binding transcriptional repressor AscG	ascG	b2714
ychT	b4771	1298514	1298567	protein YchT		
rarD	b3819	4003288	4004178	putative transporter RarD	rarD	b3819
ubiB	b3835	4020226	4021866	ubiquinone biosynthesis protein UbiB	ubiB // ubiJ // ubiE	b3835 // b3834 // b3833
fdoH	b3893	4081857	4082759	formate dehydrogenase O subunit &beta;	fdhE // fdoI // fdoH // fdoG	b3891 // b3892 // b3893 // b3894
idnR	b4264	4490141	4491139	DNA-binding transcriptional dual regulator IdnR	idnR // idnT // idnO // idnD	b4264 // b4265 // b4266 // b4267
yddY	b4746	1567178	1567219	protein YddY		
gspE	b3326	3458339	3459820	Type II secretion system protein GspE	gspO // gspM // gspL // gspK // gspJ // gspI // gspH // gspG // gspF // gspE // gspD // gspC	b3335 // b3334 // b3333 // b3332 // b3331 // b3330 // b3329 // b3328 // b3327 // b3326 // b3325 // b3324
ubiH	b2907	3052340	3053518	2-octaprenyl-6-methoxyphenol 4-hydroxylase	ygfB // pepP // ubiH // ubiI	b2909 // b2908 // b2907 // b2906
hsrA	b3754	3939185	3940612	putative transporter HsrA	yieP // hsrA	b3755 // b3754
yghO	b2981	3129043	3130215	putative DNA-binding transcriptional regulator YghO	yghO	b2981
ykiD	b4732	408947	409030	protein YkiD		
glpD	b3426	3562013	3563518	aerobic glycerol 3-phosphate dehydrogenase	glpD	b3426
uidB	b1616	1692890	1694263	glucuronide:H<sup>+</sup> symporter	uidC // uidB // uidA	b1615 // b1616 // b1617
yeeY	b2015	2087329	2088258	putative DNA-binding transcriptional regulator YeeY	yeeY	b2015
yjeV	b4670	4392892	4392945	uncharacterized protein YjeV	yjeV	b4670
ybiO	b0808	843255	845480	moderate conductance mechanosensitive channel YbiO	ybiO	b0808
ubiX	b2311	2428057	2428626	flavin prenyltransferase	ubiX // purF // cvpA	b2311 // b2312 // b2313
kch	b1250	1309016	1310269	K<sup>+</sup> channel Kch	kch	b1250
ydeO	b1499	1582926	1583687	DNA-binding transcriptional dual regulator YdeO	safA // ydeO	b1500 // b1499
yahH	b0322	339769	340089	putative uncharacterized protein YahH	yahH	b0322
nanC	b4311	4538785	4539501	<i>N</i>-acetylneuraminic acid outer membrane channel	nanM // nanC // nanS	b4310 // b4311 // b4309
adhP	b1478	1552828	1553838	ethanol dehydrogenase / alcohol dehydrogenase	adhP	b1478
narQ	b2469	2585731	2587431	sensory histidine kinase NarQ  - phosphorylated // sensory histidine kinase NarQ	narQ	b2469
mntR	b0817	853183	853650	DNA-binding transcriptional dual regulator MntR	ybiR // mntR	b0818 // b0817
hcxA	b0599	632389	633477	hydroxycarboxylate dehydrogenase A	hcxA	b0599
csgG	b1037	1100851	1101684	curli secretion channel	csgG // csgF // csgE // csgD	b1037 // b1038 // b1039 // b1040
nuoC	b2286	2402055	2403845	NADH:quinone oxidoreductase subunit CD	nuoL // nuoK // nuoJ // nuoI // nuoH // nuoG // nuoF // nuoE // nuoC // nuoB // nuoA // nuoN // nuoM	b2278 // b2279 // b2280 // b2281 // b2282 // b2283 // b2284 // b2285 // b2286 // b2287 // b2288 // b2276 // b2277
gspO	b3335	3465543	3466220	Type II secretion system prepilin peptidase	gspO // gspM // gspL // gspK // gspJ // gspI // gspH // gspG // gspF // gspE // gspD // gspC	b3335 // b3334 // b3333 // b3332 // b3331 // b3330 // b3329 // b3328 // b3327 // b3326 // b3325 // b3324
rclR	b0305	320227	321081	DNA-binding transcriptional activator RclR	rclR	b0305
ysaA	b3573	3741109	3741582	putative electron transport protein YsaA	ysaA	b3573
nirD	b3366	3496551	3496877	nitrite reductase subunit NirD	nirB // nirD // nirC // cysG	b3365 // b3366 // b3367 // b3368
fdnI	b1476	1551338	1551991	formate dehydrogenase N subunit &gamma;	fdnG // fdnH // fdnI	b1474 // b1475 // b1476
glaR	b2664	2795674	2796336	DNA-binding transcriptional repressor GlaR	glaR	b2664
yeiI	b2160	2251700	2252788	putative sugar kinase YeiI	yeiI	b2160
hypA	b2726	2850647	2850997	hydrogenase 3 nickel incorporation protein HypA	hypA // fhlA // hypE // hypD // hypC // hypB	b2726 // b2731 // b2730 // b2729 // b2728 // b2727
yghQ	b2983	3131341	3132408	putative transport protein YghQ	yghQ	b2983
eutR	b2437	2554130	2555182	putative AraC-type transcriptional regulator EutR	eutB // eutC // eutL // eutK // eutR	b2441 // b2440 // b2439 // b2438 // b2437
yibI	b3598	3771382	3771744	DUF3302 domain-containing protein YibI	yibI // yibH	b3598 // b3597
cbrA	b3690	3869377	3870441	colicin M resistance protein	cbrA	b3690
nikE	b3480	3617776	3618582	Ni(2+) ABC transporter ATP binding subunit NikE	nikR // nikA // nikB // nikC // nikD // nikE	b3481 // b3476 // b3477 // b3478 // b3479 // b3480
uhpT	b3666	3845776	3847167	hexose-6-phosphate:phosphate antiporter	uhpT	b3666
yijO	b3954	4147466	4148317	putative DNA-binding transcriptional regulator YijO	yijO	b3954
yigZ	b3848	4032492	4033106	IMPACT family member YigZ	hemG // trkH // yigZ // pepQ	b3850 // b3849 // b3848 // b3847
cirA	b2155	2244778	2246769	iron-catecholate outer membrane transporter CirA	cirA	b2155
pflD	b3951	4143995	4146292	putative formate acetyltransferase 2	pflD // pflC	b3951 // b3952
focB	b2492	2613934	2614782	formate channel FocB	focB // hyfR // hyfJ // hyfI // hyfH // hyfG // hyfF // hyfE // hyfD // hyfC // hyfB // hyfA	b2492 // b2491 // b2490 // b2489 // b2488 // b2487 // b2486 // b2485 // b2484 // b2483 // b2482 // b2481
basR	b4113	4333282	4333950	Phosphorylated DNA-binding transcriptional dual regulator BasR // DNA-binding transcriptional dual regulator BasR	basS // basR	b4112 // b4113
yjfJ	b4182	4410553	4411251	PspA family protein YjfJ	yjfJ // yjfI // rlmB // rnr // nsrR	b4182 // b4181 // b4180 // b4179 // b4178
cbrC	b3717	3898022	3898609	UPF0167 family colicin E2 tolerance protein CbrC	cbrB // cbrC	b3716 // b3717
narY	b1467	1537309	1538853	nitrate reductase Z subunit &beta;	narY // narZ // narV // narW	b1467 // b1468 // b1465 // b1466
tar	b1886	1971030	1972691	methyl-accepting chemotaxis protein Tar	cheZ // cheY // cheB // cheR // tap // tar	b1881 // b1882 // b1883 // b1884 // b1885 // b1886
melR	b4118	4340720	4341628	DNA-binding transcriptional dual regulator MelR	melR	b4118
yacC	b0122	136570	136917	putative lipoprotein YacC	yacC // speE // speD	b0122 // b0121 // b0120
fepA	b0584	610254	612494	ferric enterobactin outer membrane transporter	entD // fepA	b0583 // b0584
menF	b2265	2379348	2380643	isochorismate synthase MenF	menF // menE // menC // menB // menH // menD	b2265 // b2260 // b2261 // b2262 // b2263 // b2264
yegT	b2098	2178821	2180098	putative transporter YegT	yegV // yegU // yegT	b2100 // b2099 // b2098
rpoA	b3295	3440040	3441029	RNA polymerase subunit &alpha;	rplQ // rpoA // rpsD // rpsK // rpsM	b3294 // b3295 // b3296 // b3297 // b3298
yhcC	b3211	3353121	3354050	radical SAM family oxidoreductase YhcC	yhcC	b3211
yfjQ	b2633	2768665	2769486	CP4-57 prophage; DUF932 domain-containing protein YfjQ	yfjQ // yfjP	b2633 // b2632
napA	b2206	2300267	2302753	periplasmic nitrate reductase subunit NapA	ccmH // ccmG // ccmF // ccmE // ccmD // ccmC // ccmB // ccmA // napC // napB // napH // napG // napA // napD // napF	b2194 // b2195 // b2196 // b2197 // b2198 // b2199 // b2200 // b2201 // b2202 // b2203 // b2204 // b2205 // b2206 // b2207 // b2208
pstC	b3727	3909439	3910398	phosphate ABC transporter membrane subunit PstC	pstS // pstA // pstC // phoU // pstB	b3728 // b3726 // b3727 // b3724 // b3725
ompR	b3405	3535865	3536584	OmpR-Phosphorylated // DNA-binding transcriptional dual regulator OmpR	envZ // ompR	b3404 // b3405
yghE	b2969	3111128	3111988	putative type II secretion system L-type protein YghE	yghE // yghD	b2969 // b2968
yffM	b2444	2561368	2561613	CPZ-55 prophage; uncharacterized protein YffM	yffN // yffM	b2445 // b2444
fdoG	b3894	4082772	4085822	formate dehydrogenase O subunit &alpha;	fdhE // fdoI // fdoH // fdoG	b3891 // b3892 // b3893 // b3894
ydjK	b1775	1858850	1860229	putative transporter YdjK	ydjL // ydjK // ydjJ // ydjI // ydjH // ydjG	b1776 // b1775 // b1774 // b1773 // b1772 // b1771
lacI	b0345	366428	367510	DNA-binding transcriptional repressor LacI	lacI // mhpR	b0345 // b0346
ygdI	b2809	2942918	2943145	DUF903 domain-containing lipoprotein YgdI	ygdI	b2809
ogrK	b2082	2167302	2167520	prophage P2 late control protein OgrK	ogrK	b2082
menC	b2261	2375000	2375962	o-succinylbenzoate synthase	menH // menD // menF // menE // menC // menB	b2263 // b2264 // b2265 // b2260 // b2261 // b2262
phnM	b4095	4316082	4317218	RPnTP hydrolase	phnP // phnO // phnN // phnM // phnL // phnK // phnJ // phnI // phnH // phnG // phnF // phnE // phnD // phnC	b4092 // b4093 // b4094 // b4095 // b4096 // b4097 // b4098 // b4099 // b4100 // b4101 // b4102 // b4583 // b4105 // b4106
galS	b2151	2240628	2241668	DNA-binding transcriptional dual regulator GalS	galS	b2151
yfgG	b2504	2629290	2629481	nickel/cobalt stress response protein YfgG	yfgG	b2504
essQ	b1556	1640370	1640585	Qin prophage; putative prophage lysis protein EssQ	essQ // ydfR // rrrQ // rzpQ	b1556 // b1555 // b1554 // b1553
hyaA	b0972	1032139	1033257	hydrogenase 1 small subunit	hyaA // hyaB // hyaC // hyaD // hyaE // hyaF	b0972 // b0973 // b0974 // b0975 // b0976 // b0977
mdtI	b1599	1672820	1673149	multidrug/spermidine efflux pump membrane subunit MdtI	mdtJ // mdtI	b1600 // b1599
araC	b0064	70387	71265	DNA-binding transcriptional dual regulator AraC	araC	b0064
yfaQ	b2226	2328148	2329797	tandem DUF2300 domain-containing protein YfaQ	yfaA // yfaT // yfaS // yfaQ // yfaP	b2230 // b2229 // b4500 // b2226 // b2225
beeE	b1151	1205731	1206204	e14 prophage; protein BeeE	tfaP // ycfK // ymfQ // jayE // beeE // ymfR // ymfN // ymfM // ymfL // ymfT	b1155 // b1154 // b1153 // b1152 // b1151 // b1150 // b1149 // b1148 // b1147 // b1146
hyfG	b2487	2608487	2610154	hydrogenase 4 catalytic subunit HyfG	focB // hyfR // hyfJ // hyfI // hyfH // hyfG // hyfF // hyfE // hyfD // hyfC // hyfB // hyfA	b2492 // b2491 // b2490 // b2489 // b2488 // b2487 // b2486 // b2485 // b2484 // b2483 // b2482 // b2481
narK	b1223	1277957	1279348	nitrate:nitrite antiporter NarK	narK	b1223
ulaR	b4191	4417698	4418453	DNA-binding transcriptional repressor UlaR	ulaR	b4191
yeaY	b1806	1889951	1890532	Slp family lipoprotein YeaY	tsaB // yeaY	b1807 // b1806
ybcW	b0559	579880	580086	DLP12 prophage; uncharacterized protein YbcW	ybcW	b0559
napB	b2203	2298269	2298718	periplasmic nitrate reductase cytochrome c<SUB>550</SUB> protein	ccmH // ccmG // ccmF // ccmE // ccmD // ccmC // ccmB // ccmA // napC // napB // napH // napG // napA // napD // napF	b2194 // b2195 // b2196 // b2197 // b2198 // b2199 // b2200 // b2201 // b2202 // b2203 // b2204 // b2205 // b2206 // b2207 // b2208
puuP	b1296	1357802	1359187	putrescine:H+ symporter PuuP	puuA // ymjE // puuP	b1297 // b4742 // b1296
ygeV	b2869	3004008	3005786	putative &sigma;<sup>54</sup>-dependent transcriptional regulator YgeV	ygeV	b2869
ydhU	b1670	1749563	1750348	putative cytochrome YdhU	ydhY // ydhV // ydhW // ydhX // ydhU // ydhT	b1674 // b1673 // b1672 // b1671 // b1670 // b1669
yagN	b0280	295139	295579	CP4-6 prophage; protein YagN	yagN	b0280
nuoI	b2281	2395908	2396450	NADH:quinone oxidoreductase subunit I	nuoL // nuoK // nuoJ // nuoI // nuoH // nuoG // nuoF // nuoE // nuoC // nuoB // nuoA // nuoN // nuoM	b2278 // b2279 // b2280 // b2281 // b2282 // b2283 // b2284 // b2285 // b2286 // b2287 // b2288 // b2276 // b2277
mglC	b2148	2236743	2237753	D-galactose/methyl-galactoside ABC transporter membrane subunit	mglB // mglC // mglA	b2150 // b2148 // b2149
hprR	b1969	2038152	2038823	phosphorylated DNA-binding transcriptional dual regulator HprR // DNA-binding transcriptional dual regulator HprR	hprR // hprS	b1969 // b1968
ykfA	b0253	268097	268960	CP4-6 prophage; putative GTP-binding protein YkfA	ykfA // yafZ	b0253 // b0252
menD	b2264	2377589	2379259	2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate synthase	menH // menD // menF // menE // menC // menB	b2263 // b2264 // b2265 // b2260 // b2261 // b2262
ssuC	b0934	994041	994832	aliphatic sulfonate ABC transporter membrane subunit	ssuB // ssuC // ssuD // ssuA // ssuE	b0933 // b0934 // b0935 // b0936 // b0937
ydcI	b1422	1494148	1495071	DNA-binding transcriptional dual regulator YdcI	ydcI	b1422
intE	b1140	1199679	1200806	e14 prophage; putative integrase	ymfH // xisE // intE	b1142 // b1141 // b1140
torZ	b1872	1954578	1957007	trimethylamine <i>N</i>-oxide reductase 2	torZ // torY	b1872 // b1873
kdpC	b0696	724407	724979	K<sup>+</sup> transporting P-type ATPase subunit KdpC	kdpF // kdpC // kdpB // kdpA	b4513 // b0696 // b0697 // b0698
dpiA	b0620	653862	654542	P<sup>asp</sup> DNA-binding transcriptional dual regulator DpiA // DNA-binding transcriptional dual regulator DpiA	dpiA // dpiB	b0620 // b0619
insO	b4623			KpLE2 phage-like element; IS911B regulator fragment	insO	b4623
rpoN	b3202	3344717	3346150	RNA polymerase, sigma 54 (sigma N) factor	kdsD // yrbG // lptC // kdsC // lptB // lptA // rpoN // hpf // ptsN // rapZ // npr	b3197 // b3196 // b3199 // b3198 // b3201 // b3200 // b3202 // b3203 // b3204 // b3205 // b3206
nuoE	b2285	2401552	2402052	NADH:quinone oxidoreductase subunit E	nuoL // nuoK // nuoJ // nuoI // nuoH // nuoG // nuoF // nuoE // nuoC // nuoB // nuoA // nuoN // nuoM	b2278 // b2279 // b2280 // b2281 // b2282 // b2283 // b2284 // b2285 // b2286 // b2287 // b2288 // b2276 // b2277
dtpD	b0709	741075	742556	dipeptide:H<sup>+</sup> symporter DtpD	dtpD	b0709
rof	b0189	213678	213932	modulator of Rho-dependent transcription termination	yaeP // rof	b4406 // b0189
arpB	b4494	1803094	1804993	putative ankyrin repeat protein B, N-terminal fragment	arpB	b4494
hflK	b4174	4402038	4403297	regulator of FtsH protease	amiB // tsaE // nnr // mutL // miaA // hflC // hflK // hflX // hfq	b4169 // b4168 // b4167 // b4170 // b4171 // b4175 // b4174 // b4173 // b4172
hyfA	b2481	2601201	2601818	hydrogenase 4 component A	focB // hyfR // hyfJ // hyfI // hyfH // hyfG // hyfF // hyfE // hyfD // hyfC // hyfB // hyfA	b2492 // b2491 // b2490 // b2489 // b2488 // b2487 // b2486 // b2485 // b2484 // b2483 // b2482 // b2481
glpA	b2241	2352647	2354275	anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A	glpA // glpB // glpC	b2241 // b2242 // b2243
rseA	b2572	2708754	2709404	anti-sigma-E factor RseA	rseD // rseC // rseB // rseA // rpoE	b4725 // b2570 // b2571 // b2572 // b2573
gatC	b2092	2172921	2174278	galactitol-specific PTS enzyme IIC component	gatD // gatC // gatB // gatA // gatZ // gatY	b2091 // b2092 // b2093 // b2094 // b2095 // b2096
yjhG	b4297	4522127	4524094	KpLE2 phage-like element; D-xylonate dehydratase	yjhI // yjhH // yjhG	b4299 // b4298 // b4297
nuoF	b2284	2400218	2401555	NADH:quinone oxidoreductase subunit F	nuoL // nuoK // nuoJ // nuoI // nuoH // nuoG // nuoF // nuoE // nuoC // nuoB // nuoA // nuoN // nuoM	b2278 // b2279 // b2280 // b2281 // b2282 // b2283 // b2284 // b2285 // b2286 // b2287 // b2288 // b2276 // b2277
tauC	b0367	386971	387798	taurine ABC transporter membrane subunit	tauD // tauC // tauB // tauA	b0368 // b0367 // b0366 // b0365
ydhB	b1659	1738866	1739798	putative LysR family DNA-binding transcriptional regulator YdhB	ydhB	b1659
yqiG	b3046			putative outer membrane usher protein YqiG	yqiI // yqiH // yqiG // insD5 // insC5 // insCD5	b3048 // b3047 // b3046 // b3045 // b3044
rnlA	b2630	2765918	2766991	CP4-57 prophage; RNase LS, toxin of the RnlAB toxin-antitoxin system	rnlB // rnlA	b2631 // b2630
narZ	b1468	1538850	1542590	nitrate reductase Z subunit &alpha;	narY // narZ // narV // narW	b1467 // b1468 // b1465 // b1466
fecC	b4289	4512411	4513409	ferric citrate ABC transporter membrane subunit FecC	fecE // fecD // fecC // fecB // fecA	b4287 // b4288 // b4289 // b4290 // b4291
yiiE	b3889	4079291	4079509	putative DNA-binding transcriptional regulator YiiE	yiiE	b3889
ycgH	b4491	1219601	1222248	putative transporter component, N-terminal fragment	ycgH	b4491
yfdT	b2363	2475873	2476178	CPS-53 (KpLE1) prophage; protein YfdT	yfdT // yfdS // yfdR	b2363 // b2362 // b2361
hybO	b2997	3145143	3146261	hydrogenase 2 small subunit	hybO // hybG // hybF // hybE // hybD // hybC // hybB // hybA	b2997 // b2990 // b2991 // b2992 // b2993 // b2994 // b2995 // b2996
emrY	b2367	2480638	2482176	tripartite efflux pump membrane subunit EmrY	emrY // emrK	b2367 // b2368
greB	b3406	3536812	3537288	transcription elongation factor GreB	greB	b3406
yhiL	b4660	3632852	3634458	DUF4049 domain-containing protein YhiL	yhiL	b4660
cbeA	b2004	2077112	2077480	CP4-44 prophage; cytoskeleton bundling-enhancing antitoxin CbeA	yeeW // cbtA // cbeA // yeeT // yeeS // yeeR	b2006 // b2005 // b2004 // b2003 // b2002 // b2001
menE	b2260	2373648	2375003	<i>o</i>-succinylbenzoate&mdash;CoA ligase	menH // menD // menF // menE // menC // menB	b2263 // b2264 // b2265 // b2260 // b2261 // b2262
cysU	b2424	2541679	2542512	sulfate/thiosulfate ABC transporter inner membrane subunit CysU	cysM // cysA // cysW // cysU // cysP	b2421 // b2422 // b2423 // b2424 // b2425
gcvR	b2479	2599906	2600478	putative transcriptional regulator GcvR	gcvR	b2479
ygeL	b2856	2994937	2995092	protein YgeL	ygeL // ygeK	b2856 // b2855
rzpQ	b1553	1639030	1639527	Qin prophage; DUF2514 domain-containing protein RzpQ	essQ // ydfR // rrrQ // rzpQ	b1556 // b1555 // b1554 // b1553
napF	b2208	2303003	2303497	ferredoxin-type protein	ccmH // ccmG // ccmF // ccmE // ccmD // ccmC // ccmB // ccmA // napC // napB // napH // napG // napA // napD // napF	b2194 // b2195 // b2196 // b2197 // b2198 // b2199 // b2200 // b2201 // b2202 // b2203 // b2204 // b2205 // b2206 // b2207 // b2208
ygjI	b3078	3226234	3227667	putative transporter YgjI	ygjI	b3078
tdcA	b3118	3266127	3267065	DNA-binding transcriptional activator TdcA	tdcA // tdcG // tdcF // tdcE // tdcD // tdcC // tdcB	b3118 // b4471 // b3113 // b3114 // b3115 // b3116 // b3117
renD	b0542			DLP12 prophage; protein RenD		
ynaK	b1365	1425377	1425640	Rac prophage; ParB-like nuclease domain-containing protein YnaK	ydaY // ynaK	b1366 // b1365
fdhD	b3895	4086016	4086849	sulfurtransferase for molybdenum cofactor sulfuration	fdhD	b3895
cadB	b4132	4358697	4360031	lysine:cadaverine antiporter	cadB // cadA	b4132 // b4131
rhaR	b3906	4098646	4099494	DNA-binding transcriptional activator RhaR	rhaS // rhaR	b3905 // b3906
wbbL	b4571			interrupted rhamnosyltransferase WbbL		
ymfM	b1148	1203822	1204160	e14 prophage; uncharacterized protein YmfM	tfaP // ycfK // ymfQ // jayE // beeE // ymfR // ymfN // ymfM // ymfL // ymfT	b1155 // b1154 // b1153 // b1152 // b1151 // b1150 // b1149 // b1148 // b1147 // b1146
hyaB	b0973	1033254	1035047	hydrogenase 1 large subunit	hyaA // hyaB // hyaC // hyaD // hyaE // hyaF	b0972 // b0973 // b0974 // b0975 // b0976 // b0977
mgtA	b4242	4467625	4470321	Mg<sup>2+</sup> importing P-type ATPase	mgtL // mgtA	b4702 // b4242
nusA	b3169	3316039	3317526	transcription termination/antitermination protein NusA	pnp // rpsO // truB // rbfA // nusA // rimP // metY // infB	b3164 // b3165 // b3166 // b3167 // b3169 // b3170 // b3171 // b3168
ygaQ	b4462	2786397	2788649	putative uncharacterized protein YgaQ	ygaQ	b4462
rzpD	b0556	578107	578568	DLP12 prophage; putative prophage endopeptidase RzpD	rzpD // rrrD // essD	b0556 // b0555 // b0554
hyfH	b2488	2610164	2610709	hydrogenase 4 component H	focB // hyfR // hyfJ // hyfI // hyfH // hyfG // hyfF // hyfE // hyfD // hyfC // hyfB // hyfA	b2492 // b2491 // b2490 // b2489 // b2488 // b2487 // b2486 // b2485 // b2484 // b2483 // b2482 // b2481
arcB	b3210	3350689	3353025	ArcB-<i>N</i>-phospho-L-histidine-292 // ArcB-phospho-L-aspartate-576 // ArcB-<i>N</i>-phospho-L-histidine-717 // sensor histidine kinase ArcB	arcB	b3210
iclR	b4018	4222804	4223628	DNA-binding transcriptional repressor IclR	iclR	b4018
insN	b4587			CP4-6 prophage; IS911A regulator fragment	insI1 // insN	b0256 // b4587
yagK	b0277	292322	292948	CP4-6 prophage; uncharacterized protein YagK	yagK	b0277
napH	b2204	2298715	2299578	ferredoxin-type protein NapH	ccmH // ccmG // ccmF // ccmE // ccmD // ccmC // ccmB // ccmA // napC // napB // napH // napG // napA // napD // napF	b2194 // b2195 // b2196 // b2197 // b2198 // b2199 // b2200 // b2201 // b2202 // b2203 // b2204 // b2205 // b2206 // b2207 // b2208
cusA	b0575	598714	601857	copper/silver export system RND permease	cusA // cusB // cusF // cusC	b0575 // b0574 // b0573 // b0572
fucR	b2805	2939368	2940099	DNA-binding transcriptional activator FucR	fucP // fucI // fucK // fucU // fucR	b2801 // b2802 // b2803 // b2804 // b2805
crl	b0240			RNA polymerase holoenzyme assembly factor Crl		
ykfF	b0249	265304	265543	CP4-6 prophage; protein YkfF	yafY // ykfI // yafW // ykfH // ykfG // yafX // ykfF // ykfB	b0251 // b0245 // b0246 // b4504 // b0247 // b0248 // b0249 // b0250
ubiE	b3833	4018855	4019610	bifunctional 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol methylase and demethylmenaquinone methyltransferase	ubiB // ubiJ // ubiE	b3835 // b3834 // b3833
yhhQ	b3471	3609217	3609882	queuosine precursor transporter	yhhQ	b3471
cysB	b1275	1333855	1334829	DNA-binding transcriptional dual regulator CysB	cysB	b1275
yehH	b4499	2197410	2200269		yehH // yehI	b4499 // b2118
yagB	b0266	280385	280735	CP4-6 prophage; orphan antitoxin YagB	yagA // yagB // insX	b0267 // b0266 // b4505
lldD	b3605	3779827	3781017	L-lactate dehydrogenase	lldD // lldR // lldP	b3605 // b3604 // b3603
treB	b4240	4464759	4466180	trehalose-specific PTS enzyme IIBC component	treC // treB	b4239 // b4240
cpxR	b3912	4104972	4105670	Phosphorylated DNA-binding transcriptional dual regulator CpxR // DNA-binding transcriptional dual regulator CpxR	cpxA // cpxR	b3911 // b3912
yoeA	b4582			CP4-44 prophage; TonB-dependent receptor plug domain-containing protein YoeA	yoeA	b4582
ydfD	b1576	1649794	1649985	Qin prophage; lysis protein	intQ // insD7 // ydfE // ydfD // dicB	b1579 // b1578 // b1577 // b1576 // b1575
narG	b1224	1279864	1283607	nitrate reductase A subunit &alpha;	narG // narH // narJ // narI	b1224 // b1225 // b1226 // b1227
ccmG	b2195	2292407	2292964	thiol:disulfide oxidoreductase CcmG	ccmH // ccmG // ccmF // ccmE // ccmD // ccmC // ccmB // ccmA // napC // napB // napH // napG // napA // napD // napF	b2194 // b2195 // b2196 // b2197 // b2198 // b2199 // b2200 // b2201 // b2202 // b2203 // b2204 // b2205 // b2206 // b2207 // b2208
dgoR	b4479	3874471	3875160	DNA-binding transcriptional regulator DgoR	dgoR // dgoK // dgoA // dgoD // dgoT	b4479 // b3693 // b4477 // b4478 // b3691
yncK	b4578	1503218	1503649		yncK	b4578
pspD	b1307	1369393	1369614	phage shock protein D	pspA // pspB // pspC // pspD // pspE	b1304 // b1305 // b1306 // b1307 // b1308
torY	b1873	1957032	1958132	cytochrome <i>c</i> quinol dehydrogenase TorY	torZ // torY	b1872 // b1873
nrfC	b4072	4289808	4290479	putative menaquinol-cytochrome <i>c</i> reductase 4Fe-4S subunit	nrfA // nrfB // nrfC // nrfD // nrfE // nrfF // nrfG	b4070 // b4071 // b4072 // b4073 // b4074 // b4075 // b4076
nimR	b1790	1874755	1875576	DNA-binding transcriptional repressor NimR	nimR	b1790
yjhV	b4286	4509804	4510133	KpLE2 phage-like element; putative uncharacterized protein YjhV	yjhV	b4286
fhuA	b0150	167484	169727	ferrichrome outer membrane transporter/phage receptor	fhuA // fhuC // fhuD // fhuB	b0150 // b0151 // b0152 // b0153
nuoG	b2283	2397439	2400165	NADH:quinone oxidoreductase subunit G	nuoL // nuoK // nuoJ // nuoI // nuoH // nuoG // nuoF // nuoE // nuoC // nuoB // nuoA // nuoN // nuoM	b2278 // b2279 // b2280 // b2281 // b2282 // b2283 // b2284 // b2285 // b2286 // b2287 // b2288 // b2276 // b2277
yihO	b3876	4064363	4065766	putative sulfoquinovose transporter	yihP // yihO	b3877 // b3876
dgcM	b1341	1406563	1407795	diguanylate cyclase DgcM	dgcM	b1341
yedN	b4495	2011223	2012351	putative type III secreted effector, N-terminal fragment	yedN	b4495
abpB	b2627	2761351	2763540	CP4-57 prophage; putative helicase YfjK	abpA // abpB	b2628 // b2627
hybC	b2994	3141286	3142989	hydrogenase 2 large subunit	hybO // hybG // hybF // hybE // hybD // hybC // hybB // hybA	b2997 // b2990 // b2991 // b2992 // b2993 // b2994 // b2995 // b2996
acrB	b0462	481254	484403	multidrug efflux pump RND permease AcrB	acrA // acrB	b0463 // b0462
allR	b0506	533011	533826	DNA-binding transcriptional repressor AllR	allR	b0506
cybC	b4236	4459488	4459855		cybC	b4236
yfdQ	b2360	2474032	2474856	CPS-53 (KpLE1) prophage; DUF2303 domain-containing protein YfdQ	yfdQ // yfdP	b2360 // b2359
fdnG	b1474	1547401	1550448	formate dehydrogenase N subunit &alpha;	fdnG // fdnH // fdnI	b1474 // b1475 // b1476
ydeA	b1528	1617028	1618218	L-arabinose exporter	ydeA	b1528
xylR	b3569	3734979	3736157	DNA-binding transcriptional dual regulator XylR	xylF // xylG // xylH // xylR	b3566 // b3567 // b3568 // b3569
yhcE	b4569			putative uncharacterized protein YhcE	yhcE // yhcD // yhcA	b4569 // b3216 // b3215
yeeR	b2001	2074779	2076311	CP4-44 prophage; inner membrane protein YeeR	yeeW // cbtA // cbeA // yeeT // yeeS // yeeR	b2006 // b2005 // b2004 // b2003 // b2002 // b2001
nuoB	b2287	2403951	2404613	NADH:quinone oxidoreductase subunit B	nuoL // nuoK // nuoJ // nuoI // nuoH // nuoG // nuoF // nuoE // nuoC // nuoB // nuoA // nuoN // nuoM	b2278 // b2279 // b2280 // b2281 // b2282 // b2283 // b2284 // b2285 // b2286 // b2287 // b2288 // b2276 // b2277
caiT	b0040	40417	41931	L-carnitine:&gamma;-butyrobetaine antiporter	caiB // caiA // caiT // caiE // caiD // caiC	b0038 // b0039 // b0040 // b0035 // b0036 // b0037
rutR	b1013	1074242	1074880	DNA-binding transcriptional dual regulator RutR	rutR	b1013
lomR	b4570			Rac prophage; protein LomR_1	lomR // ynaA	b4570 // b1368
gnsB	b1550	1637609	1637782	Qin prophage; protein GnsB	gnsB	b1550
nrfB	b4071	4289245	4289811	periplasmic nitrite reductase penta-heme <i>c</i>-type cytochrome	nrfA // nrfB // nrfC // nrfD // nrfE // nrfF // nrfG	b4070 // b4071 // b4072 // b4073 // b4074 // b4075 // b4076
emrB	b2686	2812616	2814154	multidrug efflux pump membrane subunit EmrB	mprA // emrA // emrB	b2684 // b2685 // b2686
gcvA	b2808	2941650	2942567	DNA-binding transcriptional dual regulator GcvA	gcvA	b2808
yhiS	b3504			putative uncharacterized protein YhiS	yhiS	b3504
ydaU	b1359	1421119	1421976	Rac prophage; DUF1376 domain-containing protein YdaU	rzpR // ydaW // ydaV // ydaU // ydaT // ydaS	b1362 // b1361 // b1360 // b1359 // b1358 // b1357
nrfA	b4070	4287764	4289200	cytochrome <i>c</i><sub>552</sub> nitrite reductase	nrfA // nrfB // nrfC // nrfD // nrfE // nrfF // nrfG	b4070 // b4071 // b4072 // b4073 // b4074 // b4075 // b4076
lysP	b2156	2247063	2248532	lysine:H+ symporter	lysP	b2156
nikR	b3481	3618588	3618989	DNA-binding transcriptional repressor NikR	nikR // nikA // nikB // nikC // nikD // nikE	b3481 // b3476 // b3477 // b3478 // b3479 // b3480
ygeO	b2859	2995962	2996360	putative uncharacterized protein YgeO	insC4 // insD4 // insCD4 // ygeO // ygeN	b2861 // b2860 // b2859 // b2858
ymfK	b1145	1202259	1202933	e14 prophage; putative repressor protein YmfK	ymfK	b1145
nirB	b3365	3494011	3496554	nitrite reductase catalytic subunit NirB	nirB // nirD // nirC // cysG	b3365 // b3366 // b3367 // b3368
yjjB	b4363	4601624	4602097	putative succinate exporter YjjB	yjjA // yjjB // dnaC // dnaT	b4360 // b4363 // b4361 // b4362
mngR	b0730	765153	765875	DNA-binding transcriptional repressor MngR	mngR	b0730
ybcY	b0562	582152	582806	DLP12 prophage; putative SAM-dependent methyltransferase YbcY	ybcY	b0562
yagH	b0271	286789	288399	CP4-6 prophage; putative xylosidase/arabinosidase	yagH // yagG	b0271 // b0270
nikD	b3479	3617015	3617779	Ni(2+) ABC transporter ATP binding subunit NikD	nikR // nikA // nikB // nikC // nikD // nikE	b3481 // b3476 // b3477 // b3478 // b3479 // b3480
uacT	b2888	3031367	3032815	urate:H<sup>+</sup> symporter	uacT	b2888
gutM	b2706	2828621	2828980	DNA-binding transcriptional activator GutM	srlA // srlE // srlB // srlD // gutM // gutQ // srlR	b2702 // b2703 // b2704 // b2705 // b2706 // b2708 // b2707
yejO	b2190			adhesin-like autotransporter YejO	yejO	b2190
yafW	b0246	263690	264007	antitoxin of the YkfI-YafW toxin-antitoxin pair	yafY // ykfI // yafW // ykfH // ykfG // yafX // ykfF // ykfB	b0251 // b0245 // b0246 // b4504 // b0247 // b0248 // b0249 // b0250
hydN	b2713	2837578	2838105	putative electron transport protein HydN	hydN // hypF	b2713 // b2712
acrD	b2470	2587595	2590708	multidrug efflux pump RND permease AcrD	acrD	b2470
nagC	b0676	700374	701594	DNA-binding transcriptional dual regulator NagC	umpH // nagA // nagB // nagC	b0675 // b0677 // b0678 // b0676
ygaY	b2681	2808316	2809493	putative transporter YgaY, N-terminal fragment	ygaY	b2681
cspB	b1557	1641339	1641554	Qin prophage; cold shock-like protein CspB	cspB	b1557
hyfI	b2489	2610706	2611464	hydrogenase 4 catalytic subunit HyfI	focB // hyfR // hyfJ // hyfI // hyfH // hyfG // hyfF // hyfE // hyfD // hyfC // hyfB // hyfA	b2492 // b2491 // b2490 // b2489 // b2488 // b2487 // b2486 // b2485 // b2484 // b2483 // b2482 // b2481
ugpE	b3451	3589182	3590027	<i>sn</i>-glycerol 3-phosphate ABC transporter membrane subunit UgpE	ugpQ // ugpC // ugpE // ugpA // ugpB	b3449 // b3450 // b3451 // b3452 // b3453
chbR	b1735	1818605	1819447	DNA-binding transcriptional dual regulator ChbR	chbG // chbF // chbR // chbA // chbC // chbB	b1733 // b1734 // b1735 // b1736 // b1737 // b1738
yaiX	b4579			putative acyltransferase, N-terminal fragment	yaiX	b4579
ydfA	b1571	1648508	1648663	Qin prophage; DUF1391 domain-containing protein YdfA	ydfC // ydfB // ydfA	b1573 // b1572 // b1571
erpA	b0156	176610	176954	iron-sulfur cluster insertion protein ErpA	erpA	b0156
hyfD	b2484	2604811	2606250	hydrogenase 4 component D	focB // hyfR // hyfJ // hyfI // hyfH // hyfG // hyfF // hyfE // hyfD // hyfC // hyfB // hyfA	b2492 // b2491 // b2490 // b2489 // b2488 // b2487 // b2486 // b2485 // b2484 // b2483 // b2482 // b2481
nanR	b3226	3373698	3374489	DNA-binding transcriptional dual regulator NanR	nanR	b3226
yneO	b4696	1592665	1598086	AIDA-I family autotransporter YneO	yneO	b4696
pspA	b1304	1368079	1368747	phage shock protein A	pspA // pspE // pspD // pspC // pspB	b1304 // b1308 // b1307 // b1306 // b1305
napG	b2205	2299565	2300260	ferredoxin-type protein NapG	ccmH // ccmG // ccmF // ccmE // ccmD // ccmC // ccmB // ccmA // napC // napB // napH // napG // napA // napD // napF	b2194 // b2195 // b2196 // b2197 // b2198 // b2199 // b2200 // b2201 // b2202 // b2203 // b2204 // b2205 // b2206 // b2207 // b2208
secF	b0409	429505	430476	Sec translocon accessory complex subunit SecF	secF // secD // yajC // tgt	b0409 // b0408 // b0407 // b0406
hyfR	b2491	2611900	2613912	DNA-binding transcriptional activator HyfR	focB // hyfR // hyfJ // hyfI // hyfH // hyfG // hyfF // hyfE // hyfD // hyfC // hyfB // hyfA	b2492 // b2491 // b2490 // b2489 // b2488 // b2487 // b2486 // b2485 // b2484 // b2483 // b2482 // b2481
ilvG	b4488	3950560	3952204	acetolactate synthase II subunit IlvG	ilvX // ilvG // ilvA // ilvD // ilvE // ilvM // ilvL	b4669 // b4488 // b3772 // b3771 // b3770 // b3769 // b3766
dicB	b1575	1649609	1649797	Qin prophage; cell division inhibition protein DicB	intQ // insD7 // ydfE // ydfD // dicB	b1579 // b1578 // b1577 // b1576 // b1575
napC	b2202	2297657	2298259	periplasmic nitrate reductase cytochrome c protein	ccmH // ccmG // ccmF // ccmE // ccmD // ccmC // ccmB // ccmA // napC // napB // napH // napG // napA // napD // napF	b2194 // b2195 // b2196 // b2197 // b2198 // b2199 // b2200 // b2201 // b2202 // b2203 // b2204 // b2205 // b2206 // b2207 // b2208
mdtA	b2074	2154016	2155263	multidrug efflux pump membrane fusion protein MdtA	mdtD // mdtC // mdtB // mdtA // baeS // baeR	b2077 // b2076 // b2075 // b2074 // b2078 // b2079
slyA	b1642	1720390	1720824	SlyA	slyA	b1642
yfaS	b4500	2329798	2334402	putative macroglobulin family protein, N-terminal fragment	yfaA // yfaT // yfaS // yfaQ // yfaP	b2230 // b2229 // b4500 // b2226 // b2225
yfjY	b2644	2776386	2776868	CP4-57 prophage; RadC-like JAB domain-containing protein YfjY	ypjF // yfjZ // ypjJ // yfjY // yfjX	b2646 // b2645 // b4548 // b2644 // b2643
torA	b0997	1059256	1061802	trimethylamine <i>N</i>-oxide reductase 1	torC // torA // torD	b0996 // b0997 // b0998
psd	b4160	4389392	4390360	phosphatidylserine decarboxylase proenzyme // phosphatidylserine decarboxylase, &beta; chain // phosphatidylserine decarboxylase, &alpha; chain	mscM // psd	b4159 // b4160
ycjW	b1320	1382963	1383961	DNA-binding transcriptional repressor YcjW	ycjW	b1320
insB7	b4576	4518721	4519224		insB7	b4576
yfjH	b2623	2757644	2758600	CP4-57 prophage; uncharacterized protein YfjH	yfjH	b2623
menB	b2262	2375962	2376819	1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA synthase	menH // menD // menF // menE // menC // menB	b2263 // b2264 // b2265 // b2260 // b2261 // b2262
ydiM	b1690	1771071	1772285	putative exporter YdiM	ydiM	b1690
ybaQ	b0483	508218	508559	DNA-binding transcriptional regulator YbaQ	ybaQ	b0483
rpnD	b4584	4568998	4569918	putative inactive recombination-promoting nuclease-like protein RpnD	rpnD	b4584
yfdN	b2357	2472387	2472881	CPS-53 (KpLE1) prophage; uncharacterized protein YfdN	yfdO // yfdN // yfdM // yfdL // yfdK	b2358 // b2357 // b2356 // b2355 // b2354
narH	b1225	1283604	1285142	nitrate reductase A subunit &beta;	narG // narH // narJ // narI	b1224 // b1225 // b1226 // b1227
pgpB	b1278	1339330	1340094	phosphatidylglycerophosphatase B	pgpB	b1278
yebK	b1853	1936652	1937521	DNA-binding transcriptional repressor YebK	yebK	b1853
yedS	b4496	2034051	2035243	putative outer membrane protein YedS, N-terminal fragment	yedS	b4496
tfaQ	b1546	1634310	1634885	Qin prophage; putative tail fiber assembly protein TfaQ	tfaQ // stfQ // nohA	b1546 // b1547 // b1548
sucB	b0727	761522	762739	SucB-dihydrolipoate // SucB-S-succinyldihydrolipoate // SucB-lipoate // dihydrolipoyltranssuccinylase	sdhX // sdhC // sdhD // sdhA // sdhB // sucA // sucB // sucC // sucD	b4764 // b0721 // b0722 // b0723 // b0724 // b0726 // b0727 // b0728 // b0729
lsrD	b1515	1604047	1605039	Autoinducer-2 ABC transporter membrane subunit LsrD	lsrG // lsrF // lsrB // lsrD // lsrC // lsrA // tam	b1518 // b1517 // b1516 // b1515 // b1514 // b1513 // b1519
rcdB	b3521	3672414	3673313	putative DNA-binding transcriptional regulator YhjC	rcdB	b3521
insX	b4505	280114	280362		yagA // yagB // insX	b0267 // b0266 // b4505
racR	b1356	1419765	1420241	Rac prophage; DNA-binding transcriptional repressor RacR	racR	b1356
gltA	b0720	753185	754468	citrate synthase	gltA	b0720
emrE	b0543	568315	568647	DLP12 prophage; multidrug/betaine/choline efflux transporter EmrE	emrE	b0543
yeiL	b2163	2255355	2256014	DNA-binding transcriptional activator YeiL	yeiL	b2163
yjgX	b4575	4499593	4500791	KpLE2 phage-like element; putative phosphoethanolamine transferase YjgX, N-terminal fragment	yjgX	b4575
ymfH	b1142	1201069	1201380	e14 prophage; putative protein YmfH	ymfH // xisE // intE	b1142 // b1141 // b1140
fumA	b1612	1686731	1688377	fumarase A	fumA // fumC	b1612 // b1611
lolE	b1118	1177320	1178564	lipoprotein release complex - inner membrane subunit	lolE // lolD // lolC	b1118 // b1117 // b1116
rsd	b3995	4196332	4196808	regulator of sigma D	rsd	b3995
ydbA	b4492			putative outer membrane protein, N-terminal fragment	ydbA	b4492
ybcO	b0549	573084	573374	DLP12 prophage; putative nuclease YbcO	ylcG // rusA // ybcO // ninE // ybcN	b4509 // b0550 // b0549 // b0548 // b0547
sucC	b0728	763014	764180	succinyl-CoA synthetase subunit &beta;	sdhX // sdhC // sucA // sucB // sucC // sucD // sdhB // sdhA // sdhD	b4764 // b0721 // b0726 // b0727 // b0728 // b0729 // b0724 // b0723 // b0722
manY	b1818	1903082	1903882	mannose-specific PTS enzyme IIC component	manX // manY // manZ	b1817 // b1818 // b1819
marA	b1531	1619574	1619957	DNA-binding transcriptional dual regulator MarA	marR // marA // marB	b1530 // b1531 // b1532
bcsQ	b3534	3695233	3695985	cellulose biosynthesis protein	bcsQ	b3534
mmuM	b0261	276715	277647	CP4-6 prophage; homocysteine <i>S</i>-methyltransferase	mmuM // mmuP	b0261 // b0260
icd	b1136	1195123	1196373	isocitrate dehydrogenase	icd	b1136
macB	b0879	920347	922293	ABC-type tripartite efflux pump ATP binding/membrane subunit	macA // macB	b0878 // b0879
pdhR	b0113	122092	122856	DNA-binding transcriptional dual regulator PdhR	pdhR // aceE // aceF // lpd	b0113 // b0114 // b0115 // b0116
yghX	b4658	3146856	3147691	putative hydrolase fragment	yghX	b4658
ylcH	b4588	572368	572469	DLP12 prophage; uncharacterized protein YlcH		
sucD	b0729	764180	765049	succinyl-CoA synthetase subunit &alpha;	sdhX // sdhC // sucA // sucB // sucC // sucD // sdhB // sdhA // sdhD	b4764 // b0721 // b0726 // b0727 // b0728 // b0729 // b0724 // b0723 // b0722
hycF	b2720	2844210	2844752	formate hydrogenlyase subunit HycF	hycI // hycH // hycG // hycF // hycE // hycD // hycC // hycB // hycA	b2717 // b2718 // b2719 // b2720 // b2721 // b2722 // b2723 // b2724 // b2725
putA	b1014	1074920	1078882	fused DNA-binding transcriptional repressor / proline dehydrogenase / 1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase PutA	putA	b1014
efeU	b4490	1081356	1082185	inactive ferrous iron permease EfeU	efeU	b4490
ompX	b0814	850450	850965	outer membrane protein X	yliM // ompX	b4736 // b0814
sucA	b0726	758706	761507	subunit of E1(0) component of 2-oxoglutarate dehydrogenase	sdhX // sdhC // sdhD // sdhA // sdhB // sucA // sucB // sucC // sucD	b4764 // b0721 // b0722 // b0723 // b0724 // b0726 // b0727 // b0728 // b0729
dpiB	b0619	652235	653893	DpiB-<i>N</i>-phospho-L-histidine // sensor histidine kinase DpiB	dpiA // dpiB	b0620 // b0619
metJ	b3938	4128078	4128395	DNA-binding transcriptional repressor MetJ	metJ	b3938
gatR	b4498			DNA-binding transcriptional repressor GatR, N-terminal fragment	gatR	b4498
tfaE	b1156	1208517	1209119	e14 prophage; putative tail fiber assembly protein TfaE	stfE // tfaE	b1157 // b1156
fbaB	b2097	2177512	2178564	fructose-bisphosphate aldolase class I	fbaB	b2097
fucP	b2801	2934235	2935551	L-fucose:H+ symporter	fucP // fucI // fucK // fucR // fucU	b2801 // b2802 // b2803 // b2805 // b2804
hipB	b1508	1592176	1592442	antitoxin/DNA-binding transcriptional repressor HipB	hipA // hipB	b1507 // b1508
ygeF	b2850	2990554	2991043	protein YgeF	ygeF	b2850
argF	b0273	289301	290305	CP4-6 prophage; ornithine carbamoyltransferase ArgF	argF	b0273
tpiA	b3919	4110740	4111507	triose-phosphate isomerase	tpiA	b3919
bamA	b0177	197928	200360	outer membrane protein assembly factor BamA	dnaE // rnhB // lpxB // bamA // lpxA // fabZ // lpxD // skp	b0184 // b0183 // b0182 // b0177 // b0181 // b0180 // b0179 // b0178
fhlA	b2731	2854338	2856416	DNA-binding transcriptional activator FhlA	fhlA // hypE // hypD // hypC // hypB // hypA	b2731 // b2730 // b2729 // b2728 // b2727 // b2726
yaiT	b4580			putative autotransporter YaiT	yaiT	b4580
yfjU	b2638	2771840	2772154	CP4-57 prophage; putative arsenate reductase-like protein YfjU	yfjU	b2638
hycE	b2721	2844762	2846471	formate hydrogenlyase subunit HycE	hycI // hycH // hycG // hycF // hycE // hycD // hycC // hycB // hycA	b2717 // b2718 // b2719 // b2720 // b2721 // b2722 // b2723 // b2724 // b2725
envZ	b3404	3534516	3535868	sensor histidine kinase EnvZ	envZ // ompR	b3404 // b3405
birA	b3973	4173082	4174047	DNA-binding transcriptional repressor/biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase BirA	birA // murB	b3973 // b3972
yjbI	b4038	4250703	4252283	pentapeptide repeats-containing protein YjbI	yjbI	b4038
yffQ	b2448	2563592	2563969	CPZ-55 prophage; uncharacterized protein YffQ	yffR // yffQ	b2449 // b2448
ttdB	b3062	3207371	3207976	L(+)-tartrate dehydratase subunit &beta;	ttdT // ttdA // ttdB	b3063 // b3061 // b3062
xapB	b2406	2522729	2523985	xanthosine:H+ symporter XapB	xapA // xapB	b2407 // b2406
yjiR	b4340	4570162	4571574	fused putative DNA-binding transcriptional regulator/putative aminotransferase YjiR	yjiR	b4340
yfcU	b4661	2452356	2455001	putative outer membrane usher protein YfcU	yfcU // yfcS // yfcR // yfcQ // yfcP // yfcO	b4661 // b2336 // b2335 // b2334 // b2333 // b2332
yfdI	b2352	2469131	2470462	CPS-53 (KpLE1) prophage; serotype-specific glucosyl transferase YfdI	yfdI // yfdH // yfdG	b2352 // b2351 // b2350
hycB	b2724	2849238	2849849	formate hydrogenlyase subunit HycB	hycI // hycH // hycG // hycF // hycE // hycD // hycC // hycB // hycA	b2717 // b2718 // b2719 // b2720 // b2721 // b2722 // b2723 // b2724 // b2725
cyoC	b0430	448046	448660	cytochrome <i>bo</i><sub>3</sub> ubiquinol oxidase subunit 3	cyoE // cyoD // cyoC // cyoB // cyoA	b0428 // b0429 // b0430 // b0431 // b0432
nfeR	b3071	3216779	3217402	DNA-binding transcriptional repressor NfeR	nfeR	b3071
G0-10697						
flxA	b1566	1646405	1646737	Qin prophage; PF14282 domain-containing protein FlxA	flxA	b1566
pykF	b1676	1755698	1757110	pyruvate kinase I	pykF	b1676
gltK	b0653	685255	685929	glutamate/aspartate ABC transporter membrane subunit GltK	sroC // gltL // gltK // gltJ // gltI	b4763 // b0652 // b0653 // b0654 // b0655
ypdC	b2382	2501130	2501987	putative AraC-type DNA-binding transcriptional regulator YpdC	ypdC // pyrR // pyrS	b2382 // b2381 // b2380
gapC	b4493	1489713	1490713	glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase	gapC	b4493
ynaE	b1375	1433991	1434224	Rac prophage; uncharacterized protein YnaE	ynaE	b1375
fumB	b4122	4345680	4347326	fumarase B	fumB // dcuB	b4122 // b4123
betT	b0314	329463	331496	choline:H+ symporter	betT	b0314
mlc	b1594	1667344	1668564	DNA-binding transcriptional repressor Mlc	ynfK // mlc	b1593 // b1594
yeeL	b4497	2052276	2053328	putative glycosyltransferase, N-terminal fragment	yeeL	b4497
intR	b1345	1412000	1413235	Rac prophage; putative integrase	recE // recT // ralR // rcbA // xisR // intR	b1350 // b1349 // b1348 // b1347 // b1346 // b1345
pflB	b0903	951272	953554	pyruvate formate-lyase	focA // pflB	b0904 // b0903
yjeM	b4156	4383839	4385341	putative transporter YjeM	yjeM	b4156
dhaR	b1201	1251066	1252985	DNA-binding transcriptional dual regulator DhaR	dhaR	b1201
ycgI	b4521	1223564	1223907	protein YcgI	ycgI	b4521
ymfD	b1137	1196867	1197532	e14 prophage; putative SAM-dependent methyltransferase YmfD	ymfE // ymfD	b1138 // b1137
frdB	b4153	4379783	4380517	fumarate reductase iron-sulfur protein	frdD // frdC // frdB // frdA	b4151 // b4152 // b4153 // b4154
araE	b2841	2980764	2982182	arabinose:H<sup>+</sup> symporter	araE // ygeA	b2841 // b2840
iprA	b0375	394506	395129	putative DNA-binding transcriptional regulator IprA	iprA	b0375
ybcM	b0546	571454	572251	DLP12 prophage; putative DNA-binding transcriptional regulator	ybcM // ybcL	b0546 // b0545
fdhF	b4079	4297219	4299366	formate dehydrogenase H	fdhF	b4079
yiaN	b3578	3744804	3746081	2,3-diketo-L-gulonate:Na<sup>+</sup> symporter - membrane subunit	yiaM // sgbE // sgbU // sgbH // lyxK // yiaO // yiaN // yiaL // yiaK	b3577 // b3583 // b3582 // b3581 // b3580 // b3579 // b3578 // b3576 // b3575
gntR	b3438	3577731	3578726	DNA-binding transcriptional repressor GntR	gntR // gntK // gntU	b3438 // b3437 // b4476
ykfC	b0258	272847	273992	CP4-6 prophage; PF00078 domain-containing protein YkfC	ykfC	b0258
frmA	b0356	378462	379571	<i>S</i>-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase	frmR // frmA // frmB	b0357 // b0356 // b0355
dsbD	b4136	4363345	4365042	thiol-disulfide exchange protein DsbD	dsbD // yjdC	b4136 // b4135
gadW	b3515	3663890	3664618	DNA-binding transcriptional dual regulator GadW	gadA // gadX // gadW	b3517 // b3516 // b3515
rzoD	b4510	578327	578509	DLP12 prophage; putative prophage lysis lipoprotein RzoD	rzoD	b4510
frsA	b0239	256527	257771	fermentation-respiration switch protein	frsA	b0239
secG	b3175	3322173	3322505	Sec translocon subunit SecG	leuU // secG	b3174 // b3175
adiY	b4116	4337168	4337929	DNA-binding transcriptional activator AdiY	adiY	b4116
ralR	b1348	1413733	1413927	Rac prophage; endodeoxyribonuclease toxin RalR	recE // recT // ralR // rcbA // xisR // intR	b1350 // b1349 // b1348 // b1347 // b1346 // b1345
fumC	b1611	1685185	1686588	fumarase C	fumA // fumC	b1612 // b1611
yejB	b2178	2274179	2275273	putative oligopeptide ABC transporter membrane subunit YejB	yejF // yejE // yejB // yejA	b2180 // b2179 // b2178 // b2177
yidL	b3680	3860283	3861176	putative DNA-binding transcriptional regulator YidL	yidL	b3680
lit	b1139	1198695	1199588	e14 prophage; cell death peptidase Lit	lit	b1139
ppc	b3956	4150447	4153098	phosphoenolpyruvate carboxylase	ppc	b3956
ghxP	b4064	4278479	4279828	guanine/hypoxanthine transporter GhxP	ghxP	b4064
rpoH	b3461	3599929	3600783	RNA polymerase, sigma 32 (sigma H) factor	rpoH	b3461
yfjR	b2634	2769703	2770404	CP4-57 prophage; putative DNA-binding transcriptional regulator YfjR	yfjT // yfjS // ypjK // yfjR	b2637 // b2636 // b2635 // b2634
hycG	b2719	2843443	2844210	formate hydrogenlyase subunit HycG	hycI // hycH // hycG // hycF // hycE // hycD // hycC // hycB // hycA	b2717 // b2718 // b2719 // b2720 // b2721 // b2722 // b2723 // b2724 // b2725
yghB	b3009	3153563	3154222	DedA family protein YghB	yghB	b3009
phoB	b0399	417142	417831	Phosphorylated DNA-binding transcriptional dual regulator PhoB // DNA-binding transcriptional dual regulator PhoB	phoB // phoR	b0399 // b0400
yffN	b2445	2561625	2561993	CPZ-55 prophage; uncharacterized protein YffN	yffN // yffM	b2445 // b2444
ldhA	b1380	1441854	1442843	D-lactate dehydrogenase	ldhA	b1380
emrD	b3673	3853922	3855106	multidrug efflux pump EmrD	emrD	b3673
lysR	b2839	2979021	2979956	DNA-binding transcriptional dual regulator LysR	lysR	b2839
intS	b2349	2466545	2467702	CPS-53 (KpLE1) prophage; prophage CPS-53 integrase	intS	b2349
ttdA	b3061	3206463	3207374	L(+)-tartrate dehydratase subunit &alpha;	ttdT // ttdA // ttdB	b3063 // b3061 // b3062
artM	b0861	900866	901534	L-arginine ABC transporter membrane subunit ArtM	artM // artQ // artI // artP	b0861 // b0862 // b0863 // b0864
hha	b0460	480090	480308	haemolysin expression-modulating protein Hha	tomB // hha	b0461 // b0460
ydfT	b1559	1642489	1643241	Qin prophage; putative antitermination protein Q	ydfU // ydfT	b1560 // b1559
hycA	b2725	2849974	2850435	regulator of the transcriptional regulator FhlA	hycI // hycH // hycG // hycF // hycE // hycD // hycC // hycB // hycA	b2717 // b2718 // b2719 // b2720 // b2721 // b2722 // b2723 // b2724 // b2725
ftsH	b3178	3325001	3326935	ATP-dependent zinc metalloprotease FtsH	ftsH // rlmE	b3178 // b3179
fadR	b1187	1234938	1235657	DNA-binding transcriptional dual regulator FadR	fadR	b1187
stfR	b1372	1429049	1432411	Rac prophage; putative prophage side tail fiber protein StfR	tfaR // stfR	b1373 // b1372
pykA	b1854	1937649	1939091	pyruvate kinase II	pykA	b1854
lpxK	b0915	968366	969352	tetraacyldisaccharide 4'-kinase	ycaQ // lpxK // msbA // ycaI	b0916 // b0915 // b0914 // b0913
asnC	b3743	3926545	3927003	DNA-binding transcriptional dual regulator AsnC	mioC // asnC // mnmG // rsmG	b3742 // b3743 // b3741 // b3740
ymfQ	b1153	1206913	1207497	e14 prophage; DUF2313 domain-containing protein YmfQ	tfaP // ycfK // ymfQ // jayE // beeE // ymfR // ymfN // ymfM // ymfL // ymfT	b1155 // b1154 // b1153 // b1152 // b1151 // b1150 // b1149 // b1148 // b1147 // b1146
frdA	b4154	4380510	4382318	fumarate reductase flavoprotein subunit	frdD // frdC // frdB // frdA	b4151 // b4152 // b4153 // b4154
yjjP	b4364	4602088	4602858	putative succinate exporter YjjP	yjjP	b4364
yjhI	b4299	4525015	4525803	KpLE2 phage-like element; putative DNA-binding transcriptional regulator YjhI	yjhI // yjhH // yjhG	b4299 // b4298 // b4297
tfaD	b0561	581534	582097	DLP12 prophage; putative tail fiber assembly protein TfaD	tfaD	b0561
hycH	b2718	2843036	2843446	formate hydrogenlyase assembly protein	hycI // hycH // hycG // hycF // hycE // hycD // hycC // hycB // hycA	b2717 // b2718 // b2719 // b2720 // b2721 // b2722 // b2723 // b2724 // b2725
rhaT	b3907	4099491	4100525	rhamnose/lyxose:H<sup>+</sup> symporter	rhaT	b3907
yqhC	b3010	3154262	3155218	DNA-binding transcriptional activator YqhC	yqhC	b3010
intF	b0281	295696	297096	CP4-6 prophage; putative phage integrase	intF	b0281
adhE	b1241	1295446	1298121	fused acetaldehyde-CoA dehydrogenase and iron-dependent alcohol dehydrogenasealdehyde/alcohol dehydrogenase AdhE	adhE	b1241
yiaA	b3562	3726924	3727361	PF05360 family inner membrane protein YiaA	yiaA	b3562
yegW	b2101	2182035	2182781	putative DNA-binding transcriptional regulator YegW	yegW	b2101
perR	b0254	269289	270182	CP4-6 prophage; putative transcriptional regulator PerR	perR	b0254
gudP	b2789	2920748	2922100	galactarate/D-glucarate transporter GudP	gudD // gudX // gudP	b2787 // b2788 // b2789
lsrR	b1512	1600288	1601241	DNA-binding transcriptional repressor LsrR	lsrR // lsrK	b1512 // b1511
ycfK	b1154	1207501	1208130	e14 prophage; protein StfP	tfaP // ycfK // ymfQ // jayE // beeE // ymfR // ymfN // ymfM // ymfL // ymfT	b1155 // b1154 // b1153 // b1152 // b1151 // b1150 // b1149 // b1148 // b1147 // b1146
hisM	b2307	2424517	2425233	lysine/arginine/ornithine ABC transporter / histidine ABC transporter, membrane subunit HisM	hisP // hisM // hisQ // hisJ // argT	b2306 // b2307 // b2308 // b2309 // b2310
ycaN	b0900	948660	949568	putative LysR-type transcriptional regulator YcaN	ycaN	b0900
nfrA	b0568	587982	590954	bacteriophage N4 outer membrane receptor	nfrA // nfrB	b0568 // b0569
tsr	b4355	4591657	4593312	methyl-accepting chemotaxis protein Tsr	tsr	b4355
yahB	b0316	333501	334433	putative LysR-type DNA-binding transcriptional regulator YahB	yahB	b0316
hfq	b4172	4400288	4400596	RNA-binding protein Hfq	amiB // tsaE // nnr // mutL // miaA // hflC // hflK // hflX // hfq	b4169 // b4168 // b4167 // b4170 // b4171 // b4175 // b4174 // b4173 // b4172
zipA	b2412	2530247	2531233	cell division protein ZipA	zipA	b2412
cecR	b0796	829972	830643	DNA-binding transcriptional dual regulator CecR	cecR // ybhG // ybhF // ybhS // ybhR	b0796 // b0795 // b0794 // b0793 // b0792
yjhP	b4306	4532437	4533183	KpLE2 phage-like element; putative methyltransferase YjhP	yjhP	b4306
glgS	b3049	3191739	3191939	surface composition regulator	glgS	b3049
sdhD	b0722	755560	755907	succinate:quinone oxidoreductase, membrane protein SdhD	sdhX // sdhC // sdhD // sdhA // sdhB // sucA // sucB // sucC // sucD	b4764 // b0721 // b0722 // b0723 // b0724 // b0726 // b0727 // b0728 // b0729
treR	b4241	4466299	4467246	DNA-binding transcriptional repressor TreR	treR	b4241
rnlB	b2631	2766984	2767355	CP4-57 prophage; antitoxin RnlB	rnlB // rnlA	b2631 // b2630
glgB	b3432	3571316	3573502	1,4-alpha-glucan branching enzyme	glgX // glgB // glgC // glgP // glgA	b3431 // b3432 // b3430 // b3428 // b3429
shiA	b1981	2053643	2054959	shikimate:H+ symporter	shiA	b1981
zur	b4046	4259488	4260003	DNA-binding transcriptional repressor Zur	zur	b4046
intZ	b2442	2558858	2560066	CPZ-55 prophage; putative phage integrase IntZ	intZ	b2442
glgC	b3430	3568033	3569328	glucose-1-phosphate adenylyltransferase	glgX // glgB // glgC // glgP // glgA	b3431 // b3432 // b3430 // b3428 // b3429
poxB	b0871	909331	911049	pyruvate oxidase	ltaE // ybjT // poxB // hcr // hcp	b0870 // b0869 // b0871 // b0872 // b0873
baeR	b2079	2164276	2164998	Phosphorylated DNA-binding transcriptional activator BaeR // DNA-binding transcriptional activator BaeR	mdtD // mdtC // mdtB // mdtA // baeS // baeR	b2077 // b2076 // b2075 // b2074 // b2078 // b2079
cbtA	b2005	2077569	2077943	CP4-44 prophage; cytoskeleton-binding toxin CbtA	yeeW // cbtA // cbeA // yeeT // yeeS // yeeR	b2006 // b2005 // b2004 // b2003 // b2002 // b2001
yaiP	b0363	382739	383935	putative glucosyltransferase	yaiP	b0363
dtpA	b1634	1712769	1714271	dipeptide/tripeptide:H<sup>+</sup> symporter DtpA	dtpA	b1634
trpR	b4393	4632760	4633086	DNA-binding transcriptional repressor TrpR	trpR	b4393
rrrQ	b1554	1639524	1640057	Qin prophage; putative lysozyme	essQ // ydfR // rrrQ // rzpQ	b1556 // b1555 // b1554 // b1553
glgA	b3429	3566600	3568033	glycogen synthase	glgP // glgA // glgC // glgX // glgB	b3428 // b3429 // b3430 // b3431 // b3432
oppC	b1245	1303834	1304742	murein tripeptide ABC transporter / oligopeptide ABC transporter inner membrane subunit OppC	oppA // oppB // oppC // oppD // oppF	b1243 // b1244 // b1245 // b1246 // b1247
rpoB	b3987	4181245	4185273	RNA polymerase subunit &beta;	rplA // rplK // rplJ // rplL // rpoC // rpoB	b3984 // b3983 // b3985 // b3986 // b3988 // b3987
ydaY	b1366	1425621	1425980	Rac prophage; putative uncharacterized protein YdaY	ydaY // ynaK	b1366 // b1365
wcaD	b2056	2129661	2130878	putative colanic acid polymerase	wcaC // wcaD // wcaE // wcaF // gmd // fcl // gmm // wcaI // cpsB // cpsG // wcaJ // wzxC	b2057 // b2056 // b2055 // b2054 // b2053 // b2052 // b2051 // b2050 // b2049 // b2048 // b2047 // b2046
gadC	b1492	1568954	1570489	L-glutamate:4-aminobutyrate antiporter	gadB // gadC	b1493 // b1492
oxyR	b3961	4158490	4159407	DNA-binding transcriptional dual regulator OxyR	oxyR	b3961
ymfN	b1149	1204170	1205537	e14 prophage; chimeric replication protein/phage terminase YmfN	tfaP // ycfK // ymfQ // jayE // beeE // ymfR // ymfN // ymfM // ymfL // ymfT	b1155 // b1154 // b1153 // b1152 // b1151 // b1150 // b1149 // b1148 // b1147 // b1146
wcaJ	b2047	2120160	2121554	UDP-glucose:undecaprenyl-phosphate glucose-1-phosphate transferase	wcaC // wcaD // wcaE // wcaF // gmd // fcl // gmm // wcaI // cpsB // cpsG // wcaJ // wzxC	b2057 // b2056 // b2055 // b2054 // b2053 // b2052 // b2051 // b2050 // b2049 // b2048 // b2047 // b2046
mtlA	b3599	3772281	3774194	mannitol-specific PTS enzyme IICBA component	mtlA // mtlD // mtlR	b3599 // b3600 // b3601
leuO	b0076	84368	85312	DNA-binding transcriptional dual regulator LeuO	leuO	b0076
borD	b0557	578600	578893	DLP12 prophage; prophage lipoprotein BorD	borD	b0557
wcaM	b2043	2114502	2115896	putative colanic acid biosynthesis protein WcaM	wcaK // wcaL // wcaM	b2045 // b2044 // b2043
murJ	b1069	1127839	1129374	lipid II flippase MurJ	murJ	b1069
glnG	b3868	4053869	4055278	NtrC-phosphorylated monomer // DNA-binding transcriptional dual regulator NtrC	glnA // glnG // glnL	b3870 // b3868 // b3869
yagL	b0278	293220	293918	CP4-6 prophage; resolvase-like catalytic domain-containing protein YagL	yagM // yagL	b0279 // b0278
gmm	b2051	2125743	2126222	GDP-mannose mannosyl hydrolase	wcaC // wcaD // wcaE // wcaF // gmd // fcl // gmm // wcaI // cpsB // cpsG // wcaJ // wzxC	b2057 // b2056 // b2055 // b2054 // b2053 // b2052 // b2051 // b2050 // b2049 // b2048 // b2047 // b2046
malF	b4033	4243531	4245075	maltose ABC transporter membrane subunit MalF	malG // malF // malE	b4032 // b4033 // b4034
arcA	b4401	4639590	4640306	ArcA-P<sup>asp54</sup>-phosphate // Phosphorylated DNA-binding transcriptional dual regulator ArcA // DNA-binding transcriptional dual regulator ArcA	arcA	b4401
ykfB	b0250	265620	266087	CP4-6 prophage; protein YkfB	yafY // ykfI // yafW // ykfH // ykfG // yafX // ykfF // ykfB	b0251 // b0245 // b0246 // b4504 // b0247 // b0248 // b0249 // b0250
wcaC	b2057	2130853	2132070	colanic acid biosynthesis galactosyltransferase WcaC	wcaC // wcaD // wcaE // wcaF // gmd // fcl // gmm // wcaI // cpsB // cpsG // wcaJ // wzxC	b2057 // b2056 // b2055 // b2054 // b2053 // b2052 // b2051 // b2050 // b2049 // b2048 // b2047 // b2046
mdfA	b0842	883673	884905	multidrug efflux pump MdfA / Na<sup>+</sup>:H<sup>+</sup> antiporter / K<sup>+</sup>:H<sup>+</sup> antiporter	mdfA	b0842
ygfI	b2921	3066277	3067173	putative LysR-type DNA-binding transcriptional regulator YgfI	ygfI	b2921
pspF	b1303	1366935	1367912	DNA-binding transcriptional dual regulator PspF	pspF	b1303
wcaF	b2054	2128340	2128888	colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF	wcaC // wcaD // wcaE // wcaF // gmd // fcl // gmm // wcaI // cpsB // cpsG // wcaJ // wzxC	b2057 // b2056 // b2055 // b2054 // b2053 // b2052 // b2051 // b2050 // b2049 // b2048 // b2047 // b2046
hyaC	b0974	1035066	1035773	hydrogenase 1 cytochrome <i>b</i> subunit	hyaA // hyaB // hyaC // hyaD // hyaE // hyaF	b0972 // b0973 // b0974 // b0975 // b0976 // b0977
cbl	b1987	2059964	2060914	DNA-binding transcriptional activator Cbl	cbl	b1987
nohA	b1548	1635798	1636367	Qin prophage; putative prophage DNA-packaging protein NohA	tfaQ // stfQ // nohA	b1546 // b1547 // b1548
wcaL	b2044	2115907	2117127	putative colanic biosynthesis glycosyl transferase	wcaK // wcaL // wcaM	b2045 // b2044 // b2043
cusC	b0572	595600	596973	copper/silver export system outer membrane channel	cusA // cusB // cusF // cusC	b0575 // b0574 // b0573 // b0572
ydcR	b1439	1510003	1511409	fused putative DNA-binding transcriptional regulator/putative aminotransferase YdcR	ydcR	b1439
racC	b1351	1417488	1417763	Rac prophage; protein RacC	racC	b1351
wcaI	b2050	2124523	2125746	colanic acid biosynthesis fucosyltransferase WcaI	wcaC // wcaD // wcaE // wcaF // gmd // fcl // gmm // wcaI // cpsB // cpsG // wcaJ // wzxC	b2057 // b2056 // b2055 // b2054 // b2053 // b2052 // b2051 // b2050 // b2049 // b2048 // b2047 // b2046
ftsW	b0089	98403	99647	essential cell division protein FtsW	mraZ // rsmH // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL // lpxC	b0081 // b0082 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083 // b0096
modE	b0761	793856	794644	DNA-binding transcriptional dual regulator ModE	modE // modF	b0761 // b0760
grpE	b2614	2750115	2750708	nucleotide exchange factor GrpE	grpE	b2614
wzb	b2061	2135655	2136098	protein-tyrosine phosphatase	wcaB // wcaA // wzc // wzb // wza	b2058 // b2059 // b2060 // b2061 // b2062
sapB	b1293	1354505	1355470	putrescine ABC exporter membrane subunit SapB	sapA // sapB // sapC // sapD // sapF	b1294 // b1293 // b1292 // b1291 // b1290
frvR	b3897	4088107	4089855	putative transcriptional regulator FrvR	frvA // frvB // frvX // frvR	b3900 // b3899 // b3898 // b3897
yjgZ	b4277	4501260	4501589	KpLE2 phage-like element; uncharacterized protein YjgZ	yjgZ	b4277
wcaB	b2058	2132067	2132555	colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB	wcaB // wcaA // wza // wzc // wzb	b2058 // b2059 // b2062 // b2060 // b2061
entE	b0594	626070	627680	2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase	entC // entE // entB // entA // entH	b0593 // b0594 // b0595 // b0596 // b0597
ybeF	b0629	660425	661378	putative LysR-type DNA-binding transcriptional regulator YbeF	ybeF	b0629
abpA	b2628	2763537	2765153	CP4-57 prophage; anti-bacteriophage protein	abpA // abpB	b2628 // b2627
wcaE	b2055	2128904	2129650	colanic acid biosynthesis fucosyltransferase WcaE	wcaC // wcaD // wcaE // wcaF // gmd // fcl // gmm // wcaI // cpsB // cpsG // wcaJ // wzxC	b2057 // b2056 // b2055 // b2054 // b2053 // b2052 // b2051 // b2050 // b2049 // b2048 // b2047 // b2046
abgT	b1336	1400247	1401773	<i>p</i>-aminobenzoyl glutamate:H<sup>+</sup> symporter	abgA // abgB // abgT // ogt	b1338 // b1337 // b1336 // b1335
nsrR	b4178	4406190	4406615	DNA-binding transcriptional repressor NsrR	rlmB // rnr // nsrR // yjfJ // yjfI	b4180 // b4179 // b4178 // b4182 // b4181
yfdR	b2361	2474984	2475520	CPS-53 (KpLE1) prophage; 5'-deoxynucleotidase	yfdT // yfdS // yfdR	b2363 // b2362 // b2361
wcaK	b2045	2117124	2118404	putative colanic acid biosynthesis pyruvyl transferase WcaK	wcaK // wcaL // wcaM	b2045 // b2044 // b2043
cynX	b0341	359992	361146	cyanate transporter	cynX // cynS // cynT	b0341 // b0340 // b0339
tdcR	b3119	3267380	3267598	DNA-binding transcriptional activator TdcR	tdcR	b3119
yeeS	b2002	2076308	2076754	CP4-44 prophage; RadC-like JAB domain-containing protein YeeS	yeeW // cbtA // cbeA // yeeT // yeeS // yeeR	b2006 // b2005 // b2004 // b2003 // b2002 // b2001
wcaA	b2059	2132558	2133397	colanic acid biosynthesis glucuronosyltransferase WcaA	wcaB // wcaA // wza // wzc // wzb	b2058 // b2059 // b2062 // b2060 // b2061
dppC	b3542	3703859	3704761	dipeptide ABC transporter membrane subunit DppC	dppF // dppD // dppC // dppB // dppA	b3540 // b3541 // b3542 // b3543 // b3544
rhaS	b3905	4097736	4098572	DNA-binding transcriptional activator RhaS	rhaS // rhaR	b3905 // b3906
ynfN	b1551	1637954	1638109	Qin prophage; protein YnfN	ynfN	b1551
clsB	b0789	822498	823739	cardiolipin synthase B	ybhP // clsB // ybhN	b0790 // b0789 // b0788
atpH	b3735	3919870	3920403	ATP synthase F<sub>1</sub> complex subunit &delta;	atpI // atpC // atpD // atpG // atpA // atpH // atpF // atpE // atpB	b3739 // b3731 // b3732 // b3733 // b3734 // b3735 // b3736 // b3737 // b3738
nusB	b0416	435137	435556	transcription antitermination protein NusB	pgpA // thiL // nusB // ribE // ribD // nrdR	b0418 // b0417 // b0416 // b0415 // b0414 // b0413
ydaV	b1360	1421983	1422729	Rac prophage; putative ATP-binding protein YdaV	rzpR // ydaW // ydaV // ydaU // ydaT // ydaS	b1362 // b1361 // b1360 // b1359 // b1358 // b1357
clsC	b1046	1106355	1107776	cardiolipin synthase C	ymdA // ymdB // clsC	b1044 // b1045 // b1046
yfjD	b4461	2748774	2750060	UPF0053 family inner membrane protein YfjD	yfjD	b4461
ilvY	b3773	3956927	3957820	DNA-binding transcriptional dual regulator IlvY	ilvY	b3773
ymfT	b1146	1203024	1203224	e14 prophage; putative DNA-binding transcriptional regulator YmfT	tfaP // ycfK // ymfQ // jayE // beeE // ymfR // ymfN // ymfM // ymfL // ymfT	b1155 // b1154 // b1153 // b1152 // b1151 // b1150 // b1149 // b1148 // b1147 // b1146
gnsA	b4517	1052067	1052240	putative phosphatidylethanolamine synthesis regulator GnsA	ymcE // gnsA	b0991 // b4517
yhjX	b3547	3710799	3712007	putative transporter YhjX	yhjX	b3547
fur	b0683	710200	710646	DNA-binding transcriptional dual regulator Fur	uof // fur // fldA	b4637 // b0683 // b0684
essD	b0554	577398	577613	DLP12 prophage; putative phage lysis protein	rzpD // rrrD // essD	b0556 // b0555 // b0554
plsY	b3059	3204694	3205311	putative glycerol-3-phosphate acyltransferase	plsY	b3059
elyC	b0920	972622	973401	envelope biogenesis factor	elyC	b0920
cytR	b3934	4123431	4124456	DNA-binding transcriptional repressor CytR	cytR	b3934
xynR	b0272	288404	289162	CP4-6 prophage; DNA-binding transcriptional repressor XynR	xynR	b0272
plsX	b1090	1147621	1148691	putative phosphate acyltransferase	yceD // fabF // acpP // fabG // fabD // fabH // plsX // rpmF	b1088 // b1095 // b1094 // b1093 // b1092 // b1091 // b1090 // b1089
nuoK	b2279	2395043	2395345	NADH:quinone oxidoreductase subunit K	nuoL // nuoK // nuoJ // nuoI // nuoH // nuoG // nuoF // nuoE // nuoC // nuoB // nuoA // nuoN // nuoM	b2278 // b2279 // b2280 // b2281 // b2282 // b2283 // b2284 // b2285 // b2286 // b2287 // b2288 // b2276 // b2277
alsR	b4089	4312101	4312991	DNA-binding transcriptional repressor AlsR	alsR // alsE // alsC // alsA // alsB	b4089 // b4085 // b4086 // b4087 // b4088
ykfG	b0247	264256	264732	CP4-6 prophage; RadC-like JAB domain-containing protein YkfG	yafY // ykfI // yafW // ykfH // ykfG // yafX // ykfF // ykfB	b0251 // b0245 // b0246 // b4504 // b0247 // b0248 // b0249 // b0250
lapB	b1280	1340558	1341727	lipopolysaccharide assembly protein B	yciH // pyrF // lapB // lapA	b1282 // b1281 // b1280 // b1279
nupX	b2161	2252895	2254145	putative nucleoside transporter	nupX	b2161
rseB	b2571	2707798	2708754	anti-sigma factor stabilizing protein RseB	rseD // rseC // rseB // rseA // rpoE	b4725 // b2570 // b2571 // b2572 // b2573
cspF	b1558	1641855	1642067	Qin prophage; cold shock-like protein CspF	cspF	b1558
lptE	b0641	671605	672186	lipopolysaccharide assembly protein LptE	leuS // lptE // holA // nadD // cobC	b0642 // b0641 // b0640 // b0639 // b0638
plaP	b2014	2085704	2087062	putrescine:H+ symporter PlaP	plaP	b2014
dmlR	b1799	1880886	1881809	DNA-binding transcriptional regulator DmlR	dmlR	b1799
ydfB	b1572	1648665	1648793	Qin prophage; uncharacterized protein YdfB	ydfC // ydfB // ydfA	b1573 // b1572 // b1571
lapA	b1279	1340243	1340551	lipopolysaccharide assembly protein A	yciH // pyrF // lapB // lapA	b1282 // b1281 // b1280 // b1279
hybB	b2995	3142986	3144164	hydrogenase 2 membrane subunit	hybO // hybG // hybF // hybE // hybD // hybC // hybB // hybA	b2997 // b2990 // b2991 // b2992 // b2993 // b2994 // b2995 // b2996
feaR	b1384	1446378	1447283	DNA-binding transcriptional activator FeaR	feaR	b1384
pspB	b1305	1368801	1369025	phage shock protein B	pspA // pspB // pspC // pspD // pspE	b1304 // b1305 // b1306 // b1307 // b1308
kdsC	b3198	3342273	3342839	3-deoxy-D-<i>manno</i>-octulosonate 8-phosphate phosphatase KdsC	npr // rapZ // ptsN // hpf // rpoN // kdsD // yrbG // lptC // kdsC // lptB // lptA	b3206 // b3205 // b3204 // b3203 // b3202 // b3197 // b3196 // b3199 // b3198 // b3201 // b3200
yhhJ	b3485	3625679	3626803	ABC transporter family protein YhhJ	yhiI // rbbA // yhhJ	b3487 // b3486 // b3485
cusR	b0571	594760	595443	P<SUP>asp</SUP> DNA-binding transcriptional activator CusR // DNA-binding transcriptional activator CusR	cusS // cusR	b0570 // b0571
dicC	b1569	1647620	1647850	Qin prophage; putative DNA-binding transcriptional regulator DicC	dicC // ydfX // ydfW	b1569 // b1568 // b1567
lptD	b0054	54755	57109	lipopolysaccharide assembly protein LptD	lptD // surA // apaH // apaG // rsmA // pdxA	b0054 // b0053 // b0049 // b0050 // b0051 // b0052
yicL	b3660	3838248	3839171	putative transporter YicL	yicL	b3660
yfhH	b2561	2698759	2699607	putative DNA-binding transcriptional regulator YfhH	yfhH	b2561
yfjZ	b2645	2777115	2777432	CP4-57 prophage; putative antitoxin of the YpjF-YfjZ toxin-antitoxin system	ypjF // yfjZ // ypjJ // yfjY // yfjX	b2646 // b2645 // b4548 // b2644 // b2643
baeS	b2078	2162876	2164279	BaeS-<i>N</i>-phospho-L-histidine // sensor histidine kinase BaeS	mdtD // mdtC // mdtB // mdtA // baeS // baeR	b2077 // b2076 // b2075 // b2074 // b2078 // b2079
acrR	b0464	485761	486408	DNA-binding transcriptional repressor AcrR	acrR	b0464
yfjI	b2625	2758985	2760394	CP4-57 prophage; DUF3987 domain-containing protein YfjI	yfjI	b2625
dinF	b4044	4257742	4259121	DNA damage-inducible protein F	lexA // dinF	b4043 // b4044
yihL	b3872	4060447	4061157	putative transcriptional regulator YihL	yihM // yihL	b3873 // b3872
yfdO	b2358	2472878	2473246	CPS-53 (KpLE1) prophage; protein YdfO	yfdO // yfdN // yfdM // yfdL // yfdK	b2358 // b2357 // b2356 // b2355 // b2354
nhaB	b1186	1233176	1234717	Na<sup>+</sup>:H<sup>+</sup> antiporter NhaB	nhaB	b1186
narP	b2193	2290500	2291147	Phosphorylated DNA-binding transcriptional dual regulator NarP // DNA-binding transcriptional dual regulator NarP	narP	b2193
stfQ	b1547	1634885	1635847	Qin prophage; putative prophage side tail fiber protein StfQ	tfaQ // stfQ // nohA	b1546 // b1547 // b1548
ybaY	b0453	475379	475951	PF09619 family lipoprotein YbaY	ybaY	b0453
lptG	b4262	4487318	4488400	lipopolysaccharide transport system protein LptG	lptG // lptF	b4262 // b4261
uvrY	b1914	1994703	1995359	Phosphorylated DNA-binding transcriptional activator UvrY // DNA-binding transcriptional activator UvrY	uvrY // uvrC	b1914 // b1913
ydaS	b1357	1420365	1420661	Rac prophage; toxin YdaS	rzpR // ydaW // ydaV // ydaU // ydaT // ydaS	b1362 // b1361 // b1360 // b1359 // b1358 // b1357
dacD	b2010	2081381	2082547	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase DacD	dacD	b2010
hyfB	b2482	2601818	2603836	hydrogenase 4 component B	focB // hyfR // hyfJ // hyfI // hyfH // hyfG // hyfF // hyfE // hyfD // hyfC // hyfB // hyfA	b2492 // b2491 // b2490 // b2489 // b2488 // b2487 // b2486 // b2485 // b2484 // b2483 // b2482 // b2481
srlR	b2707	2829047	2829820	DNA-binding transcriptional repressor SrlR	srlA // srlE // srlB // srlD // gutM // srlR // gutQ	b2702 // b2703 // b2704 // b2705 // b2706 // b2707 // b2708
ymfI	b1143	1201497	1201838	e14 prophage; uncharacterized protein YmfI	ymfI	b1143
ldtA	b1990	2062391	2063323	L,D-transpeptidase LdtA	ldtA	b1990
yhaI	b3104	3252911	3253267	putative inner membrane protein	yhaI	b3104
relB	b1564	1645633	1645872	Qin prophage; antitoxin/DNA-binding transcriptional repressor RelB	relB // relE // hokD	b1564 // b1563 // b1562
rusA	b0550	573371	573733	DLP12 prophage; crossover junction endodeoxyribonuclease RusA	ylcG // rusA // ybcO // ninE // ybcN	b4509 // b0550 // b0549 // b0548 // b0547
mepH	b1655	1734435	1735250	peptidoglycan DD-endopeptidase MepH	mepH	b1655
mscS	b2924	3068947	3069807	small conductance mechanosensitive channel MscS	mscS	b2924
narL	b1221	1275179	1275829	Phosphorylated DNA-binding transcriptional dual regulator NarL // DNA-binding transcriptional dual regulator NarL	narL // narX	b1221 // b1222
yagE	b0268	282278	283186	CP4-6 prophage; putative 2-dehydro-3-deoxygluconate aldolase	yagF // yagE	b0269 // b0268
ldtD	b0925	981047	982894	L,D-transpeptidase LdtD	ldtD	b0925
bamD	b2595	2736146	2736883	outer membrane protein assembly factor BamD	bamD	b2595
zraR	b4004	4203320	4204645	Phosphorylated DNA-binding transcriptional activator ZraR // DNA-binding transcriptional activator ZraR	zraR // zraS	b4004 // b4003
torI	b4501	2476310	2476510	CPS-53 (KpLE1) prophage; prophage CPS-53 recombination directionality factor and response regulator inhibitor	torI	b4501
ldtB	b0819	854824	855744	L,D-transpeptidase LdtB	ldtB	b0819
modB	b0764	795862	796551	molybdate ABC transporter membrane subunit	modA // modB // modC	b0763 // b0764 // b0765
fnr	b1334	1398774	1399526	DNA-binding transcriptional dual regulator FNR	fnr	b1334
sieB	b1353	1418671	1419159	Rac prophage; phage superinfection exclusion protein	sieB	b1353
mepS	b2175	2269979	2270545	peptidoglycan DD-endopeptidase/peptidoglycan LD-carboxypeptidase	mepS	b2175
trg	b1421	1492470	1494110	methyl-accepting chemotaxis protein Trg	trg	b1421
yeiR	b2173	2267829	2268815	zinc-binding GTPase YeiR	yeiR // lpxT	b2173 // b2174
crp	b3357	3486120	3486752	DNA-binding transcriptional dual regulator CRP	crp	b3357
rem	b1561	1644651	1644902	Qin prophage; protein Rem	rem	b1561
ldtE	b1678	1757721	1758725	L,D-transpeptidase LdtE	ldtE	b1678
pyrS	b2380	2498671	2500368	PyrS-<i>N</i>-phospho-L-histidine // sensor histidine kinase PyrS	ypdC // pyrR // pyrS	b2382 // b2381 // b2380
yjbQ	b4056	4270238	4270654	UPF0047 protein YjbQ	yjbR // yjbQ	b4057 // b4056
yqgF	b2949	3093500	3093916	ribonuclease H-like domain containing nuclease	yqgF // yqgE	b2949 // b2948
pal	b0741	779067	779588	peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein Pal	cpoB // pal // tolB	b0742 // b0741 // b0740
ldtC	b1113	1169412	1170374	L,D-transpeptidase LdtC	ldtC	b1113
sdhA	b0723	755907	757673	succinate:quinone oxidoreductase, FAD binding protein	sdhX // sdhC // sdhD // sdhA // sdhB // sucA // sucB // sucC // sucD	b4764 // b0721 // b0722 // b0723 // b0724 // b0726 // b0727 // b0728 // b0729
pqqL	b1494	1572407	1575202	periplasmic metalloprotease	pqqL	b1494
miaA	b4171	4399252	4400202	tRNA dimethylallyltransferase	amiB // tsaE // nnr // mutL // miaA // hflC // hflK // hflX // hfq	b4169 // b4168 // b4167 // b4170 // b4171 // b4175 // b4174 // b4173 // b4172
btuB	b3966	4163639	4165483	cobalamin outer membrane transporter	murI // btuB	b3967 // b3966
dacC	b0839	880727	881929	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase DacC	dacC	b0839
potB	b1125	1183617	1184444	spermidine preferential ABC transporter membrane subunit PotB	potD // potC // potB // potA	b1123 // b1124 // b1125 // b1126
tesA	b0494	519139	519765	multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1	ybbO // tesA	b0493 // b0494
rtcA	b4475	3555833	3556849	RNA 3'-terminal phosphate cyclase	rtcA // rtcB	b4475 // b3421
yfjW	b2642	2773318	2775021	CP4-57 prophage; uncharacterized protein YfjW	yfjW	b2642
mepK	b0926	983075	983623	peptidoglycan LD-endopeptidase	gloC // mepK	b0927 // b0926
rsxD	b1630	1709142	1710200	SoxR [2Fe-2S] reducing system protein RsxD	nth // rsxE // rsxG // rsxD // rsxC // rsxB // rsxA // ydgK	b1633 // b1632 // b1631 // b1630 // b1629 // b1628 // b1627 // b1626
bax	b3570	3736353	3737177	putative glycoside hydrolase Bax	bax	b3570
mnmC	b2324	2441764	2443770	fused 5-methylaminomethyl-2-thiouridine-forming methyltransferase and FAD-dependent demodification enzyme	mnmC	b2324
yffR	b2449	2563980	2564372	CPZ-55 prophage; uncharacterized protein YffR	yffR // yffQ	b2449 // b2448
uppS	b0174	194903	195664	<i>ditrans,polycis</i>-undecaprenyl-diphosphate synthase [(2<i>E</i>,6<i>E</i>)-farnesyl-diphosphate specific]	dxr // cdsA // uppS	b0173 // b0175 // b0174
ompA	b0957	1019013	1020053	outer membrane protein A	ompA	b0957
yjfM	b4185	4412387	4413025	DUF1190 domain-containing protein YjfM	yjfC // yjfM // yjfL // yjfK	b4186 // b4185 // b4184 // b4183
thiI	b0423	441549	442997	tRNA uridine 4-sulfurtransferase	thiI	b0423
yfdK	b2354	2471077	2471517	CPS-53 (KpLE1) prophage; putative tail fiber assembly protein YfdK	yfdO // yfdN // yfdM // yfdL // yfdK	b2358 // b2357 // b2356 // b2355 // b2354
frvX	b3898	4089855	4090925	peptidase M42 family protein FrvX	frvA // frvB // frvX // frvR	b3900 // b3899 // b3898 // b3897
ansP	b1453	1524481	1525980	L-asparagine transporter	ansP	b1453
yicC	b3644	3816676	3817539	UPF0701 family protein YicC	yicC	b3644
dusC	b2140	2229438	2230385	tRNA-dihydrouridine<sup>16</sup> synthase	dusC	b2140
ydfW	b1567	1647174	1647323	Qin prophage; protein YdfW	dicC // ydfX // ydfW	b1569 // b1568 // b1567
chbG	b1733	1816386	1817135	chitin disaccharide deacetylase	chbG // chbF // chbR // chbA // chbC // chbB	b1733 // b1734 // b1735 // b1736 // b1737 // b1738
mreD	b3249	3398387	3398875	cell shape determining protein MreD	mreD // mreC // mreB	b3249 // b3250 // b3251
yhfW	b3380	3508587	3509813	putative mutase YhfW	yhfX // yhfW // php // yhfU // yhfT // yhfS	b3381 // b3380 // b3379 // b3378 // b3377 // b3376
rlmH	b0636	668248	668715	23S rRNA m<sup>3</sup>&Psi;1915 methyltransferase	rsfS // rlmH // mrdA // mrdB // rlpA	b0637 // b0636 // b0635 // b0634 // b0633
ydfK	b1544	1633072	1633305	Qin prophage; cold shock protein YdfK	ynfT // ydfK	b4748 // b1544
bcsZ	b3531	3689155	3690261	endo-1,4-D-glucanase	bcsC // bcsA // bcsZ // bcsB	b3530 // b3533 // b3531 // b3532
csgF	b1038	1101711	1102127	curli assembly component CsgF	csgG // csgF // csgE // csgD	b1037 // b1038 // b1039 // b1040
yciF	b1258	1315270	1315770	DUF892 domain-containing protein YciF	yciF // yciG // yciE	b1258 // b1259 // b1257
tsaD	b3064	3209530	3210543	N<sup>6</sup>-L-threonylcarbamoyladenine synthase, TsaD subunit	tsaD	b3064
xisR	b1346	1413237	1413452	Rac prophage; excisionase	recE // recT // ralR // rcbA // xisR // intR	b1350 // b1349 // b1348 // b1347 // b1346 // b1345
yciV	b1266	1323220	1324101	RNA/ssDNA 5'&rarr;3' exonuclease	yciQ // yciO // yciV	b1268 // b1267 // b1266
livM	b3456	3594203	3595480	branched chain amino acid/phenylalanine ABC transporter membrane subunit LivM	livF // livG // livM // livH // livK	b3454 // b3455 // b3456 // b3457 // b3458
yhaK	b3106	3254319	3255020	bicupin-related protein	yhaL // yhaK	b3107 // b3106
rsmG	b3740	3923057	3923680	16S rRNA m<sup>7</sup>G527 methyltransferase	rsmG // mnmG // mioC // asnC	b3740 // b3741 // b3742 // b3743
pinH	b2648	2783065	2783304	putative invertase fragment	pinH	b2648
ymfE	b1138	1197533	1198237	e14 prophage; uncharacterized protein YmfE	ymfE // ymfD	b1138 // b1137
ypdE	b2384	2504510	2505547	aminopeptidase YpdE	fryB // fryC // ypdF // ypdE // fryA	b2387 // b2386 // b2385 // b2384 // b2383
opgE	b0815	851014	852597	phosphoethanolamine transferase	opgE	b0815
hemX	b3803	3987885	3989066	PF04375 family protein HemX	hemY // hemX // hemD // hemC	b3802 // b3803 // b3804 // b3805
tusB	b3343	3474678	3474965	sulfurtransferase complex subunit TusB	yheO // tusD // tusC // tusB	b3346 // b3345 // b3344 // b3343
jayE	b1152	1206131	1206922	e14 prophage; putative protein JayE	tfaP // ycfK // ymfQ // jayE // beeE // ymfR // ymfN // ymfM // ymfL // ymfT	b1155 // b1154 // b1153 // b1152 // b1151 // b1150 // b1149 // b1148 // b1147 // b1146
ybcN	b0547	572466	572921	DLP12 prophage; DNA base-flipping protein	ylcG // rusA // ybcO // ninE // ybcN	b4509 // b0550 // b0549 // b0548 // b0547
mltF	b2558	2695801	2697357	membrane-bound lytic murein transglycosylase F	mltF	b2558
gltS	b3653	3827460	3828665	glutamate:sodium symporter	gltS	b3653
yggP	b4465	3076179	3077456	putative zinc-binding dehydrogenase YggP	cmtB // cmtA // yggP // yggF // yggC // fumE	b2934 // b2933 // b4465 // b2930 // b2928 // b2929
cmoA	b1870	1952702	1953445	carboxy-<i>S</i>-adenosyl-L-methionine synthase	cmoB // cmoA // yecN	b1871 // b1870 // b1869
xisD	b4633	565858	566079	excisionase		
rzoR	b4528	1423400	1423585	Rac prophage; putative prophage outer membrane lipoprotein RzoR	rzoR	b4528
mltD	b0211	232597	233955	membrane-bound lytic murein transglycosylase D	mltD	b0211
qmcA	b0489	514856	515773	PHB domain-containing protein QmcA	qmcA // ybbJ	b0489 // b0488
ygcQ	b2769	2894919	2895779	putative flavoprotein	ygcR // ygcQ	b2770 // b2769
tusE	b0969	1030339	1030668	sulfur transfer protein TusE	tusE	b0969
mokA	b4647	3720448	3720632			
rcbA	b1347	1413531	1413740	Rac prophage; double-strand break reduction protein	recE // recT // ralR // rcbA // xisR // intR	b1350 // b1349 // b1348 // b1347 // b1346 // b1345
slt	b4392	4630733	4632670	soluble lytic murein transglycosylase	slt	b4392
frdD	b4151	4379007	4379366	fumarate reductase membrane protein FrdD	frdD // frdC // frdB // frdA	b4151 // b4152 // b4153 // b4154
eutN	b2456	2571763	2572050	putative ethanolamine catabolic microcompartment shell protein EutN	eutN // eutE // eutJ // eutG	b2456 // b2455 // b2454 // b2453
trmL	b3606	3781215	3781688	tRNA (cytidine/uridine-2'-<i>O</i>)-ribose methyltransferase	trmL	b3606
yrhC	b4552	3623887	3624132		yrhC	b4552
ypjK	b2635	2770445	2770681	CP4-57 prophage; uncharacterized protein YpjK	yfjT // yfjS // ypjK // yfjR	b2637 // b2636 // b2635 // b2634
mltB	b2701	2824491	2825576	membrane-bound lytic murein transglycosylase B	mltB	b2701
mgtS	b4599	1622646	1622741	small protein MgtS	mgtS	b4599
yegL	b2073	2152469	2153128	IPR002035 domain-containing protein YegL	yegL // pphC	b2073 // b2072
trmD	b2607	2744572	2745339	tRNA m<sup>1</sup>G37 methyltransferase	rplS // trmD // rimM // rpsP	b2606 // b2607 // b2608 // b2609
prfH	b0236	253702	254202	putative peptide chain release factor	prfH // ykfJ	b0236 // b0235
yffO	b2446	2562111	2562527	CPZ-55 prophage; uncharacterized protein YffO	yffP // yffO	b2447 // b2446
ypdF	b2385	2505547	2506632	aminopeptidase YpdF	fryB // fryC // ypdF // ypdE // fryA	b2387 // b2386 // b2385 // b2384 // b2383
dsdX	b2365	2477847	2479184	D-serine transporter	dsdX // dsdA	b2365 // b2366
yeaX	b1803	1885845	1886810	carnitine monooxygenase subunit YeaX	yeaX	b1803
cca	b3056	3201891	3203129	fused CCA tRNA nucleotidyltransferase/phosphohydrolase	cca // ygiM	b3056 // b3055
tfaS	b2353	2470803	2471105		tfaS	b2353
yfdG	b2350	2467855	2468217	CPS-53 (KpLE1) prophage; putative bactoprenol-linked glucose translocase	yfdI // yfdH // yfdG	b2352 // b2351 // b2350
ycaL	b0909	960264	961028	periplasmic protease YcaL	ycaL	b0909
yrbG	b3196	3340275	3341252	putative transport protein YrbG	npr // kdsD // yrbG // rapZ // ptsN // hpf // rpoN // lptC // kdsC // lptB // lptA	b3206 // b3197 // b3196 // b3205 // b3204 // b3203 // b3202 // b3199 // b3198 // b3201 // b3200
ydhQ	b1664	1744871	1746127	putative adhesin-related protein YdhQ	ydhQ	b1664
rlmG	b3084	3234739	3235875	23S rRNA m<sup>2</sup>G1835 methyltransferase	rlmG	b3084
ybfO	b0703	734220	735653	RHS repeats-containing protein YbfO	ybfC // ybfO	b0704 // b0703
ydfU	b1560	1643255	1644304	Qin prophage; protein YdfU	ydfU // ydfT	b1560 // b1559
sohB	b1272	1329332	1330381	S49 peptidase family protein	sohB	b1272
cvpA	b2313	2430275	2430763	colicin V production protein	purF // cvpA // ubiX	b2312 // b2313 // b2311
ydcZ	b1447	1517882	1518331	putative inner membrane protein YdcZ	mnaT // ydcZ	b1448 // b1447
rlhA	b1435	1506781	1508742	23S rRNA 5-hydroxycytidine C2501 synthase	rlhA	b1435
ybfI	b4636	716721	716870			
tfaR	b1373	1432411	1432986	Rac prophage; putative tail fiber assembly protein TfaR	tfaR // stfR	b1373 // b1372
mltA	b2813	2946081	2947178	membrane-bound lytic murein transglycosylase A	mltA	b2813
opgB	b4359	4597150	4599441	phosphoglycerol transferase II // phosphoglycerol transferase I	opgB	b4359
ycfL	b1104	1162247	1162624	DUF1425 domain-containing protein YcfL	ycfP // nagZ // thiK // lpoB // ycfL // hinT	b1108 // b1107 // b1106 // b1105 // b1104 // b1103
rlmN	b2517	2643129	2644283	23S rRNA m<sup>2</sup>A2503 methyltransferase/tRNA m<sup>2</sup>A37 methyltransferase	rlmN	b2517
ttcC	b4638	1434958	1435008	putative tRNA 2-thiocytidine (s(2)C32) synthase		
tfaP	b1155	1208132	1208545	e14 prophage; putative tail fiber assembly protein TfaP	tfaP // ycfK // ymfQ // jayE // beeE // ymfR // ymfN // ymfM // ymfL // ymfT	b1155 // b1154 // b1153 // b1152 // b1151 // b1150 // b1149 // b1148 // b1147 // b1146
yfeW	b2430	2548102	2549406	penicillin binding protein 4B	yfeW // murP // murQ	b2430 // b2429 // b2428
atpE	b3737	3920950	3921189	ATP synthase F<sub>o</sub> complex subunit c	atpI // atpC // atpD // atpG // atpA // atpH // atpF // atpE // atpB	b3739 // b3731 // b3732 // b3733 // b3734 // b3735 // b3736 // b3737 // b3738
ybjQ	b0866	904593	904916	putative heavy metal binding protein YbjQ	amiD // ybjQ	b0867 // b0866
selU	b0503	530132	531226	tRNA 2-selenouridine synthase	selU	b0503
peaD	b4508	566376	566687		peaD	b4508
tfaX	b0563	582875	583060	DLP12 prophage; protein TfaX	tfaX	b0563
xdhD	b2881	3021316	3024186	fused putative xanthine/hypoxanthine oxidase: molybdopterin-binding subunit and Fe-S binding subunit	xdhD // ygfM	b2881 // b2880
gatA	b2094	2174597	2175049	galactitol-specific PTS enzyme IIA component	gatD // gatC // gatB // gatA // gatZ // gatY	b2091 // b2092 // b2093 // b2094 // b2095 // b2096
ybdL	b0600	633586	634746	methionine transaminase	ybdL	b0600
tgt	b0406	426137	427264	tRNA-guanine transglycosylase	tgt // secF // secD // yajC	b0406 // b0409 // b0408 // b0407
phnE	b4583	4322443	4323281	phosphonate/phosphate ABC transporter membrane subunit	phnK // phnJ // phnI // phnH // phnG // phnF // phnE // phnD // phnC // phnP // phnO // phnN // phnM // phnL	b4097 // b4098 // b4099 // b4100 // b4101 // b4102 // b4583 // b4105 // b4106 // b4092 // b4093 // b4094 // b4095 // b4096
ybcK	b0544	568902	570428	DLP12 prophage; putative recombinase YbcK	ybcK	b0544
xdhA	b2866	3000345	3002603	putative xanthine dehydrogenase molybdenum-binding subunit XdhA	xdhB // xdhC // xdhA	b2867 // b2868 // b2866
mdtF	b3514	3660414	3663527	multidrug efflux pump RND permease MdtF	gadF // mdtF // mdtE // gadE	b4718 // b3514 // b3513 // b3512
ykgH	b0310	324696	325364	uncharacterized protein YkgH	ykgH	b0310
truC	b2791	2923002	2923784	tRNA pseudouridine<sup>65</sup> synthase	yqcC // truC // yqcA	b2792 // b2791 // b2790
yjhD	b4281	4506626	4506856	KpLE2 phage-like element; surface adhesin E-like protein	yjhD	b4281
dicF	b1574	1649382	1649434	Qin prophage; small regulatory RNA DicF	dicF	b1574
xdhB	b2867	3002614	3003492	putative xanthine dehydrogenase FAD-binding subunit XdhB	xdhB // xdhC // xdhA	b2867 // b2868 // b2866
sdaC	b2796	2928229	2929518	L-serine:H+ symporter SdaC	sdaC // sdaB	b2796 // b2797
naRNA6		4325805	4325881	naRNA6		
rluE	b1135	1194298	1194951	23S rRNA pseudouridine<sup>2457</sup> synthase	rluE // nudJ	b1135 // b1134
intG	b1936	2012502	2012780	putative defective phage integrase	intG	b1936
intA	b2622	2756159	2757400	CP4-57 prophage; integrase IntA	intA	b2622
nudC	b3996	4196903	4197676	RNA decapping hydrolase	nfi // hemE // nudC	b3998 // b3997 // b3996
nuoA	b2288	2404629	2405072	NADH:quinone oxidoreductase subunit A	nuoL // nuoK // nuoJ // nuoI // nuoH // nuoG // nuoF // nuoE // nuoC // nuoB // nuoA // nuoN // nuoM	b2278 // b2279 // b2280 // b2281 // b2282 // b2283 // b2284 // b2285 // b2286 // b2287 // b2288 // b2276 // b2277
ryeG		2470472	2470665	small RNA RyeG		
rsmJ	b3497	3642380	3643132	16S rRNA m<sup>2</sup>G1516 methyltransferase	prlC // rsmJ	b3498 // b3497
ykiA	b0392	408609	408950	DUF2773 domain-containing protein YkiA	ykiA	b0392
tolB	b0740	777740	779032	Tol-Pal system periplasmic protein TolB	cpoB // pal // tolB	b0742 // b0741 // b0740
xdhC	b2868	3003489	3003968	putative xanthine dehydrogenase iron-sulfur-binding subunit XdhC	xdhB // xdhC // xdhA	b2867 // b2868 // b2866
yehW	b2128	2215745	2216476	glycine betaine ABC transporter membrane subunit YehW	yehW // yehX // yehY // osmF	b2128 // b2129 // b2130 // b2131
yoeI	b4678	2087052	2087114	uncharacterized protein YoeI		
rlmE	b3179	3327035	3327664	23S rRNA 2'-<i>O</i>-ribose U2552 methyltransferase	ftsH // rlmE	b3178 // b3179
yrdF	b4697	3404495	3404637			
intD	b0537	564815	565978	DLP12 prophage; putative integrase	intD	b0537
tehA	b1429	1500573	1501565	tellurite resistance protein	tehA // tehB	b1429 // b1430
yedJ	b1962	2032384	2033079	putative HD superfamily phosphohydrolase YedJ	drpB // yedJ	b1963 // b1962
rnpA	b3704	3884493	3884852	RNase P protein component	rnpA // rpmH	b3704 // b3703
yoeH	b4641	2068261	2068419			
yjhQ	b4307	4533239	4533784	KpLE2 phage-like element; putative acetyltransferase TopAI antitoxin YjhQ	topAI // yjhQ	b4566 // b4307
fimI	b4315	4543728	4544267	putative fimbrial protein FimI	fimD // fimH // fimG // fimF // fimC // fimI // fimA	b4317 // b4320 // b4319 // b4318 // b4316 // b4315 // b4314
yiaW	b3587	3754105	3754428	DUF3302 domain-containing protein YiaW	yiaW // yiaV	b3587 // b3586
tapT	b2583	2719223	2719921	tRNA 3-amino-3-carboxypropyltransferase	tapT // patZ	b2583 // b2584
yfaH	b2238	2349687	2349893	putative uncharacterized protein YfaH	yfaH	b2238
yfjP	b2632	2767710	2768573	CP4-57 prophage; putative GTP-binding protein YfjP	yfjQ // yfjP	b2633 // b2632
ycbV	b0943	1003439	1003954	putative fimbrial protein YcbV	ycbF // ycbV // ycbU // elfG // elfC // elfD	b0944 // b0943 // b0942 // b0941 // b0940 // b0939
yejG	b2181	2277893	2278237	protein YejG	yejG	b2181
rlmC	b0859	898518	899645	23S rRNA m<sup>5</sup>U747 methyltransferase	rlmC // ybjO	b0859 // b0858
rhsE	b1456	1527890	1529938	RhsE protein in rhs element	ydcD // rhsE	b1457 // b1456
yffL	b2443	2560257	2560898	CPZ-55 prophage; uncharacterized protein YffL	yffL	b2443
fimH	b4320	4548808	4549710	type 1 fimbriae D-mannose specific adhesin	fimD // fimH // fimG // fimF // fimC // fimI // fimA	b4317 // b4320 // b4319 // b4318 // b4316 // b4315 // b4314
yjaG	b3999	4199504	4200094	DUF416 domain-containing protein YjaG	yjaG	b3999
cmoM	b0921	973537	974322	tRNA <b>cmo</b><sup>5</sup>U34 methyltransferase	mukB // mukE // mukF // cmoM	b0924 // b0923 // b0922 // b0921
yrhA	b3443			putative uncharacterized protein YrhA	insB6 // insA6 // insAB6 // yrhA // yhhZ	b3445 // b3444 // b3443 // b3442
yeeW	b2006	2077940	2078134	CP4-44 prophage; putative uncharacterized protein YeeW	yeeW // cbtA // cbeA // yeeT // yeeS // yeeR	b2006 // b2005 // b2004 // b2003 // b2002 // b2001
mobB	b3856	4040906	4041433	molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis adaptor protein	mobB // mobA	b3856 // b3857
elfA	b0938	997868	998407	putative laminin-binding fimbrial subunit	elfA	b0938
yieE	b3712	3893881	3894630	putative phosphopantetheinyl transferase	yieF // yieE	b3713 // b3712
gluQ	b0144	159186	160112	glutamyl-Q tRNA<sup>Asp</sup> synthetase	sfsA // gluQ // dksA	b0146 // b0144 // b0145
yneL	b1506	1590334	1590536	putative HTH-type transcriptional regulator YneL	yneL	b1506
ydfR	b1555	1640054	1640365	Qin prophage; protein YdfR	essQ // ydfR // rrrQ // rzpQ	b1556 // b1555 // b1554 // b1553
panZ	b3459	3597984	3598367	acetyl-CoA-bound PanD maturation factor // PanD maturation factor	panZ	b3459
fimE	b4313	4542037	4542633	regulator for fimA	fimE	b4313
ybfD	b0706	738092	738853	H repeat-associated putative transposase YbfD	ybfD	b0706
pcnB	b0143	157729	159126	poly(A) polymerase I	folK // pcnB	b0142 // b0143
ykfJ	b0235	253467	253733	RNA ligase superfamily protein YkfJ	prfH // ykfJ	b0236 // b0235
ynaA	b1368	1426454	1427482	Rac prophage; putative prophage tail length tape measure domain-containing protein YnaA	lomR // ynaA	b4570 // b1368
yajO	b0419	437161	438135	1-deoxyxylulose-5-phosphate synthase YajO	yajO // dxs // ispA // xseB	b0419 // b0420 // b0421 // b0422
sfmF	b0534	563330	563845	putative fimbrial protein SfmF	sfmF // sfmH	b0534 // b0533
yhdH	b3253	3403484	3404458	acrylyl-CoA reductase	yhdH	b3253
queG	b4166	4392928	4394067	epoxyqueuosine reductase	queG	b4166
yjdQ	b4654	4362191	4362353			
ymfR	b1150	1205549	1205731	e14 prophage; IPR020297 domain-containing protein YmfR	tfaP // ycfK // ymfQ // jayE // beeE // ymfR // ymfN // ymfM // ymfL // ymfT	b1155 // b1154 // b1153 // b1152 // b1151 // b1150 // b1149 // b1148 // b1147 // b1146
mrp	b2113	2193059	2194168	P-loop NTPase family protein Mrp	mrp	b2113
fimB	b4312	4540957	4541559	regulator for fimA	fimB	b4312
yjeT	b4176	4404386	4404583	DUF2065 domain-containing protein YjeT	yjeT	b4176
tmcA	b2474	2593844	2595859	tRNA<sup>Met</sup> cytidine acetyltransferase	ypfJ // tmcA	b2475 // b2474
ypjI	b4644	2775545	2775816	putative UPF0401 protein YpjI		
ybcV	b0558	579184	579594	DLP12 prophage; DUF1398 domain-containing protein YbcV	ybcV	b0558
yfcV	b2339	2455083	2455646	putative fimbrial protein YfcV	yfcV	b2339
yhhA	b3448	3586943	3587383	DUF2756 domain-containing protein YhhA	yhhA	b3448
queC	b0444	464852	465547	7-cyano-7-deazaguanine synthase	queC	b0444
intB	b4271	4496750	4497940	KpLE2 phage-like element; putative integrase	intB	b4271
yagM	b0279	293945	294799	CP4-6 prophage; protein YagM	yagM // yagL	b0279 // b0278
yadN	b0141	156299	156883	putative fimbrial protein YadN	yadN	b0141
yrdD	b3283	3431420	3431962	putative DNA topoisomerase	yrdB // aroE // tsaC // yrdD	b3280 // b3281 // b3282 // b3283
rsuA	b2183	2279788	2280483	16S rRNA pseudouridine<sup>516</sup> synthase	rsuA	b2183
ygeP	b2862	2997689	2997988	protein YgeP	ygeP	b2862
yafZ	b0252	267184	268005	CP4-6 prophage; DUF932 domain-containing protein YafZ	ykfA // yafZ	b0253 // b0252
ppdD	b0108	117109	117549	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein PpdD	ppdD // hofB // hofC	b0108 // b0107 // b0106
yciA	b1253	1311848	1312246	acyl-CoA thioesterase YciA	yciA	b1253
truB	b3166	3311833	3312777	tRNA pseudouridine<sup>55</sup> synthase	truB // rbfA // infB // nusA // rimP // metY // pnp // rpsO	b3166 // b3167 // b3168 // b3169 // b3170 // b3171 // b3164 // b3165
rzpR	b1362	1423345	1423644	Rac prophage; putative endopeptidase RzpR	rzpR // ydaW // ydaV // ydaU // ydaT // ydaS	b1362 // b1361 // b1360 // b1359 // b1358 // b1357
nohD	b0560	580834	581379	DLP12 prophage; putative DNA-packaging protein NohD	nohD	b0560
yfcP	b2333	2450051	2450590	putative fimbrial protein YfcP	yfcU // yfcS // yfcR // yfcQ // yfcP // yfcO	b4661 // b2336 // b2335 // b2334 // b2333 // b2332
yqjE	b3099	3249683	3250087	inner membrane protein YqjE	yqjK // yqjE // yqjD // yqjC	b3100 // b3099 // b3098 // b3097
truA	b2318	2434824	2435636	tRNA pseudouridine<sup>38-40</sup> synthase	dedA // truA // usg // pdxB	b2317 // b2318 // b2319 // b2320
yafU	b0218	238746	239084	putative inner membrane protein	yafU	b0218
recE	b1350	1414786	1417386	Rac prophage; exonuclease VIII, ds DNA exonuclease, 5' --> 3' specific	recE // recT // ralR // rcbA // xisR // intR	b1350 // b1349 // b1348 // b1347 // b1346 // b1345
yehA	b2108	2187380	2188414	putative fimbrial adhesin YehA	yehD // yehC // yehB // yehA	b2111 // b2110 // b2109 // b2108
acrE	b3265	3413864	3415021	multidrug efflux pump membrane fusion lipoprotein AcrE	acrE // acrF	b3265 // b3266
tusC	b3344	3474973	3475332	sulfurtransferase complex subunit TusC	yheO // tusD // tusC // tusB	b3346 // b3345 // b3344 // b3343
yibW	b4651	3768892	3769256			
hflC	b4175	4403300	4404304	regulator of FtsH protease	amiB // tsaE // nnr // mutL // miaA // hflC // hflK // hflX // hfq	b4169 // b4168 // b4167 // b4170 // b4171 // b4175 // b4174 // b4173 // b4172
csgB	b1041	1103951	1104406	curlin, minor subunit	csgB // csgA // csgC	b1041 // b1042 // b1043
ygfK	b2878	3016060	3019158	putative oxidoreductase, Fe-S subunit	ygfK // ssnA	b2878 // b2879
cmoB	b1871	1953442	1954413	tRNA U34 carboxymethyltransferase	cmoB // cmoA // yecN	b1871 // b1870 // b1869
ykfL	b4627	266553	266774			
yfjM	b2629	2765513	2765776	CP4-57 prophage; protein YfjM	yfjM	b2629
ppdB	b2825	2963153	2963716	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein PpdB	ppdA // ppdB // ygdB // ppdC // recC	b2826 // b2825 // b2824 // b2823 // b2822
ygbK	b2737	2862335	2863501	putative 3-oxo-tetronate kinase YgbK	ygbK // ygbJ	b2737 // b2736
rnpB	b3123	3270216	3270592	RNase P catalytic RNA component	rnpB // garK // garR // garL // garP	b3123 // b3124 // b3125 // b3126 // b3127
mdtQ	b2139	2227323	2228758	putative multidrug resistance outer membrane protein MdtQ	mdtQ	b2139
yfdS	b2362	2475511	2475873	CPS-53 (KpLE1) prophage; protein YfdS	yfdT // yfdS // yfdR	b2363 // b2362 // b2361
elfG	b0941	1001807	1002877	putative fimbrial-like adhesin protein	ycbF // ycbV // ycbU // elfG // elfC // elfD	b0944 // b0943 // b0942 // b0941 // b0940 // b0939
yfdX	b2375	2493767	2494402	protein YfdX	yfdX // oxc // yfdV // frc // yfdE	b2375 // b2373 // b2372 // b2374 // b2371
rluF	b4022	4230354	4231226	23S rRNA pseudouridine<sup>2604</sup> and tRNA<sup>Tyr</sup> pseudouridine<sup>35</sup> synthase	rluF	b4022
pbl	b2854	2993939	2994441	transglycosylase domain-containing protein Pbl	pbl	b2854
yeeT	b2003	2076817	2077038	CP4-44 prophage; DUF987 domain-containing protein YeeT	yeeW // cbtA // cbeA // yeeT // yeeS // yeeR	b2006 // b2005 // b2004 // b2003 // b2002 // b2001
fimF	b4318	4547742	4548272	type 1 fimbriae minor subunit FimF	fimD // fimH // fimG // fimF // fimC // fimI // fimA	b4317 // b4320 // b4319 // b4318 // b4316 // b4315 // b4314
yeeJ	b1978	2044938	2052014	inverse autotransporter adhesin	yeeJ	b1978
rsmH	b0082	90094	91035	16S rRNA m<sup>4</sup>C1402 methyltransferase	rsmH // mraZ // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL // lpxC	b0082 // b0081 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083 // b0096
stfE	b1157	1209119	1209655	e14 prophage; putative side tail fiber protein fragment	stfE // tfaE	b1157 // b1156
cspI	b1552	1638455	1638667	Qin prophage; cold shock-like protein CspI	cspI	b1552
ecpA	b0293	310084	310671	common pilus major subunit	ecpA	b0293
yeaQ	b1795	1879007	1879255	PF04226 family protein YeaQ	yeaQ	b1795
rsmD	b3465	3604393	3604989	16S rRNA m<sup>2</sup>G966 methyltransferase	yhhL // rsmD	b3466 // b3465
aaaD	b4634	581354	581662	DLP12 prophage; protein AaaD		
ydaW	b1361	1422752	1423312	Rac prophage; putative uncharacterized protein YdaW	rzpR // ydaW // ydaV // ydaU // ydaT // ydaS	b1362 // b1361 // b1360 // b1359 // b1358 // b1357
fimC	b4316	4544304	4545029	type 1 fimbriae periplasmic chaperone	fimD // fimH // fimG // fimF // fimC // fimI // fimA	b4317 // b4320 // b4319 // b4318 // b4316 // b4315 // b4314
slyB	b1641	1719876	1720343	outer membrane lipoprotein SlyB	slyB	b1641
rsmI	b3146	3292475	3293335	16S rRNA 2'-<i>O</i>-ribose C1402 methyltransferase	rsmI	b3146
ysaC	b4648	3750813	3750914			
ymfL	b1147	1203268	1203825	e14 prophage; uncharacterized protein YmfL	tfaP // ycfK // ymfQ // jayE // beeE // ymfR // ymfN // ymfM // ymfL // ymfT	b1155 // b1154 // b1153 // b1152 // b1151 // b1150 // b1149 // b1148 // b1147 // b1146
yraH	b3142	3287426	3288010	putative fimbrial protein YraH	yraH	b3142
uspF	b1376	1435185	1435619	nucleotide binding filament protein	uspF	b1376
rluB	b1269	1326852	1327727	23S rRNA pseudouridine<sup>2605</sup> synthase	rluB	b1269
ysdC	b4556	3861173	3861349		glvC // glvB // glvG // ysdC	b3683 // b3682 // b3681 // b4556
rrrD	b0555	577613	578110	DLP12 prophage; lysozyme	rzpD // rrrD // essD	b0556 // b0555 // b0554
ybgD	b0719	752229	752795	putative fimbrial protein YbgD	ybgD	b0719
ycdX	b1034	1098879	1099616	zinc-binding phosphatase YcdX	ycdY // ycdX	b1035 // b1034
trmB	b2960	3102133	3102852	tRNA m<sup>7</sup>G46 methyltransferase	trmB // yggL	b2960 // b2959
yibJ	b3595	3767221	3767922	putative RHS domain-containing protein YibJ	yibJ	b3595
yagJ	b0276	291500	292231	CP4-6 prophage; protein YagJ	yagJ	b0276
yfcQ	b2334	2450587	2451075	putative fimbrial protein YfcQ	yfcU // yfcS // yfcR // yfcQ // yfcP // yfcO	b4661 // b2336 // b2335 // b2334 // b2333 // b2332
ybiW	b0823	860174	862606	putative pyruvate formate lyase	ybiY // ybiW	b0824 // b0823
mnmE	b3706	3886828	3888192	5-carboxymethylaminomethyluridine-tRNA synthase GTPase subunit	mnmE	b3706
yfdL	b2355	2471544	2472062	CPS-53 (KpLE1) prophage; putative uncharacterized protein YfdL	yfdO // yfdN // yfdM // yfdL // yfdK	b2358 // b2357 // b2356 // b2355 // b2354
yafX	b0248	264748	265206	CP4-6 prophage; protein YafX	yafY // ykfI // yafW // ykfH // ykfG // yafX // ykfF // ykfB	b0251 // b0245 // b0246 // b4504 // b0247 // b0248 // b0249 // b0250
acpT	b3475	3612969	3613556	holo-[acyl carrier protein] synthase 2	acpT	b3475
yadK	b0136	151003	151599	putative fimbrial protein YadK	yadK // yadL // yadM // yadC	b0136 // b0137 // b0138 // b0135
ylbF	b0520	549627	550442	DUF2877 domain-containing protein YlbF	ybcF // ylbF // ylbE // fdrA	b0521 // b0520 // b4572 // b0518
queF	b2794	2925348	2926196	7-cyano-7-deazaguanine reductase	queF	b2794
ybfL	b0705	736900	737961	putative transposase YbfL	ybfL	b0705
yagA	b0267	280829	281983	CP4-6 prophage; integrase core domain-containing protein YagA	yagA // yagB // insX	b0267 // b0266 // b4505
fabH	b1091	1148759	1149712	3-oxoacyl-[acyl carrier protein] synthase 3	yceD // fabF // acpP // fabG // fabD // fabH // plsX // rpmF	b1088 // b1095 // b1094 // b1093 // b1092 // b1091 // b1090 // b1089
yehD	b2111	2191680	2192222	putative fimbrial protein YehD	yehD // yehC // yehB // yehA	b2111 // b2110 // b2109 // b2108
ldtF	b0224	245065	245805	L,D-transpeptidase domain-containing protein LdtF	ldtF	b0224
ttcA	b1344	1411013	1411948	tRNA cytosine<sup>32</sup> 2-sulfurtransferase TtcA	ttcA	b1344
ykfN	b4626	263150	263212	YdiA family protein		
ydfC	b1573	1648823	1649041	Qin prophage; uncharacterized protein YdfC	ydfC // ydfB // ydfA	b1573 // b1572 // b1571
accA	b0185	208621	209580	acetyl-CoA carboxyltransferase subunit &alpha;	accA	b0185
ydeR	b1503	1587793	1588296	putative fimbrial protein YdeR	ydeT // ydeS // ydeR	b1505 // b1504 // b1503
naRNA3		4326105	4326181	naRNA3		
yfiC	b2575	2712027	2712764	tRNA m<sup>6</sup>A37 methyltransferase	yfiC	b2575
psaA	b4645	2777972	2777985			
pspC	b1306	1369025	1369384	phage shock protein C	pspA // pspB // pspC // pspD // pspE	b1304 // b1305 // b1306 // b1307 // b1308
fabA	b0954	1015952	1016470	&beta;-hydroxyacyl-acyl carrier protein dehydratase/isomerase	fabA	b0954
yadC	b0135	149715	150953	fimbrial tip-adhesin YadC	yadK // yadL // yadM // yadC	b0136 // b0137 // b0138 // b0135
esrE	b4707	4019978	4020229	small RNA EsrE	esrE	b4707
truD	b2745	2870255	2871304	tRNA pseudouridine<sup>13</sup> synthase	truD	b2745
icdC	b4519	1211413	1211577	protein IcdC	icdC	b4519
fadL	b2344	2461306	2462646	long-chain fatty acid outer membrane channel / bacteriophage T2 receptor	fadL	b2344
accD	b2316	2433012	2433926	acetyl-CoA carboxyltransferase subunit &beta;	accD	b2316
ycbU	b0942	1002889	1003431	putative fimbrial protein YcbU	ycbF // ycbV // ycbU // elfG // elfC // elfD	b0944 // b0943 // b0942 // b0941 // b0940 // b0939
yeiW	b4502	2265041	2265295	putative metal-chelating domain-containing protein YeiW	yeiW	b4502
rlmL	b0948	1007844	1009952	fused 23S rRNA m<sup>2</sup>G2445 methyltransferase and 23S rRNA m<sup>7</sup>G2069 methyltransferase	rlmL // uup	b0948 // b0949
ydfE	b1577	1650078	1650998	Qin prophage; protein YdfE	intQ // insD7 // ydfE // ydfD // dicB	b1579 // b1578 // b1577 // b1576 // b1575
ypjF	b2646	2777453	2777782	CP4-57 prophage; toxin of the YpjF-YfjZ toxin-antitoxin system	ypjF // yfjZ // ypjJ // yfjY // yfjX	b2646 // b2645 // b4548 // b2644 // b2643
fabD	b1092	1149728	1150657	[acyl-carrier-protein] <i>S</i>-malonyltransferase	yceD // fabF // acpP // fabG // fabD // fabH // plsX // rpmF	b1088 // b1095 // b1094 // b1093 // b1092 // b1091 // b1090 // b1089
fimG	b4319	4548285	4548788	type 1 fimbriae minor subunit FimG	fimD // fimH // fimG // fimF // fimC // fimI // fimA	b4317 // b4320 // b4319 // b4318 // b4316 // b4315 // b4314
yggM	b2956	3098558	3099565	DUF1202 domain-containing protein YggM	yggM	b2956
rlmA	b1822	1906251	1907060	23S rRNA m<sup>1</sup>G745 methyltransferase	rlmA	b1822
yjhE	b4282	4506861	4507109	KpLE2 phage-like element; putative membrane protein (pseudogene)	yjhE	b4282
yfjJ	b2626	2760547	2761173	CP4-57 prophage; protein YfjJ	yfjJ	b2626
fabF	b1095	1151939	1153180	3-oxoacyl-[acyl carrier protein] synthase 2	yceD // rpmF // fabH // plsX // fabD // fabG // fabF // acpP	b1088 // b1089 // b1091 // b1090 // b1092 // b1093 // b1095 // b1094
sfmA	b0530	558212	558754	putative fimbrial protein SfmA	sfmA	b0530
yiaF	b3554	3718334	3719044	DUF3053 domain-containing protein YiaF	yiaF	b3554
tadA	b2559	2697354	2697857	tRNA adenosine<sup>34</sup> deaminase	pgpC // tadA	b2560 // b2559
yeeP	b1999	2070786	2071211	CP4-44 prophage; putative GTP-binding protein	yeeP	b1999
yfdP	b2359	2473604	2473966	CPS-53 (KpLE1) prophage; uncharacterized protein YfdP	yfdQ // yfdP	b2360 // b2359
fabB	b2323	2440385	2441605	3-oxoacyl-[acyl carrier protein] synthase 1	fabB	b2323
fimD	b4317	4545096	4547732	type I fimbriae usher protein	fimD // fimH // fimG // fimF // fimC // fimI // fimA	b4317 // b4320 // b4319 // b4318 // b4316 // b4315 // b4314
yehL	b2119	2204596	2205684	putative AAA+ MoxR family ATPase YehL	yehQ // yehP // yehM // yehL	b2122 // b2121 // b2120 // b2119
queA	b0405	425011	426081	tRNA preQ134 S-adenosylmethionine ribosyltransferase-isomerase	queA	b0405
ylbH	b0499	527949	528659	putative RHS domain-containing protein YlbH	ybbD // ylbH // ybbC // rhsD	b0501 // b0499 // b0498 // b0497
flu	b2000	2071539	2074658	CP4-44 prophage; self recognizing antigen 43 (Ag43) autotransporter	isrC // flu	b4435 // b2000
fabI	b1288	1350251	1351039	enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase	fabI	b1288
yraK	b3145	3291341	3292432	putative fimbrial adhesin YraK	yraK // yraJ // yraI	b3145 // b3144 // b3143
yiiG	b3896	4087002	4088057	DUF3829 domain-containing lipoprotein YiiG	yiiG	b3896
rlmB	b4180	4409275	4410006	23S rRNA 2'-<i>O</i>-ribose G2251 methyltransferase	rlmB // rnr // nsrR // yjfJ // yjfI	b4180 // b4179 // b4178 // b4182 // b4181
insI2	b4708	279931	280104			
ydfO	b1549	1637047	1637457	Qin prophage; DUF1398 domain-containing protein YdfO	ydfO // ynfO	b1549 // b4533
fabG	b1093	1150670	1151404	3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG	yceD // fabF // acpP // fabG // fabD // fabH // plsX // rpmF	b1088 // b1095 // b1094 // b1093 // b1092 // b1091 // b1090 // b1089
ygiL	b3043	3185414	3185965	putative fimbrial protein YgiL	ygiL	b3043
yidQ	b3688	3867728	3868060	DUF1375 domain-containing putative lipoprotein YidQ	yidQ	b3688
iscS	b2530	2660317	2661531	cysteine desulfurase IscS	iscA // iscU // iscS // iscR	b2528 // b2529 // b2530 // b2531
yoeG	b4640	2067360	2067892			
ydaT	b1358	1420684	1421106	Rac prophage; protein YdaT	rzpR // ydaW // ydaV // ydaU // ydaT // ydaS	b1362 // b1361 // b1360 // b1359 // b1358 // b1357
arpA	b4017	4220301	4222487	regulator of acetyl CoA synthetase	arpA	b4017
fimA	b4314	4543115	4543663	type 1 fimbriae major subunit	fimD // fimH // fimG // fimF // fimC // fimI // fimA	b4317 // b4320 // b4319 // b4318 // b4316 // b4315 // b4314
yhcA	b3215	3362112	3362786	putative fimbrial chaperone YhcA	yhcE // yhcD // yhcA	b4569 // b3216 // b3215
miaB	b0661	693531	694955	isopentenyl-adenosine A37 tRNA methylthiolase	miaB	b0661
yafF	b4503	239190	239378	putative uncharacterized protein YafF	yafF	b4503
ymfJ	b1144	1201776	1202084	e14 prophage; uncharacterized protein YmfJ	ymfJ	b1144
fabY	b3888	4077449	4078438	putative fatty acid biosynthesis enzyme FabY	fabY // dtd // yihY // yihX	b3888 // b3887 // b3886 // b3885
yfcR	b2335	2451072	2451584	putative fimbrial protein YfcR	yfcU // yfcS // yfcR // yfcQ // yfcP // yfcO	b4661 // b2336 // b2335 // b2334 // b2333 // b2332
yghA	b3003	3149662	3150546	NADP<sup>+</sup>-dependent aldehyde reductase	yghA	b3003
rluD	b2594	2735031	2736011	23S rRNA pseudouridine<sup>1911/1915/1917</sup> synthase	rluD // pgeF	b2594 // b2593
glpR	b3423	3559848	3560605	DNA-binding transcriptional repressor GlpR	glpE // glpG // glpR	b3425 // b3424 // b3423
quuD	b0551	573956	574339	DLP12 prophage; prophage antitermination protein Q homolog QuuD	quuD	b0551
accC	b3256	3405917	3407266	biotin carboxylase	accB // accC	b3255 // b3256
yadM	b0138	152243	152812	putative fimbrial protein YadM	yadK // yadL // yadM // yadC	b0136 // b0137 // b0138 // b0135
yjeJ	b4145	4373365	4374234	protein YjeJ	yjeJ	b4145
dusB	b3260	3410280	3411245	tRNA-dihydrouridine synthase B	dusB // fis	b3260 // b3261
yifN	b3777	3960012	3960460	putative toxin YifN	yifN	b3777
yagF	b0269	283201	285168	CP4-6 prophage; D-xylonate dehydratase	yagF // yagE	b0269 // b0268
cfa	b1661	1741413	1742561	cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase	cfa	b1661
ppdA	b2826	2963707	2964177	prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain-containing protein PpdA	ppdA // ppdB // ygdB // ppdC // recC	b2826 // b2825 // b2824 // b2823 // b2822
yhaB	b3120	3267854	3268393	protein YhaB	yhaC // yhaB	b3121 // b3120
rsmA	b0051	51609	52430	16S rRNA m<sup>6</sup><sub>2</sub>A1518,m<sup>6</sup><sub>2</sub>A1519 dimethyltransferase	lptD // surA // apaH // apaG // rsmA // pdxA	b0054 // b0053 // b0049 // b0050 // b0051 // b0052
insD7	b1578	1650881	1651537	Qin prophage; putative transposase	intQ // insD7 // ydfE // ydfD // dicB	b1579 // b1578 // b1577 // b1576 // b1575
ykfI	b0245	263328	263669	CP4-6 prophage; toxin of the YkfI-YafW toxin-antitoxin system	yafY // ykfI // yafW // ykfH // ykfG // yafX // ykfF // ykfB	b0251 // b0245 // b0246 // b4504 // b0247 // b0248 // b0249 // b0250
acpS	b2563	2700618	2700998	holo-[acyl-carrier-protein] synthase	acpS // pdxJ // recO // era // rnc	b2563 // b2564 // b2565 // b2566 // b2567
ydeS	b1504	1588309	1588839	putative fimbrial protein YdeS	ydeT // ydeS // ydeR	b1505 // b1504 // b1503
yhdT	b3257	3407375	3407617	DUF997 domain-containing protein YhdT	yhdT // panF // prmA	b3257 // b3258 // b3259
tusD	b3345	3475332	3475718	sulfurtransferase complex subunit TusD	yheO // tusD // tusC // tusB	b3346 // b3345 // b3344 // b3343
afuB	b0263	278814	279162	CP4-6 prophage; ABC transporter membrane protein AfuB	insA2 // insB2 // insAB2 // afuB // afuC	b0265 // b0264 // b0263 // b0262
kilR	b1352	1418008	1418229	Rac prophage; inhibitor of FtsZ	kilR // ydaE	b1352 // b4526
fabZ	b0180	202101	202556	3-hydroxy-acyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase	dnaE // rnhB // lpxB // bamA // lpxA // fabZ // lpxD // skp	b0184 // b0183 // b0182 // b0177 // b0181 // b0180 // b0179 // b0178
ybgA	b0707	739001	739510	DUF1722 domain-containing protein YbgA	ybgA // phr	b0707 // b0708
rbn	b2268	2381608	2382525	ribonuclease BN	rbn	b2268
yjhY	b4656	4532050	4532310			
hokD	b1562	1645119	1645274	Qin prophage; toxic protein HokD	relB // relE // hokD	b1564 // b1563 // b1562
ygjP	b3085	3235960	3236463	putative metal-dependent hydrolase	ygjP	b3085
ygjV	b3090	3241193	3241744	inner membrane protein	ygjV	b3090
dusA	b4049	4261669	4262706	tRNA-dihydrouridine synthase A	dusA	b4049
pawZ	b4643	2476584	2476598			
pinE	b1158	1209685	1210239	e14 prophage; site-specific DNA recombinase	pinE	b1158
yobB	b1843	1925440	1926096	putative carbon-nitrogen hydrolase family protein YobB	exoX // yobB	b1844 // b1843
rodZ	b2516	2641831	2642844	cytoskeleton protein RodZ	rodZ	b2516
rlmD	b2785	2913699	2915000	23S rRNA m<sup>5</sup>U1939 methyltransferase	rlmD	b2785
agaA	b3135	3281122	3281625	putative truncated N-acetylgalactosamine-6-phosphate deacetylase	agaA // agaW // agaV // kbaZ	b3135 // b3134 // b3133 // b3132
dicA	b1570	1647934	1648341	DNA-binding transcriptional dual regulator DicA	dicA	b1570
ydcJ	b1423	1495288	1496631	DUF1338 domain-containing protein YdcJ	ydcJ	b1423
yqaE	b2666	2796870	2797028	Pmp3 family protein YqaE	yqaE // kbp	b2666 // b2665
rluC	b1086	1144940	1145899	23S rRNA pseudouridine<sup>955/2504/2580</sup> synthase	rluC	b1086
yqfE	b2915	3059381	3059611	putative protein YqfE	yqfE	b2915
yfjX	b2643	2775919	2776377	CP4-57 prophage; putative antirestriction protein YfjX	ypjF // yfjZ // ypjJ // yfjY // yfjX	b2646 // b2645 // b4548 // b2644 // b2643
ybeQ	b0644	675570	676547	Sel1 repeat-containing protein YbeQ	ybeQ	b0644
smrB	b2331	2448606	2449157	putative endonuclease SmrB	smrB	b2331
mnmG	b3741	3923744	3925633	5-carboxymethylaminomethyluridine-tRNA synthase subunit MnmG	rsmG // mnmG // mioC // asnC	b3740 // b3741 // b3742 // b3743
yncI	b1459	1530586	1531639	putative transposase YncI	yncI	b1459
yffS	b2450	2564523	2565332	CPZ-55 prophage; uncharacterized protein YffS	yffS	b2450
ybiI	b0803	838190	838456	zinc finger domain-containing protein YbiI	ybiI	b0803
flhE	b1878	1962580	1962972	flagellar protein FlhE	flhE // flhA // flhB	b1878 // b1879 // b1880
tsaC	b3282	3430843	3431415	L-threonylcarbamoyladenylate synthase	yrdB // aroE // tsaC // yrdD	b3280 // b3281 // b3282 // b3283
lfhA	b0229	248358	250070	flagellar system protein, promoterless fragment	lfhA	b0229
yfdM	b2356	2472112	2472387	CPS-53 (KpLE1) prophage; putative methyltransferase YfdM	yfdO // yfdN // yfdM // yfdL // yfdK	b2358 // b2357 // b2356 // b2355 // b2354
yibG	b3596	3768177	3768638	tetratricopeptide-like domain-containing protein YibG	yibG	b3596
yeaD	b1780	1863850	1864734	putative aldose 1-epimerase YeaD	gapA // yeaD	b1779 // b1780
rsmF	b1835	1920223	1921662	16S rRNA m<sup>5</sup>C1407 methyltransferase	rsmF	b1835
yibU	b4652	3769948	3770146			
ydfX	b1568	1647346	1647636	Qin prophage; protein YdfX	dicC // ydfX // ydfW	b1569 // b1568 // b1567
yciG	b1259	1315856	1316035	stress-induced bacterial acidophilic repeat motifs-containing protein YciG	yciE // yciF // yciG	b1257 // b1258 // b1259
ydgA	b1614	1689852	1691360	DUF945 domain-containing protein YdgA	ydgA	b1614
rluA	b0058	59687	60346	23S rRNA pseudouridine<sup>746</sup> and tRNA pseudouridine<sup>32</sup> synthase	rluA // rapA	b0058 // b0059
ykfK	b4628	266776	266967			
pinQ	b1545	1633622	1634212	Qin prophage; putative recombinase PinQ	pinQ	b1545
ygeG	b2851	2991268	2991759	TPR repeat-containing putative chaperone YgeG	ygeG	b2851
ycjR	b1314	1376034	1376822	3-dehydro-D-guloside 4-epimerase	ymjB // ycjV // ycjU // ycjT // ycjS // ycjR // ycjQ // ycjP // ycjO // ycjN // ycjM // ompG	b4524 // b1318 // b1317 // b1316 // b1315 // b1314 // b1313 // b1312 // b1311 // b1310 // b1309 // b1319
rlmM	b2806	2940143	2941243	23S rRNA 2'-<i>O</i>-ribose C2498 methyltransferase	rlmM	b2806
eaeH	b0297	314357	315244	putative porin domain-containing protein EaeH	insF1 // insE1 // insEF1 // eaeH	b0299 // b0298 // b0297
ydaG	b1355	1419322	1419456	Rac prophage; uncharacterized protein YdaG	ydaG // ydaF	b1355 // b4527
yoaC	b1810	1894133	1894432	DUF1889 domain-containing protein YoaC	yoaC	b1810
gfcC	b0985	1047945	1048691	capsule biosynthesis GfcC family protein	gfcB // gfcC // gfcD	b0986 // b0985 // b0984
trmA	b3965	4162170	4163270	tRNA m<sup>5</sup>U54 methyltransferase	trmA	b3965
ygeK	b2855	2994460	2994903	putative DNA-binding transcriptional regulator YgeK	ygeL // ygeK	b2856 // b2855
xisE	b1141	1200787	1201032	e14 prophage; putative excisionase	ymfH // xisE // intE	b1142 // b1141 // b1140
ycjD	b1289	1351407	1351760	DUF559 domain-containing protein YcjD	ycjD	b1289
ybiX	b0804	838530	839207	PKHD-type hydroxylase YbiX	ybiX	b0804
tcdA	b2812	2945036	2945842	tRNA threonylcarbamoyladenosine dehydratase	tcdA	b2812
insZ	b4573	1294426	1295322	putative transposase InsZ	insZ	b4573
ninE	b0548	572921	573091	DLP12 prophage; NinE family prophage protein	ylcG // rusA // ybcO // ninE // ybcN	b4509 // b0550 // b0549 // b0548 // b0547
yaiS	b0364	384059	384616	putative deacetylase YaiS	yaiS	b0364
ybbJ	b0488	514401	514859	NfeD-like family protein YbbJ	qmcA // ybbJ	b0489 // b0488
hrpA	b1413	1483061	1486963	ATP-dependent RNA helicase HrpA	hrpA	b1413
oweE	b4692	1204170	1204403	phage replication protein		
ynfO	b4533	1636756	1636989	Qin prophage; DUF3950 domain-containing protein YnfO	ydfO // ynfO	b1549 // b4533
ygaC	b2671	2799650	2799994	DUF2002 domain-containing protein YgaC	ygaC	b2671
yaaW	b0011	10643	11356	putative enzyme-specific chaperone YaaW	yaaW	b0011
rsmE	b2946	3091134	3091865	16S rRNA m<sup>3</sup>U1498 methyltransferase	gshB // rsmE	b2947 // b2946
ysaD	b4649	3750918	3751109			
alpA	b2624	2758644	2758856	CP4-57 prophage; DNA-binding transcriptional activator AlpA	alpA	b2624
yidG	b3675	3855608	3855970	inner membrane protein YidG	yidH // yidG // yidF	b3676 // b3675 // b3674
gndA		2100863	2101027	heat shock-induced protein GndA		
tsaE	b4168	4395585	4396046	N<sup>6</sup>-L-threonylcarbamoyladenine synthase, TsaE subunit	amiB // tsaE // nnr // mutL // miaA // hflC // hflK // hflX // hfq	b4169 // b4168 // b4167 // b4170 // b4171 // b4175 // b4174 // b4173 // b4172
insM	b4561	4508684	4508942		insM // insI3	b4561 // b4284
tsx	b0411	431129	432013	nucleoside-specific channel-forming protein Tsx	tsx	b0411
ypfG	b2466	2581734	2582777	DUF1176 domain-containing protein YpfG	ypfG	b2466
G0-10706		4441225	4441330	small RNA		
trmH	b3651	3824515	3825204	tRNA (Gm18) 2'-O-methyltransferase	rpoZ // spoT // trmH // recG	b3649 // b3650 // b3651 // b3652
ybbD	b0501	528640	529130	putative uncharacterized protein YbbD	ybbD // ylbH // ybbC // rhsD	b0501 // b0499 // b0498 // b0497
mcrA	b1159	1210346	1211179	e14 prophage; 5-methylcytosine-specific restriction enzyme McrA	mcrA	b1159
ynjH	b1760	1841863	1842135	DUF1496 domain-containing protein YnjH	ynjH	b1760
ydaF	b4527	1419156	1419311	Rac prophage; DUF1391 domain-containing protein YdaF	ydaG // ydaF	b1355 // b4527
queD	b2765	2892214	2892579	6-carboxy-5,6,7,8-tetrahydropterin synthase	queD	b2765
yfjV	b2641	2772167	2773182	CP4-57 prophage; putative arsenite transporter	yfjV	b2641
appY	b0564	583681	584430	DLP12 prophage; DNA-binding transcriptional activator AppY	appY	b0564
ymgG	b1172	1222644	1222988	PF13488 family protein YmgG	ymgG // ymgD	b1172 // b1171
ydiE	b1705	1789613	1789804	PF10636 family protein YdiE	ydiE	b1705
rlmI	b0967	1028779	1029969	23S rRNA m<sup>5</sup>C1962 methyltransferase	rlmI	b0967
ymdE	b1028	1095544	1095846	putative uncharacterized protein YmdE	ycdU // ymdE	b1029 // b1028
yfjT	b2637	2771148	2771615	CP4-57 prophage; uncharacterized protein YfjT	yfjT // yfjS // ypjK // yfjR	b2637 // b2636 // b2635 // b2634
yaaX	b0005	5234	5530	DUF2502 domain-containing protein YaaX	yaaX	b0005
yhjR	b3535	3695997	3696185	PF10945 family protein YhjR	yhjR	b3535
tusA	b3470	3608751	3608996	sulfur transfer protein TusA	tusA	b3470
ykgP	b4630	313716	313805	putative oxidoreductase		
yffP	b2447	2562524	2563117	CPZ-55 prophage; uncharacterized protein YffP	yffP // yffO	b2447 // b2446
sanA	b2144	2232878	2233597	DUF218 domain-containing protein SanA	yeiS // sanA	b2145 // b2144
yhiJ	b3488	3630968	3632590	DUF4049 domain-containing protein YhiJ	yhiJ	b3488
trmO	b0195	218887	219594	tRNA m<sup>6</sup>t<sup>6</sup>A37 methyltransferase	rcsF // trmO	b0196 // b0195
yrdE	b4646	3404638	3405031			
yfdH	b2351	2468214	2469134	CPS-53 (KpLE1) prophage; bactoprenol glucosyl transferase	yfdI // yfdH // yfdG	b2352 // b2351 // b2350
yedD	b1928	2007677	2008090	lipoprotein YedD	yedD	b1928
yibL	b3602	3776665	3777027	DUF2810 domain-containing protein YibL	yibL	b3602
rnd	b1804	1886864	1887991	RNase D	rnd	b1804
ypaA	b4543	2357816	2358001	protein YpaA	ypaA // rpnE	b4543 // b2244
ydfV	b1565	1645897	1646202	Qin prophage; protein YdfV	ydfV	b1565
yjfY	b4199	4424516	4424791	DUF1471 domain-containing protein YjfY	yjfY	b4199
yihM	b3873	4061165	4062145	putative TIM barrel domain-containing protein YihM	yihM // yihL	b3873 // b3872
rsmC	b4371	4606669	4607700	16S rRNA m<sup>2</sup>G1207 methyltransferase	rsmC	b4371
yjiV	b4486	4574135	4576855	putative uncharacterized protein YjiV	yjiV	b4486
ybcL	b0545	570893	571444	DLP12 prophage; periplasmic protein YbcL	ybcM // ybcL	b0546 // b0545
yfcO	b2332	2449228	2450049	DUF2544 domain-containing protein YfcO	yfcU // yfcS // yfcR // yfcQ // yfcP // yfcO	b4661 // b2336 // b2335 // b2334 // b2333 // b2332
yafE	b0210	231926	232549	putative S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase	yafE // yafD	b0210 // b0209
trmJ	b2532	2662583	2663323	tRNA Cm32/Um32 methyltransferase	trmJ	b2532
yjhR	b4308	4535015	4536031	KpLE2 phage-like element; PLD-like domain-containing protein YjhR	yjhR	b4308
ylcG	b4509	573730	573870	DLP12 prophage; uncharacterized protein YlcG	ylcG // rusA // ybcO // ninE // ybcN	b4509 // b0550 // b0549 // b0548 // b0547
cysN	b2751	2873992	2875419	sulfate adenylyltransferase subunit 1	cysC // cysN // cysD	b2750 // b2751 // b2752
ydiY	b1722	1805325	1806083	acid-inducible putative outer membrane protein YdiY	ydiY	b1722
yigI	b3820	4004230	4004697	putative thioesterase YigI	yigI	b3820
rlmF	b0807	842332	843258	23S rRNA m<sup>6</sup>A1618 methyltransferase	rlmF	b0807
yegZ	b2083	2167602	2167820	phage protein D	yegZ // yegR	b2083 // b2085
recT	b1349	1413984	1414793	Rac prophage; recombinase RecT	recE // recT // ralR // rcbA // xisR // intR	b1350 // b1349 // b1348 // b1347 // b1346 // b1345
csdA	b2810	2943337	2944542	cysteine sulfinate desulfinase	csdE // csdA	b2811 // b2810
ycbJ	b0919	971752	972645	putative phosphotransferase YcbJ	ycbJ	b0919
yjiK	b4333	4562743	4563603	uncharacterized protein YjiK	yjiK	b4333
rsmB	b3289	3435207	3436496	16S rRNA m<sup>5</sup>C967 methyltransferase	rsmB	b3289
exoD	b0539	566098	566361	DLP12 prophage; putative exonuclease ExoD	exoD	b0539
lamB	b4036	4247971	4249311	maltose outer membrane channel / phage lambda receptor protein	malK // lamB // malM	b4035 // b4036 // b4037
cysH	b2762	2887578	2888312	phosphoadenosine phosphosulfate reductase	cysH // cysI // cysJ	b2762 // b2763 // b2764
yciN	b1273	1330417	1330668	protein YciN	yciN	b1273
nfsA	b0851	891184	891906	NADPH-dependent nitroreductase NfsA	nfsA // ybjC // rimK // ybjN	b0851 // b0850 // b0852 // b0853
mnmA	b1133	1192667	1193773	tRNA-specific 2-thiouridylase	mnmA	b1133
ylbI	b4632	529497	529592	RHS element protein YlbI		
sbmC	b2009	2080789	2081262	DNA gyrase inhibitor	sbmC	b2009
dcyD	b1919	1998494	1999480	D-cysteine desulfhydrase	dcyD // tcyL // tcyN	b1919 // b1918 // b1917
yjbM	b4048	4260599	4261306	DUF2713 domain-containing protein YjbM	yjbM // yjbL	b4048 // b4047
yjdF	b4121	4344929	4345558	DUF2238 domain-containing inner membrane protein YjdF	yjdF	b4121
rdgC	b0393	409108	410019	nucleoid-associated protein RdgC	rdgC	b0393
yeeH	b4639	2066068	2066154			
lon	b0439	458888	461242	Lon protease	clpP // lon // clpX	b0437 // b0439 // b0438
yjcS	b4083	4304612	4306597	linear primary-alkylsulfatase	yjcS	b4083
yceH	b1067	1126157	1126804	DUF480 domain-containing protein YceH	yceH	b1067
yggC	b2928	3073976	3074689	P-loop NTPase domain-containing protein YggC	cmtB // cmtA // yggP // yggF // fumE // yggC	b2934 // b2933 // b4465 // b2930 // b2929 // b2928
rnhA	b0214	235535	236002	ribonuclease HI	rnhA	b0214
ymjB	b4524	1381789	1381902	hypothetical protein YmjB	ymjB // ycjV // ycjU // ycjT // ycjS // ycjR // ycjQ // ycjP // ycjO // ycjN // ycjM // ompG	b4524 // b1318 // b1317 // b1316 // b1315 // b1314 // b1313 // b1312 // b1311 // b1310 // b1309 // b1319
mprA	b2684	2810770	2811300	DNA-binding transcriptional repressor MprA	mprA // emrA // emrB	b2684 // b2685 // b2686
sufC	b1682	1761766	1762512	Fe-S cluster scaffold complex subunit SufC	sufE // sufS // sufD // sufC // sufB // sufA	b1679 // b1680 // b1681 // b1682 // b1683 // b1684
yheU	b3354	3484218	3484436	UPF0270 family protein YheU	yheU // yheT // yheS	b3354 // b3353 // b3352
yhcB	b3233	3380191	3380589	DUF1043 domain-containing inner membrane protein YhcB	yhcB	b3233
dnaT	b4362	4600978	4601517	primosomal protein DnaT	yjjA // yjjB // dnaC // dnaT	b4360 // b4363 // b4361 // b4362
nmpC	b0553			DLP12 prophage; putative outer membrane porin NmpC	nmpC	b0553
insD6	b4273	4498595	4499500	KpLE2 phage-like element; IS2 insertion element protein InsB	insD6 // insC6 // insCD6	b4273 // b4272
sufE	b1679	1758874	1759290	sulfur carrier protein SufE	sufE // sufS // sufD // sufC // sufB // sufA	b1679 // b1680 // b1681 // b1682 // b1683 // b1684
yfaT	b2229	2334336	2334959	DUF1175 domain-containing protein YfaT	yfaA // yfaT // yfaS // yfaQ // yfaP	b2230 // b2229 // b4500 // b2226 // b2225
mraZ	b0081	89634	90092	DNA-binding transcriptional repressor MraZ	mraZ // rsmH // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL // lpxC	b0081 // b0082 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083 // b0096
holB	b1099	1155762	1156766	DNA polymerase III subunit &delta;'	ycfH // holB // tmk // mltG // pabC	b1100 // b1099 // b1098 // b1097 // b1096
ytfA	b4205	4427694	4428095	putative transcriptional regulator YtfA	ytfA	b4205
insE5	b2088	2170236	2170535	IS3 element protein InsE	insF5 // insE5 // insEF5	b2089 // b2088
glpE	b3425	3561497	3561823	thiosulfate sulfurtransferase GlpE	glpE // glpG // glpR	b3425 // b3424 // b3423
ynfD	b1586	1657565	1657870	DUF1161 domain-containing protein YnfD	ynfD	b1586
ygiQ	b4469	3158927	3161146	radical SAM superfamily protein YgiQ	ygiQ	b4469
recG	b3652	3825210	3827291	ATP-dependent DNA helicase RecG	rpoZ // spoT // trmH // recG	b3649 // b3650 // b3651 // b3652
intQ	b1579	1651512	1652708	Qin prophage; putative defective integrase	intQ // insD7 // ydfE // ydfD // dicB	b1579 // b1578 // b1577 // b1576 // b1575
uup	b0949	1009964	1011871	ATP-binding protein Uup	rlmL // uup	b0948 // b0949
ssuD	b0935	994843	995988	FMNH<sub>2</sub>-dependent alkanesulfonate monooxygenase	ssuB // ssuC // ssuD // ssuA // ssuE	b0933 // b0934 // b0935 // b0936 // b0937
ybgO	b0716	747921	748982	putative fimbrial protein YbgO	ybgQ // ybgP // ybgO	b0718 // b0717 // b0716
ygeR	b2865	2999136	2999891	LysM domain-containing putative peptidase lipoprotein YgeR	ygeR	b2865
dnaG	b3066	3211107	3212852	DNA primase	dnaG // rpoD // rpsU	b3066 // b3067 // b3065
ykgA	b0300	316450	317136	putative DNA-binding transcriptional regulator YkgA	ykgA	b0300
insA2	b0265	279600	279875	IS1 protein InsA	insA2 // insB2 // insAB2 // afuB // afuC	b0265 // b0264 // b0263 // b0262
cysP	b2425	2542512	2543528	thiosulfate/sulfate ABC transporter periplasmic binding protein CysP	cysM // cysA // cysW // cysU // cysP	b2421 // b2422 // b2423 // b2424 // b2425
ybjC	b0850	890913	891200	DUF1418 domain-containing protein YbjC	nfsA // ybjC // rimK // ybjN	b0851 // b0850 // b0852 // b0853
yfjS	b2636	2770681	2771124	CP4-57 prophage; inner membrane lipoprotein YfjS	yfjT // yfjS // ypjK // yfjR	b2637 // b2636 // b2635 // b2634
holA	b0640	670574	671605	DNA polymerase III subunit &delta;	leuS // lptE // holA // nadD // cobC	b0642 // b0641 // b0640 // b0639 // b0638
yjhZ	b4657	4534430	4534675	KpLE2 phage-like element; putative acetyltransferase YjhZ		
insCD1		381351	382579	IS2 element transposase InsAB'	insD1 // insC1 // insCD1	b0361 // b0360
csdE	b2811	2944542	2944985	sulfur acceptor protein CsdE	csdE // csdA	b2811 // b2810
yiiS	b3922	4112967	4113266	DUF406 domain-containing protein YiiS	uspD // yiiS	b3923 // b3922
hxpA	b2293	2411439	2412089	hexitol phosphatase A	yfbU // hxpA	b2294 // b2293
priB	b4201	4425520	4425834	primosomal replication protein N	rpsF // priB // rpsR // rplI	b4200 // b4201 // b4202 // b4203
yoeD	b4642	2078549	2078677			
insJ	b3557	3720680	3721201	insertion element IS150 protein InsA	insJ	b3557
cysI	b2763	2888387	2890099	sulfite reductase, hemoprotein subunit	cysI // cysJ // cysH	b2763 // b2764 // b2762
ygbA	b2732	2856453	2856806	protein YgbA	ygbA	b2732
yebZ	b1840	1923719	1924591	putative inner membrane protein	yobA // yebZ // yebY	b1841 // b1840 // b1839
dnaB	b4052	4264314	4265729	replicative DNA helicase	dnaB	b4052
yhdW	b3268	3419042	3420066	putative ABC transporter periplasmic binding protein YhdW	yhdZ // yhdY // yhdX // yhdW	b3271 // b3270 // b3269 // b3268
insD3	b1996	2068952	2069857	CP4-44 prophage; IS2 insertion element protein InsB	insC3 // insD3 // insCD3	b1997 // b1996
cysC	b2750	2873387	2873992	adenylyl-sulfate kinase	cysC // cysN // cysD	b2750 // b2751 // b2752
yqjK	b3100	3250077	3250376	PF13997 family protein YqjK	yqjK // yqjE // yqjD // yqjC	b3100 // b3099 // b3098 // b3097
ynjA	b1753	1835515	1836063	AhpD-like domain-containing protein YnjA	ynjD // ynjC // ynjB // ynjA // ydjZ // ydjY // ydjX	b1756 // b1755 // b1754 // b1753 // b1752 // b1751 // b1750
cspD	b0880	922366	922590	DNA replication inhibitor CspD	cspD	b0880
agaW	b3134	3280701	3281102	<I>N</I>-acetyl-D-galactosamine specific PTS truncated enzyme IIC component	agaA // agaW // agaV // kbaZ	b3135 // b3134 // b3133 // b3132
insL2	b0582	608065	609177	IS186/IS421 transposase	insL2	b0582
sufB	b1683	1762522	1764009	Fe-S cluster scaffold complex subunit SufB	sufE // sufS // sufD // sufC // sufB // sufA	b1679 // b1680 // b1681 // b1682 // b1683 // b1684
yecM	b1875	1959280	1959846	putative metal-binding enzyme YecM	yecM // cutC	b1875 // b1874
dgcF	b1522	1610907	1611854	putative diguanylate cyclase DgcF	dgcF	b1522
polA	b3863	4046966	4049752	DNA polymerase I	polA	b3863
yddJ	b1470	1544384	1544719	uncharacterized protein YddJ	yddL // yddK // yddJ	b1472 // b1471 // b1470
insI1	b0256	270603	271754	IS30 transposase	insI1 // insN	b0256 // b4587
sseB	b2522	2654157	2654933	protein SseB	sseB	b2522
yneG	b1523	1611966	1612325	DUF4186 domain-containing protein YneG	glsB // yneG	b1524 // b1523
ychQ	b1213	1266924	1267316	SirB family protein YchQ	ychA // ychQ // kdsA	b1214 // b1213 // b1215
seqA	b0687	712987	713532	negative modulator of initiation of replication	pgm // seqA	b0688 // b0687
lafU	b0230	250072	250827	flagellar system protein, promoterless fragment	lafU	b0230
insAB3		290649	291346	InsAB' transposase	insA3 // insB3 // insAB3	b0275 // b0274
cysQ	b4214	4436755	4437495	3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase	cysQ	b4214
ybeR	b0645	676711	677418	DUF1266 domain-containing protein YbeR	djlB // ybeR	b0646 // b0645
yccX	b0968	1030064	1030342	acylphosphatase	yccX	b0968
topA	b1274	1331048	1333645	DNA topoisomerase 1	topA	b1274
yicT	b4653	3836425	3836556			
insA6	b3444	3583483	3583758	IS1 protein InsA	insB6 // insA6 // insAB6 // yrhA // yhhZ	b3445 // b3444 // b3443 // b3442
sufS	b1680	1759303	1760523	L-cysteine desulfurase	sufE // sufS // sufD // sufC // sufB // sufA	b1679 // b1680 // b1681 // b1682 // b1683 // b1684
ybiJ	b0802	837665	837925	DUF1471 domain-containing protein YbiJ	ybiJ	b0802
ybhH	b0769	800759	801811	putative isomerase YbhH	ybhH	b0769
dnaX	b0470	492092	494023	DNA polymerase III subunit &gamma; // DNA polymerase III subunit &tau;	dnaX	b0470
ykgQ	b4631	317439	317567			
insB5	b1893	1978518	1979021	IS1 protein InsB	insA5 // insB5 // insAB5	b1894 // b1893
sbp	b3917	4108834	4109823	sulfate/thiosulfate ABC transporter periplasmic binding protein Sbp	sbp	b3917
ygdD	b2807	2941236	2941631	DUF423 domain-containing inner membrane protein YgdD	ygdD	b2807
ybaV	b0442	463937	464308	helix-hairpin-helix 3 family protein	ybaV	b0442
holE	b1842	1925108	1925338	DNA polymerase III subunit &theta;	holE	b1842
ybeM	b4581	658031	658818	deamidated glutathione amidase, N-terminal fragment	ybeM	b4581
insF3	b0541	567138	568004	DLP12 prophage; IS3 element protein InsF	insF3 // insE3 // insEF3	b0541 // b0540
cysJ	b2764	2890099	2891898	sulfite reductase, flavoprotein subunit	cysI // cysJ // cysH	b2763 // b2764 // b2762
yebB	b1862	1946251	1946853	putative papain-like amidase YebB	yebB	b1862
hokE	b4415	607836	607988	protein HokE	hokE	b4415
dnaN	b3701	3881221	3882321	&beta; sliding clamp	dnaA // recF // dnaN	b3702 // b3700 // b3701
ygeN	b2858	2995314	2996020	putative type III secretion system protein YgeN	insC4 // insD4 // insCD4 // ygeO // ygeN	b2861 // b2860 // b2859 // b2858
insB1	b0021	19811	20314	IS1 protein InsB	insA1 // insB1 // insAB1	b0022 // b0021
ssuB	b0933	993277	994044	aliphatic sulfonate ABC transporter ATP binding subunit	ssuB // ssuC // ssuD // ssuA // ssuE	b0933 // b0934 // b0935 // b0936 // b0937
yghW	b2998	3146450	3146737	DUF2623 domain-containing protein YghW	yghW	b2998
ymcF	b4723	1051684	1051872	protein YmcF		
holC	b4259	4483837	4484280	DNA polymerase III subunit &chi;	holC // valS	b4259 // b4258
ycjV	b1318	1380821	1381789	putative ABC transporter ATP-binding protein YcjV	ymjB // ycjV // ycjU // ycjT // ycjS // ycjR // ycjQ // ycjP // ycjO // ycjN // ycjM // ompG	b4524 // b1318 // b1317 // b1316 // b1315 // b1314 // b1313 // b1312 // b1311 // b1310 // b1309 // b1319
insAB1		19811	20508	InsAB' transposase	insA1 // insB1 // insAB1	b0022 // b0021
cysD	b2752	2875421	2876329	sulfate adenylyltransferase subunit 2	cysC // cysN // cysD	b2750 // b2751 // b2752
yebO	b1825	1908261	1908548	uncharacterized protein YebO	yebO	b1825
yshB	b4686	4053647	4053757	uncharacterized protein YshB		
priC	b0467	490285	490812	primosomal replication protein N''	priC // ybaM	b0467 // b0466
aaaE	b4693	1204401	1205537	phage terminase		
insC5	b3044	3186187	3186552	IS2 insertion element repressor InsA	yqiI // yqiH // yqiG // insD5 // insC5 // insCD5	b3048 // b3047 // b3046 // b3045 // b3044
ynjE	b1757	1839467	1840774	molybdopterin synthase sulfurtransferase	ynjE	b1757
ynaJ	b1332	1397365	1397622	DUF2534 domain-containing protein YnaJ	ynaJ	b1332
ybdD	b4512	632182	632379	PF04328 family protein YbdD	ybdD	b4512
mioC	b3742	3926012	3926455	flavoprotein MioC	mioC // asnC // mnmG // rsmG	b3742 // b3743 // b3741 // b3740
yibS	b4650	3768639	3768890	RHS family protein YibS		
insD2	b1402	1467921	1468826	IS2 insertion element protein InsB	insC2 // insD2 // insCD2	b1403 // b1402
yidJ	b3678	3856911	3858404	putative sulfatase/phosphatase YidJ	yidK // yidJ	b3679 // b3678
ybdJ	b0580	605951	606199	DUF1158 domain-containing protein YbdJ	ybdJ	b0580
prkB	b3355	3484490	3485359	putative phosphoribulokinase	prkB	b3355
hda	b2496	2618075	2618776	inibitor of reinitiation of DNA replication	hda	b2496
sokA	b4614	3722076	3722105			
insF2	b0372	391739	392605	IS3 element protein InsF	insE2 // insF2 // insEF2	b0373 // b0372
aslA	b3801	3984352	3986007	putative sulfatase AslA	aslA	b3801
yhfG	b3362	3491453	3491620	DUF2559 domain-containing protein YhfG	fic // yhfG // pabA	b3361 // b3362 // b3360
ppnP	b0391	408177	408461	nucleoside phosphorylase PpnP	ppnP	b0391
parC	b3019	3163715	3165973	DNA topoisomerase IV subunit A	parC	b3019
ybfG	b0691	715947	716597	PF10964 domain-containing protein YbfG	ybfG	b0691
insA9	b4709	258345	258620	IS1 repressor TnpA		
sufD	b1681	1760520	1761791	Fe-S cluster scaffold complex subunit SufD	sufE // sufS // sufD // sufC // sufB // sufA	b1679 // b1680 // b1681 // b1682 // b1683 // b1684
yidH	b3676	3855960	3856307	DUF202 domain-containing inner membrane protein YidH	yidH // yidG // yidF	b3676 // b3675 // b3674
yjcF	b4066	4281783	4283075	pentapeptide repeat-containing protein YjcF	yjcF	b4066
topB	b1763	1844999	1846960	DNA topoisomerase III	ydjA // topB // selD	b1765 // b1763 // b1764
insEF2		391739	392901	IS3 element transposase	insE2 // insF2 // insEF2	b0373 // b0372
sufA	b1684	1764018	1764386	iron-sulfur cluster insertion protein SufA	sufE // sufS // sufD // sufC // sufB // sufA	b1679 // b1680 // b1681 // b1682 // b1683 // b1684
yfjF	b2618	2754008	2754298	putative component of the Rsx system	ratA // yfjF	b2619 // b2618
yebE	b1846	1929048	1929707	DUF533 domain-containing inner membrane protein YebE	yebE	b1846
gyrA	b2231	2336793	2339420	DNA gyrase subunit A	gyrA	b2231
insA7	b4294	4518527	4518802	KpLE2 phage-like element; IS1 repressor protein InsA	insA7	b4294
ydeN	b1498	1580842	1582524	putative sulfatase YdeN	ydeN // ydeM	b1498 // b1497
yeaO	b1792	1876909	1877256	DUF488 domain-containing protein YeaO	yeaO	b1792
ygiF	b3054	3199664	3200965	inorganic triphosphatase	ygiF // glnE	b3054 // b3053
rep	b3778	3960677	3962698	ATP-dependent DNA helicase Rep	rep	b3778
agrB	b4713	3648294	3648375	small regulatory RNA AgrB	agrB	b4713
insD4	b2860	2996372	2997277	IS2 insertion element protein InsB	insC4 // insD4 // insCD4 // ygeO // ygeN	b2861 // b2860 // b2859 // b2858
rutF	b1007	1069860	1070354	FMN reductase RutF	rutA // rutB // rutC // rutD // rutE // rutF // rutG	b1012 // b1011 // b1010 // b1009 // b1008 // b1007 // b1006
ymgE	b1195	1244728	1244982	PF04226 family protein YmgE	ymgE	b1195
ahr	b4269	4495190	4496209	NADPH-dependent aldehyde reductase Ahr	ahr	b4269
holD	b4372	4607803	4608216	DNA polymerase III subunit &psi;	yjjG // rimI // holD	b4374 // b4373 // b4372
ralA	b4714	1413556	1413734	Rac prophage; small regulatory RNA antitoxin RalA	ralA	b4714
insH4	b1331	1396112	1397092	IS<i>5</i> transposase and trans-activator	insH4	b1331
allC	b0516	544057	545292	allantoate amidohydrolase	allE // allC // allD	b0515 // b0516 // b0517
yahL	b0326	344176	344991	uncharacterized protein YahL	yahL	b0326
yjgN	b4257	4479730	4480926	inner membrane protein YjgN	yjgN	b4257
dnaE	b0184	205126	208608	DNA polymerase III subunit &alpha;	dnaE // rnhB // lpxB // bamA // lpxA // fabZ // lpxD // skp	b0184 // b0183 // b0182 // b0177 // b0181 // b0180 // b0179 // b0178
C0293		1196711	1196782	small regulatory RNA C0293		
insF1	b0299	315587	316453	IS3 element protein InsF	insF1 // insE1 // insEF1 // eaeH	b0299 // b0298 // b0297
ygfT	b2887	3029012	3030931	putative oxidoreductase YgfT	ygfT // ygfS	b2887 // b2886
ychJ	b1233	1288674	1289132	NTF2-like domain-containing protein YchJ	ychJ	b1233
yjjA	b4360	4599695	4600189	DUF2501 domain-containing protein YjjA	yjjB // yjjA // dnaC // dnaT	b4363 // b4360 // b4361 // b4362
priA	b3935	4124612	4126810	primosomal protein N'	priA	b3935
agrA	b4712	3648063	3648144	small RNA AgrA	agrA	b4712
insCD5		3186187	3187415	IS2 element transposase InsAB'	yqiI // yqiH // yqiG // insD5 // insC5 // insCD5	b3048 // b3047 // b3046 // b3045 // b3044
allA	b0505	532451	532933	ureidoglycolate lyase	allA	b0505
yedE	b1929	2008277	2009482	putative selenium transporter YedE	yedF // yedE	b1930 // b1929
yhhW	b3439	3578950	3579645	quercetin 2,3-dioxygenase	yhhW	b3439
parE	b3030	3173504	3175396	DNA topoisomerase IV subunit B	nudF // yqiB // cpdA // yqiA // parE	b3034 // b3033 // b3032 // b3031 // b3030
insA4	b4516	1049833	1050108	IS1 protein InsA	insB4 // insA4 // insAB4	b0988 // b4516
glnB	b2553	2687070	2687408	uridylyl-[protein PII] // nitrogen regulatory protein PII-1	glrR // glnB	b2554 // b2553
ytfI	b4215	4437707	4438645	protein YtfI	ytfI	b4215
yecA	b1908	1990954	1991619	UPF0149 family protein YecA	yecA	b1908
tus	b1610	1684259	1685188	DNA replication terminus site-binding protein	tus	b1610
insG	b4278	4502103	4503431	KpLE2 phage-like element; IS<i>4</i> putative transposase	insG	b4278
ydfG	b1539	1627517	1628263	3-hydroxy acid dehydrogenase YdfG	ydfG	b1539
yfeS	b2420	2537749	2538483	PF05406 family protein YfeS	yfeS // yfeK	b2420 // b2419
ibaG	b3190	3336549	3336803	acid stress protein IbaG	ibaG // murA	b3190 // b3189
gyrB	b3699	3877705	3880119	DNA gyrase subunit B	gyrB	b3699
insF5	b2089	2170532	2171398	IS3 element protein InsF	insF5 // insE5 // insEF5	b2089 // b2088
rutB	b1011	1072171	1072863	peroxyureidoacrylate/ureidoacrylate amidohydrolase	rutA // rutB // rutC // rutD // rutE // rutF // rutG	b1012 // b1011 // b1010 // b1009 // b1008 // b1007 // b1006
ydiZ	b1724	1807400	1807690	putative endoribonuclease YdiZ	ydiZ	b1724
rhsD	b0497	523261	527541	protein RhsD	ybbD // ylbH // ybbC // rhsD	b0501 // b0499 // b0498 // b0497
sbcB	b2011	2082756	2084183	exodeoxyribonuclease I	sbcB	b2011
b1437	b1437	1509250	1509447			
insB4	b0988	1050027	1050530	IS1 protein InsB	insB4 // insA4 // insAB4	b0988 // b4516
rutE	b1008	1070365	1070955	putative malonic semialdehyde reductase	rutA // rutB // rutC // rutD // rutE // rutF // rutG	b1012 // b1011 // b1010 // b1009 // b1008 // b1007 // b1006
yccT	b0964	1027111	1027773	DUF2057 domain-containing protein YccT	yccT	b0964
yghR	b2984	3132454	3133212	putative ATP-binding protein YghR	yghS // yghR	b2985 // b2984
nfi	b3998	4198790	4199461	endonuclease V	nfi // hemE // nudC	b3998 // b3997 // b3996
b0017	b0017	15869	16177			
insB3	b0274	290649	291152	IS1 protein InsB	insA3 // insB3 // insAB3	b0275 // b0274
allD	b0517	545314	546363	ureidoglycolate dehydrogenase	allE // allC // allD	b0515 // b0516 // b0517
ykfM	b4586	238257	238736	uncharacterized protein YkfM		
syd	b2793	2924735	2925280	SecY-interacting protein	syd	b2793
endA	b2945	3090347	3091054	DNA-specific endonuclease I	endA	b2945
tpke11		14080	14167		tpke11 // dnaK // dnaJ	b0014 // b0015
insCD2		1467921	1469149	IS2 element transposase InsAB'	insC2 // insD2 // insCD2	b1403 // b1402
patA	b3073	3219494	3220873	putrescine aminotransferase	patA	b3073
yehE	b2112	2192515	2192796	DUF2574 domain-containing protein YehE	yehE	b2112
yfgI	b2506	2630326	2630865	nalidixic acid resistance protein YfgI	yfgI // yfgH	b2506 // b2505
xseA	b2509	2634232	2635602	exodeoxyribonuclease VII subunit XseA	xseA	b2509
yjgW	b4274	4499599	4499934		yjgW	b4274
insK	b3558	3721198	3722049	IS150 conserved protein InsB	insK	b3558
allB	b0512	539147	540508	allantoinase	glxK // ybbY // ybbW // glxR // hyi // gcl // allB	b0514 // b0513 // b0511 // b0509 // b0508 // b0507 // b0512
yciI	b1251	1310569	1310865	protein YciI	yciI	b1251
arnD	b2256	2370018	2370908	putative 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose-phosphoundecaprenol deformylase ArnD	arnF // arnE // arnT // arnD // arnA // arnC // arnB	b2258 // b4544 // b2257 // b2256 // b2255 // b2254 // b2253
sbcC	b0397	412607	415753	ATP-dependent structure-specific DNA nuclease - SbcC subunit	sbcD // sbcC	b0398 // b0397
b1364	b1364	1425178	1425459			
insC3	b1997	2069815	2070180	CP4-44 prophage; IS2 insertion element repressor InsA	insC3 // insD3 // insCD3	b1997 // b1996
gltB	b3212	3354725	3359185	glutamate synthase subunit GltB	gltB // gltD // gltF	b3212 // b3213 // b3214
yhgF	b3407	3537385	3539706	putative RNA-binding protein YhgF	yhgF	b3407
yoaE	b1816	1900029	1901585	putative inner membrane protein YoaE	yoaE	b1816
ybhP	b0790	823736	824497	endonuclease/exonuclease/phosphatase domain-containing protein YbhP	ybhP // clsB // ybhN	b0790 // b0789 // b0788
sroG		3184570	3184718		sroG // ribB	b3041
insH3	b0656	687997	688977	IS<i>5</i> transposase and trans-activator	insH3	b0656
astC	b1748	1830762	1831982	succinylornithine transaminase	astE // astB // astD // astA // astC	b1744 // b1745 // b1746 // b1747 // b1748
yfbN	b2273	2387710	2388426	uncharacterized protein YfbN	yfbN	b2273
ydiL	b1689	1770615	1770971	DUF1870 domain-containing protein YdiL	ydiL	b1689
sbcD	b0398	415750	416952	ATP-dependent structure-specific DNA nuclease - SbcD subunit	sbcD // sbcC	b0398 // b0397
G0-10704		4001191	4001334			
insH1	b0259	274101	275081	CP4-6 prophage; IS<i>5</i> transposase and trans-activator	insH1	b0259
cynT	b0339	358799	359458	carbonic anhydrase 1	cynT // cynS // cynX	b0339 // b0340 // b0341
ydgH	b1604	1678427	1679371	DUF1471 domain-containing protein YdgH	ydgH	b1604
yddH	b1462	1533282	1533851	flavin reductase-like protein YddH	yddH	b1462
recJ	b2892	3036373	3038106	ssDNA-specific exonuclease RecJ	lysS // prfB // recJ // dsbC // xerD	b2890 // b2891 // b2892 // b2893 // b2894
b3975	b3975	4175213	4175368			
insAB5		1978518	1979215	InsAB' transposase	insA5 // insB5 // insAB5	b1894 // b1893
rutA	b1012	1072863	1074011	pyrimidine monooxygenase RutA	rutA // rutB // rutC // rutD // rutE // rutF // rutG	b1012 // b1011 // b1010 // b1009 // b1008 // b1007 // b1006
ybiU	b0821	857796	859061	DUF1479 domain-containing protein YbiU	ybiU	b0821
ycgL	b1179	1227681	1228007	PF05166 family protein YcgL	ycgL	b1179
rnt	b1652	1728347	1728994	RNase T	rnt // lhr	b1652 // b1653
ycdF	b1005	1067918	1068148			
insB6	b3445	3583677	3584180	IS1 protein InsB	insB6 // insA6 // insAB6 // yrhA // yhhZ	b3445 // b3444 // b3443 // b3442
ptsP	b2829	2966188	2968434	PtsP-phosphorylated // phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP	rppH // ptsP	b2830 // b2829
yfiM	b2586	2724128	2724451	protein YfiM	yfiM	b2586
ycaR	b0917	970673	970855	UPF0434 family protein YcaR	kdsB // ycaR	b0918 // b0917
mcrB	b4346	4577958	4579337	McrB<sub>S</sub> // 5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrB	mcrC // mcrB	b4345 // b4346
C0664		2835055	2835167		C0664	
insA5	b1894	1978940	1979215	IS1 protein InsA	insA5 // insB5 // insAB5	b1894 // b1893
rutD	b1009	1070965	1071765	putative aminoacrylate hydrolase RutD	rutA // rutB // rutC // rutD // rutE // rutF // rutG	b1012 // b1011 // b1010 // b1009 // b1008 // b1007 // b1006
yiiX	b3937	4127286	4127894	putative lipid-binding hydrolase YiiX	yiiX	b3937
ybgI	b0710	742827	743570	radiation resistance protein YbgI	nei // pxpA // pxpC // pxpB // ybgI	b0714 // b0713 // b0712 // b0711 // b0710
hsdM	b4349	4581459	4583048	type I restriction enzyme EcoKI methyltransferase component	hsdR // hsdS // hsdM	b4350 // b4348 // b4349
G0-10700		2278258	2278498			
insH2	b0552	574737	575717	DLP12 prophage; IS<i>5</i> transposase and trans-activator	insH2	b0552
hcp	b0873	912162	913814	protein <i>S</i>-nitrosylase	hcr // hcp // ltaE // ybjT // poxB	b0872 // b0873 // b0870 // b0869 // b0871
ygfB	b2909	3054866	3055444	UPF0149 family protein YgfB	ygfB // pepP // ubiH // ubiI	b2909 // b2908 // b2907 // b2906
yaiO	b0358	380069	380842	outer membrane protein YaiO	yaiO	b0358
mcrC	b4345	4576912	4577958	5-methylcytosine-specific restriction enzyme subunit McrC	mcrC // mcrB	b4345 // b4346
ybhU	b4591	813114	813251			
insA1	b0022	20233	20508	IS1 protein InsA	insA1 // insB1 // insAB1	b0022 // b0021
allE	b0515	543261	544046	(S)-ureidoglycine aminohydrolase	allE // allC // allD	b0515 // b0516 // b0517
yraN	b3148	3295394	3295789	UPF0102 family protein YraN	yraN	b3148
ipeX		574367	574515	small RNA IpeX		
hsdR	b4350	4583249	4586761	type I restriction enzyme EcoKI endonuclease component	hsdR // hsdS // hsdM	b4350 // b4348 // b4349
b3004	b3004	3150722	3150967			
insAB4		1049833	1050530	InsAB' transposase	insB4 // insA4 // insAB4	b0988 // b4516
gltD	b3213	3359198	3360616	glutamate synthase subunit GltD	gltB // gltD // gltF	b3212 // b3213 // b3214
yecR	b1904	1988222	1988545	lipoprotein YecR	yecR	b1904
idlP	b4722	4556913	4556996	<i>iraD</i> leader peptide	idlP // ytiD // ytiC // iraD	b4722 // b4721 // b4720 // b4326
mrr	b4351	4586949	4587863	methylated adenine and cytosine restriction protein	mrr	b4351
b0609	b0609	643407	643868			
insD5	b3045	3186510	3187415	IS2 insertion element protein InsB	yqiI // yqiH // yqiG // insD5 // insC5 // insCD5	b3048 // b3047 // b3046 // b3045 // b3044
aegA	b2468	2583546	2585525	putative oxidoreductase AegA	aegA	b2468
ynfB	b1583	1655808	1656149	DUF1283 domain-containing protein YnfB	speG // ynfB	b1584 // b1583
yoaK	b4676	1878773	1878871	uncharacterized membrane protein YoaK		
hsdS	b4348	4580068	4581462	type I restriction enzyme EcoKI specificity protein	hsdR // hsdS // hsdM	b4350 // b4348 // b4349
tpke70		2496194	2496629		tpke70	
insC2	b1403	1468784	1469149	IS2 insertion element repressor InsA	insC2 // insD2 // insCD2	b1403 // b1402
glnA	b3870	4056625	4058034	adenylyl-[glutamine synthetase] // glutamine synthetase	glnG // glnL // glnA	b3868 // b3869 // b3870
ybeT	b0647	678852	679406	Sel1 repeat-containing protein YbeT	ybeT	b0647
opgD	b1424	1496856	1498511	glucan biosynthesis protein D	opgD	b1424
dcm	b1961	2030899	2032317	DNA-cytosine methyltransferase	vsr // dcm	b1960 // b1961
fruL	b0079	87860	87946			
insE2	b0373	392602	392901	IS3 element protein InsE	insE2 // insF2 // insEF2	b0373 // b0372
patD	b1444	1515578	1517002	&gamma;-aminobutyraldehyde dehydrogenase	patD // ydcV // ydcU // ydcT // ydcS	b1444 // b1443 // b1442 // b1441 // b1440
ybcH	b0567	587091	587981	DUF4434 domain-containing protein YbcH	ybcH	b0567
yaeH	b0163	183709	184095	DUF3461 domain-containing protein YaeH	yaeH	b0163
ogt	b1335	1399721	1400236	methylated-DNA&mdash;[protein]-cysteine <i>S</i>-methyltransferase	abgA // abgB // abgT // ogt	b1338 // b1337 // b1336 // b1335
b2596	b2596	2736913	2737119			
insH21	b4711	1299567	1300547	IS<i>5</i> transposase and trans-activator		
glnK	b0450	472598	472936	uridylyl-[GlnK] // nitrogen regulator GlnK	amtB // glnK	b0451 // b0450
yebF	b1847	1930034	1930390	secreted protein YebF	yebF	b1847
hofB	b0107	115714	117099	T2SSE family protein	ppdD // hofB // hofC	b0108 // b0107 // b0106
rarA	b0892	937994	939337	replication-associated recombination protein A	rarA // lolA	b0892 // b0891
b0309	b0309	324408	324620			
insEF3		566842	568004	IS3 element transposase	insF3 // insE3 // insEF3	b0541 // b0540
rutC	b1010	1071773	1072159	putative aminoacrylate peracid reductase RutC	rutA // rutB // rutC // rutD // rutE // rutF // rutG	b1012 // b1011 // b1010 // b1009 // b1008 // b1007 // b1006
yfaA	b2230	2334956	2336644	DUF2138 domain-containing protein YfaA	yfaA // yfaT // yfaS // yfaQ // yfaP	b2230 // b2229 // b4500 // b2226 // b2225
yjbR	b4057	4270658	4271014	PF04237 family protein YjbR	yjbR // yjbQ	b4057 // b4056
xerD	b2894	3038847	3039743	site-specific recombinase	lysS // prfB // recJ // dsbC // xerD	b2890 // b2891 // b2892 // b2893 // b2894
C0362		1552001	1552386		C0362	
insC4	b2861	2997235	2997600	IS2 insertion element repressor InsA	insC4 // insD4 // insCD4 // ygeO // ygeN	b2861 // b2860 // b2859 // b2858
ugpC	b3450	3588110	3589180	<i>sn</i>-glycerol 3-phosphate ABC transporter ATP binding subunit	ugpQ // ugpC // ugpE // ugpA // ugpB	b3449 // b3450 // b3451 // b3452 // b3453
ygiZ	b3027	3171879	3172211	DUF2645 domain-containing inner membrane protein YgiZ	ygiZ	b3027
yibH	b3597	3770243	3771379	inner membrane protein YibH	yibI // yibH	b3598 // b3597
recD	b2819	2950635	2952461	exodeoxyribonuclease V subunit RecD	recB // recD // ptrA	b2820 // b2819 // b2821
b1903	b1903	1987444	1987782			
insH5	b1370	1427746	1428726	Rac prophage; IS<i>5</i> transposase and trans-activator	insH5	b1370
phnL	b4096	4317215	4317895	methylphosphonate degradation complex subunit PhnL	phnP // phnO // phnN // phnM // phnL // phnK // phnJ // phnI // phnH // phnG // phnF // phnE // phnD // phnC	b4092 // b4093 // b4094 // b4095 // b4096 // b4097 // b4098 // b4099 // b4100 // b4101 // b4102 // b4583 // b4105 // b4106
yebY	b1839	1923365	1923706	DUF2511 domain-containing protein YebY	yobA // yebZ // yebY	b1841 // b1840 // b1839
lhr	b1653	1729087	1733703	putative ATP-dependent helicase Lhr	rnt // lhr	b1652 // b1653
ihfA	b1712	1795253	1795552	integration host factor subunit &alpha;	thrS // rpmI // infC // rplT // ihfA // pheM // pheT // pheS	b1719 // b1717 // b1718 // b1716 // b1712 // b1715 // b1713 // b1714
b0100	b0100	111564	111698			
insC1	b0360	381351	381716	IS2 element protein InsA	insD1 // insC1 // insCD1	b0361 // b0360
phnI	b4099	4319599	4320663	carbon-phosphorus lyase core complex subunit PhnI	phnK // phnJ // phnI // phnH // phnG // phnF // phnE // phnD // phnC // phnP // phnO // phnN // phnM // phnL	b4097 // b4098 // b4099 // b4100 // b4101 // b4102 // b4583 // b4105 // b4106 // b4092 // b4093 // b4094 // b4095 // b4096
ydbL	b1383	1445880	1446206	DUF1318 domain-containing protein YdbL	ydbL // ynbE // ydbH	b1383 // b1382 // b1381
elbB	b3209	3349806	3350459	low activity glyoxalase ElbB	elbB // mtgA	b3209 // b3208
mutY	b2961	3103013	3104065	adenine DNA glycosylase	nupG // mutY // mltC // yggX	b2964 // b2961 // b2963 // b2962
tp2		122697	122857		tp2	
insCD6		4498272	4499500	IS2 element transposase InsAB'	insD6 // insC6 // insCD6	b4273 // b4272
ppa	b4226	4449122	4449652	inorganic pyrophosphatase	ppa	b4226
ybdN	b0602	635349	636569	putative PAPS reductase/DUF3440 domain-containing protein YbdN	ybdN	b0602
yjfP	b4190	4416952	4417701	carboxylesterase	yjfP	b4190
gph	b3385	3513631	3514389	phosphoglycolate phosphatase	aroB // aroK // damX // gph // rpe // dam // trpS	b3389 // b3390 // b3388 // b3385 // b3386 // b3387 // b3384
b0701	b0701	733370	733591			
insEF1		315291	316453	IS3 element transposase	insF1 // insE1 // insEF1 // eaeH	b0299 // b0298 // b0297
gpsA	b3608	3782642	3783661	glycerol-3-phosphate dehydrogenase	yibN // secB // gpsA // grxC	b3611 // b3609 // b3608 // b3610
ybgE	b0735	774309	774602	PF09600 family protein YbgE	ybgE // cydX	b0735 // b4515
yidA	b3697	3876140	3876952	sugar phosphatase YidA	yidA	b3697
recR	b0472	494405	495010	DNA repair protein RecR	recR // ybaB	b0472 // b0471
b1367	b1367	1426055	1426288			
insH8	b2192	2289065	2290045	IS<i>5</i> transposase and trans-activator	insH8	b2192
pstS	b3728	3910485	3911525	phosphate ABC transporter periplasmic binding protein	pstS // pstA // pstC // phoU // pstB	b3728 // b3726 // b3727 // b3724 // b3725
yadE	b0130	145081	146310	putative polysaccharide deacetylase lipoprotein YadE	yadE	b0130
yhfX	b3381	3509813	3510976	putative PLP-binding protein YhfX	yhfX // yhfW // php // yhfU // yhfT // yhfS	b3381 // b3380 // b3379 // b3378 // b3377 // b3376
ligA	b2411	2528161	2530176	DNA ligase	ligA // ypeB	b2411 // b4546
tisA	b4617	3853443	3853556			
insF4	b1026	1094275	1095141	IS3 element protein InsF	insE4 // insF4 // insEF4	b1027 // b1026
ppk	b2501	2623044	2625110	polyphosphate kinase	ppx // ppk	b2502 // b2501
yqeJ	b2848	2989304	2989786	protein YqeJ	yqeJ // yqeI	b2848 // b2847
nlpC	b1708	1792267	1792731	NlpC/P60 family lipoprotein NlpC	nlpC	b1708
dinD	b3645	3817760	3818584	DNA damage-inducible protein D	dinD	b3645
G0-10705		4058171	4058242			
insA3	b0275	291071	291346	IS1 protein InsA	insA3 // insB3 // insAB3	b0275 // b0274
phoA	b0383	401747	403162	alkaline phosphatase	phoA // psiF	b0383 // b0384
yoaF	b1793	1877278	1877532	DUF333 domain-containing lipoprotein YoaF	yoaF	b1793
yraJ	b3144	3288814	3291330	putative fimbrial usher protein YraJ	yraK // yraJ // yraI	b3145 // b3144 // b3143
dam	b3387	3515077	3515913	DNA adenine methyltransferase	aroB // aroK // damX // dam // gph // rpe // trpS	b3389 // b3390 // b3388 // b3387 // b3385 // b3386 // b3384
b4247	b4247	4472513	4472845			
insCD3		2068952	2070180	IS2 element transposase InsAB'	insC3 // insD3 // insCD3	b1997 // b1996
phnJ	b4098	4318761	4319606	carbon-phosphorus lyase core complex subunit PhnJ	phnK // phnJ // phnI // phnH // phnG // phnF // phnE // phnD // phnC // phnP // phnO // phnN // phnM // phnL	b4097 // b4098 // b4099 // b4100 // b4101 // b4102 // b4583 // b4105 // b4106 // b4092 // b4093 // b4094 // b4095 // b4096
yciU	b1248	1306821	1307150	DUF440 domain-containing protein YciU	yciU // clsA	b1248 // b1249
pspE	b1308	1369689	1370003	thiosulfate sulfurtransferase PspE	pspA // pspB // pspC // pspD // pspE	b1304 // b1305 // b1306 // b1307 // b1308
yoaA	b1808	1891325	1893235	putative ATP-dependent 5' to 3' DNA helicase	yoaA	b1808
b1052	b1052	1114211	1114309			
insC6	b4272	4498272	4498637	KpLE2 phage-like element; IS2 insertion element repressor InsA	insD6 // insC6 // insCD6	b4273 // b4272
phnG	b4101	4321244	4321696	carbon-phosphorus lyase core complex subunit PhnG	phnK // phnJ // phnI // phnH // phnG // phnF // phnE // phnD // phnC // phnP // phnO // phnN // phnM // phnL	b4097 // b4098 // b4099 // b4100 // b4101 // b4102 // b4583 // b4105 // b4106 // b4092 // b4093 // b4094 // b4095 // b4096
yahO	b0329	346484	346759	DUF1471 domain-containing protein YahO	yahO	b0329
yqgE	b2948	3092937	3093500	DUF179 domain-containing protein YqgE	yqgF // yqgE	b2949 // b2948
mutL	b4170	4397412	4399259	DNA mismatch repair protein MutL	amiB // tsaE // nnr // mutL // miaA // hflC // hflK // hflX // hfq	b4169 // b4168 // b4167 // b4170 // b4171 // b4175 // b4174 // b4173 // b4172
C0719		3121358	3121579		C0719	
insH7	b2030	2101895	2102875	IS<i>5</i> transposase and trans-activator	insH7	b2030
phoU	b3724	3906853	3907578	negative regulator of the <i>pho</i> regulon	phoU // pstB // pstA // pstC // pstS	b3724 // b3725 // b3726 // b3727 // b3728
yjjI	b4380	4615515	4617065	DUF3029 domain-containing protein YjjI	yjjI	b4380
ygcR	b2770	2895776	2896555	putative flavoprotein	ygcR // ygcQ	b2770 // b2769
vsr	b1960	2030448	2030918	DNA mismatch endonuclease Vsr	vsr // dcm	b1960 // b1961
G0-10702		3354064	3354169			
insB2	b0264	279178	279681	IS1 protein InsB	insA2 // insB2 // insAB2 // afuB // afuC	b0265 // b0264 // b0263 // b0262
phnN	b4094	4315525	4316082	ribose 1,5-bisphosphate phosphokinase	phnP // phnO // phnN // phnM // phnL // phnK // phnJ // phnI // phnH // phnG // phnF // phnE // phnD // phnC	b4092 // b4093 // b4094 // b4095 // b4096 // b4097 // b4098 // b4099 // b4100 // b4101 // b4102 // b4583 // b4105 // b4106
yedF	b1930	2009479	2009712	putative sulfurtransferase YedF	yedF // yedE	b1930 // b1929
ypfH	b2473	2593072	2593770	esterase YpfH	ypfH	b2473
recC	b2822	2959060	2962428	exodeoxyribonuclease V subunit RecC	ppdA // ppdB // ygdB // ppdC // recC	b2826 // b2825 // b2824 // b2823 // b2822
ryfB	b4607	2700059	2700377			
insAB6		3583483	3584180	InsAB' transposase	insB6 // insA6 // insAB6 // yrhA // yhhZ	b3445 // b3444 // b3443 // b3442
ugpB	b3453	3591009	3592325	<i>sn</i>-glycerol 3-phosphate ABC transporter periplasmic binding protein	ugpQ // ugpC // ugpE // ugpA // ugpB	b3449 // b3450 // b3451 // b3452 // b3453
yaaI	b0013	11382	11786	DUF2541 domain-containing protein YaaI	yaaI	b0013
pdeN	b2176	2270726	2272282	putative c-di-GMP phosphodiesterase PdeN	pdeN	b2176
nei	b0714	745935	746726	endonuclease VIII	pxpA // nei // pxpC // pxpB // ybgI	b0713 // b0714 // b0712 // b0711 // b0710
b3007	b3007	3151977	3152132			
insH11	b3505	3652182	3653162	IS<i>5</i> transposase and trans-activator	insH11	b3505
phnK	b4097	4318006	4318764	carbon-phosphorus lyase subunit PhnK	phnK // phnJ // phnI // phnH // phnG // phnF // phnE // phnD // phnC // phnP // phnO // phnN // phnM // phnL	b4097 // b4098 // b4099 // b4100 // b4101 // b4102 // b4583 // b4105 // b4106 // b4092 // b4093 // b4094 // b4095 // b4096
yfeY	b2432	2550641	2551216	DUF1131 domain-containing lipoprotein YfeY	yfeX // yfeY	b2431 // b2432
yoaB	b1809	1893367	1893711	RutC family protein YoaB	yoaB	b1809
ybaZ	b0454	475982	476371	DNA base-flipping protein	ybaZ	b0454
b0725	b0725	758464	758724			
insH6	b1994	2066305	2067285	CP4-44 prophage; IS<i>5</i> transposase and trans-activator	insH6	b1994
pstB	b3725	3907593	3908366	phosphate ABC transporter ATP binding subunit	phoU // pstB // pstA // pstC // pstS	b3724 // b3725 // b3726 // b3727 // b3728
ves	b1742	1824362	1824937	HutD family protein Ves	ves	b1742
ydhR	b1667	1746700	1747005	putative monooxygenase YdhR	ydhR	b1667
nfo	b2159	2250840	2251697	endonuclease IV	nfo	b2159
C0614		2653452	2653538		C0614	
rayT	b0228	247637	248134	REP-associated tyrosine transposase	rayT	b0228
phnH	b4100	4320663	4321247	carbon-phosphorus lyase core complex subunit PhnH	phnK // phnJ // phnI // phnH // phnG // phnF // phnE // phnD // phnC // phnP // phnO // phnN // phnM // phnL	b4097 // b4098 // b4099 // b4100 // b4101 // b4102 // b4583 // b4105 // b4106 // b4092 // b4093 // b4094 // b4095 // b4096
ymfA	b1122	1181264	1181725	putative inner membrane protein YmfA	ymfA // ycfZ	b1122 // b1121
mnaT	b1448	1518328	1518846	L-amino acid N-acyltransferase	mnaT // ydcZ	b1448 // b1447
ruvC	b1863	1946855	1947376	crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC	nudB // yebC // ruvC	b1865 // b1864 // b1863
istR-1		3853118	3853192			
insAB2		279178	279875	InsAB' transposase	insA2 // insB2 // insAB2 // afuB // afuC	b0265 // b0264 // b0263 // b0262
ssuA	b0936	995985	996944	aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic binding protein	ssuB // ssuC // ssuD // ssuA // ssuE	b0933 // b0934 // b0935 // b0936 // b0937
ytiA	b4715	4563668	4563925	uncharacterized protein YtiA		
ycfP	b1108	1165143	1165685	UPF0227 protein YcfP	ycfP // nagZ // thiK // lpoB // ycfL // hinT	b1108 // b1107 // b1106 // b1105 // b1104 // b1103
mutH	b2831	2969662	2970351	DNA mismatch repair protein MutH	mutH	b2831
b2651	b2651	2785221	2785352			
insH10	b3218	3365702	3366682	IS<i>5</i> transposase and trans-activator	insH10	b3218
pldA	b3821	4004862	4005731	outer membrane phospholipase A	pldA	b3821
yehM	b2120	2205695	2207974	uncharacterized protein YehM	yehQ // yehP // yehM // yehL	b2122 // b2121 // b2120 // b2119
ybjT	b0869	906852	908282	putative NAD(P)-dependent oxidoreductase YbjT	hcr // hcp // poxB // ltaE // ybjT	b0872 // b0873 // b0871 // b0870 // b0869
mfd	b1114	1170518	1173964	transcription-repair coupling factor	mfd	b1114
ykiB	b0370	389897	390115		ykiB	b0370
insI2	b1404	1469358	1470509	IS30 transposase	insI2	b1404
ppx	b2502	2625115	2626656	exopolyphosphatase	ppx // ppk	b2502 // b2501
yafD	b0209	231122	231922	endonuclease/exonuclease/phosphatase domain-containing protein YafD	yafE // yafD	b0210 // b0209
ybdM	b0601	634747	635376	ParB-like nuclease domain-containing protein YbdM	ybdM	b0601
recO	b2565	2701741	2702469	DNA repair protein RecO	recO // era // rnc // acpS // pdxJ	b2565 // b2566 // b2567 // b2563 // b2564
C0465		1972739	1972816		C0465	
insE3	b0540	566842	567141	DLP12 prophage; IS3 element protein InsE	insF3 // insE3 // insEF3	b0541 // b0540
phnP	b4092	4314344	4315102	5-phospho-&alpha;-D-ribosyl 1,2-cyclic phosphate phosphodiesterase	phnP // phnO // phnN // phnM // phnL // phnK // phnJ // phnI // phnH // phnG // phnF // phnE // phnD // phnC	b4092 // b4093 // b4094 // b4095 // b4096 // b4097 // b4098 // b4099 // b4100 // b4101 // b4102 // b4583 // b4105 // b4106
yjeN	b4157	4385393	4385707	uncharacterized protein YjeN	yjeO // yjeN	b4158 // b4157
yahG	b0321	338325	339743	DUF1116 domain-containing protein YahG	yahG // yahF // yahD // yahE	b0321 // b0320 // b0318 // b0319
mutM	b3635	3810343	3811152	DNA-formamidopyrimidine glycosylase	yicR // mutM // rpmG // rpmB	b3638 // b3635 // b3636 // b3637
ygiA	b3036	3179596	3179856			
insL1	b0016	15445	16557	IS186/IS421 transposase	insL1	b0016
gcvT	b2905	3049573	3050667	aminomethyltransferase	gcvH // gcvT // gcvP	b2904 // b2905 // b2903
yfcL	b2325	2443891	2444169	PF08891 family protein YfcL	prmB // aroC // mepA // yfcA // epmC // yfcL	b2330 // b2329 // b2328 // b2327 // b2326 // b2325
orzP		2204402	2204484	small RNA OrzP		
exoX	b1844	1926120	1926782	exonuclease X	exoX // yobB	b1844 // b1843
b2084	b2084	2167735	2168001			
insEF4		1094275	1095437	IS3 element transposase	insE4 // insF4 // insEF4	b1027 // b1026
tnaC	b3707	3888435	3888509	<i>tnaAB</i> operon leader peptide	tnaC // tnaA // tnaB	b3707 // b3708 // b3709
ydhW	b1672	1751077	1751724	uncharacterized protein YdhW	ydhY // ydhV // ydhW // ydhX // ydhU // ydhT	b1674 // b1673 // b1672 // b1671 // b1670 // b1669
3'ETS-<i>leuZ</i>	b4759	1991748	1991814	small regulatory RNA 3'ETS<sup><i>leuZ</i></sup>	3'ETS-<i>leuZ</i> // leuZ // cysT // glyW	b4759 // b1909 // b1910 // b1911
radA	b4389	4625912	4627294	DNA recombination protein	nadR // radA // serB	b4390 // b4389 // b4388
b0105	b0105	114407	114514			
insH9	b2982	3130214	3131194	IS<i>5</i> transposase and trans-activator	insH9	b2982
kbl	b3617	3791355	3792551	2-amino-3-ketobutyrate CoA ligase	tdh // kbl	b3616 // b3617
ycaP	b0906	956762	957454	DUF421 domain-containing protein YcaP	ycaP	b0906
ymjD	b4673	1390868	1390933	uncharacterized protein YmjD	ymjD // ycjY // ymjC // mpaA	b4673 // b1327 // b4525 // b1326
xthA	b1749	1832428	1833234	exodeoxyribonuclease III	xthA	b1749
C0067		238462	238586		C0067	
pinR	b1374	1433084	1433674	Rac prophage; putative site-specific recombinase	pinR	b1374
tdcG	b4471	3258285	3259649	L-serine deaminase III	tdcG // tdcF // tdcE // tdcD // tdcC // tdcB // tdcA	b4471 // b3113 // b3114 // b3115 // b3116 // b3117 // b3118
ydcH	b1426	1498651	1498875	protein YdcH	ydcH	b1426
ybaN	b0468	490882	491259	DUF454 domain-containing inner membrane protein YbaN	ybaN	b0468
ada	b2213	2309341	2310405	DNA-binding transcriptional dual regulator / DNA repair protein Ada	alkB // ada	b2212 // b2213
b1425	b1425	1498432	1498635			
insD1	b0361	381674	382579	IS2 element protein	insD1 // insC1 // insCD1	b0361 // b0360
dppD	b3541	3702865	3703848	dipeptide ABC transporter ATP binding subunit DppD	dppF // dppD // dppC // dppB // dppA	b3540 // b3541 // b3542 // b3543 // b3544
yijF	b3944	4137040	4137657	DUF1287 domain-containing protein YijF	yijF	b3944
yjtD	b4403	4640942	4641628	putative rRNA methyltransferase	yjtD	b4403
uvrC	b1913	1992874	1994706	excision nuclease subunit C	uvrY // uvrC	b1914 // b1913
ackB						
insB9	b4710	257923	258426	IS1 transposase B		
tdh	b3616	3790320	3791345	threonine dehydrogenase	tdh // kbl	b3616 // b3617
yigF	b3817	4002419	4002799	DUF2628 domain-containing protein YigF	yigG // yigF	b3818 // b3817
yejL	b2187	2284129	2284356	DUF1414 domain-containing protein YejL	yejM // yejL	b2188 // b2187
ung	b2580	2716754	2717443	uracil-DNA glycosylase	ung	b2580
sraF	b4448	3238374	3238561			
insEF5		2170236	2171398	IS3 element transposase	insF5 // insE5 // insEF5	b2089 // b2088
dsdA	b2366	2479202	2480530	D-serine ammonia-lyase	dsdX // dsdA	b2365 // b2366
yrbL	b3207	3348452	3349084	protein kinase-like domain-containing protein YrbL	yrbL	b3207
yjaH	b4001	4200566	4201261	DUF1481 domain-containing protein YjaH	yjaH	b4001
nth	b1633	1711523	1712158	endonuclease III	nth // rsxE // rsxG // rsxD // rsxC // rsxB // rsxA // ydgK	b1633 // b1632 // b1631 // b1630 // b1629 // b1628 // b1627 // b1626
b4250	b4250	4474227	4474391			
insI3	b4284	4507466	4508617	KpLE2 phage-like element; IS30 transposase	insM // insI3	b4561 // b4284
astD	b1746	1828256	1829734	aldehyde dehydrogenase	astE // astB // astD // astA // astC	b1744 // b1745 // b1746 // b1747 // b1748
yfaP	b2225	2327367	2328143	DUF2135 domain-containing protein YfaP	yfaA // yfaT // yfaS // yfaQ // yfaP	b2230 // b2229 // b4500 // b2226 // b2225
yieH	b3715	3896774	3897439	6-phosphogluconate phosphatase	yieH	b3715
tag	b3549	3713092	3713655	3-methyl-adenine DNA glycosylase I, constitutive	yiaC // tag	b3550 // b3549
b1354	b1354	1419168	1419344			
insL3	b2394	2514331	2515443	putative IS186/IS421 transposase	insL3	b2394
sapF	b1290	1351828	1352634	putrescine ABC exporter ATP binding protein SapF	sapA // sapB // sapC // sapD // sapF	b1294 // b1293 // b1292 // b1291 // b1290
ynfC	b1585	1656747	1657457	UPF0257 family lipoprotein YnfC	ynfC	b1585
ydcC	b1460	1531816	1532952	H repeat-associated putative transposase YdcC	ydcC	b1460
mutS	b2733	2857093	2859654	DNA mismatch repair protein MutS	mutS	b2733
sroD		1888017	1888102		sroD // fadD	b1805
insE4	b1027	1095138	1095437	IS3 element protein InsE	insE4 // insF4 // insEF4	b1027 // b1026
aspC	b0928	984519	985709	aspartate aminotransferase	aspC	b0928
chiQ	b0682	709790	710116	lipoprotein ChiQ	chiP // chiQ	b0681 // b0682
msyB	b1051	1113807	1114181	acidic protein MsyB	msyB	b1051
recQ	b3822	4005864	4007693	ATP-dependent DNA helicase RecQ	recQ	b3822
G0-10703		3367613	3367770			
insE1	b0298	315291	315590	IS3 element protein InsE	insF1 // insE1 // insEF1 // eaeH	b0299 // b0298 // b0297
gcvP	b2903	3046168	3049041	glycine decarboxylase	gcvP // gcvH // gcvT	b2903 // b2904 // b2905
yacL	b0119	134388	134750	UPF0231 family protein YacL	yacL	b0119
yjfI	b4181	4410133	4410534	DUF2170 domain-containing protein YjfI	rlmB // rnr // nsrR // yjfJ // yjfI	b4180 // b4179 // b4178 // b4182 // b4181
yegP	b2080	2165189	2165521	DUF1508 domain-containing protein YegP	yegP	b2080
b3254	b3254	3404516	3404617			
insCD4		2996372	2997600	IS2 element transposase InsAB'	insC4 // insD4 // insCD4 // ygeO // ygeN	b2861 // b2860 // b2859 // b2858
ansA	b1767	1850860	1851876	L-asparaginase 1	pncA // ansA	b1768 // b1767
yihD	b3858	4042069	4042338	DUF1040 domain-containing protein YihD	yihD	b3858
yibA	b3594	3766337	3767179	putative lyase containing HEAT-repeat	yibA // rhsA	b3594 // b3593
xseB	b0422	441101	441343	exodeoxyribonuclease VII subunit XseB	dxs // ispA // xseB // yajO	b0420 // b0421 // b0422 // b0419
yliL	b0816	852671	852940			
rpnA	b3411	3543167	3544045	recombination-promoting nuclease RpnA	rpnA	b3411
sdaB	b2797	2929576	2930943	L-serine deaminase II	sdaC // sdaB	b2796 // b2797
ygdB	b2824	2962749	2963156	DUF2509 domain-containing protein YgdB	ppdA // ppdB // ygdB // ppdC // recC	b2826 // b2825 // b2824 // b2823 // b2822
yhfS	b3376	3504935	3506020	putative aminotransferase YhfS	yhfX // yhfW // php // yhfU // yhfT // yhfS	b3381 // b3380 // b3379 // b3378 // b3377 // b3376
recF	b3700	3880148	3881221	DNA repair protein RecF	dnaA // recF // dnaN	b3702 // b3700 // b3701
IS128		2653515	2653723		IS128	
metB	b3939	4128672	4129832	<i>O</i>-succinylhomoserine(thiol)-lyase / <i>O</i>-succinylhomoserine lyase	metL // metB	b3940 // b3939
ytjA	b4568	4612128	4612289	DUF1328 domain-containing protein YtjA	ytjA	b4568
yciB	b1254	1312351	1312890	inner membrane protein	yciC // yciB	b1255 // b1254
alkB	b2212	2308691	2309341	DNA oxidative demethylase	alkB // ada	b2212 // b2213
G0-10698		1670949	1671136			
dppF	b3540	3701864	3702868	dipeptide ABC transporter ATP binding subunit DppF	dppF // dppD // dppC // dppB // dppA	b3540 // b3541 // b3542 // b3543 // b3544
yheV	b4551	3478592	3478792	DUF2387 domain-containing protein YheV	kefG // kefB // yheV	b3351 // b3350 // b4551
yqjF	b3101	3250562	3250954	DoxX family protein	yqjF	b3101
alkA	b2068	2146692	2147540	DNA-3-methyladenine glycosylase 2	alkA	b2068
ybfK	b4590	720583	720840			
dadA	b1189	1237571	1238869	D-amino acid dehydrogenase	dadX // dadA	b1190 // b1189
yehK	b4541	2203972	2204289	uncharacterized protein YehK	yehK	b4541
fic	b3361	3490861	3491463	putative adenosine monophosphate&mdash;protein transferase Fic	fic // yhfG // pabA	b3361 // b3362 // b3360
recB	b2820	2952461	2956003	exodeoxyribonuclease V subunit RecB	recB // recD // ptrA	b2820 // b2819 // b2821
b2653	b2653	2785800	2785973			
livF	b3454	3592724	3593437	branched chain amino acid/phenylalanine ABC transporter ATP binding subunit LivF	livF // livG // livM // livH // livK	b3454 // b3455 // b3456 // b3457 // b3458
yniD	b4535	1805165	1805272	uncharacterized protein YniD	yniD	b4535
ssnA	b2879	3019161	3020489	putative aminohydrolase SsnA	ssnA // ygfK	b2879 // b2878
phr	b0708	739507	740925	deoxyribodipyrimidine photolyase	ybgA // phr	b0707 // b0708
b0538	b0538	565972	566532			
tdcE	b3114	3260124	3262418	activated 2-ketobutyrate formate-lyase / pyruvate formate-lyase 4 // 2-ketobutyrate formate-lyase/pyruvate formate-lyase 4	tdcG // tdcF // tdcE // tdcD // tdcC // tdcB // tdcA	b4471 // b3113 // b3114 // b3115 // b3116 // b3117 // b3118
yjbT	b4620	4239777	4240055	PF17089 family protein YjbT		
ygcN	b2766	2892657	2893928	putative oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain	ygcP // ygcO // ygcN	b2768 // b2767 // b2766
mug	b3068	3214967	3215473	stationary phase mismatch/uracil DNA glycosylase	mug	b3068
isrB	b4434	1987839	1987998		isrB	b4434
tnaA	b3708	3888730	3890145	tryptophanase	tnaA // tnaB // tnaC	b3708 // b3709 // b3707
ysaB	b4553	3725413	3725712	putative lipoprotein YsaB	ysaB	b4553
yfeK	b2419	2537342	2537716	DUF5329 domain-containing protein YfeK	yfeS // yfeK	b2420 // b2419
pepE	b4021	4229453	4230142	peptidase E	pepE	b4021
yzfA	b4223	4447976	4448245		yzfA	b4223
gcvH	b2904	3049160	3049549	lipoyl-GcvH-protein // glycine cleavage system H protein	gcvH // gcvT // gcvP	b2904 // b2905 // b2903
yohO	b4542	2215657	2215764	UPF0387 family protein YohO	yohO	b4542
yeeN	b1983	2056858	2057574	putative transcriptional regulator YeeN	yeeN	b1983
pepQ	b3847	4031161	4032492	Xaa-Pro dipeptidase	hemG // trkH // yigZ // pepQ	b3850 // b3849 // b3848 // b3847
b2191	b2191	2288905	2289027			
astA	b1747	1829731	1830765	arginine N-succinyltransferase	astE // astB // astD // astA // astC	b1744 // b1745 // b1746 // b1747 // b1748
yobH	b4536	1908925	1909164	uncharacterized protein YobH	yobH	b4536
yeaR	b1797	1879589	1879948	DUF1971 domain-containing protein YeaR	yeaR // yoaG	b1797 // b1796
pepD	b0237	254259	255716	peptidase D	pepD	b0237
b0165	b0165	184987	185118			
amiC	b2817	2947757	2949010	<i>N</i>-acetylmuramoyl-L-alanine amidase C	amiC	b2817
lhgD	b2660	2789982	2791250	L-2-hydroxyglutarate dehydrogenase	lhgD // glaH // gabP // gabT // gabD	b2660 // b2659 // b2663 // b2662 // b2661
yicS	b4555	3840215	3840508	uncharacterized protein YicS	yicS	b4555
ydhJ	b1644	1721264	1722121	putative membrane fusion protein YdhJ	ydhK // ydhJ // ydhI	b1645 // b1644 // b1643
degQ	b3234	3380743	3382110	periplasmic serine endoprotease	degS // degQ	b3235 // b3234
C0299		1230629	1230707		C0299	
murI	b3967	4165428	4166285	glutamate racemase	murI // btuB	b3967 // b3966
tdcB	b3117	3265039	3266028	catabolic threonine dehydratase	tdcG // tdcF // tdcE // tdcD // tdcC // tdcB // tdcA	b4471 // b3113 // b3114 // b3115 // b3116 // b3117 // b3118
ypeB	b4546	2527941	2528159	PF12843 family protein YpeB	ligA // ypeB	b2411 // b4546
ynbB	b1409	1478226	1479122	putative CDP-diglyceride synthase	ynbD // ynbC // ynbB // ynbA	b1411 // b1410 // b1409 // b1408
degP	b0161	180884	182308	periplasmic serine endoprotease DegP	degP	b0161
ddlA	b0381	399829	400923	D-alanine&mdash;D-alanine ligase A	ddlA	b0381
astE	b1744	1825955	1826923	succinylglutamate desuccinylase	astE // astB // astD // astA // astC	b1744 // b1745 // b1746 // b1747 // b1748
yecJ	b4537	1987507	1987758	DUF2766 domain-containing protein YecJ	yecJ	b4537
ycdZ	b1036	1100296	1100787	inner membrane protein YcdZ	ycdZ	b1036
ddpX	b1488	1562495	1563076	D-alanyl-D-alanine dipeptidase	ddpF // ddpD // ddpC // ddpB // ddpA // ddpX	b1483 // b1484 // b1485 // b1486 // b1487 // b1488
mpaA	b1326	1389870	1390598	murein tripeptide amidase A	ymjD // ycjY // ymjC // mpaA	b4673 // b1327 // b4525 // b1326
sdaA	b1814	1896932	1898296	L-serine deaminase I	sdaA	b1814
ydbJ	b4529	1441058	1441324	DUF333 domain-containing protein YdbJ	ydbJ	b4529
pdeI	b0833	872979	875327	putative c-di-GMP phosphodiesterase PdeI	dgcI // pdeI	b0834 // b0833
clpP	b0437	456677	457300	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit	clpP // lon // clpX	b0437 // b0439 // b0438
bolA	b0435	454472	454789	DNA binding transcriptional dual regulator BolA-phosphate // DNA-binding transcriptional dual regulator BolA	bolA	b0435
ansB	b2957	3099682	3100728	L-asparaginase 2	ansB	b2957
bcsC	b3530	3685700	3689173	cellulose synthase outer membrane channel	bcsC // bcsA // bcsZ // bcsB	b3530 // b3533 // b3531 // b3532
sfmD	b0532	559697	562300	putative fimbrial usher protein SfmD	sfmD // sfmC	b0532 // b0531
sppA	b1766	1848837	1850693	protease IV, a signal peptide peptidase	sppA	b1766
mpl	b4233	4455785	4457158	UDP-<i>N</i>-acetylmuramate&mdash;L-alanyl-&gamma;-D-glutamyl-<i>meso</i>-2,6-diaminoheptanedioate ligase	mpl	b4233
sapA	b1294	1355467	1357110	putative periplasmic binding protein SapA	sapA // sapB // sapC // sapD // sapF	b1294 // b1293 // b1292 // b1291 // b1290
eutM	b2457	2572157	2572450	putative ethanolamine catabolic microcompartment shell protein EutM	eutS // eutP // eutQ // eutT // eutD // eutM	b2462 // b2461 // b2460 // b2459 // b2458 // b2457
yafY	b0251	266110	266553	CP4-6 prophage; inner membrane lipoprotein YafY	yafY // ykfI // yafW // ykfH // ykfG // yafX // ykfF // ykfB	b0251 // b0245 // b0246 // b4504 // b0247 // b0248 // b0249 // b0250
rssB	b1235	1290242	1291255	RssB-P // regulator of RpoS	rssA // rssB	b1234 // b1235
murD	b0088	97087	98403	UDP-<i>N</i>-acetylmuramoyl-L-alanine&mdash;D-glutamate ligase	mraZ // rsmH // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL // lpxC	b0081 // b0082 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083 // b0096
dadX	b1190	1238879	1239949	alanine racemase 2	dadX // dadA	b1190 // b1189
ecpD	b0290	305174	306817	fimbrial adhesin EcpD	ecpB // ecpC // ecpD // ecpE	b0292 // b0291 // b0290 // b0289
naRNA4		4326005	4326081	naRNA4		
prc	b1830	1912768	1914816	tail-specific protease	proQ // prc	b1831 // b1830
mrcB	b0149	164730	167264	PBP1B&gamma; // peptidoglycan glycosyltransferase / peptidoglycan DD-transpeptidase MrcB	mrcB	b0149
livG	b3455	3593439	3594206	branched chain amino acid/phenylalanine ABC transporter ATP binding subunit LivG	livF // livG // livM // livH // livK	b3454 // b3455 // b3456 // b3457 // b3458
eutS	b2462	2575470	2575805	putative ethanolamine catabolic microcompartment shell protein EutS	eutS // eutP // eutQ // eutT // eutD // eutM	b2462 // b2461 // b2460 // b2459 // b2458 // b2457
nc1		297137	297304	small noncoding RNA involved in nucleoid organization		
smpB	b2620	2754896	2755378	SsrA-binding protein	smpB	b2620
mtgA	b3208	3349081	3349809	peptidoglycan glycosyltransferase MtgA	elbB // mtgA	b3209 // b3208
glyA	b2551	2684254	2685507	serine hydroxymethyltransferase	glyA	b2551
mcbA	b0806	841796	842056	DUF1471 domain-containing protein McbA	mcbA	b0806
ydgU	b4601	1671777	1671860	uncharacterized protein YdgU		
pepN	b0932	990622	993234	aminopeptidase N	pepN	b0932
murB	b3972	4172057	4173085	UDP-<i>N</i>-acetylenolpyruvoylglucosamine reductase	birA // murB	b3973 // b3972
glaH	b2659	2788985	2789962	glutarate hydroxylase GlaH	lhgD // glaH // gabP // gabT // gabD	b2660 // b2659 // b2663 // b2662 // b2661
htrE	b0139	152829	155426	putative fimbrial usher protein HtrE	htrE // yadV	b0139 // b0140
yggN	b2958	3100904	3101623	DUF2884 domain-containing protein YggN	yggN	b2958
iadA	b4328	4558354	4559526	isoaspartyl dipeptidase	yjiH // yjiG // iadA	b4330 // b4329 // b4328
ddlB	b0092	102233	103153	D-alanine&mdash;D-alanine ligase B	mraZ // rsmH // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL // lpxC	b0081 // b0082 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083 // b0096
iaaA	b0828	866568	867533	&beta; cleavage product of IaaA // &alpha; cleavage product of IaaA // isoaspartyl dipeptidase proenzyme	gsiD // gsiC // gsiB // gsiA // iaaA	b0832 // b0831 // b0830 // b0829 // b0828
lpxT	b2174	2268854	2269567	Kdo<sub>2</sub>-lipid A phosphotransferase	lpxT // yeiR	b2174 // b2173
yiaL	b3576	3743743	3744210	DUF386 domain-containing protein YiaL	yiaM // sgbE // sgbU // sgbH // lyxK // yiaO // yiaN // yiaL // yiaK	b3577 // b3583 // b3582 // b3581 // b3580 // b3579 // b3578 // b3576 // b3575
pepT	b1127	1185844	1187070	peptidase T	pepT	b1127
mipA	b1782	1865726	1866472	MltA-interacting protein	mipA	b1782
astB	b1745	1826916	1828259	<i>N</i>-succinylarginine dihydrolase	astE // astB // astD // astA // astC	b1744 // b1745 // b1746 // b1747 // b1748
yehS	b2124	2211726	2212196	DUF1456 domain-containing protein YehS	yehS	b2124
tsaB	b1807	1890572	1891267	N<sup>6</sup>-L-threonylcarbamoyladenine synthase, TsaB subunit	tsaB // yeaY	b1807 // b1806
mrcA	b3396	3522871	3525423	peptidoglycan glycosyltransferase / peptidoglycan DD-transpeptidase MrcA	mrcA	b3396
sapD	b1291	1352636	1353628	putrescine ABC exporter ATP binding protein SapD	sapA // sapB // sapC // sapD // sapF	b1294 // b1293 // b1292 // b1291 // b1290
yiiQ	b3920	4111615	4112214	DUF1454 domain-containing protein YiiQ	yiiQ	b3920
clpS	b0881	922913	923233	specificity factor for ClpA-ClpP chaperone-protease complex	clpS	b0881
dacB	b3182	3328963	3330396	peptidoglycan DD-endopeptidase DacB	dacB	b3182
speF	b0693	718262	720460	inducible ornithine decarboxylase	speFL // potE // speF	b4803 // b0692 // b0693
yidR	b3689	3868062	3869309	DUF3748 domain-containing galacturonate catabolism protein YidR	yidR	b3689
ptrB	b1845	1926779	1928839	oligopeptidase B	ptrB	b1845
murE	b0085	93166	94653	UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--2,6-diaminopimelate ligase	mraZ // rsmH // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL // lpxC	b0081 // b0082 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083 // b0096
asnB	b0674	697513	699177	asparagine synthetase B	asnB	b0674
ycgB	b1188	1235709	1237241	PF04293 family protein YcgB	ycgB	b1188
pepB	b2523	2655075	2656358	aminopeptidase B	pepB	b2523
ampC	b4150	4377811	4378944	&beta;-lactamase	ampC	b4150
eutE	b2455	2570348	2571751	acetaldehyde dehydrogenase (acetylating) EutE	eutN // eutE // eutJ // eutG	b2456 // b2455 // b2454 // b2453
lolB	b1209	1262877	1263500	outer membrane lipoprotein LolB	ispE // lolB // prs	b1208 // b1209 // b1207
ptrA	b2821	2955996	2958884	protease 3	recB // recD // ptrA	b2820 // b2819 // b2821
pbpG	b2134	2223938	2224870	peptidoglycan DD-endopeptidase PbpG	pbpG	b2134
eutB	b2441	2557318	2558679	ethanolamine ammonia-lyase subunit &alpha;	eutB // eutC // eutL // eutK // eutR	b2441 // b2440 // b2439 // b2438 // b2437
blc	b4149	4377189	4377722	outer membrane lipoprotein Blc	blc	b4149
pepP	b2908	3053515	3054840	Xaa-Pro aminopeptidase	ygfB // pepP // ubiH // ubiI	b2909 // b2908 // b2907 // b2906
mrdA	b0635	666316	668217	peptidoglycan DD-transpeptidase MrdA	rsfS // rlmH // mrdA // mrdB // rlpA	b0637 // b0636 // b0635 // b0634 // b0633
tauD	b0368	387795	388646	taurine dioxygenase	tauD // tauC // tauB // tauA	b0368 // b0367 // b0366 // b0365
yhaC	b3121	3268415	3269602	uncharacterized protein YhaC	yhaC // yhaB	b3121 // b3120
degS	b3235	3382200	3383267	serine endoprotease	degS // degQ	b3235 // b3234
mepA	b2328	2445560	2446384	peptidoglycan DD-endopeptidase/peptidoglycan LD-endopeptidase	prmB // aroC // mepA // yfcA // epmC // yfcL	b2330 // b2329 // b2328 // b2327 // b2326 // b2325
potG	b0855	894991	896124	putrescine ABC transporter ATP binding subunit	potF // potG // potH // potI	b0854 // b0855 // b0856 // b0857
argL	b4766	290275	290370	putative translational regulatory protein ArgL		
yrdA	b3279	3429236	3429790	hexapeptide repeats-containing protein YrdA	yrdA	b3279
pepA	b4260	4484440	4485951	aminopeptidase A/I	pepA	b4260
murA	b3189	3335235	3336494	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	ibaG // murA	b3190 // b3189
eutK	b2438	2555228	2555728	putative structural protein, ethanolamine utilization microcompartment	eutB // eutC // eutL // eutK // eutR	b2441 // b2440 // b2439 // b2438 // b2437
chaB	b1217	1272119	1272349	putative cation transport regulator ChaB	chaB // chaC	b1217 // b1218
ybgC	b0736	774752	775156	esterase/thioesterase	ybgC // tolQ // tolR // tolA	b0736 // b0737 // b0738 // b0739
elaD	b2269	2382713	2383924	protease ElaD	elaD	b2269
ftsI	b0084	91413	93179	peptidoglycan DD-transpeptidase FtsI	mraZ // rsmH // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL // lpxC	b0081 // b0082 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083 // b0096
puuD	b1298	1361120	1361884	&gamma;-glutamyl-&gamma;-aminobutyrate hydrolase	puuR // puuD // puuE // puuB // puuC	b1299 // b1298 // b1302 // b1301 // b1300
rcsF	b0196	219591	219995	sensor lipoprotein RcsF	rcsF // trmO	b0196 // b0195
yqjC	b3097	3248969	3249337	DUF1090 domain-containing protein YqjC	yqjK // yqjE // yqjD // yqjC	b3100 // b3099 // b3098 // b3097
tatD	b4483	4023554	4024336	3' &rarr; 5' ssDNA/RNA  exonuclease TatD	tatC // tatB // tatA // tatD	b3839 // b3838 // b3836 // b4483
pbpC	b2519	2645013	2647325	peptidoglycan glycosyltransferase PbpC	yfhM // pbpC	b2520 // b2519
feaB	b1385	1447519	1449018	phenylacetaldehyde dehydrogenase	feaB	b1385
cnu	b1625	1704949	1705164	H-NS- and StpA-binding protein	cnu	b1625
yjiA	b4352	4587909	4588865	P-loop guanosine triphosphatase YjiA	yjiX // yjiA	b4353 // b4352
dcp	b1538	1625335	1627380	peptidyl-dipeptidase Dcp	dcp	b1538
dapB	b0031	28374	29195	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate reductase	dapB	b0031
tauB	b0366	386207	386974	taurine ABC transporter ATP binding subunit	tauD // tauC // tauB // tauA	b0368 // b0367 // b0366 // b0365
purR	b1658	1737844	1738869	DNA-binding transcriptional repressor PurR	purR	b1658
ygaM	b2672	2800146	2800475	DUF883 domain-containing protein YgaM	ygaM	b2672
ycbZ	b0955	1016539	1018299	putative ATP-dependent protease YcbZ	ycbZ	b0955
ldcA	b1192	1242166	1243080	murein L,D-carboxypeptidase	ldcA	b1192
puuC	b1300	1362743	1364230	&gamma;-glutamyl-&gamma;-aminobutyraldehyde dehydrogenase	puuR // puuD // puuE // puuB // puuC	b1299 // b1298 // b1302 // b1301 // b1300
ycgR	b1194	1243793	1244527	flagellar brake protein YcgR	ycgR	b1194
yfcZ	b2343	2460650	2460934	DUF406 domain-containing protein YfcZ	yfcZ	b2343
aat	b0885	926728	927432	leucyl/phenylalanyl-tRNA&mdash;protein transferase	aat	b0885
murF	b0086	94650	96008	D-alanyl-D-alanine-adding enzyme	mraZ // rsmH // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL // lpxC	b0081 // b0082 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083 // b0096
eutT	b2459	2573502	2574305	putative ethanolamine utilization cobalamin adenosyltransferase	eutS // eutP // eutQ // eutT // eutD // eutM	b2462 // b2461 // b2460 // b2459 // b2458 // b2457
baxL	b4794	3737177	3737203	putative translational regulatory protein BaxL		
yedP	b1955	2025511	2026326	putative mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase	yedP	b1955
rseP	b0176	196546	197898	intramembrane zinc metalloprotease RseP	rseP	b0176
ampD	b0110	118733	119284	1,6-anhydro-<i>N</i>-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	ampD // ampE	b0110 // b0111
eutC	b2440	2556410	2557297	ethanolamine ammonia-lyase subunit &beta;	eutB // eutC // eutL // eutK // eutR	b2441 // b2440 // b2439 // b2438 // b2437
rseX	b4603	2033649	2033739	small regulatory RNA RseX	rseX	b4603
yeaH	b1784	1868955	1870238	DUF444 domain-containing protein YeaH	yeaH // yeaG	b1784 // b1783
glrK	b2556	2689671	2691098	GlrK-<i>N</i>-phospho-L-histidine // histidine kinase GlrK	glrK	b2556
murC	b0091	100765	102240	UDP-<i>N</i>-acetylmuramate&mdash;L-alanine ligase	mraZ // rsmH // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL // lpxC	b0081 // b0082 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083 // b0096
eutG	b2453	2568324	2569511	putative alcohol dehydrogenase EutG	eutN // eutE // eutJ // eutG	b2456 // b2455 // b2454 // b2453
bipA	b3871	4058407	4060230	50S ribosomal subunit assembly factor BipA	bipA	b3871
uidC	b1615	1691586	1692851	outer membrane porin family protein UidC	uidC // uidB // uidA	b1615 // b1616 // b1617
iap	b2753	2876581	2877618	alkaline phosphatase isozyme conversion protein	iap	b2753
amiA	b2435	2552352	2553221	<i>N</i>-acetylmuramoyl-L-alanine amidase A	amiA // hemF	b2435 // b2436
caiE	b0035	34781	35371	putative transferase CaiE	caiE // caiD // caiC // caiB // caiA // caiT	b0035 // b0036 // b0037 // b0038 // b0039 // b0040
pdeL	b0315	332371	333459	DNA-binding transcriptional activator/c-di-GMP phosphodiesterase PdeL	pdeL	b0315
ycjS	b1315	1376832	1377887	D-glucoside 3-dehydrogenase	ymjB // ycjV // ycjU // ycjT // ycjS // ycjR // ycjQ // ycjP // ycjO // ycjN // ycjM // ompG	b4524 // b1318 // b1317 // b1316 // b1315 // b1314 // b1313 // b1312 // b1311 // b1310 // b1309 // b1319
epmC	b2326	2444203	2444751	EF-P-Lys34 hydroxylase	prmB // aroC // mepA // yfcA // epmC // yfcL	b2330 // b2329 // b2328 // b2327 // b2326 // b2325
amiB	b4169	4396065	4397402	<i>N</i>-acetylmuramoyl-L-alanine amidase B	amiB // tsaE // nnr // mutL // miaA // hflC // hflK // hflX // hfq	b4169 // b4168 // b4167 // b4170 // b4171 // b4175 // b4174 // b4173 // b4172
eutL	b2439	2555741	2556400	putative structural protein, ethanolamine utilization microcompartment	eutB // eutC // eutL // eutK // eutR	b2441 // b2440 // b2439 // b2438 // b2437
dosC	b1490	1565758	1567140	diguanylate cyclase DosC	dosP // dosC	b1489 // b1490
gfcB	b0986	1048688	1049332	lipoprotein GfcB	gfcB // gfcC // gfcD	b0986 // b0985 // b0984
cusS	b0570	593328	594770	CusS-<i>N</i>-phospho-L-histidine // sensor histidine kinase CusS	cusS // cusR	b0570 // b0571
rrsC	b3756	3941808	3943349	16S ribosomal RNA	rrfC // rrlC // gltU // rrsC	b3759 // b3758 // b3757 // b3756
puuB	b1301	1364232	1365512	&gamma;-glutamylputrescine oxidase	puuR // puuD // puuE // puuB // puuC	b1299 // b1298 // b1302 // b1301 // b1300
speFL	b4803	720718	720822	leader peptide SpeFL	speFL // potE // speF	b4803 // b0692 // b0693
ybiT	b0820	855963	857555	putative ATP-binding protein YbiT	ybiT	b0820
yjaB	b4012	4213680	4214123	peptidyl-lysine <i>N</i>-acetyltransferase YjaB	yjaB	b4012
rrfA	b3855	4040517	4040636	5S ribosomal RNA	alaT // ileT // rrsA // rrfA // rrlA	b3853 // b3852 // b3851 // b3855 // b3854
caiC	b0037	36271	37824	carnitine&mdash;CoA ligase	caiE // caiD // caiC // caiB // caiA // caiT	b0035 // b0036 // b0037 // b0038 // b0039 // b0040
yoaL	b4751	1901573	1901731	protein YoaL		
ybbO	b0493	518340	519149	NADP<sup>+</sup>-dependent aldehyde reductase YbbO	ybbO // tesA	b0493 // b0494
hyaD	b0975	1035770	1036357	putative hydrogenase 1 maturation protease HyaD	hyaA // hyaB // hyaC // hyaD // hyaE // hyaF	b0972 // b0973 // b0974 // b0975 // b0976 // b0977
rpsQ	b3311	3448314	3448568	30S ribosomal subunit protein S17	rpsQ // rpmC // rplP // rpsC // rplV // rpsS // rplB // rplW // rplD // rplC // rpsJ	b3311 // b3312 // b3313 // b3314 // b3315 // b3316 // b3317 // b3318 // b3319 // b3320 // b3321
puuE	b1302	1365550	1366815	4-aminobutyrate aminotransferase PuuE	puuR // puuD // puuE // puuB // puuC	b1299 // b1298 // b1302 // b1301 // b1300
pdeH	b3525	3678420	3679187	c-di-GMP phosphodiesterase PdeH	pdeH	b3525
yaeQ	b0190	214291	214836	uncharacterized protein YaeQ	nlpE // arfB // yaeQ	b0192 // b0191 // b0190
wzc	b2060	2133490	2135652	protein-tyrosine kinase Wzc	wcaB // wcaA // wzc // wzb // wza	b2058 // b2059 // b2060 // b2061 // b2062
rpsA	b0911	961995	963668	30S ribosomal subunit protein S1	cmk // rpsA // ihfB	b0910 // b0911 // b0912
eutQ	b2460	2574302	2575003	putative ethanolamine utilization acetate kinase EutQ	eutS // eutP // eutQ // eutT // eutD // eutM	b2462 // b2461 // b2460 // b2459 // b2458 // b2457
thrL	b0001	190	255	<i>thr</i> operon leader peptide	thrL // thrA // thrB // thrC	b0001 // b0002 // b0003 // b0004
naRNA1		4326305	4326381	naRNA1		
prmB	b2330	2447508	2448440	50S ribosomal subunit protein L3 <i>N</i><sup>5</sup>-glutamine methyltransferase	prmB // aroC // mepA // yfcA // epmC // yfcL	b2330 // b2329 // b2328 // b2327 // b2326 // b2325
rplP	b3313	3448759	3449169	50S ribosomal subunit protein L16	rpsQ // rpmC // rplP // rpsC // rplV // rpsS // rplB // rplW // rplD // rplC // rpsJ	b3311 // b3312 // b3313 // b3314 // b3315 // b3316 // b3317 // b3318 // b3319 // b3320 // b3321
tynA	b1386	1449076	1451349	copper-containing amine oxidase	tynA	b1386
lsrF	b1517	1606100	1606975	3-hydroxy-2,4-pentadione 5-phosphate thiolase	lsrG // lsrF // lsrB // lsrD // lsrC // lsrA // tam	b1518 // b1517 // b1516 // b1515 // b1514 // b1513 // b1519
pmrR	b4703	4332116	4332205	putative bitopic inner membrane protein		
rimL	b1427	1498938	1499477	ribosomal-protein-L12-serine <i>N</i>-acetyltransferase	rimL	b1427
deaD	b3162	3305971	3307860	ATP-dependent RNA helicase DeaD	deaD // yrbN	b3162 // b4685
potF	b0854	893784	894896	putrescine ABC transporter periplasmic binding protein	potF // potG // potH // potI	b0854 // b0855 // b0856 // b0857
yjdM	b4108	4326399	4326734	zinc ribbon domain-containing protein YjdM	yjdM	b4108
yidD	b4557	3884816	3885073	membrane protein insertion efficiency factor		
yjjW	b4379	4614680	4615543	putative glycyl-radical enzyme activating enzyme YjjW	yjjW	b4379
rrlH	b0204	225759	228662	23S ribosomal RNA	alaV // ileV // rrsH // rrfH // rrlH	b0203 // b0202 // b0201 // b0205 // b0204
potD	b1123	1181783	1182829	spermidine preferential ABC transporter periplasmic binding protein	potD // potC // potB // potA	b1123 // b1124 // b1125 // b1126
hspQ	b0966	1028404	1028721	heat shock protein HspQ	hspQ	b0966
nudK	b2467	2582903	2583478	GDP-mannose hydrolase	nudK	b2467
yeaG	b1783	1866908	1868842	protein kinase YeaG	yeaH // yeaG	b1784 // b1783
yggL	b2959	3101807	3102133	putative ribosome assembly factor YggL	trmB // yggL	b2960 // b2959
puuA	b1297	1359490	1360908	glutamate-putrescine ligase	puuA // ymjE // puuP	b1297 // b4742 // b1296
bcsE	b3536	3696458	3698029	c-di-GMP-binding protein BcsE	bcsG // bcsF // bcsE	b3538 // b3537 // b3536
yfaE	b2236	2348514	2348768	ferredoxin-like diferric-tyrosyl radical cofactor maintenance protein YfaE	nrdA // nrdB // yfaE	b2234 // b2235 // b2236
rpsN	b3307	3446579	3446884	30S ribosomal subunit protein S14	rpmJ // secY // rplO // rpmD // rpsE // rplR // rplF // rpsH // rpsN // rplE // rplX // rplN	b3299 // b3300 // b3301 // b3302 // b3303 // b3304 // b3305 // b3306 // b3307 // b3308 // b3309 // b3310
potA	b1126	1184458	1185594	spermidine preferential ABC transporter ATP binding subunit	potD // potC // potB // potA	b1123 // b1124 // b1125 // b1126
yhdN	b3293	3439141	3439509	DUF1992 domain-containing protein YhdN	yhdN // zntR	b3293 // b3292
hypF	b2712	2835173	2837425	carbamoyl--[HypE] ligase	hydN // hypF	b2713 // b2712
rpmF	b1089	1147367	1147540	50S ribosomal subunit protein L32	rpmF // yceD // fabF // acpP // fabG // fabD // fabH // plsX	b1089 // b1088 // b1095 // b1094 // b1093 // b1092 // b1091 // b1090
eutP	b2461	2574978	2575457	putative ethanolamine utilization acetate kinase EutP	eutS // eutP // eutQ // eutT // eutD // eutM	b2462 // b2461 // b2460 // b2459 // b2458 // b2457
yihY	b3886	4076146	4077018	PF03631 family membrane protein YihY	fabY // dtd // yihY // yihX	b3888 // b3887 // b3886 // b3885
rimI	b4373	4608185	4608631	protein <i>N</i>-acetyltransferase RimI	yjjG // rimI // holD	b4374 // b4373 // b4372
rplM	b3231	3378223	3378651	50S ribosomal subunit protein L13	rplM // rpsI	b3231 // b3230
tauA	b0365	385232	386194	taurine ABC transporter periplasmic binding protein	tauD // tauC // tauB // tauA	b0368 // b0367 // b0366 // b0365
yicH	b3655	3830457	3832166	AsmA famly protein YicH	yicH	b3655
pphB	b2734	2859760	2860416	phosphoprotein phosphatase 2	pphB	b2734
der	b2511	2635884	2637356	50S ribosomal subunit stability factor	der // bamB	b2511 // b2512
ydjI	b1773	1856933	1857769	L-<i>glycero</i>-L-galacto-octuluronate-1-phosphate aldolase	ydjL // ydjK // ydjJ // ydjI // ydjH // ydjG	b1776 // b1775 // b1774 // b1773 // b1772 // b1771
rmuC	b3832	4017333	4018760	putative recombination limiting protein RmuC	rmuC	b3832
etp	b0982	1044230	1044676	phosphotyrosine-protein phosphatase Etp	gfcE // etp // etk	b0983 // b0982 // b0981
luxS	b2687	2814218	2814733	<i>S</i>-ribosylhomocysteine lyase	luxS	b2687
rrlD	b3275	3423880	3426783	23S ribosomal RNA	rrfF // thrV // rrfD // rrlD // alaU // ileU // rrsD	b3272 // b3273 // b3274 // b3275 // b3276 // b3277 // b3278
paaZ	b1387	1451597	1453642	fused 3-oxo-5,6-dehydrosuberyl-CoA semialdehyde dehydrogenase and oxepin-CoA hydrolase	paaZ	b1387
yjiX	b4353	4588876	4589079	PF04328 family protein YjiX	yjiX // yjiA	b4353 // b4352
def	b3287	3433690	3434199	peptide deformylase	def // fmt	b3287 // b3288
ygiS	b3020	3166111	3167718	putative deoxycholate binding periplasmic protein	ygiS	b3020
rpmI	b1717	1799802	1799999	50S ribosomal subunit protein L35	thrS // rpmI // infC // rplT // ihfA // pheM // pheT // pheS	b1719 // b1717 // b1718 // b1716 // b1712 // b1715 // b1713 // b1714
xylF	b3566	3731131	3732123	xylose ABC transporter periplasmic binding protein	xylF // xylG // xylH // xylR	b3566 // b3567 // b3568 // b3569
gspB	b3322	3453508	3453927	putative general secretion pathway protein B	gspB // gspA	b3322 // b3323
phnO	b4093	4315104	4315538	aminoalkylphosphonate <i>N</i>-acetyltransferase	phnP // phnO // phnN // phnM // phnL // phnK // phnJ // phnI // phnH // phnG // phnF // phnE // phnD // phnC	b4092 // b4093 // b4094 // b4095 // b4096 // b4097 // b4098 // b4099 // b4100 // b4101 // b4102 // b4583 // b4105 // b4106
ytfQ	b4227	4449962	4450918	galactofuranose ABC transporter periplasmic binding protein	yjfF // ytfT // ytfR // ytfQ	b4231 // b4230 // b4485 // b4227
rpsK	b3297	3441709	3442098	30S ribosomal subunit protein S11	rplQ // rpoA // rpsD // rpsK // rpsM	b3294 // b3295 // b3296 // b3297 // b3298
uxaA	b3091	3241827	3243314	D-altronate dehydratase	uxaA // uxaC	b3091 // b3092
yjdI	b4126	4351843	4352073	PF06902 family protein YjdI	yjdJ // yjdI	b4127 // b4126
patZ	b2584	2719953	2722613	peptidyl-lysine <i>N</i>-acetyltransferase	patZ // tapT	b2584 // b2583
znuA	b1857	1941651	1942583	Zn<sup>2+</sup> ABC transporter periplasmic binding protein	znuA	b1857
rpmC	b3312	3448568	3448759	50S ribosomal subunit protein L29	rpsQ // rpmC // rplP // rpsC // rplV // rpsS // rplB // rplW // rplD // rplC // rpsJ	b3311 // b3312 // b3313 // b3314 // b3315 // b3316 // b3317 // b3318 // b3319 // b3320 // b3321
alsE	b4085	4307783	4308478	D-allulose-6-phosphate 3-epimerase	alsE // alsC // alsA // alsB // alsR	b4085 // b4086 // b4087 // b4088 // b4089
ygaZ	b2682	2809617	2810354	L-valine exporter, YgaZ component	ygaH // ygaZ	b2683 // b2682
ygiB	b3037	3179744	3180415	DUF1190 domain-containing protein YgiB	ygiC // ygiB // tolC	b3038 // b3037 // b3035
ybiY	b0824	862612	863511	putative pyruvate formate-lyase activating enzyme YbiY	ybiY // ybiW	b0824 // b0823
btuF	b0158	177662	178462	vitamin B<sub>12</sub> ABC transporter periplasmic binding protein	mtn // btuF // yadS	b0159 // b0158 // b0157
rplJ	b3985	4179996	4180493	50S ribosomal subunit protein L10	rplA // rplK // rplJ // rplL // rpoC // rpoB	b3984 // b3983 // b3985 // b3986 // b3988 // b3987
yieL	b3719	3899408	3900577	putative hydrolase YieL	bglH // yieL // yieK	b3720 // b3719 // b3718
mlaD	b3193	3337910	3338461	intermembrane phospholipid transport system, substrate binding protein MlaD	mlaB // mlaC // mlaD // mlaE // mlaF	b3191 // b3192 // b3193 // b3194 // b3195
yhcO	b3239	3385857	3386129	putative barnase inhibitor	yhcO	b3239
srkA	b3859	4042415	4043401	stress response kinase A	srkA // dsbA	b3859 // b3860
phnD	b4105	4323336	4324352	phosphonate/phosphate ABC transporter periplasmic binding protein	phnK // phnJ // phnI // phnH // phnG // phnF // phnE // phnD // phnC // phnP // phnO // phnN // phnM // phnL	b4097 // b4098 // b4099 // b4100 // b4101 // b4102 // b4583 // b4105 // b4106 // b4092 // b4093 // b4094 // b4095 // b4096
rplU	b3186	3333140	3333451	50S ribosomal subunit protein L21	rpmA // rplU // yhbE // obgE	b3185 // b3186 // b3184 // b3183
mak	b0394	410144	411052	fructokinase	mak	b0394
letA	b1833	1916258	1917541	intermembrane transport protein LetA	letB // letA	b1834 // b1833
yajD	b0410	430605	430952	HNH nuclease family protein YajD	yajD	b0410
aceK	b4016	4218596	4220332	isocitrate dehydrogenase kinase/phosphatase	aceB // aceA // aceK	b4014 // b4015 // b4016
ddpA	b1487	1560931	1562481	putative D,D-dipeptide ABC transporter periplasmic binding protein	ddpF // ddpD // ddpC // ddpB // ddpA // ddpX	b1483 // b1484 // b1485 // b1486 // b1487 // b1488
rrlA	b3854	4037519	4040423	23S ribosomal RNA	alaT // ileT // rrsA // rrfA // rrlA	b3853 // b3852 // b3851 // b3855 // b3854
dgoD	b4478	3871850	3872998	D-galactonate dehydratase	dgoR // dgoK // dgoA // dgoD // dgoT	b4479 // b3693 // b4477 // b4478 // b3691
pqiC	b0952	1014896	1015459	intermembrane transport lipoprotein PqiC	pqiC // pqiB // pqiA	b0952 // b0951 // b0950
ygjH	b3074	3220915	3221247	putative tRNA-binding protein YgjH	ygjH	b3074
sixA	b2340	2456327	2456812	phosphohistidine phosphatase SixA	sixA	b2340
yejA	b2177	2272364	2274178	putative oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein YejA	yejF // yejE // yejB // yejA	b2180 // b2179 // b2178 // b2177
rimM	b2608	2745370	2745918	ribosome maturation factor RimM	rplS // trmD // rimM // rpsP	b2606 // b2607 // b2608 // b2609
frlC	b4474	3502340	3503170	fructoselysine 3-epimerase	frlD // frlC // frlB // frlA // frlR	b3374 // b4474 // b3371 // b3370 // b3375
nlpA	b3661	3839175	3839993	lipoprotein-28	nlpA	b3661
hyuA	b2873	3010028	3011413	phenylhydantoinase	hyuA	b2873
citX	b0614	647484	648035	apo-citrate lyase phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase	citC // citD // citE // citF // citX // citG	b0618 // b0617 // b0616 // b0615 // b0614 // b0613
ycjN	b1310	1371909	1373201	putative ABC transporter periplasmic binding protein YcjN	ymjB // ycjV // ycjU // ycjT // ycjS // ycjR // ycjQ // ycjP // ycjO // ycjN // ycjM // ompG	b4524 // b1318 // b1317 // b1316 // b1315 // b1314 // b1313 // b1312 // b1311 // b1310 // b1309 // b1319
rpsH	b3306	3446153	3446545	30S ribosomal subunit protein S8	rpmJ // secY // rplO // rpmD // rpsE // rplR // rplF // rpsH // rpsN // rplE // rplX // rplN	b3299 // b3300 // b3301 // b3302 // b3303 // b3304 // b3305 // b3306 // b3307 // b3308 // b3309 // b3310
fucO	b2799	2931865	2933013	L-1,2-propanediol oxidoreductase	fucO // fucA	b2799 // b2800
lptF	b4261	4486218	4487318	lipopolysaccharide transport system protein LptF	lptG // lptF	b4262 // b4261
ypjA	b2647	2778146	2782726	adhesin-like autotransporter YpjA	ypjA	b2647
hybD	b2993	3140792	3141286	hydrogenase 2 maturation protease	hybO // hybG // hybF // hybE // hybD // hybC // hybB // hybA	b2997 // b2990 // b2991 // b2992 // b2993 // b2994 // b2995 // b2996
metQ	b0197	220113	220928	L-methionine/D-methionine ABC transporter membrane anchored binding protein	metQ // metI // metN	b0197 // b0198 // b0199
rplX	b3309	3447453	3447767	50S ribosomal subunit protein L24	rpmJ // secY // rplO // rpmD // rpsE // rplR // rplF // rpsH // rpsN // rplE // rplX // rplN	b3299 // b3300 // b3301 // b3302 // b3303 // b3304 // b3305 // b3306 // b3307 // b3308 // b3309 // b3310
chbB	b1738	1821299	1821619	<I>N,N'</I>-diacetylchitobiose-specific PTS enzyme IIB component	chbG // chbF // chbR // chbA // chbC // chbB	b1733 // b1734 // b1735 // b1736 // b1737 // b1738
lolA	b0891	937372	937983	outer membrane lipoprotein carrier protein	rarA // lolA	b0892 // b0891
yfbU	b2294	2412100	2412594	UPF0304 family protein YfbU	yfbU // hxpA	b2294 // b2293
hypD	b2729	2852136	2853257	Fe-(CN)<sub>2</sub>CO cofactor assembly scaffold protein HypD	fhlA // hypE // hypD // hypC // hypB // hypA	b2731 // b2730 // b2729 // b2728 // b2727 // b2726
lptA	b3200	3343380	3343937	lipopolysaccharide transport system protein LptA	npr // rapZ // ptsN // hpf // rpoN // kdsD // yrbG // lptB // lptA // lptC // kdsC	b3206 // b3205 // b3204 // b3203 // b3202 // b3197 // b3196 // b3201 // b3200 // b3199 // b3198
rplE	b3308	3446899	3447438	50S ribosomal subunit protein L5	rpmJ // secY // rplO // rpmD // rpsE // rplR // rplF // rpsH // rpsN // rplE // rplX // rplN	b3299 // b3300 // b3301 // b3302 // b3303 // b3304 // b3305 // b3306 // b3307 // b3308 // b3309 // b3310
aldA	b1415	1488232	1489671	aldehyde dehydrogenase A	aldA	b1415
aaeB	b3240	3386221	3388188	aromatic carboxylic acid efflux pump subunit AaeB	aaeX // aaeA // aaeB	b3242 // b3241 // b3240
yobA	b1841	1924595	1924969	CopC domain-containing protein	yobA // yebZ // yebY	b1841 // b1840 // b1839
yegI	b2070	2149039	2150985	putative serine/threonine-protein kinase YegI	yegI	b2070
tcyJ	b1920	1999585	2000385	cystine ABC transporter periplasmic binding protein	tcyJ // fliZ // fliA	b1920 // b1921 // b1922
rrsH	b0201	223771	225312	16S ribosomal RNA	alaV // ileV // rrsH // rrfH // rrlH	b0203 // b0202 // b0201 // b0205 // b0204
pta	b2297	2414747	2416891	phosphate acetyltransferase	pta // ackA	b2297 // b2296
copA	b0484	508875	511379	soluble Cu<sup>+</sup> chaperone // Cu<sup>+</sup> exporting P-type ATPase	copA	b0484
ynjI	b1762	1843831	1844871	DUF1266 domain-containing protein YnjI	ynjI	b1762
qseC	b3026	3170484	3171833	QseC-<i>N</i>-phospho-L-histidine // sensor histidine kinase QseC	qseC // qseB	b3026 // b3025
lsrB	b1516	1605051	1606073	Autoinducer-2 ABC transporter periplasmic binding protein	lsrG // lsrF // lsrB // lsrD // lsrC // lsrA // tam	b1518 // b1517 // b1516 // b1515 // b1514 // b1513 // b1519
rrfE	b4010	4213040	4213159	5S ribosomal RNA	gltV // rrsE // rrfE // rrlE	b4008 // b4007 // b4010 // b4009
gatY	b2096	2176350	2177204	tagatose-1,6-bisphosphate aldolase 2	gatY // gatA // gatB // gatC // gatD // gatZ	b2096 // b2094 // b2093 // b2092 // b2091 // b2095
ygaH	b2683	2810344	2810679	L-valine exporter, YgaH component	ygaH // ygaZ	b2683 // b2682
yneK	b1527	1615763	1616878	protein YneK	yneK	b1527
glnL	b3869	4055290	4056339	sensory histidine kinase NtrB	glnA // glnG // glnL	b3870 // b3868 // b3869
nikA	b3476	3613667	3615241	Ni(2+) ABC transporter periplasmic binding protein	nikR // nikA // nikB // nikC // nikD // nikE	b3481 // b3476 // b3477 // b3478 // b3479 // b3480
rpsU	b3065	3210781	3210996	30S ribosomal subunit protein S21	rpsU // dnaG // rpoD	b3065 // b3066 // b3067
kdgK	b3526	3679419	3680348	2-dehydro-3-deoxygluconokinase	kdgK	b3526
feoC	b3410	3542728	3542964	ferrous iron transport protein FeoC	feoC // feoA // feoB	b3410 // b3408 // b3409
yciO	b1267	1324098	1324718	putative RNA-binding protein YciO	yciQ // yciO // yciV	b1268 // b1267 // b1266
nrdG	b4237	4459900	4460364	anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein	nrdG // nrdD	b4237 // b4238
gsiB	b0830	869411	870949	glutathione ABC transporter periplasmic binding protein	gsiD // gsiC // gsiB // gsiA // iaaA	b0832 // b0831 // b0830 // b0829 // b0828
rpsE	b3303	3444726	3445229	30S ribosomal subunit protein S5	rpmJ // secY // rplO // rpmD // rpsE // rplR // rplF // rpsH // rpsN // rplE // rplX // rplN	b3299 // b3300 // b3301 // b3302 // b3303 // b3304 // b3305 // b3306 // b3307 // b3308 // b3309 // b3310
frwB	b3950	4143624	4143944	putative PTS enzyme IIB component FrwB	frwB // frwC	b3950 // b3949
letB	b1834	1917510	1920143	lipophilic envelope spanning tunnel	letB // letA	b1834 // b1833
gfcE	b0983	1044664	1045803	putative exopolysaccharide export lipoprotein GfcE	gfcE // etp // etk	b0983 // b0982 // b0981
pphA	b1838	1922313	1922969	phosphoprotein phosphatase 1	sdsR // pphA	b4433 // b1838
yphF	b2548	2678384	2679367	putative ABC transporter periplasmic binding protein YphF	yphF // yphE // yphD	b2548 // b2547 // b2546
rplT	b1716	1799393	1799749	50S ribosomal subunit protein L20	thrS // rpmI // infC // rplT // ihfA // pheM // pheT // pheS	b1719 // b1717 // b1718 // b1716 // b1712 // b1715 // b1713 // b1714
fruB	b2169	2262365	2263495	FruB - his299 phosphorylated // fructose-specific PTS multiphosphoryl transfer protein FruB	fruA // fruK // fruB	b2167 // b2168 // b2169
yehB	b2109	2188430	2190910	putative fimbrial usher protein YehB	yehD // yehC // yehB // yehA	b2111 // b2110 // b2109 // b2108
ybhL	b0786	819884	820588	Bax1-I family protein YbhL	ybhL	b0786
rcsD	b2216	2313488	2316160	RcsD-<i>N</i>-phospho-L-histidine // RcsD phosphotransferase	rcsD // rcsB	b2216 // b2217
ynjB	b1754	1836073	1837239	putative ABC transporter periplasmic binding protein YnjB	ynjD // ynjC // ynjB // ynjA // ydjZ // ydjY // ydjX	b1756 // b1755 // b1754 // b1753 // b1752 // b1751 // b1750
rplB	b3317	3450543	3451364	50S ribosomal subunit protein L2	rpsQ // rpmC // rplP // rpsC // rplV // rpsS // rplB // rplW // rplD // rplC // rpsJ	b3311 // b3312 // b3313 // b3314 // b3315 // b3316 // b3317 // b3318 // b3319 // b3320 // b3321
malZ	b0403	422518	424332	maltodextrin glucosidase	malZ	b0403
zntB	b1342	1408050	1409033	Zn<sup>2+</sup>:H<sup>+</sup> symporter	zntB	b1342
pdeB	b0457	477067	478617	c-di-GMP phosphodiesterase PdeB	pdeB	b0457
glnE	b3053	3196801	3199641	fused glutamine synthetase deadenylase/glutamine synthetase adenylyltransferase	ygiF // glnE	b3054 // b3053
osmF	b2131	2218564	2219481	glycine betaine ABC transporter periplasmic binding protein OsmF	yehW // yehX // yehY // osmF	b2128 // b2129 // b2130 // b2131
rrsD	b3278	3427221	3428762	16S ribosomal RNA	rrfF // thrV // rrfD // rrlD // alaU // ileU // rrsD	b3272 // b3273 // b3274 // b3275 // b3276 // b3277 // b3278
dkgA	b3012	3156623	3157450	methylglyoxal reductase DkgA	yqhD // dkgA	b3011 // b3012
yidC	b3705	3885076	3886722	membrane protein insertase YidC		
rttR	b4425	1287066	1287236	small RNA RttR	rttR	b4425
rimJ	b1066	1125562	1126146	ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase	rimJ	b1066
tcyN	b1917	1997062	1997814	cystine ABC transporter ATP binding subunit	dcyD // tcyL // tcyN	b1919 // b1918 // b1917
rrfB	b3971	4171637	4171756	5S ribosomal RNA	gltT // rrsB // rrfB // rrlB	b3969 // b3968 // b3971 // b3970
fucA	b2800	2933041	2933688	L-fuculose-phosphate aldolase	fucA // fucO	b2800 // b2799
pqiA	b0950	1012001	1013254	intermembrane transport protein PqiA	pqiC // pqiB // pqiA	b0952 // b0951 // b0950
ynfQ	b4724	1638256	1638444	Qin prophage; protein YnfQ		
sdhE	b2897	3040804	3041070	FAD assembly factor	sdhE // ygfX	b2897 // b2896
ybhF	b0794	827245	828981	ABC exporter ATP binding subunit YbhF	cecR // ybhG // ybhF // ybhS // ybhR	b0796 // b0795 // b0794 // b0793 // b0792
rpsR	b4202	4425839	4426066	30S ribosomal subunit protein S18	rpsF // priB // rpsR // rplI	b4200 // b4201 // b4202 // b4203
bglB	b3721	3902289	3903701	6-phospho-&beta;-glucosidase B	bglB // bglF // bglG	b3721 // b3722 // b3723
aaeA	b3241	3388194	3389126	aromatic carboxylic acid efflux pump membrane fusion protein	aaeX // aaeA // aaeB	b3242 // b3241 // b3240
arrS	b4704	3657985	3658054	small regulatory RNA ArrS	arrS	b4704
npr	b3206	3347966	3348238	Npr phosphorylated // phosphorelay protein NPr	npr // kdsD // yrbG // lptC // kdsC // lptA // rapZ // ptsN // hpf // rpoN // lptB	b3206 // b3197 // b3196 // b3199 // b3198 // b3200 // b3205 // b3204 // b3203 // b3202 // b3201
yhdZ	b3271	3422436	3423194	putative ABC transporter ATP-binding subunit YhdZ	yhdZ // yhdY // yhdX // yhdW	b3271 // b3270 // b3269 // b3268
rpsB	b0169	189874	190599	30S ribosomal subunit protein S2	tff // rpsB // tsf	b4414 // b0169 // b0170
aceE	b0114	123017	125680	pyruvate dehydrogenase E1 component	pdhR // aceE // aceF // lpd	b0113 // b0114 // b0115 // b0116
cusF	b0573	597131	597463	copper/silver export system periplasmic binding protein	cusA // cusB // cusF // cusC	b0575 // b0574 // b0573 // b0572
ybfQ	b4514	736445	736699	inactive transposase YbfQ	ybfQ	b4514
nrdI	b2674	2800965	2801375	dimanganese-tyrosyl radical cofactor maintenance flavodoxin NrdI	nrdH // nrdI // nrdF // nrdE	b2673 // b2674 // b2676 // b2675
yphE	b2547	2676850	2678361	putative ABC transporter ATP-binding protein YphE	yphF // yphE // yphD	b2548 // b2547 // b2546
rplQ	b3294	3439616	3439999	50S ribosomal subunit protein L17	rplQ // rpoA // rpsD // rpsK // rpsM	b3294 // b3295 // b3296 // b3297 // b3298
gudX	b2788	2919406	2920746	glucarate dehydratase-related protein	gudD // gudX // gudP	b2787 // b2788 // b2789
mlaB	b3191	3336963	3337256	intermembrane phospholipid transport system protein MlaB	mlaB // mlaC // mlaD // mlaE // mlaF	b3191 // b3192 // b3193 // b3194 // b3195
ycaI	b0913	964320	966584	metallo-&beta;-lactamase superfamily inner membrane protein YcaI	ycaQ // lpxK // msbA // ycaI	b0916 // b0915 // b0914 // b0913
rimO	b0835	876710	878035	ribosomal protein S12 methylthiotransferase RimO	rimO	b0835
lsrA	b1513	1601490	1603025	Autoinducer-2 ABC transporter ATP binding subunit	lsrG // lsrF // lsrB // lsrD // lsrC // lsrA // tam	b1518 // b1517 // b1516 // b1515 // b1514 // b1513 // b1519
hflX	b4173	4400672	4401952	ribosome rescue factor HflX	amiB // tsaE // nnr // mutL // miaA // hflC // hflK // hflX // hfq	b4169 // b4168 // b4167 // b4170 // b4171 // b4175 // b4174 // b4173 // b4172
paaK	b1398	1462125	1463438	phenylacetate-CoA ligase	paaK // paaI // paaH // paaG // paaF // paaE // paaD // paaC // paaB // paaA // paaJ	b1398 // b1396 // b1395 // b1394 // b1393 // b1392 // b1391 // b1390 // b1389 // b1388 // b1397
yahN	b0328	345666	346337	putative amino acid exporter YahN	yahN	b0328
yhjD	b3522	3673362	3674375	putative transporter YhjD	yhjD	b3522
pflC	b3952	4146258	4147136	putative pyruvate formate-lyase 2 activating enzyme PflC	pflD // pflC	b3951 // b3952
ydcT	b1441	1512817	1513830	putative ABC transporter ATP-binding protein YdcT	patD // ydcT // ydcU // ydcV // ydcS	b1444 // b1441 // b1442 // b1443 // b1440
rrsA	b3851	4035531	4037072	16S ribosomal RNA	alaT // ileT // rrsA // rrfA // rrlA	b3853 // b3852 // b3851 // b3855 // b3854
glxR	b0509	536586	537464	tartronate semialdehyde reductase 2	ybbW // glxR // hyi // gcl // allB // glxK // ybbY	b0511 // b0509 // b0508 // b0507 // b0512 // b0514 // b0513
mlaA	b2346	2464252	2465007	intermembrane phospholipid transport system - outer membrane lipoprotein MlaA	mlaA	b2346
yhhL	b3466	3604979	3605248	DUF1145 domain-containing protein YhhL	yhhL // rsmD	b3466 // b3465
glnD	b0167	185978	188650	PII uridylyltransferase / uridylyl removing enzyme	map // glnD // dapD	b0168 // b0167 // b0166
gsiA	b0829	867520	869391	glutathione ABC transporter ATP binding subunit GsiA	gsiD // gsiC // gsiB // gsiA // iaaA	b0832 // b0831 // b0830 // b0829 // b0828
yhbY	b3180	3327790	3328083	ribosome assembly factor YhbY	yhbY	b3180
dgoA	b4477	3872995	3873612	2-dehydro-3-deoxy-6-phosphogalactonate aldolase	dgoR // dgoK // dgoA // dgoD // dgoT	b4479 // b3693 // b4477 // b4478 // b3691
lplT	b2835	2972669	2973862	lysophospholipid transporter	aas // lplT	b2836 // b2835
yjcH	b4068	4284899	4285213	DUF485 domain-containing inner membrane protein YjcH	yjcH // acs // actP	b4068 // b4069 // b4067
map	b0168	188712	189506	methionine aminopeptidase	map // dapD // glnD	b0168 // b0166 // b0167
yehX	b2129	2216481	2217407	glycine betaine ABC transporter ATP binding subunit YehX	yehW // yehX // yehY // osmF	b2128 // b2129 // b2130 // b2131
rpsO	b3165	3311415	3311684	30S ribosomal subunit protein S15	truB // rbfA // infB // nusA // rimP // metY // pnp // rpsO	b3166 // b3167 // b3168 // b3169 // b3170 // b3171 // b3164 // b3165
gatB	b2093	2174282	2174566	galactitol-specific PTS enzyme IIB component	gatD // gatC // gatB // gatA // gatZ // gatY	b2091 // b2092 // b2093 // b2094 // b2095 // b2096
clcB	b1592	1665315	1666571	putative chloride:H<sup>+</sup> antiporter ClcB	clcB	b1592
yddE	b1464	1534965	1535858	PF02567 family protein YddE	yddE	b1464
pflA	b0902	950340	951080	pyruvate formate-lyase activating enzyme	pflA	b0902
ynjD	b1756	1838747	1839400	putative ABC transporter ATP-binding protein YnjD	ynjD // ynjC // ynjB // ynjA // ydjZ // ydjY // ydjX	b1756 // b1755 // b1754 // b1753 // b1752 // b1751 // b1750
rpmG	b3636	3811250	3811417	50S ribosomal subunit protein L33	yicR // mutM // rpmG // rpmB	b3638 // b3635 // b3636 // b3637
rhaB	b3904	4095979	4097448	rhamnulokinase	rhaA // rhaB // rhaD	b3903 // b3904 // b3902
wzxE	b3792	3976278	3977528	lipid III flippase	rffM // wzyE // wecF // wzxE // wecE // rffC // rffH // rffG // wecC // wecB // wzzE // rfe	b3794 // b3793 // b4481 // b3792 // b3791 // b3790 // b3789 // b3788 // b3787 // b3786 // b3785 // b3784
smf	b4473	3432436	3433560	protein Smf	smf	b4473
iscU	b2529	2659903	2660289	scaffold protein for iron-sulfur cluster assembly	iscA // iscU // iscS // iscR	b2528 // b2529 // b2530 // b2531
ybbA	b0495	519733	520419	putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA	ybbP // ybbA	b0496 // b0495
rplN	b3310	3447778	3448149	50S ribosomal subunit protein L14	rpmJ // secY // rplO // rpmD // rpsE // rplR // rplF // rpsH // rpsN // rplE // rplX // rplN	b3299 // b3300 // b3301 // b3302 // b3303 // b3304 // b3305 // b3306 // b3307 // b3308 // b3309 // b3310
garK	b3124	3270625	3271770	glycerate 2-kinase 1	garK // garL // garP // garR // rnpB	b3124 // b3126 // b3127 // b3125 // b3123
pqiB	b0951	1013259	1014899	intermembrane transport protein PqiB	pqiC // pqiB // pqiA	b0952 // b0951 // b0950
argK	b2918	3062987	3063982	methylmalonyl-CoA mutase-interacting GTPase YgfD	scpC // scpB // argK // scpA	b2920 // b2919 // b2918 // b2917
citC	b0618	650798	651856	citrate lyase synthetase	citC // citD // citE // citF // citX // citG	b0618 // b0617 // b0616 // b0615 // b0614 // b0613
ddpF	b1483	1557112	1558038	putative D,D-dipeptide ABC transporter ATP-binding subunit DdpF	ddpF // ddpD // ddpC // ddpB // ddpA // ddpX	b1483 // b1484 // b1485 // b1486 // b1487 // b1488
rsgA	b4161	4390457	4391509	ribosome small subunit-dependent GTPase A	rsgA	b4161
srlE	b2703	2826392	2827351	sorbitol-specific PTS enzyme IIBC<sub>1</sub> component	srlA // srlE // srlB // srlD // gutM // gutQ // srlR	b2702 // b2703 // b2704 // b2705 // b2706 // b2708 // b2707
fepE	b0587	618254	619387	polysaccharide co-polymerase family protein FepE	ybdZ // fes // entF // fepE	b4511 // b0585 // b0586 // b0587
sgcQ	b4303	4528111	4528917	KpLE2 phage-like element; putative nucleoside triphosphatase	sgcX // sgcB // sgcC // sgcQ // sgcA // sgcE // sgcR	b4305 // b4565 // b4304 // b4303 // b4302 // b4301 // b4300
hybF	b2991	3139977	3140318	hydrogenase maturation protein HybF	hybO // hybG // hybF // hybE // hybD // hybC // hybB // hybA	b2997 // b2990 // b2991 // b2992 // b2993 // b2994 // b2995 // b2996
ytfR	b4485	4451058	4452560	galactofuranose ABC transporter putative ATP binding subunit	yjfF // ytfT // ytfR // ytfQ	b4231 // b4230 // b4485 // b4227
rrlE	b4009	4210043	4212946	23S ribosomal RNA	gltV // rrsE // rrfE // rrlE	b4008 // b4007 // b4010 // b4009
nanM	b4310	4537659	4538765	<i>N</i>-acetylneuraminate mutarotase	nanM // nanC // nanS	b4310 // b4311 // b4309
ytfL	b4218	4439872	4441215	UPF0053 family inner membrane protein YtfL	ytfL	b4218
creA	b4397	4635521	4635994	PF05981 family protein CreA	creA // creB // creC // creD	b4397 // b4398 // b4399 // b4400
glrR	b2554	2687469	2688803	P<sup>asp56</sup> DNA-binding transcriptional activator GlrR // DNA-binding transcriptional activator GlrR	glrR // glnB	b2554 // b2553
metN	b0199	221614	222645	L-methionine/D-methionine ABC transporter ATP binding subunit	metQ // metI // metN	b0197 // b0198 // b0199
rpmJ	b3299	3442618	3442734	50S ribosomal subunit protein L36	rpmJ // secY // rplO // rpmD // rpsE // rplR // rplF // rpsH // rpsN // rplE // rplX // rplN	b3299 // b3300 // b3301 // b3302 // b3303 // b3304 // b3305 // b3306 // b3307 // b3308 // b3309 // b3310
kduI	b2843	2983288	2984124	5-dehydro-4-deoxy-D-glucuronate isomerase	kduI	b2843
ybhG	b0795	828974	829972	HlyD_D23 family protein YbhG	cecR // ybhG // ybhF // ybhS // ybhR	b0796 // b0795 // b0794 // b0793 // b0792
yhhZ	b3442	3581863	3583041	putative endonuclease YhhZ	insB6 // insA6 // insAB6 // yrhA // yhhZ	b3445 // b3444 // b3443 // b3442
hypE	b2730	2853254	2854264	HypE-S-carboxamide // hydrogenase maturation protein, carbamoyl dehydratase	fhlA // hypE // hypD // hypC // hypB // hypA	b2731 // b2730 // b2729 // b2728 // b2727 // b2726
lolD	b1117	1176619	1177320	lipoprotein release complex - ATP binding subunit	lolE // lolD // lolC	b1118 // b1117 // b1116
rpsL	b3342	3474178	3474552	30S ribosomal subunit protein S12	rpsG // rpsL // fusA // tufA	b3341 // b3342 // b3340 // b3339
glgP	b3428	3564134	3566581	glycogen phosphorylase	glgP // glgA // glgC // glgX // glgB	b3428 // b3429 // b3430 // b3431 // b3432
mlaC	b3192	3337256	3337891	intermembrane phospholipid transport system - periplasmic binding protein	mlaB // mlaC // mlaD // mlaE // mlaF	b3191 // b3192 // b3193 // b3194 // b3195
yfcA	b2327	2444751	2445560	putative transporter YfcA	prmB // aroC // mepA // yfcA // epmC // yfcL	b2330 // b2329 // b2328 // b2327 // b2326 // b2325
pphC	b2072	2151711	2152472	protein-serine/threonine phosphatase PphC	yegL // pphC	b2073 // b2072
yadG	b0127	142779	143705	putative ABC transporter ATP-binding protein YadG	yadH // yadG	b0128 // b0127
rpmD	b3302	3444543	3444722	50S ribosomal subunit protein L30	rpmJ // secY // rplO // rpmD // rpsE // rplR // rplF // rpsH // rpsN // rplE // rplX // rplN	b3299 // b3300 // b3301 // b3302 // b3303 // b3304 // b3305 // b3306 // b3307 // b3308 // b3309 // b3310
eda	b1850	1932115	1932756	KHG/KDPG aldolase	edd // eda	b1851 // b1850
proY	b0402	420986	422359	putative transporter ProY	proY // brnQ	b0402 // b0401
yhcG	b3220	3367827	3368954	DUF1016 domain-containing protein YhcG	yhcG	b3220
ppsR	b1703	1787445	1788278	phosphoenolpyruvate synthetase regulatory protein	ppsR	b1703
mlaF	b3195	3339256	3340065	intermembrane phospholipid transport system, ATP binding subunit MlaF	mlaB // mlaC // mlaD // mlaE // mlaF	b3191 // b3192 // b3193 // b3194 // b3195
rplK	b3983	4178447	4178875	50S ribosomal subunit protein L11	rplA // rplK // rplJ // rplL // rpoC // rpoB	b3984 // b3983 // b3985 // b3986 // b3988 // b3987
ascB	b2716	2840990	2842414	6-phospho-&beta;-glucosidase AscB	ascF // ascB	b2715 // b2716
rlpA	b0633	664102	665190	rare lipoprotein RlpA	rsfS // rlmH // mrdA // mrdB // rlpA	b0637 // b0636 // b0635 // b0634 // b0633
hprS	b1968	2036794	2038152	HprS-<i>N</i>-phospho-L-histidine // sensor histidine kinase HprS	hprR // hprS	b1969 // b1968
yejF	b2180	2276300	2277889	putative oligopeptide ABC transporter ATP binding subunit YejF	yejF // yejE // yejB // yejA	b2180 // b2179 // b2178 // b2177
rpmA	b3185	3332862	3333119	50S ribosomal subunit protein L27	rpmA // rplU // yhbE // obgE	b3185 // b3186 // b3184 // b3183
hcaB	b2541	2671225	2672037	2,3-dihydroxy-2,3-dihydrophenylpropionate dehydrogenase	hcaD // hcaB // hcaC // hcaF // hcaE	b2542 // b2541 // b2540 // b2539 // b2538
yghS	b2985	3133244	3133957	putative ATP-binding protein YghS	yghS // yghR	b2985 // b2984
prmC	b1212	1266094	1266927	protein-(glutamine-N5) methyltransferase	prmC // prfA // hemA	b1212 // b1211 // b1210
lptB	b3201	3343944	3344669	lipopolysaccharide transport system ATP binding protein LptB	npr // rapZ // ptsN // hpf // rpoN // kdsD // yrbG // lptB // lptA // lptC // kdsC	b3206 // b3205 // b3204 // b3203 // b3202 // b3197 // b3196 // b3201 // b3200 // b3199 // b3198
rrlB	b3970	4168641	4171544	23S ribosomal RNA	gltT // rrsB // rrfB // rrlB	b3969 // b3968 // b3971 // b3970
paaG	b1394	1458264	1459052	putative ring 1,2-epoxyphenylacetyl-CoA isomerase (oxepin-CoA forming)	paaK // paaI // paaH // paaG // paaF // paaE // paaD // paaC // paaB // paaA // paaJ	b1398 // b1396 // b1395 // b1394 // b1393 // b1392 // b1391 // b1390 // b1389 // b1388 // b1397
ygdR	b2833	2971271	2971489	DUF903 domain-containing lipoprotein YgdR	ygdR	b2833
rimK	b0852	891967	892869	ribosomal protein S6 modification protein	rimK // nfsA // ybjC // ybjN	b0852 // b0851 // b0850 // b0853
ddpD	b1484	1558031	1559017	putative D,D-dipeptide ABC transporter ATP-binding subunit DdpD	ddpF // ddpD // ddpC // ddpB // ddpA // ddpX	b1483 // b1484 // b1485 // b1486 // b1487 // b1488
rbfA	b3167	3312777	3313178	30S ribosome binding factor	truB // rbfA // infB // nusA // rimP // metY // pnp // rpsO	b3166 // b3167 // b3168 // b3169 // b3170 // b3171 // b3164 // b3165
acnB	b0118	131615	134212	AcnB	acnB	b0118
yfgM	b2513	2638663	2639283	ancillary SecYEG translocon subunit	yfgM	b2513
dcuS	b4125	4350031	4351662	DcuS-<i>N</i>-phospho-L-histidine // sensor histidine kinase DcuS	dcuS // dcuR	b4125 // b4124
aroK	b3390	3518543	3519064	shikimate kinase 1	aroB // aroK // damX // dam // gph // rpe // trpS	b3389 // b3390 // b3388 // b3387 // b3385 // b3386 // b3384
rpsI	b3230	3377815	3378207	30S ribosomal subunit protein S9	rpsI // rplM	b3230 // b3231
tktB	b2465	2579636	2581639	transketolase 2	tktB // talA	b2465 // b2464
elaB	b2266	2380722	2381027	tail-anchored inner membrane protein ElaB	elaB	b2266
torT	b0994	1056261	1057289	TorT-TMAO // periplasmic trimethylamine-N-oxide binding protein	torT	b0994
aroD	b1693	1774686	1775444	3-dehydroquinate dehydratase	aroD // ydiB // ydiN	b1693 // b1692 // b1691
rplY	b2185	2282517	2282801	50S ribosomal subunit protein L25	rplY	b2185
frvA	b3900	4092377	4092823	putative PTS enzyme IIA component FrvA	frvA // frvB // frvX // frvR	b3900 // b3899 // b3898 // b3897
yobD	b1820	1904801	1905259	DUF986 domain-containing inner membrane protein YobD	yobD	b1820
yiaC	b3550	3713652	3714092	peptidyl-lysine <i>N</i>-acetyltransferase YiaC	yiaC // tag	b3550 // b3549
aroA	b0908	958812	960095	3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase	aroA // serC	b0908 // b0907
rplF	b3305	3445607	3446140	50S ribosomal subunit protein L6	rpmJ // secY // rplO // rpmD // rpsE // rplR // rplF // rpsH // rpsN // rplE // rplX // rplN	b3299 // b3300 // b3301 // b3302 // b3303 // b3304 // b3305 // b3306 // b3307 // b3308 // b3309 // b3310
tktA	b2935	3079644	3081635	transketolase 1	tktA	b2935
ydiU	b1706	1789808	1791244	UPF0061 family protein YdiU	ydiU	b1706
ycaO	b0905	954872	956632	ribosomal protein S12 methylthiotransferase accessory factor YcaO	ycaO	b0905
aroL	b0388	406405	406929	shikimate kinase 2	aroL // yaiA // aroM	b0388 // b0389 // b0390
rrfF	b3272	3423423	3423542	5S ribosomal RNA	rrfF // thrV // rrfD // rrlD // alaU // ileU // rrsD	b3272 // b3273 // b3274 // b3275 // b3276 // b3277 // b3278
xylB	b3564	3727917	3729371	xylulokinase	xylB // xylA	b3564 // b3565
nhoA	b1463	1534024	1534869	arylamine <i>N</i>-acetyltransferase	nhoA	b1463
btsS	b2126	2212959	2214644	BtsS-<i>N</i>-phospho-L-histidine // high-affinity pyruvate receptor	btsS // btsR	b2126 // b2125
aroE	b3281	3430020	3430838	shikimate dehydrogenase	yrdB // aroE // tsaC // yrdD	b3280 // b3281 // b3282 // b3283
rrfG	b2588	2726069	2726188	5S ribosomal RNA	rrlG // gltW // rrsG // rrfG	b2589 // b2590 // b2591 // b2588
hcaF	b2539	2670390	2670908	putative 3-phenylpropionate/cinnamate dioxygenase subunit &beta;	hcaD // hcaB // hcaC // hcaF // hcaE	b2542 // b2541 // b2540 // b2539 // b2538
tesB	b0452	474301	475161	acyl-CoA thioesterase II	tesB	b0452
ycgN	b1181	1228815	1229276	PF03693 family protein YcgN	ycgN	b1181
roxA	b1128	1187119	1188240	ribosomal protein-arginine oxygenase	roxA	b1128
aroB	b3389	3517398	3518486	3-dehydroquinate synthase	aroB // aroK // damX // dam // gph // rpe // trpS	b3389 // b3390 // b3388 // b3387 // b3385 // b3386 // b3384
srmB	b2576	2712896	2714230	ATP-dependent RNA helicase SrmB	srmB	b2576
idnD	b4267	4493375	4494406	L-idonate 5-dehydrogenase	idnT // idnO // idnD // idnR	b4265 // b4266 // b4267 // b4264
nanY	b4280	4505287	4506405	KpLE2 phage-like element; 2,7-anhydro-<i>N</i>-acetylneuraminate hydratase	nanX // nanY	b4279 // b4280
elfC	b0940	999216	1001816	putative fimbrial usher protein ElfC	ycbF // ycbV // ycbU // elfG // elfC // elfD	b0944 // b0943 // b0942 // b0941 // b0940 // b0939
dps	b0812	848408	848911	DNA protection during starvation protein	dps	b0812
ydiB	b1692	1773789	1774655	quinate/shikimate dehydrogenase	ydiB // ydiN // aroD	b1692 // b1691 // b1693
rpsF	b4200	4425118	4425513	30S ribosomal subunit protein S6	rpsF // priB // rpsR // rplI	b4200 // b4201 // b4202 // b4203
malM	b4037	4249554	4250474	maltose regulon periplasmic protein	malK // lamB // malM	b4035 // b4036 // b4037
ydeP	b1501	1584207	1586486	putative oxidoreductase YdeP	ydeP	b1501
ybgQ	b0718	749722	752169	putative fimbrial usher protein YbgQ	ybgQ // ybgP // ybgO	b0718 // b0717 // b0716
lrp	b0889	932595	933089	DNA-binding transcriptional dual regulator Lrp	lrp	b0889
aroF	b2601	2740080	2741150	3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase, Tyr-sensitive	tyrA // aroF	b2600 // b2601
rplV	b3315	3449901	3450233	50S ribosomal subunit protein L22	rpsQ // rpmC // rplP // rpsC // rplV // rpsS // rplB // rplW // rplD // rplC // rpsJ	b3311 // b3312 // b3313 // b3314 // b3315 // b3316 // b3317 // b3318 // b3319 // b3320 // b3321
ebgA	b3076	3222633	3225725	evolved &beta;-D-galactosidase subunit &alpha;	ebgA // ebgC	b3076 // b3077
nudF	b3034	3177281	3177910	ADP-sugar pyrophosphatase	nudF // yqiB // cpdA // yqiA // parE	b3034 // b3033 // b3032 // b3031 // b3030
yaiI	b0387	405764	406222	DUF188 domain-containing protein YaiI	yaiI	b0387
hupA	b4000	4200281	4200553	DNA-binding protein HU-&alpha;	hupA	b4000
aroC	b2329	2446388	2447473	chorismate synthase	prmB // aroC // mepA // yfcA // epmC // yfcL	b2330 // b2329 // b2328 // b2327 // b2326 // b2325
rplC	b3320	3452297	3452926	50S ribosomal subunit protein L3	rpsQ // rpmC // rplP // rpsC // rplV // rpsS // rplB // rplW // rplD // rplC // rpsJ	b3311 // b3312 // b3313 // b3314 // b3315 // b3316 // b3317 // b3318 // b3319 // b3320 // b3321
araG	b1900	1983555	1985069	arabinose ABC transporter ATP binding subunit	araH // araG // araF	b4460 // b1900 // b1901
nudE	b3397	3525589	3526149	ADP-sugar diphosphatase NudE	nudE	b3397
yciY	b4595	1308788	1308961	uncharacterized protein YciY	yciY	b4595
tpr	b1229	1287087	1287176	protamine-like protein	tpr // tyrV // tyrT	b1229 // b1230 // b1231
ilvN	b3670	3850802	3851092	acetohydroxy acid synthase I subunit IlvN	ilvN // ilvB // ivbL // uhpC // uhpB // uhpA	b3670 // b3671 // b3672 // b3667 // b3668 // b3669
rrsE	b4007	4208147	4209688	16S ribosomal RNA	gltV // rrsE // rrfE // rrlE	b4008 // b4007 // b4010 // b4009
murP	b2429	2546673	2548097	N-acetylmuramic acid-specific PTS enzyme IICB component / anhydro-N-acetylmuramic acid transporter	yfeW // murP // murQ	b2430 // b2429 // b2428
paaI	b1396	1460471	1460893	phenylacetyl-CoA thioesterase	paaK // paaI // paaH // paaG // paaF // paaE // paaD // paaC // paaB // paaA // paaJ	b1398 // b1396 // b1395 // b1394 // b1393 // b1392 // b1391 // b1390 // b1389 // b1388 // b1397
ytiC	b4720	4556574	4556675	protein YtiC	ytiD // ytiC // idlP // iraD	b4721 // b4720 // b4722 // b4326
hupB	b0440	461451	461723	DNA-binding protein HU-&beta;	hupB	b0440
ilvH	b0078	87357	87848	acetolactate synthase / acetohydroxybutanoate synthase, regulatory subunit	ilvH // ilvI	b0078 // b0077
rrfC	b3759	3946700	3946819	5S ribosomal RNA	rrfC // rrlC // gltU // rrsC	b3759 // b3758 // b3757 // b3756
paaD	b1391	1455925	1456422	phenylacetate degradation protein	paaK // paaI // paaH // paaG // paaF // paaE // paaD // paaC // paaB // paaA // paaJ	b1398 // b1396 // b1395 // b1394 // b1393 // b1392 // b1391 // b1390 // b1389 // b1388 // b1397
yiaY	b3589	3756676	3757827	L-threonine dehydrogenase	yiaY	b3589
yrbN	b4685	3307853	3307933	uncharacterized protein YrbN	deaD // yrbN	b3162 // b4685
ihfB	b0912	963828	964112	integration host factor subunit &beta;	cmk // ihfB // rpsA	b0910 // b0912 // b0911
ilvC	b3774	3957970	3959445	ketol-acid reductoisomerase (NADP<sup>+</sup>)	ilvC	b3774
rpsS	b3316	3450248	3450526	30S ribosomal subunit protein S19	rpsQ // rpmC // rplP // rpsC // rplV // rpsS // rplB // rplW // rplD // rplC // rpsJ	b3311 // b3312 // b3313 // b3314 // b3315 // b3316 // b3317 // b3318 // b3319 // b3320 // b3321
kbaY	b3137	3283143	3284003	tagatose-1,6-bisphosphate aldolase 1	agaI // agaD // agaC // agaB // kbaY // agaS	b3141 // b3140 // b3139 // b3138 // b3137 // b3136
agaI	b3141	3286270	3287025	putative deaminase AgaI	agaI // agaD // agaC // agaB // kbaY // agaS	b3141 // b3140 // b3139 // b3138 // b3137 // b3136
yajI	b0412	432312	432851	putative lipoprotein YajI	yajI	b0412
dnaA	b3702	3882326	3883729	chromosomal replication initiator protein DnaA	dnaA // recF // dnaN	b3702 // b3700 // b3701
ilvI	b0077	85630	87354	acetolactate synthase / acetohydroxybutanoate synthase, catalytic subunit	ilvH // ilvI	b0078 // b0077
rpsC	b3314	3449182	3449883	30S ribosomal subunit protein S3	rpsQ // rpmC // rplP // rpsC // rplV // rpsS // rplB // rplW // rplD // rplC // rpsJ	b3311 // b3312 // b3313 // b3314 // b3315 // b3316 // b3317 // b3318 // b3319 // b3320 // b3321
sgbE	b3583	3750086	3750781	L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase SgbE	yiaM // sgbE // sgbU // sgbH // lyxK // yiaO // yiaN // yiaL // yiaK	b3577 // b3583 // b3582 // b3581 // b3580 // b3579 // b3578 // b3576 // b3575
ycjM	b1309	1370216	1371895	glucosylglycerate phosphorylase	ymjB // ycjV // ycjU // ycjT // ycjS // ycjR // ycjQ // ycjP // ycjO // ycjN // ycjM // ompG	b4524 // b1318 // b1317 // b1316 // b1315 // b1314 // b1313 // b1312 // b1311 // b1310 // b1309 // b1319
yaeI	b0164	184257	185069	phosphodiesterase YaeI	yaeI	b0164
yejK	b2186	2282940	2283947	nucleoid-associated protein YejK	yejK	b2186
ilvD	b3771	3953478	3955328	dihydroxy-acid dehydratase	ilvX // ilvG // ilvD // ilvE // ilvM // ilvL // ilvA	b4669 // b4488 // b3771 // b3770 // b3769 // b3766 // b3772
rplR	b3304	3445244	3445597	50S ribosomal subunit protein L18	rpmJ // secY // rplO // rpmD // rpsE // rplR // rplF // rpsH // rpsN // rplE // rplX // rplN	b3299 // b3300 // b3301 // b3302 // b3303 // b3304 // b3305 // b3306 // b3307 // b3308 // b3309 // b3310
yihT	b3881	4071773	4072651	6-deoxy-6-sulfofructose-1-phosphate aldolase	yihS // yihT // yihU	b3880 // b3881 // b3882
fsaB	b3946	4139046	4139708	fructose-6-phosphate aldolase 2	ptsA // fsaB // gldA	b3947 // b3946 // b3945
ydcF	b1414	1487235	1488035	DUF218 domain-containing protein YdcF	ydcF	b1414
rob	b4396	4634441	4635310	DNA-binding transcriptional dual regulator Rob	rob	b4396
ilvL	b3766	3950322	3950420	<i>ilvXGMEDA</i> operon leader peptide	ilvX // ilvG // ilvA // ilvD // ilvE // ilvM // ilvL	b4669 // b4488 // b3772 // b3771 // b3770 // b3769 // b3766
relA	b2784	2911417	2913651	GDP/GTP pyrophosphokinase	mazG // mazF // mazE // relA	b2781 // b2782 // b2783 // b2784
uxaB	b1521	1609229	1610680	tagaturonate reductase	uxaB	b1521
yqaB	b2690	2816937	2817503	fructose-1-phosphate phosphatase YqaB	yqaB // yqaA	b2690 // b2689
yjcB	b4060	4274760	4275041	uncharacterized protein YjcB	yjcB	b4060
argP	b2916	3059753	3060646	DNA-binding transcriptional dual regulator ArgP	argP	b2916
ilvA	b3772	3955331	3956875	threonine deaminase	ilvX // ilvG // ilvM // ilvL // ilvA // ilvD // ilvE	b4669 // b4488 // b3769 // b3766 // b3772 // b3771 // b3770
rrsB	b3968	4166659	4168200	16S ribosomal RNA	gltT // rrsB // rrfB // rrlB	b3969 // b3968 // b3971 // b3970
rbsD	b3748	3933351	3933770	D-ribose pyranase	rbsR // rbsD // rbsA // rbsC // rbsB // rbsK	b3753 // b3748 // b3749 // b3750 // b3751 // b3752
ghrA	b1033	1097886	1098824	glyoxylate/hydroxypyruvate reductase A	ghrA	b1033
ybfE	b0685	711605	711898	ribbon-helix-helix domain-containing protein YbfE	ybfE	b0685
hns	b1237	1292509	1292922	DNA-binding transcriptional dual regulator H-NS	hns	b1237
ilvM	b3769	3952201	3952464	acetolactate synthase II subunit IlvM	ilvX // ilvG // ilvA // ilvD // ilvE // ilvM // ilvL	b4669 // b4488 // b3772 // b3771 // b3770 // b3769 // b3766
ffs	b0455	476448	476561	signal recognition particle 4.5S RNA	ffs	b0455
mhpC	b0349	371239	372105	2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioate hydrolase	mhpF // mhpE // mhpD // mhpC // mhpB // mhpA	b0351 // b0352 // b0350 // b0349 // b0348 // b0347
yieK	b3718	3898671	3899393	putative glucosamine-6-phosphate deaminase YieK	bglH // yieL // yieK	b3720 // b3719 // b3718
yabI	b0065	71351	72115	DedA family protein YabI	yabI	b0065
fis	b3261	3411271	3411567	DNA-binding transcriptional dual regulator Fis	dusB // fis	b3260 // b3261
ivbL	b3672	3852890	3852988	<i>ilvBN</i> operon leader peptide	uhpC // uhpB // uhpA // ilvN // ilvB // ivbL	b3667 // b3668 // b3669 // b3670 // b3671 // b3672
rpsP	b2609	2745937	2746185	30S ribosomal subunit protein S16	rplS // trmD // rimM // rpsP	b2606 // b2607 // b2608 // b2609
ulaD	b4196	4422186	4422836	3-keto-L-gulonate-6-phosphate decarboxylase UlaD	ulaF // ulaE // ulaD // ulaC // ulaB // ulaA	b4198 // b4197 // b4196 // b4195 // b4194 // b4193
yfaU	b2245	2358042	2358845	2-keto-3-deoxy-L-rhamnonate aldolase	yfaX // rhmD // yfaV // yfaU	b2248 // b2247 // b2246 // b2245
yhiD	b3508	3655255	3655902	inner membrane protein YhiD	yhiD // hdeB // hdeA	b3508 // b3509 // b3510
htpG	b0473	495120	496994	chaperone protein HtpG	htpG	b0473
ilvB	b3671	3851096	3852784	acetohydroxy acid synthase I subunit IlvB	ilvN // ilvB // ivbL // uhpC // uhpB // uhpA	b3670 // b3671 // b3672 // b3667 // b3668 // b3669
rpmH	b3703	3884336	3884476	50S ribosomal subunit protein L34	rnpA // rpmH	b3704 // b3703
chbF	b1734	1817148	1818500	monoacetylchitobiose-6-phosphate hydrolase	chbG // chbF // chbR // chbA // chbC // chbB	b1733 // b1734 // b1735 // b1736 // b1737 // b1738
fsaA	b0825	863642	864304	fructose-6-phosphate aldolase 1	fsaA	b0825
ytfJ	b4216	4438708	4439262	PF09695 family protein YtfJ	ytfJ	b4216
eutJ	b2454	2569501	2570337	putative ethanolamine utilization chaperonin EutJ	eutN // eutE // eutJ // eutG	b2456 // b2455 // b2454 // b2453
trpL	b1265	1323038	1323082	<i>trp</i> operon leader peptide	trpA // trpB // trpC // trpD // trpE // trpL	b1260 // b1261 // b1262 // b1263 // b1264 // b1265
rplO	b3301	3444105	3444539	50S ribosomal subunit protein L15	rpmJ // secY // rplO // rpmD // rpsE // rplR // rplF // rpsH // rpsN // rplE // rplX // rplN	b3299 // b3300 // b3301 // b3302 // b3303 // b3304 // b3305 // b3306 // b3307 // b3308 // b3309 // b3310
araD	b0061	65855	66550	L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase AraD	araD // araA // araB	b0061 // b0062 // b0063
yceF	b1087	1146011	1146595	m<sup>7</sup>GTP pyrophosphatase	yceF	b1087
yidB	b3698	3877067	3877465	DUF937 domain-containing protein YidB	yidB	b3698
cnoX	b0492	517425	518279	chaperedoxin	cnoX	b0492
trpD	b1263	1319789	1321384	anthranilate synthase subunit TrpD	trpD // trpE // trpL // trpA // trpB // trpC	b1263 // b1264 // b1265 // b1260 // b1261 // b1262
dbpA	b1343	1409511	1410884	ATP-dependent RNA helicase DbpA		
dmlA	b1800	1881912	1882997	D-malate/3-isopropylmalate dehydrogenase (decarboxylating)	dmlA	b1800
ycaC	b0897	944931	945557	putative hydrolase	ycaC	b0897
yhfY	b3382	3511060	3511422	PRD domain-containing protein YhfY	yhfZ // yhfY	b3383 // b3382
ppiA	b3363	3491725	3492297	peptidyl-prolyl <i>cis-trans</i> isomerase A	ppiA	b3363
trpA	b1260	1316416	1317222	tryptophan synthase subunit &alpha;	trpA // trpB // trpC // trpD // trpE // trpL	b1260 // b1261 // b1262 // b1263 // b1264 // b1265
rrlG	b2589	2726281	2729184	23S ribosomal RNA	rrlG // gltW // rrsG // rrfG	b2589 // b2590 // b2591 // b2588
paaA	b1388	1453927	1454856	phenylacetyl-CoA 1,2-epoxidase, monooxygenase subunit	paaK // paaI // paaH // paaG // paaF // paaE // paaD // paaC // paaB // paaA // paaJ	b1398 // b1396 // b1395 // b1394 // b1393 // b1392 // b1391 // b1390 // b1389 // b1388 // b1397
glsB	b1524	1612325	1613251	glutaminase 2	glsB // yneG	b1524 // b1523
ydjA	b1765	1848125	1848676	putative oxidoreductase YdjA	ydjA // topB // selD	b1765 // b1763 // b1764
hchA	b1967	2035835	2036686	protein/nucleic acid deglycase 1	hchA	b1967
aroH	b1704	1788435	1789481	3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase, Trp-sensitive	aroH	b1704
sra	b1480	1555826	1555963	30S ribosomal subunit protein S22	bdm // sra	b1481 // b1480
yiaK	b3575	3742733	3743731	2,3-diketo-L-gulonate reductase	yiaM // sgbE // sgbU // sgbH // lyxK // yiaO // yiaN // yiaL // yiaK	b3577 // b3583 // b3582 // b3581 // b3580 // b3579 // b3578 // b3576 // b3575
ycaK	b0901	949668	950258	putative NAD(P)H-dependent oxidoreductase YcaK	ycaK	b0901
yhbP	b3154	3299472	3299915	putative FMN binding protein YhbP	yhbP	b3154
ecpE	b0289	304495	305205	putative fimbrial chaperone EcpE	ecpB // ecpC // ecpD // ecpE	b0292 // b0291 // b0290 // b0289
trpE	b1264	1321384	1322946	anthranilate synthase subunit TrpE	trpD // trpE // trpL // trpA // trpB // trpC	b1263 // b1264 // b1265 // b1260 // b1261 // b1262
rpsM	b3298	3442115	3442471	30S ribosomal subunit protein S13	rplQ // rpoA // rpsD // rpsK // rpsM	b3294 // b3295 // b3296 // b3297 // b3298
rpiB	b4090	4313350	4313799	allose-6-phosphate isomerase / ribose-5-phosphate isomerase B	rpiB	b4090
qorB	b4211	4433164	4434024	NAD(P)H:quinone oxidoreductase	qorB	b4211
rhsA	b3593	3762183	3766316	rhs element protein RhsA	rhsA // yibA	b3593 // b3594
hscA	b2526	2657085	2658935	iron-sulfur cluster biosynthesis chaperone HscA	iscX // fdx // hscA // hscB	b2524 // b2525 // b2526 // b2527
trpB	b1261	1317222	1318415	tryptophan synthase subunit &beta;	trpA // trpB // trpC // trpD // trpE // trpL	b1260 // b1261 // b1262 // b1263 // b1264 // b1265
rpmE	b3936	4127013	4127225	50S ribosomal subunit protein L31	rpmE	b3936
rbsA	b3749	3933778	3935283	ribose ABC transporter ATP binding subunit	rbsR // rbsD // rbsA // rbsC // rbsB // rbsK	b3753 // b3748 // b3749 // b3750 // b3751 // b3752
ynbA	b1408	1477621	1478226	CDP-alcohol phosphatidyltransferase domain-containing protein YnbA	ynbD // ynbC // ynbB // ynbA	b1411 // b1410 // b1409 // b1408
yggU	b2953	3096383	3096673	DUF167 domain-containing protein YggU	yggU // yggT // yggS // hemW // rdgB	b2953 // b2952 // b2951 // b2955 // b2954
oppA	b1243	1301182	1302813	oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein	oppA // oppF // oppD // oppC // oppB	b1243 // b1247 // b1246 // b1245 // b1244
trpC	b1262	1318427	1319788	fused indole-3-glycerol phosphate synthase/phosphoribosylanthranilate isomerase	trpA // trpB // trpC // trpD // trpE // trpL	b1260 // b1261 // b1262 // b1263 // b1264 // b1265
rplL	b3986	4180560	4180925	50S ribosomal subunit protein L7 // 50S ribosomal subunit protein L12	rpoC // rpoB // rplL // rplJ // rplA // rplK	b3988 // b3987 // b3986 // b3985 // b3984 // b3983
rpe	b3386	3514382	3515059	ribulose-phosphate 3-epimerase	aroB // aroK // damX // gph // rpe // dam // trpS	b3389 // b3390 // b3388 // b3385 // b3386 // b3387 // b3384
yibQ	b3614	3788101	3789060	divergent polysaccharide deacetylase domain-containing protein YibQ	yibQ // envC // gpmM	b3614 // b3613 // b3612
queE	b2777	2904747	2905418	putative 7-carboxy-7-deazaguanine synthase QueE	queE	b2777
dnaQ	b0215	236067	236798	DNA polymerase III subunit &epsilon;	dnaQ	b0215
thrB	b0003	2801	3733	homoserine kinase	thrA // thrB // thrC // thrL	b0002 // b0003 // b0004 // b0001
rmf	b0953	1015715	1015882	ribosome modulation factor	rmf	b0953
frlD	b3374	3503167	3503952	fructoselysine 6-kinase	frlD // frlC // frlB // frlA // frlR	b3374 // b4474 // b3371 // b3370 // b3375
kefG	b3351	3480607	3481161	glutathione-regulated potassium-efflux system ancillary protein KefG	kefG // kefB // yheV	b3351 // b3350 // b4551
ypfJ	b2475	2595874	2596737	uncharacterized protein YpfJ	ypfJ // tmcA	b2475 // b2474
ytfE	b4209	4431321	4431983	iron-sulfur cluster repair protein YtfE	ytfE	b4209
thrC	b0004	3734	5020	threonine synthase	thrA // thrB // thrC // thrL	b0002 // b0003 // b0004 // b0001
rrlC	b3758	3943704	3946607	23S ribosomal RNA	rrfC // rrlC // gltU // rrsC	b3759 // b3758 // b3757 // b3756
lacZ	b0344	363231	366305	&beta;-galactosidase	lacZ // lacA // lacY	b0344 // b0342 // b0343
ycjT	b1316	1377884	1380151	kojibiose phosphorylase	ymjB // ycjV // ycjU // ycjT // ycjS // ycjR // ycjQ // ycjP // ycjO // ycjN // ycjM // ompG	b4524 // b1318 // b1317 // b1316 // b1315 // b1314 // b1313 // b1312 // b1311 // b1310 // b1309 // b1319
yfaY	b2249	2362431	2363633	IPR008135 CinA family protein YfaY	yfaY	b2249
yajL	b0424	443051	443641	protein/nucleic acid deglycase 3	panE // yajL	b0425 // b0424
cysE	b3607	3781741	3782562	serine acetyltransferase	cysE	b3607
rimP	b3170	3317554	3318006	ribosome maturation factor RimP	pnp // rpsO // truB // rbfA // infB // nusA // rimP // metY	b3164 // b3165 // b3166 // b3167 // b3168 // b3169 // b3170 // b3171
araA	b0062	66835	68337	L-arabinose isomerase	araD // araA // araB	b0061 // b0062 // b0063
mqo	b2210	2305108	2306754	malate:quinone oxidoreductase	mqo	b2210
yoaH	b1811	1894552	1894731	UFP0181 family protein YoaH	yoaH	b1811
clpX	b0438	457426	458700	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	clpP // lon // clpX	b0437 // b0439 // b0438
cysK	b2414	2532409	2533380	cysteine synthase A	cysK	b2414
rpsJ	b3321	3452959	3453270	30S ribosomal subunit protein S10	rpsQ // rpmC // rplP // rpsC // rplV // rpsS // rplB // rplW // rplD // rplC // rpsJ	b3311 // b3312 // b3313 // b3314 // b3315 // b3316 // b3317 // b3318 // b3319 // b3320 // b3321
dhaL	b1199	1249125	1249757	dihydroxyacetone kinase subunit L	dhaL // dhaK // dhaM	b1199 // b1200 // b1198
ygeX	b2871	3007510	3008706	2,3-diaminopropionate ammonia-lyase	ygeX	b2871
ydhT	b1669	1748747	1749559	uncharacterized protein YdhT	ydhY // ydhV // ydhW // ydhX // ydhU // ydhT	b1674 // b1673 // b1672 // b1671 // b1670 // b1669
nfuA	b3414	3545624	3546199	iron-sulfur cluster carrier protein NfuA	yhgH // nfuA	b3413 // b3414
cysM	b2421	2538672	2539583	cysteine synthase B	cysM // cysA // cysW // cysU // cysP	b2421 // b2422 // b2423 // b2424 // b2425
rpmB	b3637	3811438	3811674	50S ribosomal subunit protein L28	yicR // mutM // rpmG // rpmB	b3638 // b3635 // b3636 // b3637
uxuB	b4323	4552901	4554361	D-mannonate oxidoreductase	uxuB // uxuA	b4323 // b4322
solA	b1059	1119468	1120586	N-methyl-L-tryptophan oxidase	solA // yceO	b1059 // b1058
curA	b1449	1519027	1520064	NADPH-dependent curcumin/dihydrocurcumin reductase	curA	b1449
ybgP	b0717	748979	749707	putative fimbrial chaperone YbgP	ybgQ // ybgP // ybgO	b0718 // b0717 // b0716
gltL	b0652	684530	685255	glutamate/aspartate ABC transporter ATP binding subunit	sroC // gltL // gltK // gltJ // gltI	b4763 // b0652 // b0653 // b0654 // b0655
rplI	b4203	4426108	4426557	50S ribosomal subunit protein L9	rpsF // priB // rpsR // rplI	b4200 // b4201 // b4202 // b4203
alsB	b4088	4311107	4312042	D-allose ABC transporter periplasmic binding protein	alsE // alsC // alsA // alsB // alsR	b4085 // b4086 // b4087 // b4088 // b4089
pptA	b1461	1533052	1533285	tautomerase PptA	pptA	b1461
cobB	b1120	1179520	1180359	CobB-S // protein-lysine deacetylase/desuccinylase/lipoamidase	cobB // nagK	b1120 // b1119
ppiC	b3775	3959532	3959813	peptidyl-prolyl <i>cis-trans</i> isomerase C	ppiC	b3775
gltI	b0655	686839	687747	glutamate/aspartate ABC transporter periplasmic binding protein	sroC // gltL // gltK // gltJ // gltI	b4763 // b0652 // b0653 // b0654 // b0655
ssrA	b2621	2755593	2755955	tmRNA	ssrA	b2621
ghrB	b3553	3717310	3718284	glyoxylate reductase	ghrB	b3553
rhmD	b2247	2360209	2361414	L-rhamnonate dehydratase	yfaX // rhmD // yfaV // yfaU	b2248 // b2247 // b2246 // b2245
ybjX	b0877	918128	919120	DUF535 domain-containing protein YbjX	ybjX	b0877
hypC	b2728	2851864	2852136	hydrogenase 3 maturation protein HypC	fhlA // hypE // hypD // hypC // hypB // hypA	b2731 // b2730 // b2729 // b2728 // b2727 // b2726
gdhA	b1761	1842371	1843714	glutamate dehydrogenase	gdhA	b1761
rrfH	b0205	228756	228875	5S ribosomal RNA	alaV // ileV // rrsH // rrfH // rrlH	b0203 // b0202 // b0201 // b0205 // b0204
frwD	b3953	4147138	4147479	putative PTS enzyme IIB component FrwD	frwD	b3953
yliI	b0837	878742	879857	aldose sugar dehydrogenase YliI	yliI	b0837
ybeU	b0648	679508	680215	DUF1266 domain-containing protein YbeU	djlC // ybeU	b0649 // b0648
aslB	b3800	3982958	3984193	putative anaerobic sulfatase maturation enzyme AslB	aslB	b3800
leuA	b0074	81958	83529	2-isopropylmalate synthase	leuD // leuC // leuB // leuA // leuL	b0071 // b0072 // b0073 // b0074 // b0075
raiA	b2597	2737154	2737495	ribosome-associated inhibitor A	raiZ // raiA	b4805 // b2597
galM	b0756	787797	788837	galactose-1-epimerase	galM // galK // galT // galE	b0756 // b0757 // b0758 // b0759
kefF	b0046	47246	47776	regulator of KefC-mediated potassium transport and quinone oxidoreductase	kefC // kefF	b0047 // b0046
yahK	b0325	342884	343933	aldehyde reductase, NADPH-dependent	yahK	b0325
yraI	b3143	3288090	3288785	putative fimbrial chaperone YraI	yraK // yraJ // yraI	b3145 // b3144 // b3143
leuB	b0073	80867	81958	3-isopropylmalate dehydrogenase	leuD // leuC // leuB // leuA // leuL	b0071 // b0072 // b0073 // b0074 // b0075
rpsG	b3341	3473542	3474081	30S ribosomal subunit protein S7	rpsG // rpsL // fusA // tufA	b3341 // b3342 // b3340 // b3339
uxaC	b3092	3243329	3244741	D-glucoronate/D-galacturonate isomerase	uxaA // uxaC	b3091 // b3092
preA	b2147	2235265	2236500	NAD-dependent dihydropyrimidine dehydrogenase subunit PreA	preA // preT	b2147 // b2146
rbsZ	b4804	3937045	3937278	small regulatory RNA RbsZ		
djlB	b0646	677415	678842	J domain-containing protein DjlB	djlB // ybeR	b0646 // b0645
leuL	b0075	83622	83708	<i>leu</i> operon leader peptide	leuD // leuC // leuB // leuA // leuL	b0071 // b0072 // b0073 // b0074 // b0075
rplW	b3318	3451382	3451684	50S ribosomal subunit protein L23	rpsQ // rpmC // rplP // rpsC // rplV // rpsS // rplB // rplW // rplD // rplC // rpsJ	b3311 // b3312 // b3313 // b3314 // b3315 // b3316 // b3317 // b3318 // b3319 // b3320 // b3321
kbaZ	b3132	3278914	3280194	putative tagatose-1,6-bisphosphate aldolase 1 chaperone	agaA // agaW // agaV // kbaZ	b3135 // b3134 // b3133 // b3132
yegS	b2086	2168712	2169611	lipid kinase YegS	yegS	b2086
sokE	b4700	607734	607792	small RNA SokE		
torD	b0998	1061799	1062398	trimethylamine-N-oxide reductase-specific chaperone	torC // torA // torD	b0996 // b0997 // b0998
livJ	b3460	3598555	3599658	branched chain amino acid/phenylalanine ABC transporter periplasmic binding protein	livJ	b3460
rplD	b3319	3451681	3452286	50S ribosomal subunit protein L4	rpsQ // rpmC // rplP // rpsC // rplV // rpsS // rplB // rplW // rplD // rplC // rpsJ	b3311 // b3312 // b3313 // b3314 // b3315 // b3316 // b3317 // b3318 // b3319 // b3320 // b3321
lacA	b0342	361249	361860	galactoside <i>O</i>-acetyltransferase	lacA // lacY // lacZ	b0342 // b0343 // b0344
glsA	b0485	511641	512573	glutaminase 1	ybaT // glsA	b0486 // b0485
ypdK	b4680	2496921	2496992	uncharacterized membrane protein YpdK		
dsbC	b2893	3038112	3038822	protein disulfide isomerase DsbC	lysS // prfB // recJ // dsbC // xerD	b2890 // b2891 // b2892 // b2893 // b2894
leuD	b0071	78848	79453	3-isopropylmalate dehydratase subunit LeuD	leuD // leuC // leuB // leuA // leuL	b0071 // b0072 // b0073 // b0074 // b0075
rrsG	b2591	2729616	2731157	16S ribosomal RNA	rrlG // gltW // rrsG // rrfG	b2589 // b2590 // b2591 // b2588
fucI	b2802	2935584	2937359	L-fucose isomerase	fucP // fucI // fucK // fucR // fucU	b2801 // b2802 // b2803 // b2805 // b2804
cdh	b3918	4109930	4110685	CDP-diacylglycerol diphosphatase	cdh	b3918
yfaL	b2233	2340417	2344169	putative autotransporter adhesin YfaL	yfaL	b2233
hyaE	b0976	1036354	1036752	putative HyaA chaperone	hyaA // hyaB // hyaC // hyaD // hyaE // hyaF	b0972 // b0973 // b0974 // b0975 // b0976 // b0977
livK	b3458	3596451	3597560	L-leucine/L-phenylalanine ABC transporter periplasmic binding protein	livF // livG // livM // livH // livK	b3454 // b3455 // b3456 // b3457 // b3458
rrfD	b3274	3423668	3423787	5S ribosomal RNA	rrfF // thrV // rrfD // rrlD // alaU // ileU // rrsD	b3272 // b3273 // b3274 // b3275 // b3276 // b3277 // b3278
aceF	b0115	125695	127587	AceF-dihydrolipoate // AceF-S-acetyldihydrolipoate // AceF-lipoate // pyruvate dehydrogenase, E2 subunit	pdhR // aceE // aceF // lpd	b0113 // b0114 // b0115 // b0116
ridA	b4243	4470527	4470913	enamine/imine deaminase, redox-regulated chaperone	ridA	b4243
rpnE	b2244	2356904	2357803	inactive recombination-promoting nuclease-like protein RpnE	ypaA // rpnE	b4543 // b2244
hycI	b2717	2842573	2843043	hydrogenase 3 maturation protease	hycI // hycH // hycG // hycF // hycE // hycD // hycC // hycB // hycA	b2717 // b2718 // b2719 // b2720 // b2721 // b2722 // b2723 // b2724 // b2725
leuC	b0072	79464	80864	3-isopropylmalate dehydratase subunit LeuC	leuD // leuC // leuB // leuA // leuL	b0071 // b0072 // b0073 // b0074 // b0075
rpsT	b0023	20815	21078	30S ribosomal subunit protein S20	rpsT	b0023
glxK	b0514	541888	543033	glycerate 2-kinase 2	ybbY // allB // ybbW // glxR // hyi // gcl // glxK	b0513 // b0512 // b0511 // b0509 // b0508 // b0507 // b0514
azoR	b1412	1482255	1482860	FMN dependent NADH:quinone oxidoreductase	azoR	b1412
pgeF	b2593	2734303	2735034	polyphenol oxidase YfiH	rluD // pgeF	b2594 // b2593
sfmC	b0531	558974	559666	putative fimbrial chaperone SfmC	sfmD // sfmC	b0532 // b0531
hisC	b2021	2092398	2093468	histidinol-phosphate aminotransferase	hisG // hisD // hisC // hisI // hisF // hisA // hisH // hisB // hisL	b2019 // b2020 // b2021 // b2026 // b2025 // b2024 // b2023 // b2022 // b2018
rpsD	b3296	3441055	3441675	30S ribosomal subunit protein S4	rplQ // rpoA // rpsD // rpsK // rpsM	b3294 // b3295 // b3296 // b3297 // b3298
dgoK	b3693	3873596	3874474	2-dehydro-3-deoxygalactonokinase	dgoR // dgoK // dgoA // dgoD // dgoT	b4479 // b3693 // b4477 // b4478 // b3691
cueO	b0123	137083	138633	multicopper oxidase CueO	cueO	b0123
yjbD	b4023	4231359	4231631	DUF3811 domain-containing protein YjbD	yjbD	b4023
hybE	b2992	3140311	3140799	hydrogenase 2-specific chaperone	hybO // hybG // hybF // hybE // hybD // hybC // hybB // hybA	b2997 // b2990 // b2991 // b2992 // b2993 // b2994 // b2995 // b2996
hisL	b2018	2089996	2090046	<i>his</i> operon leader peptide	hisL // hisG // hisD // hisC // hisB // hisH // hisA // hisF // hisI	b2018 // b2019 // b2020 // b2021 // b2022 // b2023 // b2024 // b2025 // b2026
rplS	b2606	2744183	2744530	50S ribosomal subunit protein L19	rplS // trmD // rimM // rpsP	b2606 // b2607 // b2608 // b2609
idnK	b4268	4494623	4495186	D-gluconate kinase, thermosensitive	idnK	b4268
yhfK	b3358	3486791	3488893	putative transporter YhfK	yhfK	b3358
efeB	b1019	1083376	1084647	heme-containing peroxidase/deferrochelatase	efeB // efeO	b1019 // b1018
ppiB	b0525	553943	554437	peptidyl-prolyl <i>cis-trans</i> isomerase B	ppiB // lpxH	b0525 // b0524
hisH	b2023	2094535	2095125	imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH	hisL // hisG // hisD // hisC // hisB // hisH // hisA // hisF // hisI	b2018 // b2019 // b2020 // b2021 // b2022 // b2023 // b2024 // b2025 // b2026
rplA	b3984	4178879	4179583	50S ribosomal subunit protein L1	rplA // rplK // rplJ // rplL // rpoC // rpoB	b3984 // b3983 // b3985 // b3986 // b3988 // b3987
garR	b3125	3271867	3272751	tartronate semialdehyde reductase	rnpB // garK // garR // garL // garP	b3123 // b3124 // b3125 // b3126 // b3127
ydbK	b1378	1437260	1440784	putative pyruvate-flavodoxin oxidoreductase	ompN // ydbK	b1377 // b1378
wrbA	b1004	1067112	1067708	NAD(P)H:quinone oxidoreductase	wrbA // yccJ	b1004 // b1003
yfcS	b2336	2451584	2452336	putative fimbrial chaperone YfcS	yfcU // yfcS // yfcR // yfcQ // yfcP // yfcO	b4661 // b2336 // b2335 // b2334 // b2333 // b2332
hisD	b2020	2091097	2092401	histidinal/histidinol dehydrogenase	hisG // hisD // hisC // hisI // hisF // hisA // hisH // hisB // hisL	b2019 // b2020 // b2021 // b2026 // b2025 // b2024 // b2023 // b2022 // b2018
rfbC	b2038	2109581	2110138	dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase	rfbX // rfbC // rfbA // rfbD // rfbB	b2037 // b2038 // b2039 // b2040 // b2041
srlB	b2704	2827362	2827733	sorbitol-specific PTS enzyme IIA component	srlA // srlE // srlB // srlD // gutM // gutQ // srlR	b2702 // b2703 // b2704 // b2705 // b2706 // b2708 // b2707
hinT	b1103	1161885	1162244	purine nucleoside phosphoramidase	ycfP // nagZ // thiK // lpoB // ycfL // hinT	b1108 // b1107 // b1106 // b1105 // b1104 // b1103
hflD	b1132	1191990	1192631	lysogenization regulator	purB // hflD	b1131 // b1132
ecpB	b0292	309358	310026	putative fimbrial chaperone EcpB	ecpB // ecpC // ecpD // ecpE	b0292 // b0291 // b0290 // b0289
hisA	b2024	2095125	2095862	1-(5-phosphoribosyl)-5-[(5-phosphoribosylamino)methylideneamino]imidazole-4-carboxamide isomerase	hisL // hisG // hisD // hisC // hisB // hisH // hisA // hisF // hisI	b2018 // b2019 // b2020 // b2021 // b2022 // b2023 // b2024 // b2025 // b2026
rcsA	b1951	2023968	2024591	DNA-binding transcriptional activator RcsA	rcsA	b1951
pfkA	b3916	4107552	4108514	6-phosphofructokinase 1	pfkA	b3916
ygjK	b3080	3228888	3231239	glycoside hydrolase	ygjK // ygjJ	b3080 // b3079
yjfK	b4183	4411302	4411961	DUF2491 domain-containing protein YjfK	yjfC // yjfM // yjfL // yjfK	b4186 // b4185 // b4184 // b4183
hscB	b2527	2658952	2659467	[Fe-S] cluster biosynthesis co-chaperone HscB	iscX // fdx // hscA // hscB	b2524 // b2525 // b2526 // b2527
hisI	b2026	2096614	2097225	putative bifunctional phosphoribosyl-AMP cyclohydrolase/phosphoribosyl-ATP pyrophosphatase	hisL // hisG // hisD // hisC // hisB // hisH // hisA // hisF // hisI	b2018 // b2019 // b2020 // b2021 // b2022 // b2023 // b2024 // b2025 // b2026
asmA	b2064	2139759	2141612	putative assembly protein AsmA	asmA	b2064
lgoD	b4358	4595990	4597012	L-galactonate oxidoreductase	lgoD	b4358
nudJ	b1134	1193827	1194288	phosphatase NudJ	rluE // nudJ	b1135 // b1134
htrL	b3618	3792826	3793683	protein HtrL	htrL	b3618
pcm	b2743	2868893	2869519	L-isoaspartate protein carboxylmethyltransferase type II	pcm // umpG	b2743 // b2744
hisF	b2025	2095844	2096620	imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF	hisL // hisG // hisD // hisC // hisB // hisH // hisA // hisF // hisI	b2018 // b2019 // b2020 // b2021 // b2022 // b2023 // b2024 // b2025 // b2026
lpxA	b0181	202560	203348	acyl-[acyl-carrier-protein]&mdash;UDP-<i>N</i>-acetylglucosamine <i>O</i>-acyltransferase	dnaE // rnhB // lpxB // bamA // lpxA // fabZ // lpxD // skp	b0184 // b0183 // b0182 // b0177 // b0181 // b0180 // b0179 // b0178
malX	b1621	1699355	1700947	PTS enzyme IIBC component MalX	malX // malY	b1621 // b1622
yihX	b3885	4075553	4076152	&alpha;-D-glucose-1-phosphate phosphatase YihX	fabY // dtd // yihY // yihX	b3888 // b3887 // b3886 // b3885
php	b3379	3507712	3508590	putative hydrolase	yhfX // yhfW // php // yhfU // yhfT // yhfS	b3381 // b3380 // b3379 // b3378 // b3377 // b3376
dppA	b3544	3706098	3707705	dipeptide ABC transporter periplasmic binding protein	dppF // dppD // dppC // dppB // dppA	b3540 // b3541 // b3542 // b3543 // b3544
hisB	b2022	2093468	2094535	imidazoleglycerol-phosphate dehydratase / histidinol-phosphatase	hisL // hisG // hisD // hisC // hisB // hisH // hisA // hisF // hisI	b2018 // b2019 // b2020 // b2021 // b2022 // b2023 // b2024 // b2025 // b2026
rffM	b3794	3979956	3980696	UDP-N-acetyl-D-mannosaminuronic acid transferase	rffM // wzyE // wecF // wzxE // wecE // rffC // rffH // rffG // wecC // wecB // wzzE // rfe	b3794 // b3793 // b4481 // b3792 // b3791 // b3790 // b3789 // b3788 // b3787 // b3786 // b3785 // b3784
glgX	b3431	3569346	3571319	limit dextrin alpha-1,6-glucohydrolase	glgX // glgB // glgC // glgP // glgA	b3431 // b3432 // b3430 // b3428 // b3429
nudI	b2251	2364554	2364979	pyrimidine deoxynucleotide diphosphatase NudI	nudI	b2251
yciE	b1257	1314718	1315224	DUF892 domain-containing protein YciE	yciE // yciF // yciG	b1257 // b1258 // b1259
ydeM	b1497	1579633	1580790	putative anaerobic sulfatase maturation enzyme YdeM	ydeN // ydeM	b1498 // b1497
hisG	b2019	2090192	2091091	ATP phosphoribosyltransferase	hisG // hisD // hisC // hisI // hisF // hisA // hisH // hisB // hisL	b2019 // b2020 // b2021 // b2026 // b2025 // b2024 // b2023 // b2022 // b2018
waaB	b3628	3803058	3804137	UDP-D-galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide-1,6-D-galactosyltransferase	rirA // waaY // waaJ // waaO // waaB // waaS // waaP // waaG // waaQ // waaU // waaZ	b4760 // b3625 // b3626 // b3627 // b3628 // b3629 // b3630 // b3631 // b3632 // b3623 // b3624
fbaA	b2925	3070165	3071244	fructose-bisphosphate aldolase class II	epd // fbaA // pgk	b2927 // b2925 // b2926
hcr	b0872	911182	912150	NADH oxidoreductase	hcr // hcp // ltaE // ybjT // poxB	b0872 // b0873 // b0870 // b0869 // b0871
yqjG	b3102	3251024	3252010	glutathionyl-hydroquinone reductase YqjG	yqjG	b3102
djlA	b0055	57364	58179	co-chaperone protein DjlA	djlA	b0055
metE	b3829	4013053	4015314	cobalamin-independent homocysteine transmethylase	metE	b3829
glmS	b3729	3911839	3913668	L-glutamine&mdash;D-fructose-6-phosphate aminotransferase	glmS // glmU	b3729 // b3730
hcaD	b2542	2672047	2673249	putative 3-phenylpropionate/cinnamate dioxygenase ferredoxin reductase subunit	hcaD // hcaB // hcaC // hcaF // hcaE	b2542 // b2541 // b2540 // b2539 // b2538
adeD	b3665	3843964	3845730	adenine deaminase	adeD	b3665
gor	b3500	3646299	3647651	glutathione reductase (NADPH)	gor	b3500
narJ	b1226	1285139	1285849	nitrate reductase 1 molybdenum cofactor assembly chaperone	narG // narH // narJ // narI	b1224 // b1225 // b1226 // b1227
metA	b4013	4214280	4215209	homoserine <i>O</i>-succinyltransferase	metA	b4013
lpxH	b0524	553218	553940	UDP-2,3-diacylglucosamine diphosphatase	ppiB // lpxH	b0525 // b0524
paaH	b1395	1459054	1460481	3-hydroxyadipyl-CoA dehydrogenase	paaK // paaI // paaH // paaG // paaF // paaE // paaD // paaC // paaB // paaA // paaJ	b1398 // b1396 // b1395 // b1394 // b1393 // b1392 // b1391 // b1390 // b1389 // b1388 // b1397
preT	b2146	2234033	2235271	NAD-dependent dihydropyrimidine dehydrogenase subunit PreT	preA // preT	b2147 // b2146
ygfM	b2880	3020540	3021319	putative oxidoreductase	xdhD // ygfM	b2881 // b2880
dnaJ	b0015	14168	15298	chaperone protein DnaJ	tpke11 // dnaK // dnaJ	b0014 // b0015
metH	b4019	4223828	4227511	cobalamin-dependent methionine synthase	metH	b4019
rffC	b3790	3974467	3975141	dTDP-4-amino-4,6-dideoxy-D-galactose acyltransferase	rffM // wzyE // wecF // wzxE // wecE // rffC // rffH // rffG // wecC // wecB // wzzE // rfe	b3794 // b3793 // b4481 // b3792 // b3791 // b3790 // b3789 // b3788 // b3787 // b3786 // b3785 // b3784
mngB	b0732	767978	770611	&alpha;-mannosidase	mngA // mngB	b0731 // b0732
ybdK	b0581	606265	607383	carboxylate-amine ligase	ybdK	b0581
ygcP	b2768	2894196	2894771	putative anti-terminator regulatory protein	ygcP // ygcO // ygcN	b2768 // b2767 // b2766
cpxP	b4484	4105820	4106320	periplasmic protein CpxP	cpxQ // cpxP	b4716 // b4484
metC	b3008	3152236	3153423	cystathionine &beta;-lyase / L-cysteine desulfhydrase / alanine racemase	metC	b3008
waaP	b3630	3805153	3805950	lipopolysaccharide core heptose (I) kinase	rirA // waaY // waaJ // waaO // waaB // waaS // waaP // waaG // waaQ // waaU // waaZ	b4760 // b3625 // b3626 // b3627 // b3628 // b3629 // b3630 // b3631 // b3632 // b3623 // b3624
dhaM	b1198	1247696	1249114	dihydroxyacetone kinase subunit M	dhaM // dhaL // dhaK	b1198 // b1199 // b1200
yhdE	b3248	3397785	3398378	nucleoside triphosphate pyrophosphatase YhdE		
yfeX	b2431	2549646	2550545	porphyrinogen peroxidase	yfeX // yfeY	b2431 // b2432
elfD	b0939	998490	999191	putative fimbrial chaperone ElfD	ycbF // ycbV // ycbU // elfG // elfC // elfD	b0944 // b0943 // b0942 // b0941 // b0940 // b0939
aroG	b0754	785633	786685	3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase, Phe-sensitive	aroG	b0754
lpxC	b0096	106557	107474	UDP-3-O-acyl-N-acetylglucosamine deacetylase	mraZ // rsmH // lpxC // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL	b0081 // b0082 // b0096 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083
ucpA	b2426	2543832	2544623	oxidoreductase UcpA	ucpA	b2426
yeeX	b2007	2079032	2079361	DUF496 domain-containing protein YeeX	yeeX	b2007
msrB	b1778	1862016	1862429	methionine sulfoxide reductase B	msrB	b1778
pheL	b2598	2737599	2737646	<i>phe</i> operon leader peptide	pheA // pheL	b2599 // b2598
wecH	b3561	3725887	3726882	<i>O</i>-acetyltransferase WecH	wecH	b3561
rhaD	b3902	4093448	4094272	rhamnulose-1-phosphate aldolase	rhaD // rhaA // rhaB	b3902 // b3903 // b3904
yeaW	b1802	1884665	1885789	carnitine monooxygenase subunit YeaW	yeaW // yeaV	b1802 // b1801
yadV	b0140	155461	156201	putative fimbrial chaperone YadV	htrE // yadV	b0139 // b0140
asnA	b3744	3927155	3928147	asparagine synthetase A	asnA	b3744
wecC	b3787	3971260	3972522	UDP-<i>N</i>-acetyl-D-mannosamine dehydrogenase	rffM // wzyE // wecF // wzxE // wecE // rffC // rffH // rffG // wecC // wecB // wzzE // rfe	b3794 // b3793 // b4481 // b3792 // b3791 // b3790 // b3789 // b3788 // b3787 // b3786 // b3785 // b3784
rpiA	b2914	3058666	3059325	ribose-5-phosphate isomerase A	rpiA	b2914
ydhL	b1648	1725681	1725920	DUF1289 domain-containing protein YdhL	ydhL	b1648
mglB	b2150	2239350	2240348	D-galactose/methyl-galactoside ABC transporter periplasmic binding protein	mglB // mglC // mglA	b2150 // b2148 // b2149
ltaE	b0870	908293	909294	low-specificity L-threonine aldolase	hcr // hcp // poxB // ltaE // ybjT	b0872 // b0873 // b0871 // b0870 // b0869
glmU	b3730	3913830	3915200	fused N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase and glucosamine-1-phosphate acetyltransferase	glmS // glmU	b3729 // b3730
malP	b3417	3550080	3552473	maltodextrin phosphorylase	malP // malQ	b3417 // b3416
ydcL	b1431	1502457	1503125	DUF3313 domain-containing lipoprotein YdcL	ydcL	b1431
fkpA	b3347	3476607	3477419	peptidyl-prolyl <i>cis-trans</i> isomerase FkpA	fkpA	b3347
artP	b0864	903006	903734	L-arginine ABC transporter ATP binding subunit	artM // artQ // artI // artP	b0861 // b0862 // b0863 // b0864
glf	b2036	2107226	2108329	UDP-galactopyranose mutase	wbbH // glf	b2035 // b2036
ebgC	b3077	3225722	3226171	DUF386 domain-containing evolved &beta;-D-galactosidase subunit &beta;	ebgA // ebgC	b3076 // b3077
yceM	b1068	1126806	1127729	putative oxidoreductase YceM	yceM	b1068
djlC	b0649	680212	681663	co-chaperone DjlC	djlC // ybeU	b0649 // b0648
argB	b3959	4156013	4156789	acetylglutamate kinase	argC // argB // argH	b3958 // b3959 // b3960
waaY	b3625	3800267	3800965	lipopolysaccharide core heptose (II) kinase	rirA // waaY // waaJ // waaO // waaB // waaS // waaP // waaG // waaQ // waaU // waaZ	b4760 // b3625 // b3626 // b3627 // b3628 // b3629 // b3630 // b3631 // b3632 // b3623 // b3624
paaE	b1392	1456430	1457500	phenylacetyl-CoA 1,2-epoxidase, reductase subunit	paaK // paaI // paaH // paaG // paaF // paaE // paaD // paaC // paaB // paaA // paaJ	b1398 // b1396 // b1395 // b1394 // b1393 // b1392 // b1391 // b1390 // b1389 // b1388 // b1397
dgcI	b0834	875335	876663	putative diguanylate cyclase DgcI	dgcI // pdeI	b0834 // b0833
yegD	b2069	2147674	2149026	HSP70 family protein YegD	yegD	b2069
argH	b3960	4156850	4158223	argininosuccinate lyase	argC // argB // argH	b3958 // b3959 // b3960
yjbE	b4026	4235906	4236148	uncharacterized protein YjbE	yjbH // yjbG // yjbF // yjbE	b4029 // b4028 // b4027 // b4026
glk	b2388	2508461	2509426	glucokinase	glk	b2388
ybdF	b0579	605518	605886	PF04237 family protein YbdF	ybdF	b0579
nrfF	b4075	4293163	4293546	putative formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfF	nrfA // nrfB // nrfC // nrfD // nrfE // nrfF // nrfG	b4070 // b4071 // b4072 // b4073 // b4074 // b4075 // b4076
argG	b3172	3318637	3319980	argininosuccinate synthetase	argG	b3172
lpxB	b0182	203348	204496	lipid A disaccharide synthase	dnaE // rnhB // lpxB // bamA // lpxA // fabZ // lpxD // skp	b0184 // b0183 // b0182 // b0177 // b0181 // b0180 // b0179 // b0178
aldB	b3588	3754973	3756511	aldehyde dehydrogenase B	aldB	b3588
ecpC	b0291	306807	309332	putative fimbrial usher protein EcpC	ecpB // ecpC // ecpD // ecpE	b0292 // b0291 // b0290 // b0289
fkpB	b0028	25826	26275	peptidyl-prolyl <i>cis-trans</i> isomerase FkpB	ribF // ispH // fkpB // lspA // ileS	b0025 // b0029 // b0028 // b0027 // b0026
argC	b3958	4155001	4156005	N-acetylglutamylphosphate reductase	argC // argB // argH	b3958 // b3959 // b3960
glmM	b3176	3322733	3324070	phosphoglucosamine mutase	folP // glmM	b3177 // b3176
bglX	b2132	2219692	2221989	&beta;-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic	bglX	b2132
tff	b4414	189712	189847	putative small RNA T44	tff // rpsB // tsf	b4414 // b0169 // b0170
naRNA5		4325905	4325981	naRNA5		
hyaF	b0977	1036749	1037606	protein HyaF	hyaA // hyaB // hyaC // hyaD // hyaE // hyaF	b0972 // b0973 // b0974 // b0975 // b0976 // b0977
argE	b3957	4153696	4154847	acetylornithine deacetylase	argE	b3957
waaO	b3627	3802039	3803058	UDP-D-glucose:(glucosyl)LPS &alpha;-1,3-glucosyltransferase	rirA // waaY // waaJ // waaO // waaB // waaS // waaP // waaG // waaQ // waaU // waaZ	b4760 // b3625 // b3626 // b3627 // b3628 // b3629 // b3630 // b3631 // b3632 // b3623 // b3624
amyA	b1927	2006156	2007643	alpha-amylase	amyA	b1927
umpG	b2744	2869513	2870274	broad specificity 5'(3')-nucleotidase and polyphosphatase	pcm // umpG	b2743 // b2744
micL	b4717	1958441	1958520	small regulatory RNA MicL-S	micL	b4717
hemW	b2955	3097267	3098403	heme chaperone HemW	hemW // rdgB // yggU // yggT // yggS	b2955 // b2954 // b2953 // b2952 // b2951
argI	b4254	4477307	4478311	ornithine carbamoyltransferase ArgI	argI	b4254
dsrA	b1954	2025223	2025313	small regulatory RNA DsrA	dsrA	b1954
uxuA	b4322	4551636	4552820	D-mannonate dehydratase	uxuB // uxuA	b4323 // b4322
lsrK	b1511	1598617	1600209	autoinducer-2 kinase	lsrR // lsrK	b1512 // b1511
insJK		3720680	3722049	IS150 protein InsAB		
sfmH	b0533	562336	563319	putative fimbrial adhesin protein SfmH	sfmF // sfmH	b0534 // b0533
artJ	b0860	899844	900575	L-arginine ABC transporter periplasmic binding protein	artJ	b0860
wecE	b3791	3975146	3976276	dTDP-4-dehydro-6-deoxy-D-glucose transaminase	rffM // wzyE // wecF // wzxE // wecE // rffC // rffH // rffG // wecC // wecB // wzzE // rfe	b3794 // b3793 // b4481 // b3792 // b3791 // b3790 // b3789 // b3788 // b3787 // b3786 // b3785 // b3784
rbsK	b3752	3937294	3938223	ribokinase	rbsR // rbsD // rbsA // rbsC // rbsB // rbsK	b3753 // b3748 // b3749 // b3750 // b3751 // b3752
ibsA	b4667	2153349	2153408	toxic peptide IbsA		
ybcI	b0527	556032	556553	PF04307 family inner membrane protein YbcI	ybcI	b0527
cbpA	b1000	1062855	1063775	curved DNA-binding protein	cbpM // cbpA	b0999 // b1000
argA	b2818	2949242	2950573	N-acetylglutamate synthase	argA	b2818
waaQ	b3632	3807064	3808098	lipopolysaccharide core heptosyltransferase 3	rirA // waaY // waaJ // waaO // waaB // waaS // waaP // waaG // waaQ // waaU // waaZ	b4760 // b3625 // b3626 // b3627 // b3628 // b3629 // b3630 // b3631 // b3632 // b3623 // b3624
mhpD	b0350	372115	372924	2-hydroxypentadienoate hydratase	mhpF // mhpE // mhpD // mhpC // mhpB // mhpA	b0351 // b0352 // b0350 // b0349 // b0348 // b0347
ibsD	b4664	3194766	3194825	putative toxic peptide IbsD	ibsD	b4664
yiaV	b3586	3752963	3754099	putative membrane fusion protein YiaV	yiaW // yiaV	b3587 // b3586
hybG	b2990	3139716	3139964	hydrogenase maturation factor HybG	hybO // hybG // hybF // hybE // hybD // hybC // hybB // hybA	b2997 // b2990 // b2991 // b2992 // b2993 // b2994 // b2995 // b2996
glnQ	b0809	845741	846463	L-glutamine ABC transporter ATP binding subunit	glnQ // glnP // glnH	b0809 // b0810 // b0811
lpxD	b0179	200971	201996	UDP-3-<i>O</i>-(3-hydroxymyristoyl)glucosamine <i>N</i>-acyltransferase	dnaE // rnhB // lpxB // bamA // lpxA // fabZ // lpxD // skp	b0184 // b0183 // b0182 // b0177 // b0181 // b0180 // b0179 // b0178
mglA	b2149	2237769	2239289	D-galactose/methyl-galactoside ABC transporter ATP binding subunit	mglB // mglC // mglA	b2150 // b2148 // b2149
tomB	b0461	480334	480708	Hha toxicity modulator TomB	tomB // hha	b0461 // b0460
yohC	b2135	2225044	2225631	putative inner membrane protein	yohC	b2135
surA	b0053	53416	54702	chaperone SurA	lptD // surA // apaH // apaG // rsmA // pdxA	b0054 // b0053 // b0049 // b0050 // b0051 // b0052
glnH	b0811	847258	848004	L-glutamine ABC transporter periplasmic binding protein	glnP // glnH // glnQ	b0810 // b0811 // b0809
rfbD	b2040	2111077	2111976	dTDP-4-dehydrorhamnose reductase	rfbD // rfbB // rfbX // rfbC // rfbA	b2040 // b2041 // b2037 // b2038 // b2039
gatZ	b2095	2175059	2176321	putative tagatose-1,6-bisphosphate aldolase 2 chaperone	gatD // gatC // gatB // gatA // gatZ // gatY	b2091 // b2092 // b2093 // b2094 // b2095 // b2096
ygfX	b2896	3040416	3040823	protein YgfX	sdhE // ygfX	b2897 // b2896
yeeD	b2012	2084226	2084453	putative sulfurtransferase YeeD	yeeE // yeeD	b2013 // b2012
skp	b0178	200482	200967	periplasmic chaperone Skp	dnaE // rnhB // lpxB // bamA // lpxA // fabZ // lpxD // skp	b0184 // b0183 // b0182 // b0177 // b0181 // b0180 // b0179 // b0178
artI	b0863	902257	902988	putative ABC transporter periplasmic binding protein ArtI	artM // artQ // artI // artP	b0861 // b0862 // b0863 // b0864
rffG	b3788	3972522	3973589	dTDP-glucose 4,6-dehydratase 2	rffM // wzyE // wecF // wzxE // wecE // rffC // rffH // rffG // wecC // wecB // wzzE // rfe	b3794 // b3793 // b4481 // b3792 // b3791 // b3790 // b3789 // b3788 // b3787 // b3786 // b3785 // b3784
paaB	b1389	1454868	1455155	phenylacetyl-CoA 1,2-epoxidase subunit B	paaK // paaI // paaH // paaG // paaF // paaE // paaD // paaC // paaB // paaA // paaJ	b1398 // b1396 // b1395 // b1394 // b1393 // b1392 // b1391 // b1390 // b1389 // b1388 // b1397
shoB	b4687	2700117	2700197	toxic peptide ShoB	shoB	b4687
yidX	b3696	3875438	3876094	putative lipoprotein YidX	yidX	b3696
eutA	b2451	2565481	2566884	ethanolamine ammonia-lyase reactivase EutA	eutH // eutA	b2452 // b2451
alaA	b2290	2407561	2408778	glutamate&mdash;pyruvate aminotransferase AlaA	alaA // yfbR	b2290 // b2291
wbbH	b2035	2106060	2107226	putative O-antigen polymerase	wbbH // glf	b2035 // b2036
bglA	b2901	3043662	3045101	6-phospho-&beta;-glucosidase A	bglA	b2901
ibsC	b4665	3056890	3056949	toxic peptide IbsC	ibsC	b4665
ybfB	b0702	733776	734102	uncharacterized protein YbfB	ybfB // rhsC	b0702 // b0700
iscA	b2528	2659563	2659886	iron-sulfur cluster insertion protein IscA	iscA // iscU // iscS // iscR	b2528 // b2529 // b2530 // b2531
ilvE	b3770	3952484	3953413	branched-chain-amino-acid aminotransferase	ilvX // ilvG // ilvD // ilvE // ilvM // ilvL // ilvA	b4669 // b4488 // b3771 // b3770 // b3769 // b3766 // b3772
waaZ	b3624	3799345	3800196	lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaZ	rirA // waaY // waaJ // waaO // waaB // waaS // waaP // waaG // waaQ // waaU // waaZ	b4760 // b3625 // b3626 // b3627 // b3628 // b3629 // b3630 // b3631 // b3632 // b3623 // b3624
lyxK	b3580	3747084	3748580	L-xylulose kinase	yiaM // sgbE // sgbU // sgbH // lyxK // yiaO // yiaN // yiaL // yiaK	b3577 // b3583 // b3582 // b3581 // b3580 // b3579 // b3578 // b3576 // b3575
ghoT	b4559	4352908	4353081	toxin of the GhoTS toxin-antitoxin system	ghoT // ghoS	b4559 // b4128
pdxI	b1406	1474221	1475081	pyridoxine 4-dehydrogenase	pdxI	b1406
tldE	b4235	4457959	4459311	metalloprotease subunit TldE	tldE	b4235
alaC	b2379	2497057	2498295	glutamate&mdash;pyruvate aminotransferase AlaC	alaC	b2379
rfe	b3784	3967916	3969019	UDP-<i>N</i>-acetylglucosamine&mdash;undecaprenyl-phosphate <i>N</i>-acetylglucosaminephosphotransferase	rffM // wzyE // wecF // wzxE // wecE // rffC // rffH // rffG // wecC // wecB // wzzE // rfe	b3794 // b3793 // b4481 // b3792 // b3791 // b3790 // b3789 // b3788 // b3787 // b3786 // b3785 // b3784
alsA	b4087	4309448	4310980	D-allose ABC transporter ATP binding subunit	alsE // alsC // alsA // alsB // alsR	b4085 // b4086 // b4087 // b4088 // b4089
yhdJ	b3262	3411653	3412537	DNA adenine methyltransferase	yhdJ	b3262
yjeO	b4158	4385704	4386018	DUF2645 domain-containing inner membrane protein YjeO	yjeO // yjeN	b4158 // b4157
fdhE	b3891	4080299	4081228	formate dehydrogenase formation protein	fdhE // fdoI // fdoH // fdoG	b3891 // b3892 // b3893 // b3894
alr	b4053	4265782	4266861	alanine racemase 1	alr	b4053
rfbA	b2039	2110138	2111019	dTDP-glucose pyrophosphorylase	rfbX // rfbC // rfbA // rfbD // rfbB	b2037 // b2038 // b2039 // b2040 // b2041
yihQ	b3878	4067240	4069276	sulfoquinovosidase	yihQ	b3878
yodE	b4780	2470497	2470643	CPS-53 (KpLE1) prophage; toxic protein YodE		
yhfA	b3356	3485414	3485818	OsmC family protein YhfA	yhfA	b3356
paoD	b0283	297770	298726	molybdenum cofactor insertion chaperone PaoD	paoA // paoB // paoC // paoD	b0286 // b0285 // b0284 // b0283
alaB				glutamate&mdash;pyruvate aminotransferase AlaB		
waaU	b3623	3798239	3799312	putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase 4	rirA // waaU // waaZ // waaY // waaJ // waaO // waaB // waaS // waaP // waaG // waaQ	b4760 // b3623 // b3624 // b3625 // b3626 // b3627 // b3628 // b3629 // b3630 // b3631 // b3632
malS	b3571	3737497	3739527	alpha-amylase	malS	b3571
ibsB	b4668	2153681	2153737	putative toxic peptide IbsB		
yrdB	b3280	3429766	3430023	DUF1488 domain-containing protein YrdB	yrdB // aroE // tsaC // yrdD	b3280 // b3281 // b3282 // b3283
ccmE	b2197	2294901	2295380	periplasmic heme chaperone	ccmH // ccmG // ccmF // ccmE // ccmD // ccmC // ccmB // ccmA // napC // napB // napH // napG // napA // napD // napF	b2194 // b2195 // b2196 // b2197 // b2198 // b2199 // b2200 // b2201 // b2202 // b2203 // b2204 // b2205 // b2206 // b2207 // b2208
avtA	b3572	3739705	3740958	valine&mdash;pyruvate aminotransferase	avtA	b3572
wecF	b4481	3977525	3978604	TDP-<i>N</i>-acetylfucosamine:lipid II <i>N</i>-acetylfucosaminyltransferase	rffM // wzyE // wecF // wzxE // wecE // rffC // rffH // rffG // wecC // wecB // wzzE // rfe	b3794 // b3793 // b4481 // b3792 // b3791 // b3790 // b3789 // b3788 // b3787 // b3786 // b3785 // b3784
rbsB	b3751	3936278	3937168	ribose ABC transporter periplasmic binding protein	rbsR // rbsD // rbsA // rbsC // rbsB // rbsK	b3753 // b3748 // b3749 // b3750 // b3751 // b3752
ibsE	b4666	3195141	3195200	toxic peptide IbsE		
yceB	b1063	1122713	1123273	putative lipid-binding lipoprotein YceB	yceB	b1063
slyD	b3349	3477907	3478497	FKBP-type peptidyl-prolyl <i>cis-trans</i> isomerase SlyD	slyD	b3349
pheA	b2599	2737745	2738905	fused chorismate mutase/prephenate dehydratase	pheA // pheL	b2599 // b2598
waaJ	b3626	3800983	3801999	UDP-glucose:(glucosyl)LPS &alpha;-1,2-glucosyltransferase	rirA // waaY // waaJ // waaO // waaB // waaS // waaP // waaG // waaQ // waaU // waaZ	b4760 // b3625 // b3626 // b3627 // b3628 // b3629 // b3630 // b3631 // b3632 // b3623 // b3624
hcaE	b2538	2669032	2670393	putative 3-phenylpropionate/cinnamate dioxygenase subunit &alpha;	hcaD // hcaB // hcaC // hcaF // hcaE	b2542 // b2541 // b2540 // b2539 // b2538
yqjD	b3098	3249375	3249680	ribosome- and membrane-associated DUF883 domain-containing protein YqjD	yqjK // yqjE // yqjD // yqjC	b3100 // b3099 // b3098 // b3097
narW	b1466	1536614	1537309	NarW, putative private chaperone for NarZ nitrate reductase subunit	narV // narW // narY // narZ	b1465 // b1466 // b1467 // b1468
tyrA	b2600	2738948	2740069	fused chorismate mutase/prephenate dehydrogenase	tyrA // aroF	b2600 // b2601
wzzB	b2027	2097321	2098301	regulator of length of O-antigen component of lipopolysaccharide chains	wzzB	b2027
lpd	b0116	127912	129336	lipoamide dehydrogenase	pdhR // aceE // aceF // lpd	b0113 // b0114 // b0115 // b0116
aroM	b0390	407428	408105	protein AroM	aroM // yaiA // aroL	b0390 // b0389 // b0388
fklB	b4207	4428935	4429555	peptidyl-prolyl <i>cis-trans</i> isomerase FklB	fklB	b4207
tyrB	b4054	4267114	4268307	tyrosine aminotransferase	tyrB	b4054
waaS	b3629	3804181	3805116	lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaS	rirA // waaY // waaJ // waaO // waaB // waaS // waaP // waaG // waaQ // waaU // waaZ	b4760 // b3625 // b3626 // b3627 // b3628 // b3629 // b3630 // b3631 // b3632 // b3623 // b3624
chbA	b1736	1819455	1819805	<i>N,N'</i>-diacetylchitobiose-specific PTS enzyme IIA component	chbG // chbF // chbR // chbA // chbC // chbB	b1733 // b1734 // b1735 // b1736 // b1737 // b1738
yqeC	b2876	3014287	3015057	uncharacterized protein YqeC	yqeC	b2876
ycdY	b1035	1099640	1100194	chaperone protein YcdY	ycdY // ycdX	b1035 // b1034
dapA	b2478	2598882	2599760	4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase	dapA // bamC	b2478 // b2477
rfbB	b2041	2111976	2113061	dTDP-glucose 4,6-dehydratase 1	rfbD // rfbB // rfbX // rfbC // rfbA	b2040 // b2041 // b2037 // b2038 // b2039
araB	b0063	68348	70048	ribulokinase	araD // araA // araB	b0061 // b0062 // b0063
ygbJ	b2736	2861430	2862338	putative L-threonate dehydrogenase	ygbJ // ygbK	b2736 // b2737
ycbF	b0944	1003947	1004657	putative fimbrial chaperone YcbF	ycbF // ycbV // ycbU // elfG // elfC // elfD	b0944 // b0943 // b0942 // b0941 // b0940 // b0939
argT	b2310	2427009	2427791	lysine/arginine/ornithine ABC transporter periplasmic binding protein	argT // hisP // hisM // hisQ // hisJ	b2310 // b2306 // b2307 // b2308 // b2309
rffH	b3789	3973608	3974489	dTDP-glucose pyrophosphorylase 2	rffM // wzyE // wecF // wzxE // wecE // rffC // rffH // rffG // wecC // wecB // wzzE // rfe	b3794 // b3793 // b4481 // b3792 // b3791 // b3790 // b3789 // b3788 // b3787 // b3786 // b3785 // b3784
ydjH	b1772	1855981	1856928	L-<i>glycero</i>-L-galacto-octuluronate kinase	ydjL // ydjK // ydjJ // ydjI // ydjH // ydjG	b1776 // b1775 // b1774 // b1773 // b1772 // b1771
oxc	b2373	2490256	2491950	oxalyl-CoA decarboxylase	yfdX // oxc // yfdV // frc // yfdE	b2375 // b2373 // b2372 // b2374 // b2371
yehC	b2110	2190926	2191645	putative fimbrial chaperone YehC	yehD // yehC // yehB // yehA	b2111 // b2110 // b2109 // b2108
dapF	b3809	3994762	3995586	diaminopimelate epimerase	yigB // xerC // yigA // dapF // yifL	b3812 // b3811 // b3810 // b3809 // b4558
waaG	b3631	3805943	3807067	lipopolysaccharide glucosyltransferase I	rirA // waaY // waaJ // waaO // waaB // waaS // waaP // waaG // waaQ // waaU // waaZ	b4760 // b3625 // b3626 // b3627 // b3628 // b3629 // b3630 // b3631 // b3632 // b3623 // b3624
dhaK	b1200	1249768	1250838	dihydroxyacetone kinase subunit K	dhaL // dhaK // dhaM	b1199 // b1200 // b1198
hiuH	b1970	2038956	2039369	hydroxyisourate hydrolase / transthyretin-related protein	hiuH	b1970
clpA	b0882	923264	925540	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA	clpA	b0882
asd	b3433	3573775	3574878	aspartate-semialdehyde dehydrogenase	asd	b3433
waaF	b3620	3794929	3795975	ADP-heptose&mdash;LPS heptosyltransferase 2	waaL // waaC // waaF // rfaD	b3622 // b3621 // b3620 // b3619
garD	b3128	3275282	3276853	GarD	garD	b3128
dgcP	b1794	1877715	1878740	diguanylate cyclase DgcP	dgcP	b1794
hslO	b3401	3529774	3530652	molecular chaperone Hsp33	hslR // yrfG // hslO	b3400 // b3399 // b3401
metL	b3940	4129835	4132267	fused aspartate kinase/homoserine dehydrogenase 2	metL // metB	b3940 // b3939
wecB	b3786	3970133	3971263	UDP-<i>N</i>-acetylglucosamine 2-epimerase	rffM // wzyE // wecF // wzxE // wecE // rffC // rffH // rffG // wecC // wecB // wzzE // rfe	b3794 // b3793 // b4481 // b3792 // b3791 // b3790 // b3789 // b3788 // b3787 // b3786 // b3785 // b3784
xylG	b3567	3732201	3733742	xylose ABC transporter ATP binding subunit	xylF // xylG // xylH // xylR	b3566 // b3567 // b3568 // b3569
ydgK	b1626	1705250	1705690	DUF2569 domain-containing inner membrane protein YdgK	ydgK // nth // rsxE // rsxG // rsxD // rsxC // rsxB // rsxA	b1626 // b1633 // b1632 // b1631 // b1630 // b1629 // b1628 // b1627
hscC	b0650	681723	683393	chaperone protein HscC	hscC	b0650
lysA	b2838	2977637	2978899	diaminopimelate decarboxylase	lysA	b2838
waaC	b3621	3795979	3796938	ADP-heptose:LPS heptosyltransferase 1	waaL // waaC // waaF // rfaD	b3622 // b3621 // b3620 // b3619
alsK	b4084	4306870	4307799	D-allose kinase	alsK	b4084
smrA	b1340	1405979	1406542	DNA endonuclease SmrA	smrA	b1340
iscX	b2524	2656536	2656736	accessory iron-sulfur cluster assembly protein IscX	iscX // fdx // hscA // hscB	b2524 // b2525 // b2526 // b2527
dapD	b0166	185123	185947	tetrahydrodipicolinate succinylase	map // dapD // glnD	b0168 // b0166 // b0167
waaA	b3633	3808540	3809817	KDO transferase	coaD // waaA	b3634 // b3633
glvG	b3681	3861349	3861987	putative inactive phospho-glucosidase	glvC // glvB // glvG // ysdC	b3683 // b3682 // b3681 // b4556
bssR	b0836	878248	878631	regulator of biofilm formation	bssR	b0836
efeO	b1018	1082243	1083370	ferrous iron transport system protein EfeO	efeB // efeO	b1019 // b1018
nrfG	b4076	4293543	4294139	putative formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfG	nrfA // nrfB // nrfC // nrfD // nrfE // nrfF // nrfG	b4070 // b4071 // b4072 // b4073 // b4074 // b4075 // b4076
argD	b3359	3488960	3490180	<i>N</i>-acetylornithine aminotransferase / <i>N</i>-succinyldiaminopimelate aminotransferase	argD	b3359
galE	b0759	791039	792055	UDP-glucose 4-epimerase	galM // galK // galT // galE	b0756 // b0757 // b0758 // b0759
srlA	b2702	2825832	2826395	sorbitol-specific PTS enzyme IIC<sub>2</sub> component	srlA // srlE // srlB // srlD // gutM // gutQ // srlR	b2702 // b2703 // b2704 // b2705 // b2706 // b2708 // b2707
bssS	b1060	1120701	1120955	regulator of biofilm formation	bssS	b1060
ybiV	b0822	859213	860028	sugar phosphatase YbiV	ybiV	b0822
hypB	b2727	2851001	2851873	hydrogenase isoenzymes nickel incorporation protein HypB	fhlA // hypE // hypD // hypC // hypB // hypA	b2731 // b2730 // b2729 // b2728 // b2727 // b2726
thrA	b0002	337	2799	fused aspartate kinase/homoserine dehydrogenase 1	thrA // thrB // thrC // thrL	b0002 // b0003 // b0004 // b0001
ugd	b2028	2098447	2099613	UDP-glucose 6-dehydrogenase	ugd	b2028
frlB	b3371	3501268	3502290	fructoselysine 6-phosphate deglycase	frlD // frlC // frlB // frlA // frlR	b3374 // b4474 // b3371 // b3370 // b3375
lsrG	b1518	1606999	1607289	(4<i>S</i>)-4-hydroxy-5-phosphonooxypentane-2,3-dione isomerase	lsrG // lsrF // lsrB // lsrD // lsrC // lsrA // tam	b1518 // b1517 // b1516 // b1515 // b1514 // b1513 // b1519
fdrA	b0518	546680	548347	putative acyl-CoA synthetase FdrA	ybcF // ylbF // ylbE // fdrA	b0521 // b0520 // b4572 // b0518
dsbG	b0604	637827	638573	protein sulfenic acid reductase and chaperone DsbG	dsbG	b0604
lysC	b4024	4231884	4233233	aspartate kinase III	lysC	b4024
manA	b1613	1688576	1689751	mannose-6-phosphate isomerase	manA	b1613
fucK	b2803	2937468	2938886	L-fuculokinase	fucP // fucI // fucK // fucR // fucU	b2801 // b2802 // b2803 // b2805 // b2804
yafV	b0219	239419	240189	2-oxoglutaramate amidase	yafV	b0219
cbpM	b0999	1062550	1062855	chaperone modulator CbpM	cbpM // cbpA	b0999 // b1000
dapE	b2472	2591607	2592734	succinyl-diaminopimelate desuccinylase	ypfN // dapE // yffB	b4547 // b2472 // b2471
galK	b0757	788831	789979	galactokinase	galM // galK // galT // galE	b0756 // b0757 // b0758 // b0759
ackA	b2296	2413470	2414672	acetate kinase	ackA // pta	b2296 // b2297
naRNA2		4326205	4326281	naRNA2		
pheM	b1715	1799226	1799270	<i>pheST-ihfA</i> operon leader peptide	thrS // rpmI // infC // rplT // ihfA // pheM // pheT // pheS	b1719 // b1717 // b1718 // b1716 // b1712 // b1715 // b1713 // b1714
serA	b2913	3057178	3058410	phosphoglycerate dehydrogenase	serA	b2913
cpsB	b2049	2123084	2124520	mannose-1-phosphate guanylyltransferase	wcaC // wcaD // wcaE // wcaF // gmd // fcl // gmm // wcaI // cpsB // cpsG // wcaJ // wzxC	b2057 // b2056 // b2055 // b2054 // b2053 // b2052 // b2051 // b2050 // b2049 // b2048 // b2047 // b2046
paaY	b1400	1464471	1465061	2-hydroxycyclohepta-1,4,6-triene-1-carboxyl-CoA thioesterase	paaY // paaX	b1400 // b1399
mntS	b4705	852869	852997	small protein MntS	rybA // mntS	b4416 // b4705
glyS	b3559	3722328	3724397	glycine&mdash;tRNA ligase subunit &beta;	glyS // glyQ	b3559 // b3560
serB	b4388	4624895	4625863	phosphoserine phosphatase	nadR // radA // serB	b4390 // b4389 // b4388
ypdI	b2376	2494698	2494973	colanic acid synthesis putative lipoprotein YpdI	ypdI	b2376
glcB	b2976	3121634	3123805	malate synthase G	glcA // glcB // glcG // glcF // glcE // glcD	b2975 // b2976 // b2977 // b4467 // b4468 // b2979
yifL	b4558	3994522	3994725	putative lipoprotein YifL	yigB // xerC // yigA // dapF // yifL	b3812 // b3811 // b3810 // b3809 // b4558
trpS	b3384	3512634	3513638	tryptophan&mdash;tRNA ligase	aroB // aroK // damX // dam // trpS // gph // rpe	b3389 // b3390 // b3388 // b3387 // b3384 // b3385 // b3386
serC	b0907	957653	958741	phosphoserine/phosphohydroxythreonine aminotransferase	aroA // serC	b0908 // b0907
gmd	b2053	2127193	2128314	GDP-mannose 4,6-dehydratase	wcaC // wcaD // wcaE // wcaF // gmd // fcl // gmm // wcaI // cpsB // cpsG // wcaJ // wzxC	b2057 // b2056 // b2055 // b2054 // b2053 // b2052 // b2051 // b2050 // b2049 // b2048 // b2047 // b2046
gatD	b2091	2171833	2172873	galactitol-1-phosphate 5-dehydrogenase	gatD // gatC // gatB // gatA // gatZ // gatY	b2091 // b2092 // b2093 // b2094 // b2095 // b2096
ycfJ	b1110	1167599	1168138	PF05433 family protein YcfJ	ycfJ	b1110
glnS	b0680	706093	707757	glutamine&mdash;tRNA ligase	glnS	b0680
proA	b0243	261503	262756	glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase	proB // proA	b0242 // b0243
rcsB	b2217	2316177	2316827	P<SUP>asp56</SUP> RcsB // DNA-binding transcriptional activator RcsB	rcsB // rcsD	b2217 // b2216
treF	b3519	3669592	3671241	cytoplasmic trehalase	treF	b3519
yhjY	b3548	3712236	3712934	putative outer membrane protein YhjY	yhjY	b3548
selD	b1764	1846965	1848008	selenide, water dikinase	ydjA // topB // selD	b1765 // b1763 // b1764
proB	b0242	260388	261491	glutamate 5-kinase	proB // proA	b0242 // b0243
galT	b0758	789983	791029	galactose-1-phosphate uridylyltransferase	galM // galK // galT // galE	b0756 // b0757 // b0758 // b0759
zwf	b1852	1934839	1936314	NADP+-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase	zwf	b1852
yehI	b2118	2200279	2203911	DUF4132 domain-containing protein YehI	yehH // yehI	b4499 // b2118
asnS	b0930	987585	988985	asparagine&mdash;tRNA ligase	asnS	b0930
proC	b0386	404835	405644	pyrroline-5-carboxylate reductase	proC	b0386
cpsG	b2048	2121609	2122979	phosphomannomutase	wcaC // wcaD // wcaE // wcaF // gmd // fcl // gmm // wcaI // cpsB // cpsG // wcaJ // wzxC	b2057 // b2056 // b2055 // b2054 // b2053 // b2052 // b2051 // b2050 // b2049 // b2048 // b2047 // b2046
srlD	b2705	2827737	2828516	sorbitol-6-phosphate 2-dehydrogenase	srlA // srlE // srlB // srlD // gutM // gutQ // srlR	b2702 // b2703 // b2704 // b2705 // b2706 // b2708 // b2707
yiiF	b3890	4079751	4079969	protein YiiF	yiiF	b3890
pheS	b1714	1797959	1798942	phenylalanine&mdash;tRNA ligase subunit &alpha;	thrS // rpmI // infC // rplT // ihfA // pheM // pheT // pheS	b1719 // b1717 // b1718 // b1716 // b1712 // b1715 // b1713 // b1714
thiH	b3990	4190735	4191868	2-iminoacetate synthase	thiS // thiH // thiG // thiF // thiE // thiC	b4407 // b3990 // b3991 // b3992 // b3993 // b3994
fcl	b2052	2126225	2127190	GDP-L-fucose synthase	wcaC // wcaD // wcaE // wcaF // gmd // fcl // gmm // wcaI // cpsB // cpsG // wcaJ // wzxC	b2057 // b2056 // b2055 // b2054 // b2053 // b2052 // b2051 // b2050 // b2049 // b2048 // b2047 // b2046
pfkB	b1723	1806370	1807299	6-phosphofructokinase 2	pfkB	b1723
yicN	b3663	3841950	3842402	DUF1198 domain-containing protein YicN	yicN	b3663
lysS	b2890	3033657	3035174	lysine&mdash;tRNA ligase, constitutive	lysS // xerD // prfB // recJ // dsbC	b2890 // b2894 // b2891 // b2892 // b2893
thiE	b3993	4193569	4194204	thiamine phosphate synthase	thiS // thiH // thiG // thiF // thiE // thiC	b4407 // b3990 // b3991 // b3992 // b3993 // b3994
galU	b1236	1291457	1292365	UTP&mdash;glucose-1-phosphate uridylyltransferase	galU	b1236
malY	b1622	1700957	1702129	negative regulator of MalT activity/cystathionine &beta;-lyase	malX // malY	b1621 // b1622
mliC	b1639	1718066	1718395	inhibitor of c-type lysozyme, putative lipoprotein	mliC	b1639
ybaK	b0481	506603	507082	Cys-tRNA<sup>Pro</sup> and Cys-tRNA<sup>Cys</sup> deacylase	ybaK	b0481
thiD	b2103	2183716	2184516	bifunctional hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase	thiM // thiD	b2104 // b2103
flgH	b1079	1135564	1136262	flagellar L-ring protein	flgB // flgC // flgD // flgE // flgF // flgG // flgH // flgI // flgJ	b1073 // b1074 // b1075 // b1076 // b1077 // b1078 // b1079 // b1080 // b1081
gnd	b2029	2099862	2101268	6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating	gnd	b2029
yjjU	b4377	4612411	4613484	putative patatin-like phospholipase YjjU	yjjV // yjjU	b4378 // b4377
hisS	b2514	2639301	2640575	histidine&mdash;tRNA ligase	hisS	b2514
thiS	b4407	4192637	4192837	sulfur carrier protein ThiS	thiS // thiH // thiG // thiF // thiE // thiC	b4407 // b3990 // b3991 // b3992 // b3993 // b3994
fliS	b1925	2005303	2005713	flagellar biosynthesis protein FliS	fliD // fliS // fliT	b1924 // b1925 // b1926
garL	b3126	3272787	3273557	&alpha;-dehydro-&beta;-deoxy-<i>D</i>-glucarate aldolase	garK // garL // garP // garR // rnpB	b3124 // b3126 // b3127 // b3125 // b3123
yiaB	b3563	3727407	3727748	PF05360 family inner membrane protein YiaB	yiaB	b3563
tyrS	b1637	1715948	1717222	tyrosine&mdash;tRNA ligase	pdxH // tyrS // pdxY	b1638 // b1637 // b1636
thiF	b3992	4192821	4193576	sulfur carrier protein ThiS adenylyltransferase	thiS // thiH // thiG // thiF // thiE // thiC	b4407 // b3990 // b3991 // b3992 // b3993 // b3994
flgE	b1076	1132574	1133782	flagellar hook protein FlgE	flgB // flgC // flgD // flgE // flgF // flgG // flgH // flgI // flgJ	b1073 // b1074 // b1075 // b1076 // b1077 // b1078 // b1079 // b1080 // b1081
gudD	b2787	2918045	2919385	<i>D</i>-glucarate dehydratase	gudD // gudX // gudP	b2787 // b2788 // b2789
yjeI	b4144	4372809	4373162	DUF4156 domain-containing lipoprotein YjeI	yjeI	b4144
gltX	b2400	2519257	2520672	glutamate&mdash;tRNA ligase	gltX	b2400
thiB	b0068	74497	75480	thiamine ABC transporter periplasmic binding protein	sgrR // thiB // thiP // thiQ // sroA	b0069 // b0068 // b0067 // b0066 // b4762
fliE	b1937	2012700	2013014	flagellar protein FliE	fliE	b1937
paaJ	b1397	1460893	1462098	&beta;-ketoadipyl-CoA thiolase	paaK // paaI // paaH // paaG // paaF // paaE // paaD // paaC // paaB // paaA // paaJ	b1398 // b1396 // b1395 // b1394 // b1393 // b1392 // b1391 // b1390 // b1389 // b1388 // b1397
ygiD	b3039	3181619	3182434	4,5-DOPA dioxygenase extradiol	ygiD	b3039
serS	b0893	939428	940720	serine&mdash;tRNA ligase	serS	b0893
thiM	b2104	2184513	2185301	hydroxyethylthiazole kinase	thiM // thiD	b2104 // b2103
flgB	b1073	1131018	1131434	flagellar basal-body rod protein FlgB	flgB // flgC // flgD // flgE // flgF // flgG // flgH // flgI // flgJ	b1073 // b1074 // b1075 // b1076 // b1077 // b1078 // b1079 // b1080 // b1081
mhpE	b0352	373868	374881	4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase	mhpF // mhpE // mhpD // mhpC // mhpB // mhpA	b0351 // b0352 // b0350 // b0349 // b0348 // b0347
yhdP	b4472	3392458	3396258	outer membrane permeability factor YhdP	yhdP	b4472
aspS	b1866	1948750	1950522	aspartate&mdash;tRNA ligase	aspS	b1866
cof	b0446	467412	468230	HMP-PP phosphatase	cof	b0446
fliK	b1943	2018386	2019513	flagellar hook-length control protein	fliF // fliG // fliH // fliI // fliJ // fliK	b1938 // b1939 // b1940 // b1941 // b1942 // b1943
pgm	b0688	713558	715198	phosphoglucomutase	pgm // seqA	b0688 // b0687
ybaA	b0456	476672	477025	DUF1428 domain-containing protein YbaA	ybaA	b0456
pheT	b1713	1795557	1797944	phenylalanine&mdash;tRNA ligase subunit &beta;	thrS // rpmI // infC // rplT // ihfA // pheM // pheT // pheS	b1719 // b1717 // b1718 // b1716 // b1712 // b1715 // b1713 // b1714
thiL	b0417	435634	436611	thiamine monophosphate kinase	pgpA // thiL // nusB // ribE // ribD // nrdR	b0418 // b0417 // b0416 // b0415 // b0414 // b0413
fliQ	b1949	2022616	2022885	flagellar biosynthesis protein FliQ	fliL // fliM // fliN // fliO // fliP // fliQ // fliR	b1944 // b1945 // b1946 // b1947 // b1948 // b1949 // b1950
rhaA	b3903	4094723	4095982	L-rhamnose isomerase	rhaA // rhaB // rhaD	b3903 // b3904 // b3902
ygjQ	b3086	3236540	3237232	DUF218 domain-containing protein YgjQ	ygjQ	b3086
lysU	b4129	4353200	4354717	lysine&mdash;tRNA ligase/Ap<sub>4</sub>A synthetase/Ap<sub>3</sub>A synthetase	lysU	b4129
thiG	b3991	4191865	4192635	1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate:thiol sulfurtransferase	thiS // thiH // thiG // thiF // thiE // thiC	b4407 // b3990 // b3991 // b3992 // b3993 // b3994
fliL	b1944	2019618	2020082	flagellar protein FliL	fliL // fliM // fliN // fliO // fliP // fliQ // fliR	b1944 // b1945 // b1946 // b1947 // b1948 // b1949 // b1950
aes	b0476	499014	499973	acetylesterase	aes	b0476
ypjB	b2649	2783638	2784429	DUF5508 domain-containing protein YpjB	ypjB	b2649
alaS	b2697	2819381	2822011	alanine&mdash;tRNA ligase/DNA-binding transcriptional repressor	alaS	b2697
thiC	b3994	4194204	4196099	phosphomethylpyrimidine synthase	thiS // thiH // thiG // thiF // thiE // thiC	b4407 // b3990 // b3991 // b3992 // b3993 // b3994
fliH	b1940	2015868	2016554	flagellar biosynthesis protein FliH	fliF // fliG // fliH // fliI // fliJ // fliK	b1938 // b1939 // b1940 // b1941 // b1942 // b1943
sfsA	b0146	160782	161486	putative DNA-binding transcriptional regulator of maltose metabolism	sfsA // gluQ // dksA	b0146 // b0144 // b0145
yfcE	b2300	2419234	2419788	phosphodiesterase YfcE	yfcE	b2300
ileS	b0026	22391	25207	isoleucine&mdash;tRNA ligase	ribF // ispH // fkpB // lspA // ileS	b0025 // b0029 // b0028 // b0027 // b0026
thiQ	b0066	72229	72927	thiamine ABC transporter ATP binding subunit	sgrR // thiB // thiP // thiQ // sroA	b0069 // b0068 // b0067 // b0066 // b4762
flhC	b1891	1977266	1977844	DNA-binding transcriptional dual regulator FlhC	flhC // flhD	b1891 // b1892
mtlD	b3600	3774424	3775572	mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase	mtlA // mtlD // mtlR	b3599 // b3600 // b3601
cutC	b1874	1958520	1959266	protein CutC	yecM // cutC	b1875 // b1874
valS	b4258	4480982	4483837	valine&mdash;tRNA ligase	holC // valS	b4259 // b4258
thiK	b1106	1163260	1164084	thiamine kinase	ycfP // nagZ // thiK // lpoB // ycfL // hinT	b1108 // b1107 // b1106 // b1105 // b1104 // b1103
flgI	b1080	1136274	1137371	flagellar P-ring protein	flgB // flgC // flgD // flgE // flgF // flgG // flgH // flgI // flgJ	b1073 // b1074 // b1075 // b1076 // b1077 // b1078 // b1079 // b1080 // b1081
nanS	b4309	4536614	4537594	<i>N</i>-acetyl-9-<i>O</i>-acetylneuraminate esterase	nanM // nanC // nanS	b4310 // b4311 // b4309
yeaC	b1777	1861702	1861974	DUF1315 domain-containing protein YeaC	yeaC	b1777
glyQ	b3560	3724407	3725318	glycine&mdash;tRNA ligase subunit &alpha;	glyS // glyQ	b3559 // b3560
panE	b0425	443604	444515	2-dehydropantoate 2-reductase	panE // yajL	b0425 // b0424
fliT	b1926	2005713	2006078	flagellar biosynthesis protein FliT	fliD // fliS // fliT	b1924 // b1925 // b1926
malQ	b3416	3547986	3550070	4-&alpha;-glucanotransferase	malQ // malP	b3416 // b3417
ynfA	b1582	1655347	1655673	putative transporter YnfA	ynfA	b1582
thrS	b1719	1800642	1802570	threonine&mdash;tRNA ligase	thrS // rpmI // infC // rplT // ihfA // pheM // pheT // pheS	b1719 // b1717 // b1718 // b1716 // b1712 // b1715 // b1713 // b1714
panC	b0133	147944	148795	pantothenate synthetase	panC // panB	b0133 // b0134
flgF	b1077	1133802	1134557	flagellar basal-body rod protein FlgF	flgB // flgC // flgD // flgE // flgF // flgG // flgH // flgI // flgJ	b1073 // b1074 // b1075 // b1076 // b1077 // b1078 // b1079 // b1080 // b1081
hcaC	b2540	2670908	2671228	putative 3-phenylpropionate/cinnamate dioxygenase ferredoxin subunit	hcaD // hcaB // hcaC // hcaF // hcaE	b2542 // b2541 // b2540 // b2539 // b2538
ycjQ	b1313	1374963	1376015	D-guloside 3-dehydrogenase	ymjB // ycjV // ycjU // ycjT // ycjS // ycjR // ycjQ // ycjP // ycjO // ycjN // ycjM // ompG	b4524 // b1318 // b1317 // b1316 // b1315 // b1314 // b1313 // b1312 // b1311 // b1310 // b1309 // b1319
cysS	b0526	554611	555996	cysteine&mdash;tRNA ligase	cysS	b0526
coaA	b3974	4174076	4175026	pantothenate kinase	coaA	b3974
fliF	b1938	2013229	2014887	flagellar basal-body MS-ring and collar protein	fliF // fliG // fliH // fliI // fliJ // fliK	b1938 // b1939 // b1940 // b1941 // b1942 // b1943
paaF	b1393	1457497	1458264	putative 2,3-dehydroadipyl-CoA hydratase	paaK // paaI // paaH // paaG // paaF // paaE // paaD // paaC // paaB // paaA // paaJ	b1398 // b1396 // b1395 // b1394 // b1393 // b1392 // b1391 // b1390 // b1389 // b1388 // b1397
gfcD	b0984	1045849	1047945	putative lipoprotein GfcD	gfcB // gfcC // gfcD	b0986 // b0985 // b0984
proS	b0194	217057	218775	proline&mdash;tRNA ligase	proS	b0194
dfp	b3639	3812731	3813951	fused 4'-phosphopantothenoylcysteine decarboxylase and phosphopantothenoylcysteine synthetase	dfp	b3639
flgC	b1074	1131438	1131842	flagellar basal-body rod protein FlgC	flgB // flgC // flgD // flgE // flgF // flgG // flgH // flgI // flgJ	b1073 // b1074 // b1075 // b1076 // b1077 // b1078 // b1079 // b1080 // b1081
gpmM	b3612	3785260	3786804	2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase	yibQ // envC // gpmM	b3614 // b3613 // b3612
ybhN	b0788	821542	822498	PF03706 family inner membrane protein YbhN	ybhP // clsB // ybhN	b0790 // b0789 // b0788
argS	b1876	1960062	1961795	arginine&mdash;tRNA ligase	argS	b1876
panD	b0131	146314	146694	PanD &beta; cleavage product // PanD &alpha; cleavage product // aspartate 1-decarboxylase proenzyme	panD	b0131
fliD	b1924	2003872	2005278	flagellar filament capping protein	fliD // fliS // fliT	b1924 // b1925 // b1926
yihV	b3883	4073739	4074635	6-deoxy-6-sulfofructose kinase	yihV // csqR	b3883 // b3884
ybaP	b0482	507286	508080	TraB family protein YbaP	ybaP	b0482
metG	b2114	2194300	2196333	methionine&mdash;tRNA ligase	metG	b2114
coaD	b3634	3809825	3810304	pantetheine-phosphate adenylyltransferase	coaD // waaA	b3634 // b3633
flgN	b1070	1129414	1129830	flagellar biosynthesis protein FlgN	flgN // flgM // flgA	b1070 // b1071 // b1072
treC	b4239	4463054	4464709	trehalose-6-phosphate hydrolase	treC // treB	b4239 // b4240
dgd				D-galactose 1-dehydrogenase		
leuS	b0642	672201	674783	leucine&mdash;tRNA ligase	leuS // lptE // holA // nadD // cobC	b0642 // b0641 // b0640 // b0639 // b0638
coaE	b0103	112599	113219	dephospho-CoA kinase	coaE // zapD // yacG	b0103 // b0102 // b0101
fliR	b1950	2022893	2023678	flagellar biosynthesis protein FliR	fliL // fliM // fliN // fliO // fliP // fliQ // fliR	b1944 // b1945 // b1946 // b1947 // b1948 // b1949 // b1950
xylA	b3565	3729443	3730765	xylose isomerase	xylB // xylA	b3564 // b3565
rseD	b4725	2710009	2710164	<i>rpoE</i> leader peptide	rseD // rseC // rseB // rseA // rpoE	b4725 // b2570 // b2571 // b2572 // b2573
ykgO	b4506	312374	312514	50S ribosomal subunit protein L36B	ykgM // ykgO	b0296 // b4506
panB	b0134	148807	149601	3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase	panC // panB	b0133 // b0134
fliM	b1945	2020087	2021091	flagellar motor switch protein FliM	fliL // fliM // fliN // fliO // fliP // fliQ // fliR	b1944 // b1945 // b1946 // b1947 // b1948 // b1949 // b1950
mhpF	b0351	372921	373871	acetaldehyde dehydrogenase (acetylating) MhpF	mhpF // mhpE // mhpD // mhpC // mhpB // mhpA	b0351 // b0352 // b0350 // b0349 // b0348 // b0347
och5		3067187	3067344	small regulatory RNA Och5		
prmA	b3259	3409070	3409951	ribosomal protein L11 methyltransferase	yhdT // panF // prmA	b3257 // b3258 // b3259
folB	b3058	3204221	3204589	dihydroneopterin aldolase	folB	b3058
fliI	b1941	2016554	2017927	flagellum-specific ATP synthase FliI	fliF // fliG // fliH // fliI // fliJ // fliK	b1938 // b1939 // b1940 // b1941 // b1942 // b1943
idnO	b4266	4492587	4493351	5-keto-D-gluconate 5-reductase	idnT // idnO // idnD // idnR	b4265 // b4266 // b4267 // b4264
ymdF	b4518	1068081	1068254	stress-induced bacterial acidophilic repeat motifs-containing protein YmdF	ymdF	b4518
ffh	b2610	2746434	2747795	signal recognition particle protein component	ffh	b2610
folK	b0142	157253	157732	2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine diphosphokinase	folK // pcnB	b0142 // b0143
flgK	b1082	1138378	1140021	flagellar hook-filament junction protein 1	flgL // flgK	b1083 // b1082
malK	b4035	4246784	4247899	maltose ABC transporter ATP binding subunit	malK // lamB // malM	b4035 // b4036 // b4037
yecE	b1868	1951395	1952213	DUF72 domain-containing protein YecE	yecE // yecD	b1868 // b1867
pppA	b2972	3113543	3114352	prepilin peptidase	pppA	b2972
pabA	b3360	3490266	3490829	aminodeoxychorismate synthase subunit 2	fic // yhfG // pabA	b3361 // b3362 // b3360
flhD	b1892	1977847	1978197	DNA-binding transcriptional dual regulator FlhD	flhC // flhD	b1891 // b1892
crr	b2417	2535834	2536343	Enzyme IIA<sup>Glc</sup>	ptsH // ptsI // crr	b2415 // b2416 // b2417
yhjG	b3524	3676290	3678350	AsmA family protein YhjG	yhjG	b3524
napD	b2207	2302750	2303013	NapA signal peptide-binding chaperone NapD	ccmH // ccmG // ccmF // ccmE // ccmD // ccmC // ccmB // ccmA // napC // napB // napH // napG // napA // napD // napF	b2194 // b2195 // b2196 // b2197 // b2198 // b2199 // b2200 // b2201 // b2202 // b2203 // b2204 // b2205 // b2206 // b2207 // b2208
folP	b3177	3324063	3324911	dihydropteroate synthase	folP // glmM	b3177 // b3176
flgJ	b1081	1137371	1138312	putative peptidoglycan hydrolase FlgJ	flgB // flgC // flgD // flgE // flgF // flgG // flgH // flgI // flgJ	b1073 // b1074 // b1075 // b1076 // b1077 // b1078 // b1079 // b1080 // b1081
araF	b1901	1985139	1986128	arabinose ABC transporter periplasmic binding protein	araH // araG // araF	b4460 // b1900 // b1901
yhiI	b3487	3629535	3630602	putative membrane fusion protein YhiI	yhiI // rbbA // yhhJ	b3487 // b3486 // b3485
tilS	b0188	212331	213629	tRNAIle-lysidine synthetase	tilS	b0188
folE	b2153	2242984	2243652	GTP cyclohydrolase 1	folE // yeiB	b2153 // b2152
flgL	b1083	1140033	1140986	flagellar hook-filament junction protein 2	flgL // flgK	b1083 // b1082
fryC	b2386	2506647	2507894	putative PTS enzyme IIC component FryC	fryB // fryC // ypdF // ypdE // fryA	b2387 // b2386 // b2385 // b2384 // b2383
yjcO	b4078	4296436	4297125	Sel1 repeat-containing protein YjcO	yjcO	b4078
yheS	b3352	3481289	3483202	putative ATP-binding protein YheS	yheU // yheT // yheS	b3354 // b3353 // b3352
pabB	b1812	1894805	1896166	aminodeoxychorismate synthase subunit 1	nudL // pabB	b1813 // b1812
flgG	b1078	1134729	1135511	flagellar basal-body rod protein FlgG	flgB // flgC // flgD // flgE // flgF // flgG // flgH // flgI // flgJ	b1073 // b1074 // b1075 // b1076 // b1077 // b1078 // b1079 // b1080 // b1081
paaC	b1390	1455164	1455910	phenylacetyl-CoA 1,2-epoxidase, structural subunit	paaK // paaI // paaH // paaG // paaF // paaE // paaD // paaC // paaB // paaA // paaJ	b1398 // b1396 // b1395 // b1394 // b1393 // b1392 // b1391 // b1390 // b1389 // b1388 // b1397
yihF	b3861	4044199	4045629	DUF945 domain-containing protein YihF	yihF	b3861
hipA	b1507	1590854	1592176	phosphorylated serine/threonine-protein kinase HipA // serine/threonine-protein kinase toxin HipA	hipA // hipB	b1507 // b1508
pabC	b1096	1153300	1154109	aminodeoxychorismate lyase	ycfH // holB // tmk // mltG // pabC	b1100 // b1099 // b1098 // b1097 // b1096
fliA	b1922	2001070	2001789	RNA polymerase, sigma 28 (sigma F) factor	fliZ // fliA // tcyJ	b1921 // b1922 // b1920
ldcC	b0186	209679	211820	lysine decarboxylase 2	ldcC	b0186
ydeJ	b1537	1624773	1625291	PF02464 family protein YdeJ	ydeJ	b1537
secM	b0097	107705	108217	SecA translation regulator	mutT // secA // secM	b0099 // b0098 // b0097
nudB	b1865	1948180	1948632	dihydroneopterin triphosphate diphosphatase	nudB // yebC // ruvC	b1865 // b1864 // b1863
flgD	b1075	1131854	1132549	flagellar biosynthesis, initiation of hook assembly	flgB // flgC // flgD // flgE // flgF // flgG // flgH // flgI // flgJ	b1073 // b1074 // b1075 // b1076 // b1077 // b1078 // b1079 // b1080 // b1081
sgbU	b3582	3749232	3750092	putative L-xylulose 5-phosphate 3-epimerase	yiaM // sgbE // sgbU // sgbH // lyxK // yiaO // yiaN // yiaL // yiaK	b3577 // b3583 // b3582 // b3581 // b3580 // b3579 // b3578 // b3576 // b3575
yigG	b3818	4002813	4003193	inner membrane protein	yigG // yigF	b3818 // b3817
rbbA	b3486	3626803	3629538	ribosome-associated ATPase	yhiI // rbbA // yhhJ	b3487 // b3486 // b3485
znuC	b1858	1942662	1943417	Zn<sup>2+</sup> ABC transporter ATP binding subunit	znuB // znuC	b1859 // b1858
fliO	b1947	2021504	2021869	flagellar biosynthesis protein FliO	fliL // fliM // fliN // fliO // fliP // fliQ // fliR	b1944 // b1945 // b1946 // b1947 // b1948 // b1949 // b1950
yihS	b3880	4070515	4071756	sulfoquinovose isomerase	yihS // yihT // yihU	b3880 // b3881 // b3882
yjiH	b4330	4559997	4560680	Gate family protein YjiH	yjiH // yjiG // iadA	b4330 // b4329 // b4328
dksA	b0145	160149	160604	RNA polymerase-binding transcription factor DksA	sfsA // gluQ // dksA	b0146 // b0144 // b0145
hemL	b0154	173602	174882	glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase	hemL	b0154
flgA	b1072	1130204	1130863	flagellar basal body P-ring formation protein FlgA	flgA // flgN // flgM	b1072 // b1070 // b1071
uidA	b1617	1694260	1696071	&beta;-glucuronidase	uidC // uidB // uidA	b1615 // b1616 // b1617
ychA	b1214	1267320	1268129	transglutaminase-like/TPR repeat-containing protein	ychA // ychQ // kdsA	b1214 // b1213 // b1215
tsf	b0170	190857	191708	protein chain elongation factor EF-Ts	tff // rpsB // tsf	b4414 // b0169 // b0170
hemC	b3805	3989825	3990766	hydroxymethylbilane synthase	hemY // hemX // hemD // hemC	b3802 // b3803 // b3804 // b3805
fliN	b1946	2021088	2021501	flagellar motor switch protein FliN	fliL // fliM // fliN // fliO // fliP // fliQ // fliR	b1944 // b1945 // b1946 // b1947 // b1948 // b1949 // b1950
mhpA	b0347	368611	370275	3-(3-hydroxyphenyl)propanoate hydroxylase	mhpF // mhpE // mhpD // mhpC // mhpB // mhpA	b0351 // b0352 // b0350 // b0349 // b0348 // b0347
dcrB	b3472	3609955	3610512	periplasmic bacteriophage sensitivity protein DcrB	dcrB	b3472
pth	b1204	1257929	1258513	peptidyl-tRNA hydrolase	pth // ychF	b1204 // b1203
hemN	b3867	4052045	4053418	coproporphyrinogen III dehydrogenase	hemN	b3867
fliJ	b1942	2017946	2018389	flagellar biosynthesis protein FliJ	fliF // fliG // fliH // fliI // fliJ // fliK	b1938 // b1939 // b1940 // b1941 // b1942 // b1943
melA	b4119	4341911	4343266	&alpha;-galactosidase	melA // melB	b4119 // b4120
ygeA	b2840	2979943	2980635	amino acid racemase YgeA	araE // ygeA	b2841 // b2840
rsfS	b0637	668719	669036	ribosomal silencing factor RsfS	rsfS // rlmH // mrdA // mrdB // rlpA	b0637 // b0636 // b0635 // b0634 // b0633
hemG	b3850	4034608	4035153	protoporphyrinogen oxidase	hemG // trkH // yigZ // pepQ	b3850 // b3849 // b3848 // b3847
fliP	b1948	2021869	2022606	flagellar biosynthesis protein FliP	fliL // fliM // fliN // fliO // fliP // fliQ // fliR	b1944 // b1945 // b1946 // b1947 // b1948 // b1949 // b1950
fucU	b2804	2938888	2939310	L-fucose mutarotase	fucP // fucI // fucK // fucU // fucR	b2801 // b2802 // b2803 // b2804 // b2805
yhcH	b3221	3369014	3369478	DUF386 domain-containing protein YhcH	yhcH // nanK // nanE // nanT // nanA	b3221 // b3222 // b3223 // b3224 // b3225
lepA	b2569	2705325	2707124	30S ribosomal subunit biogenesis factor LepA	lepA // lepB	b2569 // b2568
hemD	b3804	3989088	3989828	uroporphyrinogen-III synthase	hemY // hemX // hemD // hemC	b3802 // b3803 // b3804 // b3805
fliC	b1923	2002110	2003606	flagellar filament structural protein	fliC	b1923
prpD	b0334	351215	352666	2-methylcitrate dehydratase	prpE // prpD // prpC // prpB	b0335 // b0334 // b0333 // b0331
ytjB	b4387	4624145	4624789	protein Smp	lplA // ytjB	b4386 // b4387
ybeY	b0659	691874	692341	endoribonuclease YbeY	ybeZ // ybeY // ybeX // lnt	b0660 // b0659 // b0658 // b0657
hemA	b1210	1263714	1264970	glutamyl-tRNA reductase	prmC // prfA // hemA	b1212 // b1211 // b1210
flgM	b1071	1129835	1130128	anti-sigma factor for FliA (&sigma;<sup>28</sup>)	flgN // flgM // flgA	b1070 // b1071 // b1072
fadB	b3846	4028782	4030971	multifunctional enoyl-CoA hydratase, 3-hydroxyacyl-CoA epimerase, &Delta;<sup>3</sup>-<i>cis</i>- &Delta;<sup>2</sup>-<i>trans</i>-enoyl-CoA isomerase, L-3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase	fadA // fadB	b3845 // b3846
yqhH	b3014	3158627	3158884	lipoprotein YqhH	yqhH	b3014
infA	b0884	926225	926443	translation initiation factor IF-1	infA // serW	b0884 // b0883
hemF	b2436	2553225	2554124	coproporphyrinogen III oxidase	hemF // amiA	b2436 // b2435
fliG	b1939	2014880	2015875	flagellar motor switch protein FliG	fliF // fliG // fliH // fliI // fliJ // fliK	b1938 // b1939 // b1940 // b1941 // b1942 // b1943
fadJ	b2341	2457015	2459159	3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase FadJ	fadJ // fadI	b2341 // b2342
yqeH	b2846	2987536	2988168	putative LuxR family transcriptional regulator YqeH	yqeH	b2846
yciH	b1282	1342658	1342984	putative translation factor	yciH // pyrF // lapB // lapA	b1282 // b1281 // b1280 // b1279
hemE	b3997	4197716	4198780	uroporphyrinogen decarboxylase	nfi // hemE // nudC	b3998 // b3997 // b3996
flk	b2321	2437950	2438945	putative flagella assembly protein	flk	b2321
ydiF	b1694	1775587	1777182	putative acetate-CoA transferase YdiF	ydiO // ydiF	b1695 // b1694
yphB	b2544	2673816	2674688	putative aldose 1-epimerase YphB	yphC // yphB	b2545 // b2544
arfA	b4550	3438431	3438649	alternative ribosome-rescue factor A	arfA	b4550
hemH	b0475	498055	499017	ferrochelatase	hemH	b0475
yddB	b1495	1575247	1577619	putative TonB-dependent receptor YddB	yddA // yddB	b1496 // b1495
ydiR	b1698	1780401	1781339	putative electron transfer flavoprotein subunit YdiR	fadK // ydiT // ydiS // ydiR // ydiQ	b1701 // b1700 // b1699 // b1698 // b1697
yfbK	b2270	2383995	2385722	IPR002035/DUF3520 domain-containing protein YfbK	yfbK	b2270
ettA	b4391	4628855	4630522	energy-dependent translational throttle protein EttA	ettA	b4391
hemB	b0369	388753	389727	porphobilinogen synthase	hemB	b0369
aas	b2836	2973855	2976014	fused 2-acylglycerophospho-ethanolamine acyltransferase/acyl-acyl carrier protein synthetase	aas // lplT	b2836 // b2835
atoA	b2222	2324109	2324759	acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit &beta;	atoB // atoD // atoA // atoE	b2224 // b2221 // b2222 // b2223
msrC	b1832	1915631	1916128	free methionine-(<i>R</i>)-sulfoxide reductase	msrC	b1832
frr	b0172	192872	193429	ribosome-recycling factor	frr	b0172
cysG	b3368	3497828	3499201	siroheme synthase	nirB // nirD // nirC // cysG	b3365 // b3366 // b3367 // b3368
eptA	b4114	4333947	4335590	phosphoethanolamine transferase EptA	eptA	b4114
fadM	b0443	464402	464800	long-chain acyl-CoA thioesterase FadM	fadM	b0443
ydjX	b1750	1833401	1834111	DedA family protein YdjX	ynjD // ynjC // ynjB // ynjA // ydjZ // ydjY // ydjX	b1756 // b1755 // b1754 // b1753 // b1752 // b1751 // b1750
tufA	b3339	3470145	3471329	translation elongation factor Tu 1	rpsG // rpsL // fusA // tufA	b3341 // b3342 // b3340 // b3339
ynfK	b1593	1666524	1667219	putative dethiobiotin synthetase	ynfK // mlc	b1593 // b1594
bioP	b3827	4011076	4011975	biotin transporter	bioP	b3827
fadD	b1805	1888061	1889746	long-chain-fatty-acid&mdash;CoA ligase	sroD // fadD	b1805
yneE	b1520	1608108	1609022	PF01062 family inner membrane protein YneE	yneE	b1520
efp	b4147	4375699	4376265	protein chain elongation factor EF-P, &beta;-lysyl-Lys34 // protein chain elongation factor EF-P	efp	b4147
bioD	b0778	812270	812947	dethiobiotin synthetase	bioB // bioF // bioC // bioD	b0775 // b0776 // b0777 // b0778
plsC	b3018	3162744	3163481	1-acylglycerol-3-phosphate <i>O</i>-acyltransferase PlsC	plsC	b3018
prpE	b0335	352706	354592	propionyl-CoA synthetase	prpE // prpD // prpC // prpB	b0335 // b0334 // b0333 // b0331
ycgV	b1202	1253085	1255952	putative autotransporter adhesin YcgV	ycgV	b1202
selA	b3591	3759858	3761249	selenocysteine synthase	selB // selA	b3590 // b3591
bioA	b0774	807968	809257	adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase	bioA	b0774
mscM	b4159	4386047	4389370	miniconductance mechanosensitive channel MscM	mscM // psd	b4159 // b4160
prpB	b0331	348682	349572	2-methylisocitrate lyase	prpE // prpD // prpC // prpB	b0335 // b0334 // b0333 // b0331
yccF	b0961	1023902	1024348	PF03733 family inner membrane protein YccF	yccF // yccS	b0961 // b0960
spf	b3864	4049899	4050009	small regulatory RNA Spot 42	spf	b3864
bisC	b3551	3714061	3716394	biotin sulfoxide reductase	bisC	b3551
focA	b0904	953609	954466	formate channel FocA	focA // pflB	b0904 // b0903
fadI	b2342	2459159	2460469	3-ketoacyl-CoA thiolase FadI	fadJ // fadI	b2341 // b2342
ybgS	b0753	784937	785317	PF13985 family protein YbgS	ybgS	b0753
prfA	b1211	1265012	1266094	peptide chain release factor RF1	prmC // prfA // hemA	b1212 // b1211 // b1210
bioF	b0776	810381	811535	8-amino-7-oxononanoate synthase	bioB // bioF // bioC // bioD	b0775 // b0776 // b0777 // b0778
aer	b3072	3217556	3219076	aerotaxis sensor receptor, flavoprotein	aer	b3072
fadH	b3081	3231665	3233683	2,4-dienoyl-CoA reductase	fadH	b3081
yajQ	b0426	444683	445174	nucleotide binding protein YajQ	yajQ	b0426
infB	b3168	3313342	3316014	translation initiation factor IF-2	pnp // rpsO // truB // rbfA // nusA // rimP // metY // infB	b3164 // b3165 // b3166 // b3167 // b3169 // b3170 // b3171 // b3168
bioB	b0775	809344	810384	biotin synthase	bioB // bioF // bioC // bioD	b0775 // b0776 // b0777 // b0778
yccA	b0970	1030759	1031418	modulator of FtsH protease	yccA	b0970
ydiS	b1699	1781395	1782684	putative electron transfer flavoprotein-quinone oxidoreductase YdiS	fadK // ydiT // ydiS // ydiR // ydiQ	b1701 // b1700 // b1699 // b1698 // b1697
yjdP	b4487	4313868	4314197	protein YjdP	yjdP	b4487
relE	b1563	1645346	1645633	Qin prophage; mRNA interferase toxin RelE	relB // relE // hokD	b1564 // b1563 // b1562
bioH	b3412	3544074	3544844	pimeloyl-acyl carrier protein methyl ester esterase	bioH	b3412
yphA	b2543	2673346	2673768	putative inner membrane protein	yphA	b2543
prpC	b0333	350012	351181	2-methylcitrate synthase	prpE // prpD // prpC // prpB	b0335 // b0334 // b0333 // b0331
ytiD	b4721	4556654	4556797	protein YtiD	ytiD // ytiC // idlP // iraD	b4721 // b4720 // b4722 // b4326
symR	b4625	4579835	4579911	small regulatory RNA antitoxin SymR	symR	b4625
bioC	b0777	811522	812277	malonyl-acyl carrier protein methyltransferase	bioB // bioF // bioC // bioD	b0775 // b0776 // b0777 // b0778
tolQ	b0737	775153	775845	Tol-Pal system protein TolQ	ybgC // tolQ // tolR // tolA	b0736 // b0737 // b0738 // b0739
fadA	b3845	4027609	4028772	3-ketoacyl-CoA thiolase	fadA // fadB	b3845 // b3846
yohP	b4679	2228982	2229065	uncharacterized membrane protein YohP		
arfB	b0191	214833	215255	peptidyl-tRNA hydrolase, ribosome rescue factor	nlpE // arfB // yaeQ	b0192 // b0191 // b0190
ribC	b1662	1742601	1743242	riboflavin synthase	ribC	b1662
yfcC	b2298	2417081	2418601	putative transporter YfcC	yfcC	b2298
mhpB	b0348	370277	371221	3-carboxyethylcatechol 2,3-dioxygenase	mhpF // mhpE // mhpD // mhpC // mhpB // mhpA	b0351 // b0352 // b0350 // b0349 // b0348 // b0347
ybhC	b0772	805998	807281	outer membrane lipoprotein YbhC	ybhC	b0772
fusA	b3340	3471400	3473514	elongation factor G	fusA // rpsG // rpsL // tufA	b3340 // b3341 // b3342 // b3339
ribD	b0414	433455	434558	fused diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase / 5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase	ribD // nrdR // pgpA // thiL // nusB // ribE	b0414 // b0413 // b0418 // b0417 // b0416 // b0415
rbsC	b3750	3935288	3936253	ribose ABC transporter membrane subunit	rbsR // rbsD // rbsA // rbsC // rbsB // rbsK	b3753 // b3748 // b3749 // b3750 // b3751 // b3752
fadE	b0221	240859	243303	acyl-CoA dehydrogenase	fadE	b0221
yjjJ	b4385	4621769	4623100	toxin YjjJ	yjjJ	b4385
tufB	b3980	4175944	4177128	translation elongation factor Tu 2	tufB // thrU // tyrU // glyT // thrT	b3980 // b3976 // b3977 // b3978 // b3979
ribB	b3041	3183813	3184466	3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase	sroG // ribB	b3041
mntP	b1821	1905688	1906254	Mn2+ exporter	mntP	b1821
ydiT	b1700	1782681	1782974	ferredoxin-like protein YdiT	fadK // ydiT // ydiS // ydiR // ydiQ	b1701 // b1700 // b1699 // b1698 // b1697
qseG	b2555	2688793	2689506	outer membrane lipoprotein QseG	qseG	b2555
prfC	b4375	4609414	4611003	peptide chain release factor RF3	prfC	b4375
ybjI	b0844	885316	886131	5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil phosphatase	ybjJ // ybjI	b0845 // b0844
plsB	b4041	4254043	4256466	glycerol-3-phosphate 1-<i>O</i>-acyltransferase	plsB	b4041
fadK	b1701	1782977	1784677	short chain acyl-CoA synthetase	fadK // ydiT // ydiS // ydiR // ydiQ	b1701 // b1700 // b1699 // b1698 // b1697
pdeC	b4061	4275471	4277057	c-di-GMP phosphodiesterase PdeC	pdeC	b4061
selB	b3590	3758017	3759861	selenocysteyl-tRNA-specific translation elongation factor	selB // selA	b3590 // b3591
ribE	b0415	434647	435117	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	pgpA // thiL // nusB // ribE // ribD // nrdR	b0418 // b0417 // b0416 // b0415 // b0414 // b0413
rsxA	b1627	1705767	1706348	SoxR [2Fe-2S] reducing system protein RsxA	nth // rsxE // rsxG // rsxD // rsxC // rsxB // rsxA // ydgK	b1633 // b1632 // b1631 // b1630 // b1629 // b1628 // b1627 // b1626
atoD	b2221	2323447	2324109	acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA transferase subunit &alpha;	atoB // atoD // atoA // atoE	b2224 // b2221 // b2222 // b2223
ybfF	b0686	712038	712802	esterase	ybfF	b0686
hpf	b3203	3346173	3346460	ribosome hibernation-promoting factor	kdsD // yrbG // lptC // kdsC // lptB // lptA // rpoN // hpf // ptsN // rapZ // npr	b3197 // b3196 // b3199 // b3198 // b3201 // b3200 // b3202 // b3203 // b3204 // b3205 // b3206
ribF	b0025	21407	22348	bifunctional riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase	ribF // ispH // fkpB // lspA // ileS	b0025 // b0029 // b0028 // b0027 // b0026
nirC	b3367	3497003	3497809	nitrite transporter NirC	nirB // nirD // nirC // cysG	b3365 // b3366 // b3367 // b3368
acs	b4069	4285413	4287371	acetyl-CoA synthetase (AMP-forming)	yjcH // acs // actP	b4068 // b4069 // b4067
hcxB	b0801	836351	837436	hydroxycarboxylate dehydrogenase B	hcxB	b0801
prfB	b2891	3035184	3036282	peptide chain release factor RF2	recJ // dsbC // xerD // lysS // prfB	b2892 // b2893 // b2894 // b2890 // b2891
ribA	b1277	1338570	1339160	GTP cyclohydrolase 2	ribA	b1277
ydcO	b1433	1504905	1506080	putative transport protein YdcO	ydcO	b1433
ispH	b0029	26277	27227	1-hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl 4-diphosphate reductase	ribF // ispH // fkpB // lspA // ileS	b0025 // b0029 // b0028 // b0027 // b0026
yjgA	b4234	4457314	4457865	DUF615 domain-containing protein YjgA	yjgA	b4234
infC	b1718	1800096	1800638	translation initiation factor IF-3	thrS // rpmI // infC // rplT // ihfA // pheM // pheT // pheS	b1719 // b1717 // b1718 // b1716 // b1712 // b1715 // b1713 // b1714
yigB	b3812	3997183	3997899	5-amino-6-(5-phospho-D-ribitylamino)uracil phosphatase	yigB // xerC // yigA // dapF // yifL	b3812 // b3811 // b3810 // b3809 // b4558
motB	b1889	1975329	1976255	motility protein B	cheW // cheA // motB // motA	b1887 // b1888 // b1889 // b1890
pmrD	b2259	2373272	2373538	signal transduction protein PmrD	pmrD	b2259
ytfP	b4222	4447894	4448235	&gamma;-glutamylamine cyclotransferase family protein YtfP	ytfP // tamB // tamA	b4222 // b4221 // b4220
bepA	b2494	2616094	2617557	&beta;-barrel assembly-enhancing protease	yfgD // bepA	b2495 // b2494
nudL	b1813	1896170	1896748	putative NUDIX hydrolase with low 3-phosphohydroxypyruvate phosphatase activity	nudL // pabB	b1813 // b1812
gfcA	b0987	1049439	1049744	threonine-rich inner membrane protein GfcA	gfcA	b0987
ampH	b0376	395130	396287	peptidoglycan DD-carboxypeptidase/peptidoglycan DD-endopeptidase	ampH	b0376
yigA	b3810	3995583	3996290	DUF484 domain-containing protein YigA	yigB // xerC // yigA // dapF // yifL	b3812 // b3811 // b3810 // b3809 // b4558
citG	b0613	646631	647509	triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase	citC // citD // citE // citF // citX // citG	b0618 // b0617 // b0616 // b0615 // b0614 // b0613
pdxA	b0052	52427	53416	4-hydroxythreonine-4-phosphate dehydrogenase	lptD // surA // apaH // apaG // rsmA // pdxA	b0054 // b0053 // b0049 // b0050 // b0051 // b0052
lacY	b0343	361926	363179	lactose permease	lacA // lacY // lacZ	b0342 // b0343 // b0344
mdtN	b4082	4303078	4304109	putative multidrug efflux pump membrane fusion protein	mdtN // mdtO // mdtP	b4082 // b4081 // b4080
yrfG	b3399	3528669	3529337	purine nucleotidase	yrfG // hslO // hslR	b3399 // b3401 // b3400
ygfZ	b2898	3041313	3042293	folate-binding protein	ygfZ	b2898
pdxB	b2320	2436715	2437851	erythronate-4-phosphate dehydrogenase	pdxB // dedA // truA // usg	b2320 // b2317 // b2318 // b2319
ybhM	b0787	820793	821506	Bax1-I family protein YbhM	ybhM	b0787
fau	b2912	3056241	3056789	putative 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase	fau // ssrS	b2912 // b2911
yebC	b1864	1947411	1948151	putative transcriptional regulator YebC	nudB // yebC // ruvC	b1865 // b1864 // b1863
yeaK	b1787	1873574	1874077	mischarged aminoacyl-tRNA deacylase	yeaK	b1787
pdxJ	b2564	2700998	2701729	pyridoxine 5'-phosphate synthase	acpS // pdxJ // recO // era // rnc	b2563 // b2564 // b2565 // b2566 // b2567
glpG	b3424	3560622	3561452	rhomboid protease GlpG	glpG // glpE // glpR	b3424 // b3425 // b3423
nfsB	b0578	604771	605424	NAD(P)H nitroreductase NfsB	nfsB	b0578
yhbS	b3156	3300255	3300758	putative <i>N</i>-acetyltransferase YhbS	ubiT // yhbS	b3157 // b3156
lipB	b0630	661637	662278	lipoyl(octanoyl) transferase	lipB // ybeD	b0630 // b0631
mdlA	b0448	468871	470643	ABC transporter family protein MdlA	mdlB // mdlA	b0449 // b0448
tehB	b1430	1501562	1502155	tellurite methyltransferase	tehA // tehB	b1429 // b1430
rhsB	b3482	3619192	3623427	rhs element protein RhsB	rhsB	b3482
lplA	b4386	4623101	4624117	lipoate&mdash;protein ligase A	lplA // ytjB	b4386 // b4387
fepG	b0589	620196	621188	ferric enterobactin ABC transporter membrane subunit FepG	fepC // fepG // fepD	b0588 // b0589 // b0590
arnB	b2253	2365910	2367067	UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose aminotransferase	arnF // arnE // arnT // arnD // arnA // arnC // arnB	b2258 // b4544 // b2257 // b2256 // b2255 // b2254 // b2253
yghD	b2968	3110590	3111126	putative type II secretion system M-type protein YghD	yghE // yghD	b2969 // b2968
lipA	b0628	659251	660216	lipoyl synthase	lipA	b0628
cydX	b4515	774196	774309	cytochrome <i>bd</i>-I ubiquinol oxidase accessory subunit CydX	ybgE // cydX	b0735 // b4515
btsR	b2125	2212243	2212962	Phosphorylated DNA-binding transcriptional dual regulator BtsR // DNA-binding transcriptional dual regulator BtsR	btsS // btsR	b2126 // b2125
yqcC	b2792	2923784	2924113	DUF446 domain-containing protein YqcC	yqcC // truC // yqcA	b2792 // b2791 // b2790
cobT	b1991	2063388	2064467	nicotinate-nucleotide&mdash;dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase	cobT // cobS // cobU	b1991 // b1992 // b1993
dmsA	b0894	940959	943403	dimethyl sulfoxide reductase subunit A	dmsA // dmsB // dmsC	b0894 // b0895 // b0896
cysA	b2422	2539717	2540814	sulfate/thiosulfate ABC transporter ATP binding subunit	cysM // cysA // cysW // cysU // cysP	b2421 // b2422 // b2423 // b2424 // b2425
yfgH	b2505	2629792	2630310	lipoprotein YfgH	yfgI // yfgH	b2506 // b2505
btuD	b1709	1792809	1793558	vitamin B<sub>12</sub> ABC transporter ATP binding subunit	btuD // btuE // btuC	b1709 // b1710 // b1711
garP	b3127	3273573	3274907	galactarate/D-glucarate transporter GarP	garK // garL // garP // garR // rnpB	b3124 // b3126 // b3127 // b3125 // b3123
mdtP	b4080	4299564	4301030	putative multidrug efflux pump outer membrane channel	mdtN // mdtO // mdtP	b4082 // b4081 // b4080
yfaZ	b2250	2363733	2364275	putative porin YfaZ	yfaZ	b2250
cobU	b1993	2065219	2065764	cobinamide-P guanylyltransferase / cobinamide kinase	cobT // cobS // cobU	b1991 // b1992 // b1993
cpxA	b3911	4103602	4104975	CpxA-<i>N</i>-phospho-L-histidine // sensor histidine kinase CpxA	cpxA // cpxR	b3911 // b3912
arnA	b2255	2368039	2370021	fused UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase/UDP-glucuronate dehydrogenase	arnF // arnE // arnT // arnD // arnA // arnC // arnB	b2258 // b4544 // b2257 // b2256 // b2255 // b2254 // b2253
pdeD	b1815	1898427	1900025	putative c-di-GMP phosphodiesterase PdeD	pdeD	b1815
btuR	b1270	1327767	1328357	cobinamide/cobalamin adenosyltransferase	yciK // btuR	b1271 // b1270
gntP	b4321	4549953	4551296	fructuronate transporter	gntP	b4321
mdaB	b3028	3172530	3173111	NADPH:quinone oxidoreductase MdaB	mdaB	b3028
ydiK	b1688	1769074	1770186	putative transporter YdiK	ydiK	b1688
cobC	b0638	669296	669907	putative adenosylcobalamin phosphatase/&alpha;-ribazole phosphatase	leuS // lptE // holA // nadD // cobC	b0642 // b0641 // b0640 // b0639 // b0638
atpB	b3738	3921236	3922051	ATP synthase F<sub>o</sub> complex subunit a	atpI // atpC // atpD // atpG // atpA // atpH // atpF // atpE // atpB	b3739 // b3731 // b3732 // b3733 // b3734 // b3735 // b3736 // b3737 // b3738
mdtO	b4081	4301027	4303078	putative multidrug efflux pump subunit MdtO	mdtN // mdtO // mdtP	b4082 // b4081 // b4080
yncE	b1452	1523307	1524368	PQQ-like domain-containing protein YncE	yncE	b1452
cobS	b1992	2064479	2065222	cobalamin 5'-phosphate synthase	cobT // cobS // cobU	b1991 // b1992 // b1993
dauA	b1206	1259124	1260803	aerobic C4-dicarboxylate transporter DauA	dauA	b1206
yqiA	b3031	3175425	3176006	esterase YqiA	nudF // yqiB // cpdA // yqiA // parE	b3034 // b3033 // b3032 // b3031 // b3030
pdeG	b1168	1217328	1218851	putative c-di-GMP phosphodiesterase PdeG	pdeG	b1168
ligB	b3647	3819488	3821170	DNA ligase B	ligB	b3647
gshA	b2688	2814883	2816439	glutamate&mdash;cysteine ligase	gshA	b2688
uspB	b3494	3639385	3639720	putative universal stress (ethanol tolerance) protein B	uspB	b3494
yahD	b0318	335280	335885	ankyrin repeat-containing protein YahD	yahG // yahF // yahD // yahE	b0321 // b0320 // b0318 // b0319
ycaQ	b0916	969389	970621	interstrand DNA crosslink repair glycosylase	ycaQ // lpxK // msbA // ycaI	b0916 // b0915 // b0914 // b0913
nudG	b1759	1841490	1841897	5-hydroxy-CTP diphosphatase	nudG	b1759
gshB	b2947	3091878	3092828	glutathione synthetase	gshB // rsmE	b2947 // b2946
mdtD	b2077	2161464	2162879	putative multidrug efflux pump MdtD	mdtD // mdtC // mdtB // mdtA // baeS // baeR	b2077 // b2076 // b2075 // b2074 // b2078 // b2079
yeaE	b1781	1864782	1865636	methylglyoxal reductase YeaE	yeaE	b1781
ybeZ	b0660	692338	693378	PhoH-like protein	ybeZ // ybeY // ybeX // lnt	b0660 // b0659 // b0658 // b0657
helD	b0962	1024471	1026525	DNA helicase IV	helD	b0962
pncB	b0931	989154	990356	nicotinate phosphoribosyltransferase	pncB	b0931
yojI	b2211	2306972	2308615	ABC transporter family protein / microcin J25 efflux protein	yojI	b2211
paoC	b0284	298736	300934	aldehyde dehydrogenase: molybdenum cofactor-binding subunit	paoA // paoB // paoC // paoD	b0286 // b0285 // b0284 // b0283
yaiL	b0354	376772	377311	DUF2058 domain-containing protein YaiL	yaiL	b0354
nadA	b0750	782085	783128	quinolinate synthase	pnuC // nadA	b0751 // b0750
lldP	b3603	3777399	3779054	lactate/glycolate:H<sup>+</sup> symporter LldP	lldD // lldR // lldP	b3605 // b3604 // b3603
yieF	b3713	3894652	3895218	chromate reductase	yieF // yieE	b3713 // b3712
raiZ	b4805	2737381	2737542	small RNA RaiZ	raiZ // raiA	b4805 // b2597
nadC	b0109	117752	118645	quinolinate phosphoribosyltransferase (decarboxylating)	nadC	b0109
kdgT	b3909	4101690	4102673	2-dehydro-3-deoxy-D-gluconate:H<sup>+</sup> symporter	kdgT	b3909
katE	b1732	1813867	1816128	catalase HPII	katE	b1732
gadF	b4718	3658992	3659082	small regulatory RNA GadF	mdtF // mdtE // gadF // gadE	b3514 // b3513 // b4718 // b3512
pncA	b1768	1851887	1852528	nicotinamidase	pncA // ansA	b1768 // b1767
metI	b0198	220968	221621	L-methionine/D-methionine ABC transporter membrane subunit	metQ // metI // metN	b0197 // b0198 // b0199
sodC	b1646	1724134	1724655	superoxide dismutase (Cu-Zn)	sodC	b1646
yoaJ	b4675	1878874	1878948	uncharacterized protein YoaJ		
nadB	b2574	2710420	2712042	L-aspartate oxidase	nadB	b2574
bacA	b3057	3203310	3204131	undecaprenyl pyrophosphate phosphatase	bacA	b3057
ybiA	b0798	832468	832950	<i>N</i>-glycosidase YbiA	ybiA	b0798
ybeL	b0643	675018	675500	DUF1451 domain-containing protein YbeL	ybeL	b0643
nadD	b0639	669931	670572	nicotinate-mononucleotide adenylyltransferase	leuS // lptE // holA // nadD // cobC	b0642 // b0641 // b0640 // b0639 // b0638
clsA	b1249	1307185	1308645	cardiolipin synthase A	yciU // clsA	b1248 // b1249
bcp	b2480	2600478	2600948	thiol peroxidase	bcp	b2480
hrpB	b0148	162105	164534	RNA-dependent NTPase HrpB	hrpB	b0148
rybA	b4416	852725	853064	small RNA RybA	rybA // mntS	b4416 // b4705
nadE	b1740	1822458	1823285	NH<sub>3</sub>-dependent NAD<sup>+</sup> synthetase	nadE	b1740
corA	b3816	4001426	4002376	Ni<sup>2+</sup>/Co<sup>2+</sup>/Mg<sup>2+</sup> transporter	corA	b3816
tam	b1519	1607346	1608104	<i>trans</i>-aconitate 2-methyltransferase	lsrG // lsrF // lsrB // lsrD // lsrC // lsrA // tam	b1518 // b1517 // b1516 // b1515 // b1514 // b1513 // b1519
thpR	b0147	161501	162031	RNA 2',3'-cyclic phosphodiesterase	thpR	b0147
pncC	b2700	2823849	2824346	NMN aminohydrolase	pncC	b2700
barA	b2786	2915057	2917813	BarA-<i>N</i>-phospho-L-histidine-861 // BarA-<i>N</i>-phospho-L-histidine-302 // BarA-phospho-L-aspartate-718 // sensor histidine kinase BarA	barA	b2786
ahpF	b0606	639753	641318	alkyl hydroperoxide reductase, AhpF component	ahpC // ahpF	b0605 // b0606
rydB	b4430	1764713	1764780	small regulatory RNA RydB	rydB	b4430
nadK	b2615	2750831	2751709	NAD kinase	nadK	b2615
tatA	b3836	4021945	4022214	twin arginine protein translocation system - TatA protein	tatD // tatC // tatB // tatA	b4483 // b3839 // b3838 // b3836
cyuA	b4470	3255341	3256651	putative L-cysteine desulfidase CyuA	cyuP // cyuA	b3110 // b4470
arcZ	b4450	3350577	3350697	small regulatory RNA ArcZ	arcZ	b4450
moaB	b0782	818055	818567	protein MoaB	moaE // moaD // moaC // moaB // moaA	b0785 // b0784 // b0783 // b0782 // b0781
rstB	b1609	1682882	1684183	sensory histidine kinase RstB - phosphorylated // sensory histidine kinase RstB	rstB // rstA	b1609 // b1608
gstB	b0838	879854	880480	glutathione <i>S</i>-transferase GstB	gstB	b0838
sroH	b4691	4190327	4190487	small RNA SroH	sroH	b4691
moeB	b0826	864380	865129	molybdopterin-synthase adenylyltransferase	moeB // moeA	b0826 // b0827
yqhA	b3002	3148977	3149471	uncharacterized protein YqhA	yqhA	b3002
yfgD	b2495	2617578	2617937	putative oxidoreductase YfgD	yfgD // bepA	b2495 // b2494
sraB	b4418	1146589	1146757	small RNA SraB	sraB	b4418
modA	b0763	795089	795862	molybdate ABC transporter periplasmic binding protein	modA // modB // modC	b0763 // b0764 // b0765
xylE	b4031	4240779	4242254	D-xylose:H<sup>+</sup> symporter	xylE	b4031
pxpB	b0711	743593	744249	5-oxoprolinase component B	nei // pxpA // pxpC // pxpB // ybgI	b0714 // b0713 // b0712 // b0711 // b0710
chiX	b4585	507204	507287	small regulatory RNA ChiX	chiX	b4585
mobA	b3857	4041415	4041999	molybdenum cofactor guanylyltransferase	mobB // mobA	b3856 // b3857
yfgO	b2493	2614820	2615881	putative transporter YfgO	yfgO	b2493
yiiM	b3910	4102822	4103496	2-amino-6-<i>N</i>-hydroxylaminopurine resistance protein	yiiM	b3910
sokX	b4701	2887353	2887408	small RNA SokX	sokX	b4701
moaD	b0784	819048	819293	MoaD-S // molybdopterin synthase sulfur carrier subunit	moaE // moaD // moaC // moaB // moaA	b0785 // b0784 // b0783 // b0782 // b0781
tdcC	b3116	3263686	3265017	threonine/serine:H<sup>+</sup> symporter	tdcG // tdcF // tdcE // tdcD // tdcC // tdcB // tdcA	b4471 // b3113 // b3114 // b3115 // b3116 // b3117 // b3118
sodA	b3908	4100810	4101430	superoxide dismutase (Mn)	sodA	b3908
sdsR	b4433	1923104	1923207	small regulatory RNA SdsR	pphA // sdsR	b1838 // b4433
mog	b0009	9306	9893	molybdopterin adenylyltransferase	mog	b0009
rcnA	b2106	2185917	2186741	Ni<sup>2+</sup>/Co<sup>2+</sup> exporter	rcnA // rcnB	b2106 // b2107
paoB	b0285	300931	301887	aldehyde dehydrogenase, FAD-binding subunit	paoA // paoB // paoC // paoD	b0286 // b0285 // b0284 // b0283
ynbC	b1410	1479138	1480895	hydrolase/methyltransferase domain-containing protein YnbC	ynbD // ynbC // ynbB // ynbA	b1411 // b1410 // b1409 // b1408
ybcJ	b0528	556661	556873	putative RNA-binding protein YbcJ	folD // ybcJ	b0529 // b0528
modC	b0765	796554	797612	molybdate ABC transporter ATP binding subunit	modA // modB // modC	b0763 // b0764 // b0765
ptsG	b1101	1157869	1159302	EIIBC<sup>glc</sup> - phosphorylated // glucose-specific PTS enzyme IIBC component	ptsG	b1101
nnr	b4167	4394066	4395613	NAD(P)HX epimerase / NAD(P)HX dehydratase	nnr // hflC // hflK // hflX // hfq // miaA // mutL // amiB // tsaE	b4167 // b4175 // b4174 // b4173 // b4172 // b4171 // b4170 // b4169 // b4168
ycgZ	b1164	1215789	1216025	putative two-component system connector protein YcgZ	ymgC // ariR // ymgA // ycgZ	b1167 // b1166 // b1165 // b1164
ryfA	b4440	2653855	2654158	small regulatory RNA RyfA	ryfA	b4440
moaE	b0785	819295	819747	molybdopterin synthase catalytic subunit	moaE // moaD // moaC // moaB // moaA	b0785 // b0784 // b0783 // b0782 // b0781
yeaL	b1789	1874352	1874798	DUF441 domain-containing inner membrane protein YeaL	yeaL	b1789
katG	b3942	4133835	4136015	catalase/hydroperoxidase HPI	katG	b3942
ybjH	b0843	884946	885230	uncharacterized protein YbjH	ybjH	b0843
rhlE	b0797	830872	832236	ATP-dependent RNA helicase RhlE	rhlE	b0797
moaA	b0781	817044	818033	GTP 3',8'-cyclase	moaA // moaE // moaD // moaC // moaB	b0781 // b0785 // b0784 // b0783 // b0782
creC	b4399	4636696	4638120	sensory histidine kinase CreC	creA // creB // creC // creD	b4397 // b4398 // b4399 // b4400
nemA	b1650	1726659	1727756	<i>N</i>-ethylmaleimide reductase	nemA // nemR // gloA	b1650 // b1649 // b1651
ykgE	b0306	321608	322327	putative lactate utilization oxidoreductase YkgE	ykgG // ykgF // ykgE	b0308 // b0307 // b0306
csrC	b4457	4051036	4051281	small regulatory RNA CsrC	csrC	b4457
moeA	b0827	865129	866364	molybdopterin molybdotransferase	moeB // moeA	b0826 // b0827
mdtJ	b1600	1673136	1673501	multidrug/spermidine efflux pump membrane subunit MdtJ	mdtJ // mdtI	b1600 // b1599
norW	b2711	2833912	2835045	NADH:flavorubredoxin reductase	norW // norV	b2711 // b2710
ythB	b4802	4536597	4536695	protein YthB		
rtcB	b3421	3556853	3558079	RNA-splicing ligase	rtcA // rtcB	b4475 // b3421
mocA	b2877	3015160	3015738	molybdenum cofactor cytidylyltransferase	mocA	b2877
narV	b1465	1535937	1536617	nitrate reductase Z subunit &gamma;	narV // narW // narY // narZ	b1465 // b1466 // b1467 // b1468
cynS	b0340	359489	359959	cyanase	cynT // cynS // cynX	b0339 // b0340 // b0341
yqgH	b4785	3109317	3109400	protein YqgH		
ryeA	b4432	1923066	1923337	small antisense RNA RyeA	ryeA	b4432
moaC	b0783	818570	819055	cyclic pyranopterin monophosphate synthase	moaE // moaD // moaC // moaB // moaA	b0785 // b0784 // b0783 // b0782 // b0781
ycjO	b1311	1373222	1374103	putative ABC transporter membrane subunit YcjO	ymjB // ycjV // ycjU // ycjT // ycjS // ycjR // ycjQ // ycjP // ycjO // ycjN // ycjM // ompG	b4524 // b1318 // b1317 // b1316 // b1315 // b1314 // b1313 // b1312 // b1311 // b1310 // b1309 // b1319
sad	b1525	1613315	1614703	succinate semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)<sup>+</sup>) Sad	sad	b1525
ybgV	b4768	754658	754690	protein YbgV		
sroC	b4763	686681	686843	small regulatory RNA SroC	sroC // gltL // gltK // gltJ // gltI	b4763 // b0652 // b0653 // b0654 // b0655
entA	b0596	628551	629297	2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase	entC // entE // entB // entA // entH	b0593 // b0594 // b0595 // b0596 // b0597
minD	b1175	1224549	1225361	Z-ring positioning protein MinD	minE // minD // minC	b1174 // b1175 // b1176
yhhY	b3441	3581138	3581626	<i>N</i>-acetyltransferase YhhY	yhhY	b3441
ykgV	b4729	294918	295142	CP4-6 prophage; protein YkgV		
eyeA	b4690	272580	272654	CP4-6 prophage; small RNA EyeA		
entC	b0593	624885	626060	isochorismate synthase EntC	entC // entE // entB // entA // entH	b0593 // b0594 // b0595 // b0596 // b0597
kdpD	b0695	721730	724414	sensor histidine kinase KdpD	kdpE // kdpD	b0694 // b0695
ycbX	b0947	1006491	1007600	6-<i>N</i>-hydroxylaminopurine resistance protein	ycbX	b0947
ytcA	b4622	4304128	4304403	putative lipoprotein YtcA		
isrC	b4435	2071317	2071511	CP4-44 prophage; small RNA IsrC	flu // isrC	b2000 // b4435
ispF	b2746	2871301	2871780	2-<i>C</i>-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase	ispF // ispD	b2746 // b2747
abrB	b0715	746723	747769	putative regulator	abrB	b0715
yjjG	b4374	4608646	4609323	pyrimidine 5'-nucleotidase YjjG	yjjG // rimI // holD	b4374 // b4373 // b4372
yjjZ	b4567	4605804	4606040	DUF1435 domain-containing protein YjjZ	yjjZ	b4567
ryfD	b4609	2734153	2734295	small regulatory RNA RyfD	ryfD	b4609
ubiU	b3158	3301485	3302480	ubiquinone biosynthesis protein UbiU	ubiV // ubiU	b3159 // b3158
glpB	b2242	2354265	2355524	anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B	glpA // glpB // glpC	b2241 // b2242 // b2243
ydbD	b1407	1475144	1477450	DUF2773 domain-containing protein YdbD	ydbD	b1407
yabP	b0056	58474	59124	putative uncharacterized protein YabP	yabQ // yabP	b0057 // b0056
rybB	b4417	887979	888057	small regulatory RNA RybB	rybB	b4417
ubiJ	b3834	4019624	4020229	ubiquinone biosynthesis accessory factor UbiJ	ubiB // ubiJ // ubiE	b3835 // b3834 // b3833
yaiW	b0378	397872	398966	surface-exposed outer membrane lipoprotein	yaiW // sbmA	b0378 // b0377
gpr	b3001	3147897	3148937	L-glyceraldehyde 3-phosphate reductase	gpr	b3001
bcsF	b3537	3698026	3698217	putative cellulose biosynthesis protein BcsF	bcsG // bcsF // bcsE	b3538 // b3537 // b3536
stpA	b2669	2798091	2798495	DNA-binding transcriptional repressor StpA with RNA chaperone activity	stpA	b2669
ispB	b3187	3333710	3334681	<i>all-trans</i>-octaprenyl-diphosphate synthase	ispB	b3187
fecD	b4288	4511458	4512414	ferric citrate ABC transporter membrane subunit FecD	fecE // fecD // fecC // fecB // fecA	b4287 // b4288 // b4289 // b4290 // b4291
pxpC	b0712	744243	745175	5-oxoprolinase component C	nei // pxpA // pxpC // pxpB // ybgI	b0714 // b0713 // b0712 // b0711 // b0710
yehR	b2123	2211225	2211686	DUF1307 domain-containing lipoprotein YehR	yehR	b2123
ryjA	b4459	4277926	4278066	small RNA RyjA	ryjA	b4459
idi	b2889	3033065	3033613	isopentenyl-diphosphate &Delta;-isomerase	idi	b2889
dctA	b3528	3682161	3683447	C4 dicarboxylate/orotate:H<sup>+</sup> symporter	dctA	b3528
sodB	b1656	1735378	1735959	superoxide dismutase (Fe)	sodB	b1656
cbrB	b3716	3897506	3897973	putative inner membrane protein	cbrB // cbrC	b3716 // b3717
sraG	b4449	3311183	3311398	small regulatory RNA SraG	sraG	b4449
ubiF	b0662	695101	696276	2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase	ubiF	b0662
cysW	b2423	2540804	2541679	sulfate/thiosulfate ABC transporter inner membrane subunit CysW	cysM // cysA // cysW // cysU // cysP	b2421 // b2422 // b2423 // b2424 // b2425
rcnB	b2107	2186960	2187298	periplasmic protein involved in nickel/cobalt export	rcnA // rcnB	b2106 // b2107
yjjY	b4402	4640402	4640542	uncharacterized protein YjjY	yjjY	b4402
sroE	b4761	2640595	2640686	small RNA SroE	ispG // sroE	b2515 // b4761
ubiI	b2906	3051115	3052317	2-octaprenylphenol 6-hydroxylase	ygfB // pepP // ubiH // ubiI	b2909 // b2908 // b2907 // b2906
sstT	b3089	3239944	3241188	serine/threonine:Na+ symporter	sstT	b3089
paoA	b0286	301884	302573	aldehyde dehydrogenase, Fe-S subunit	paoA // paoB // paoC // paoD	b0286 // b0285 // b0284 // b0283
yijD	b3964	4161771	4162130	DUF1422 domain-containing inner membrane protein YijD	yijD // fabR	b3964 // b3963
sraA		458728	458784	small RNA SraA	sraA	
menH	b2263	2376834	2377592	2-succinyl-6-hydroxy-2,4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase	menH // menD // menF // menE // menC // menB	b2263 // b2264 // b2265 // b2260 // b2261 // b2262
cdsA	b0175	195677	196534	CDP-diglyceride synthetase	dxr // cdsA // uppS	b0173 // b0175 // b0174
yihU	b3882	4072675	4073571	3-sulfolactaldehyde reductase	yihS // yihT // yihU	b3880 // b3881 // b3882
yzcX	b3808	3993850	3994335	protein YzcX	yzcX	b3808
sroA	b4762	75516	75608	small RNA SroA	sgrR // sroA // thiB // thiP // thiQ	b0069 // b4762 // b0068 // b0067 // b0066
ubiV	b3159	3302489	3303367	ubiquinone biosynthesis protein UbiV	ubiV // ubiU	b3159 // b3158
idnT	b4265	4491206	4492525	L-idonate/5-ketogluconate/gluconate transporter	idnT // idnO // idnD // idnR	b4265 // b4266 // b4267 // b4264
hxpB	b1727	1809380	1810048	hexitol phosphatase B	hxpB	b1727
yjdN	b4107	4325298	4325741	PF06983 family protein YjdN	yjdN	b4107
ryjB	b4624	4527977	4528066	small RNA RyjB	ryjB	b4624
ispG	b2515	2640686	2641804	(<em>E</em>)-4-hydroxy-3-methylbut-2-enyl-diphosphate synthase (flavodoxin)	ispG // sroE	b2515 // b4761
aroP	b0112	120178	121551	aromatic amino acid:H<sup>+</sup> symporter AroP	aroP	b0112
yjjX	b4394	4633233	4633745	ITPase/XTPase	yjjX	b4394
yraQ	b3151	3297098	3298138	permease family protein YraQ	yraQ	b3151
ubiK	b3042	3184840	3185130	ubiquinone biosynthesis accessory factor UbiK	ubiK	b3042
znuB	b1859	1943414	1944199	Zn<sup>2+</sup> ABC transporter membrane subunit	znuB // znuC	b1859 // b1858
dkgB	b0207	229167	229970	methylglyoxal reductase DkgB	dkgB	b0207
yqgC	b2940	3086187	3086402	protein YqgC	yqgC	b2940
ubiD	b3843	4024988	4026481	3-octaprenyl-4-hydroxybenzoate decarboxylase	ubiD	b3843
yhhS	b3473	3610516	3611733	putative transporter YhhS	yhhS	b3473
gstA	b1635	1714377	1714982	glutathione <i>S</i>-transferase GstA	gstA	b1635
ygcE	b2776	2901896	2903374	putative sugar kinase YgcE	ygcE // yqcE	b2776 // b2775
menI	b1686	1765222	1765632	1,4-dihydroxy-2-naphthoyl-CoA hydrolase	ydiJ // menI // ydiH	b1687 // b1686 // b1685
lgt	b2828	2965162	2966037	phosphatidylglycerol--prolipoprotein diacylglyceryl transferase	thyA // lgt	b2827 // b2828
arsC	b3503	3650237	3650662	arsenate reductase	arsR // arsB // arsC	b3501 // b3502 // b3503
yfeZ	b2433	2551277	2551726	putative inner membrane protein	ypeA // yfeZ	b2434 // b2433
dxr	b0173	193521	194717	1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate reductoisomerase	dxr // cdsA // uppS	b0173 // b0175 // b0174
ccmF	b2196	2292961	2294904	holocytochrome <I>c</I> synthase CcmF component	ccmH // ccmG // ccmF // ccmE // ccmD // ccmC // ccmB // ccmA // napC // napB // napH // napG // napA // napD // napF	b2194 // b2195 // b2196 // b2197 // b2198 // b2199 // b2200 // b2201 // b2202 // b2203 // b2204 // b2205 // b2206 // b2207 // b2208
yjjQ	b4365	4603477	4604202	DNA-binding transcriptional repressor YjjQ	bglJ // yjjQ	b4366 // b4365
yegV	b2100	2181096	2182061	putative sugar kinase YegV	yegV // yegU // yegT	b2100 // b2099 // b2098
ispE	b1208	1262026	1262877	4-(cytidine 5'-diphospho)-2-<i>C</i>-methyl-D-erythritol kinase	ispE // lolB // prs	b1208 // b1209 // b1207
nrfD	b4073	4290476	4291432	putative menaquinol-cytochrome <i>c</i> reductase subunit NrfD	nrfA // nrfB // nrfC // nrfD // nrfE // nrfF // nrfG	b4070 // b4071 // b4072 // b4073 // b4074 // b4075 // b4076
tpx	b1324	1388305	1388811	lipid hydroperoxide peroxidase	tpx	b1324
ydjL	b1776	1860256	1861332	putative zinc-binding dehydrogenase YdjL	ydjL // ydjK // ydjJ // ydjI // ydjH // ydjG	b1776 // b1775 // b1774 // b1773 // b1772 // b1771
ispA	b0421	440202	441101	geranyl diphosphate/farnesyl diphosphate synthase	dxs // ispA // xseB // yajO	b0420 // b0421 // b0422 // b0419
yihP	b3877	4065809	4067194	putative 2,3-dihydroxypropane-1-sulfonate export protein	yihP // yihO	b3877 // b3876
ahpC	b0605	638945	639508	alkyl hydroperoxide reductase, AhpC component	ahpC // ahpF	b0605 // b0606
ydhI	b1643	1721025	1721261	DUF1656 domain-containing protein YdhI	ydhK // ydhJ // ydhI	b1645 // b1644 // b1643
mqsR	b3022	3168248	3168544	mRNA interferase toxin MqsR	mqsR // mqsA	b3022 // b3021
ubiT	b3157	3300752	3301276	anaerobic ubiquinone biosynthesis accessory factor UbiT	ubiT // yhbS	b3157 // b3156
yidK	b3679	3858401	3860116	putative transporter YidK	yidK // yidJ	b3679 // b3678
yqiI	b3048	3190632	3191696	putative fimbrial protein YqiI	yqiI // yqiH // yqiG // insD5 // insC5 // insCD5	b3048 // b3047 // b3046 // b3045 // b3044
hslJ	b1379	1441321	1441743	lipoprotein implicated in Novobiocin resistance	hslJ	b1379
malE	b4034	4245229	4246419	maltose ABC transporter periplasmic binding protein	malG // malF // malE	b4032 // b4033 // b4034
ispD	b2747	2871780	2872490	2-<i>C</i>-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase	ispF // ispD	b2746 // b2747
marC	b1529	1618243	1618908	inner membrane protein MarC	marC	b1529
pxpA	b0713	745165	745899	5-oxoprolinase component A	nei // pxpA // pxpC // pxpB // ybgI	b0714 // b0713 // b0712 // b0711 // b0710
yceQ	b1085	1144502	1144822	DUF2655 domain-containing protein YceQ	yceQ	b1085
dgcJ	b1786	1872041	1873531	putative diguanylate cyclase DgcJ	dgcJ	b1786
ubiC	b4039	4252506	4253003	chorismate lyase	ubiC // ubiA	b4039 // b4040
yaaU	b0045	45807	47138	putative transporter YaaU	yaaU	b0045
yeiG	b2154	2243910	2244746	<i>S</i>-formylglutathione hydrolase / <i>S</i>-lactoylglutathione hydrolase	yeiG	b2154
ybhJ	b0771	803503	805764	putative hydratase YbhJ	ybhJ	b0771
bdm	b1481	1556065	1556280	biofilm-dependent modulation protein	bdm // sra	b1481 // b1480
dxs	b0420	438315	440177	1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate synthase	dxs // ispA // xseB // yajO	b0420 // b0421 // b0422 // b0419
wzyE	b3793	3978601	3979953	putative enterobacterial common antigen polymerase	rffM // wzyE // wecF // wzxE // wecE // rffC // rffH // rffG // wecC // wecB // wzzE // rfe	b3794 // b3793 // b4481 // b3792 // b3791 // b3790 // b3789 // b3788 // b3787 // b3786 // b3785 // b3784
frmB	b0355	377535	378368	<i>S</i>-formylglutathione hydrolase FrmB	frmR // frmA // frmB	b0357 // b0356 // b0355
yafP	b0234	252709	253161	putative acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain	yafP // yafO // yafN // dinB	b0234 // b0233 // b0232 // b0231
cheW	b1887	1972836	1973339	chemotaxis protein CheW	cheW // cheA // motB // motA	b1887 // b1888 // b1889 // b1890
umpH	b0675	699574	700326	UMP phosphatase	umpH // nagC // nagA // nagB	b0675 // b0676 // b0677 // b0678
mdtG	b1053	1114264	1115490	efflux pump MdtG	mdtG	b1053
dtd	b3887	4077015	4077452	D-aminoacyl-tRNA deacylase	fabY // dtd // yihY // yihX	b3888 // b3887 // b3886 // b3885
ysgD	b4799	4001218	4001274	protein YsgD		
dgcT	b1025	1092876	1094234	probable diguanylate cyclase DgcT	dgcT	b1025
pyrB	b4245	4471460	4472395	aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit	pyrL // pyrI // pyrB	b4246 // b4244 // b4245
dcuA	b4138	4365472	4366773	C4-dicarboxylate transporter DcuA	dcuA // aspA	b4138 // b4139
fpr	b3924	4113726	4114472	flavodoxin/ferredoxin-NADP<sup>+</sup> reductase	fpr	b3924
pssL	b4782	2722702	2722743	protein PssL		
chaC	b1218	1272507	1273202	glutathione-specific &gamma;-glutamylcyclotransferase	chaB // chaC	b1217 // b1218
purL	b2557	2691656	2695543	phosphoribosylformylglycinamide synthetase	purL	b2557
mltC	b2963	3104433	3105512	membrane-bound lytic murein transglycosylase C	nupG // mutY // mltC // yggX	b2964 // b2961 // b2963 // b2962
dinJ	b0226	246242	246502	antitoxin/DNA-binding transcriptional repressor DinJ	dinJ // yafQ	b0226 // b0225
ysdD	b4757	3884026	3884106	protein YsdD		
cheA	b1888	1973360	1975324	chemotaxis protein CheA // chemotaxis protein CheA(S)	cheW // cheA // motB // motA	b1887 // b1888 // b1889 // b1890
purF	b2312	2428721	2430238	amidophosphoribosyltransferase	purF // cvpA // ubiX	b2312 // b2313 // b2311
ampE	b0111	119281	120135	protein AmpE	ampD // ampE	b0110 // b0111
hokB	b4428	1491922	1492071	toxin HokB	hokB	b4428
ymjE	b4742	1359177	1359341	protein YmjE	puuA // ymjE // puuP	b1297 // b4742 // b1296
yehP	b2121	2207967	2209103	VWA domain-containing protein YehP	yehQ // yehP // yehM // yehL	b2122 // b2121 // b2120 // b2119
purC	b2476	2596905	2597618	phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase	purC	b2476
uhpB	b3668	3848634	3850136	sensory histidine kinase UhpB - phosphorylated // sensory histidine kinase UhpB	uhpC // uhpB // uhpA // ilvN // ilvB // ivbL	b3667 // b3668 // b3669 // b3670 // b3671 // b3672
ldrA	b4419	1269168	1269275	small toxic polypeptide LdrA	ldrA	b4419
yabR	b4726	85467	85511	protein YabR	yabR	b4726
dgcQ	b1956	2026323	2028017	putative diguanylate cyclase DgcQ	dgcQ	b1956
purB	b1131	1190616	1191986	adenylosuccinate lyase	purB // hflD	b1131 // b1132
hyfE	b2485	2606262	2606912	hydrogenase 4 component E	focB // hyfR // hyfJ // hyfI // hyfH // hyfG // hyfF // hyfE // hyfD // hyfC // hyfB // hyfA	b2492 // b2491 // b2490 // b2489 // b2488 // b2487 // b2486 // b2485 // b2484 // b2483 // b2482 // b2481
hlyE	b1182	1229483	1230394	hemolysin E	hlyE	b1182
yrhD	b4612	3584404	3584559	uncharacterized protein YrhD		
dgcN	b2604	2742383	2743609	diguanylate cyclase DgcN	yfiB // dgcN // yfiR	b2605 // b2604 // b2603
purM	b2499	2621197	2622234	phosphoribosylformylglycinamide cyclo-ligase	purM // purN	b2499 // b2500
bamE	b2617	2753605	2753946	outer membrane protein assembly factor BamE	bamE	b2617
yafO	b0233	252301	252699	ribosome-dependent mRNA interferase toxin YafO	yafP // yafO // yafN // dinB	b0234 // b0233 // b0232 // b0231
ypfN	b4547	2592762	2592962	UPF0370 protein YpfN	ypfN // dapE // yffB	b4547 // b2472 // b2471
cheY	b1882	1967048	1967437	CheY-acetylated // CheY-P<sup>asp</sup> // chemotaxis protein CheY	cheZ // cheY // cheB // cheR // tap // tar	b1881 // b1882 // b1883 // b1884 // b1885 // b1886
purD	b4005	4204642	4205931	phosphoribosylamine--glycine ligase	purD // purH	b4005 // b4006
mdtB	b2075	2155263	2158385	multidrug efflux pump RND permease subunit MdtB	mdtD // mdtC // mdtB // mdtA // baeS // baeR	b2077 // b2076 // b2075 // b2074 // b2078 // b2079
hokA	b4455	3720448	3720600	small toxic polypeptide	hokA	b4455
ygiM	b3055	3201207	3201827	putative signal transduction protein (SH3 domain)	cca // ygiM	b3056 // b3055
cheB	b1883	1967452	1968501	CheB-P<SUP>asp</SUP> // protein-glutamate methylesterase/protein glutamine deamidase	cheZ // cheY // cheB // cheR // tap // tar	b1881 // b1882 // b1883 // b1884 // b1885 // b1886
purT	b1849	1930881	1932059	phosphoribosylglycinamide formyltransferase 2	purT	b1849
pssA	b2585	2722727	2724082	phosphatidylserine synthase	pssA	b2585
ldrB	b4421	1269703	1269810	small toxic polypeptide LdrB	ldrB	b4421
yhhN	b3468	3605751	3606377	PF07947 family protein YhhN	yhhN	b3468
yfiR	b2603	2741875	2742393	DUF4154 domain-containing protein YfiR	yfiB // dgcN // yfiR	b2605 // b2604 // b2603
purN	b2500	2622234	2622872	phosphoribosylglycinamide formyltransferase 1	purM // purN	b2499 // b2500
ydiN	b1691	1772512	1773777	putative transporter YdiN	ydiB // ydiN // aroD	b1692 // b1691 // b1693
ratA	b2619	2754288	2754764	ribosome association toxin RatA	ratA // yfjF	b2619 // b2618
wbbK	b2032	2103391	2104509	putative glycosyltransferase WbbK	wbbK // wbbJ // wbbI	b2032 // b2033 // b2034
dgcZ	b1535	1622960	1623850	diguanylate cyclase DgcZ	dgcZ	b1535
purK	b0522	551527	552594	5-(carboxyamino)imidazole ribonucleotide synthase	purK // purE	b0522 // b0523
pgsA	b1912	1992269	1992817	CDP-diacylglycerol&mdash;glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase	pgsA	b1912
ldrD	b4453	3699980	3700087	small toxic polypeptide LdrD	ldrD	b4453
yicG	b3646	3818874	3819491	PF03458 family inner membrane protein YicG	yicG	b3646
cdgI	b1785	1870385	1871860	putative c-di-GMP binding protein CdgI	cdgI	b1785
purE	b0523	552591	553100	<i>N<sup>5</sup></i>-carboxyaminoimidazole ribonucleotide mutase	purK // purE	b0522 // b0523
ydfJ	b1543	1631002	1632285	putative transporter YdfJ	ydfJ	b1543
yafQ	b0225	245961	246239	ribosome-dependent mRNA interferase toxin YafQ	dinJ // yafQ	b0226 // b0225
yjiS	b4341	4571751	4571915	DUF1127 domain-containing protein YjiS	yjiS	b4341
cheZ	b1881	1966393	1967037	chemotaxis protein CheZ	cheZ // cheY // cheB // cheR // tap // tar	b1881 // b1882 // b1883 // b1884 // b1885 // b1886
psuK	b2166	2258355	2259296	putative pseudouridine kinase	psuK // psuG	b2166 // b2165
nagE	b0679	703944	705890	N-acetylglucosamine-specific PTS enzyme IIABC component	nagE	b0679
mokC	b0018	16751	16960	regulatory protein MokC	mokC // hokC	b0018 // b4412
yeiB	b2152	2241810	2242967	DUF418 domain-containing protein YeiB	folE // yeiB	b2153 // b2152
cheR	b1884	1968504	1969364	chemotaxis protein methyltransferase	cheZ // cheY // cheB // cheR // tap // tar	b1881 // b1882 // b1883 // b1884 // b1885 // b1886
pyrC	b1062	1121561	1122607	dihydroorotase	pyrC	b1062
cvrA	b1191	1240335	1242071	putative K<sup>+</sup>:H<sup>+</sup> antiporter	cvrA	b1191
ldrC	b4423	1270238	1270345	small toxic polypeptide LdrC	ldrC	b4423
yzgL	b3427	3563724	3564005	putative uncharacterized protein YzgL	yzgL	b3427
dgcE	b2067	2143266	2146583	putative diguanylate cyclase DgcE	dgcE	b2067
carA	b0032	29651	30799	carbamoyl phosphate synthetase subunit &alpha;	carA // carB	b0032 // b0033
manZ	b1819	1903895	1904746	mannose-specific PTS enzyme IID component	manX // manY // manZ	b1817 // b1818 // b1819
hokC	b4412	16751	16903	protein HokC	mokC // hokC	b0018 // b4412
creD	b4400	4638178	4639530	putative inner membrane protein CreD	creA // creB // creC // creD	b4397 // b4398 // b4399 // b4400
cas1	b2755	2878855	2879772	multifunctional nuclease Cas1	casA // casB // casC // casD // casE // cas1 // cas2	b2760 // b2759 // b2758 // b2757 // b2756 // b2755 // b2754
yahI	b0323	340165	341115	carbamate kinase-like protein YahI	yahJ // yahI	b0324 // b0323
ftsK	b0890	933224	937213	cell division DNA translocase FtsK	ftsK	b0890
cspG	b0990	1051461	1051673	cold shock protein CspG	cspG	b0990
ygjR	b3087	3237311	3238297	putative oxidoreductase YgjR	ygjR	b3087
yggE	b2922	3067340	3068080	DUF541 domain-containing protein YggE	yggE	b2922
carB	b0033	30817	34038	carbamoyl phosphate synthetase subunit &beta;	carA // carB	b0032 // b0033
kdpA	b0698	727059	728732	K<sup>+</sup> transporting P-type ATPase subunit KdpA	kdpF // kdpC // kdpB // kdpA	b4513 // b0696 // b0697 // b0698
ybeD	b0631	662379	662642	DUF493 domain-containing protein YbeD	lipB // ybeD	b0630 // b0631
ygfS	b2886	3028524	3029012	putative electron transport protein YgfS	ygfT // ygfS	b2887 // b2886
cas2	b2754	2878569	2878853	CRISPR-associated endoribonuclease Cas2	casA // casB // casC // casD // casE // cas1 // cas2	b2760 // b2759 // b2758 // b2757 // b2756 // b2755 // b2754
yfbR	b2291	2408862	2409461	dCMP phosphohydrolase	alaA // yfbR	b2290 // b2291
dcuC	b0621	654583	655968	anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuC	dcuC	b0621
hslR	b3400	3529348	3529749	heat shock protein Hsp15	hslR // yrfG // hslO	b3400 // b3399 // b3401
ygcO	b2767	2893919	2894179	putative 4Fe-4S cluster-containing protein	ygcP // ygcO // ygcN	b2768 // b2767 // b2766
pspG	b4050	4262840	4263082	phage shock protein G	pspG	b4050
pyrL	b4246	4472399	4472533	<i>pyrBI</i> operon leader peptide	pyrL // pyrI // pyrB	b4246 // b4244 // b4245
gcd	b0124	138835	141225	quinoprotein glucose dehydrogenase	gcd	b0124
clpB	b2592	2731600	2734173	ClpB80 // chaperone protein ClpB	clpB	b2592
yfdY	b2377	2495050	2495292	DUF2545 domain-containing protein YfdY	yfdY	b2377
casB	b2759	2882155	2882637	type I-E CRISPR system Cascade subunit CasB	casA // casB // casC // cas2 // cas1 // casE // casD	b2760 // b2759 // b2758 // b2754 // b2755 // b2756 // b2757
pyrE	b3642	3815127	3815768	orotate phosphoribosyltransferase	pyrE // rph	b3642 // b3643
mmuP	b0260	275325	276728	CP4-6 prophage; <i>S</i>-methyl-L-methionine transporter	mmuM // mmuP	b0261 // b0260
yigL	b3826	4010200	4011000	phosphosugar phosphatase YigL	yigL // pldB	b3826 // b3825
yegJ	b2071	2151185	2151646	DUF2314 domain-containing protein YegJ	yegJ	b2071
hdeA	b3510	3656408	3656740	periplasmic acid stress chaperone HdeA	yhiD // hdeB // hdeA	b3508 // b3509 // b3510
prs	b1207	1260928	1261875	ribose-phosphate diphosphokinase	ispE // lolB // prs	b1208 // b1209 // b1207
exbB	b3006	3151250	3151984	Ton complex subunit ExbB	exbB // exbD	b3006 // b3005
yggX	b2962	3104093	3104368	putative Fe<sup>2+</sup>-trafficking protein	nupG // mutY // mltC // yggX	b2964 // b2961 // b2963 // b2962
ydjZ	b1752	1834808	1835515	DedA family protein YdjZ	ynjD // ynjC // ynjB // ynjA // ydjZ // ydjY // ydjX	b1756 // b1755 // b1754 // b1753 // b1752 // b1751 // b1750
casE	b2756	2879788	2880387	pre-CRISPR RNA endonuclease	casA // casB // casC // casD // casE // cas1 // cas2	b2760 // b2759 // b2758 // b2757 // b2756 // b2755 // b2754
wbbI	b2034	2105065	2106057	&beta;-1,6-galactofuranosyltransferase WbbI	wbbK // wbbJ // wbbI	b2032 // b2033 // b2034
mngA	b0731	765984	767960	2-O-alpha-mannosyl-D-glycerate specific PTS enzyme II	mngA // mngB	b0731 // b0732
acnA	b1276	1335831	1338506	aconitate hydratase 1	ymiC // acnA	b4741 // b1276
ydfZ	b1541	1629215	1629418	putative selenoprotein YdfZ	ydfZ	b1541
mazF	b2782	2910756	2911091	endoribonuclease toxin MazF	relA // mazG // mazF // mazE	b2784 // b2781 // b2782 // b2783
hldE	b3052	3195320	3196753	fused heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase	hldE	b3052
cyoD	b0429	447717	448046	cytochrome <i>bo</i><sub>3</sub> ubiquinol oxidase subunit 4	cyoE // cyoD // cyoC // cyoB // cyoA	b0428 // b0429 // b0430 // b0431 // b0432
yaaA	b0006	5683	6459	DNA binding and peroxide stress response protein YaaA	yaaA	b0006
yddL	b1472	1545738	1546028	putative uncharacterized protein YddL	yddL // yddK // yddJ	b1472 // b1471 // b1470
csgC	b1043	1104961	1105293	curlin chaperone	csgB // csgA // csgC	b1041 // b1042 // b1043
eptB	b3546	3708784	3710475	Kdo2-lipid A phosphoethanolamine 7''-transferase	eptB	b3546
yedI	b1958	2028449	2029366	DUF808 domain-containing inner membrane protein YedI	yedI	b1958
ortT	b1445	1517389	1517562	orphan toxin OrtT	ortT	b1445
ymjA	b1295	1357423	1357668	DUF2543 domain-containing protein YmjA	ymjA	b1295
oppD	b1246	1304754	1305767	murein tripeptide ABC transporter / oligopeptide ABC transporter ATP binding subunit OppD	oppA // oppB // oppC // oppD // oppF	b1243 // b1244 // b1245 // b1246 // b1247
kdsB	b0918	970852	971598	3-deoxy-<i>manno</i>-octulosonate cytidylyltransferase	kdsB // ycaR	b0918 // b0917
bglF	b3722	3903720	3905597	&beta;-glucoside specific PTS enzyme II / BglG kinase / BglG phosphatase	bglB // bglF // bglG	b3721 // b3722 // b3723
iraD	b4326	4556993	4557385	anti-adaptor protein IraD, inhibitor of &sigma;<sup>S</sup> proteolysis	idlP // ytiD // ytiC // iraD	b4722 // b4721 // b4720 // b4326
yccM	b0992	1052289	1053362	putative electron transport protein YccM	yccM	b0992
mazE	b2783	2911091	2911339	antitoxin of the MazF-MazE toxin-antitoxin system MazE	relA // mazG // mazF // mazE	b2784 // b2781 // b2782 // b2783
kdsD	b3197	3341266	3342252	D-arabinose 5-phosphate isomerase KdsD	npr // kdsD // yrbG // rapZ // ptsN // hpf // rpoN // lptC // kdsC // lptB // lptA	b3206 // b3197 // b3196 // b3205 // b3204 // b3203 // b3202 // b3199 // b3198 // b3201 // b3200
cycA	b4208	4429864	4431276	D-serine/alanine/glycine/:H<sup>+</sup>symporter	cycA	b4208
msrQ	b1972	2040483	2041118	protein-L-methionine sulfoxide reductase heme-binding subunit MsrQ	msrQ // msrP	b1972 // b1971
ylbE	b4572	548357	549616	DUF1116 domain-containing protein YlbE	ybcF // ylbF // ylbE // fdrA	b0521 // b0520 // b4572 // b0518
cas3	b2761	2884553	2887219	CRISPR-associated endonuclease/helicase Cas3	cas3	b2761
gutQ	b2708	2829813	2830778	D-arabinose 5-phosphate isomerase GutQ	srlA // srlE // srlB // srlD // gutM // gutQ // srlR	b2702 // b2703 // b2704 // b2705 // b2706 // b2708 // b2707
araH	b4460	1982554	1983540	arabinose ABC transporter membrane subunit	araH // araG // araF	b4460 // b1900 // b1901
ydeI	b1536	1624105	1624497	BOF family protein YdeI	ydeI	b1536
yafT	b0217	237335	238120	lipoprotein YafT	yafT	b0217
casA	b2760	2882630	2884138	type I-E CRISPR system Cascade subunit CasA	casA // casB // casC // cas2 // cas1 // casE // casD	b2760 // b2759 // b2758 // b2754 // b2755 // b2756 // b2757
gmhA	b0222	243543	244121	D-sedoheptulose 7-phosphate isomerase	gmhA	b0222
yacH	b0117	129407	131260	DUF3300 domain-containing protein YacH	yacH	b0117
ychH	b1205	1258791	1259069	stress-induced protein	ychH	b1205
yibY	b4796	3798039	3798149	protein YibY		
msrA	b4219	4441538	4442176	methionine sulfoxide reductase A	msrA	b4219
gmhB	b0200	222833	223408	D-<i>glycero</i>-&beta;-D-<i>manno</i>-heptose-1,7-bisphosphate 7-phosphatase	gmhB	b0200
ampG	b0433	452070	453545	muropeptide:H<sup>+</sup> symporter	yajG // ampG	b0434 // b0433
ygiW	b3024	3169284	3169676	BOF family protein YgiW	ygiW	b3024
yecV	b4778	1961837	1961881	protein YecV		
casD	b2757	2880374	2881048	type I-E CRISPR system Cascade subunit CasD	casA // casB // casC // casD // casE // cas1 // cas2	b2760 // b2759 // b2758 // b2757 // b2756 // b2755 // b2754
ais	b2252	2365018	2365620	putative lipopolysaccharide core heptose(II)-phosphate phosphatase	ais	b2252
feoB	b3409	3540407	3542728	Fe<sup>2+</sup> transporter FeoB	feoC // feoA // feoB	b3410 // b3408 // b3409
ychF	b1203	1256721	1257812	redox-responsive ATPase YchF	ychF // pth	b1203 // b1204
yqfI	b4754	3050958	3051041	protein YqfI		
chpS	b4224	4448447	4448698	ChpS antitoxin of the ChpB-ChpS toxin-antitoxin system	chpS // chpB	b4224 // b4225
rfaD	b3619	3793987	3794919	ADP-L-glycero-D-mannoheptose 6-epimerase	waaL // waaC // waaF // rfaD	b3622 // b3621 // b3620 // b3619
yejE	b2179	2275273	2276298	putative oligopeptide ABC transporter membrane subunit YejE	yejF // yejE // yejB // yejA	b2180 // b2179 // b2178 // b2177
yfcF	b2301	2419841	2420485	glutathione <i>S</i>-transferase YfcF	yfcF	b2301
ymgL	b4739	1212540	1212650	protein YmgL		
mppA	b1329	1393227	1394840	murein tripeptide ABC transporter periplasmic binding protein	mppA	b1329
kdsA	b1215	1268165	1269019	3-deoxy-D-<i>manno</i>-octulosonate 8-phosphate synthase	kdsA // ychA // ychQ	b1215 // b1214 // b1213
yjcE	b4065	4279980	4281629	putative transporter YjcE	yjcE	b4065
maa	b0459	479367	479918	maltose <i>O</i>-acetyltransferase	maa	b0459
ymiB	b4672	1346796	1346900	putative protein YmiB		
oppF	b1247	1305764	1306768	murein tripeptide ABC transporter / oligopeptide ABC transporter ATP binding subunit OppF	oppA // oppB // oppC // oppD // oppF	b1243 // b1244 // b1245 // b1246 // b1247
arnT	b2257	2370908	2372560	lipid IVA 4-amino-4-deoxy-L-arabinosyltransferase	arnF // arnE // arnT // arnD // arnA // arnC // arnB	b2258 // b4544 // b2257 // b2256 // b2255 // b2254 // b2253
etk	b0981	1042030	1044210	protein-tyrosine kinase Etk	gfcE // etp // etk	b0983 // b0982 // b0981
ibpA	b3687	3867009	3867422	small heat shock protein IbpA	ibpA // ibpB	b3687 // b3686
yojO	b4604	2303606	2303770	uncharacterized protein YojO		
yoeB	b4539	2089211	2089465	ribosome-dependent mRNA interferase toxin YoeB	yefM // yoeB	b2017 // b4539
arnC	b2254	2367071	2368039	undecaprenyl-phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase	arnF // arnE // arnT // arnD // arnA // arnC // arnB	b2258 // b4544 // b2257 // b2256 // b2255 // b2254 // b2253
pnuC	b0751	783166	783885	nicotinamide riboside transporter	pnuC // nadA	b0751 // b0750
hisP	b2306	2423736	2424509	lysine/arginine/ornithine ABC transporter / histidine ABC transporter, ATP binding subunit	hisP // hisM // hisQ // hisJ // argT	b2306 // b2307 // b2308 // b2309 // b2310
ymjC	b4525	1390680	1390862	putative uncharacterized protein YmjC	ymjD // ycjY // ymjC // mpaA	b4673 // b1327 // b4525 // b1326
yefM	b2017	2089462	2089713	YefM antitoxin of the YoeB-YefM toxin-antitoxin pair and DNA binding transcriptional repressor	yefM // yoeB	b2017 // b4539
pagP	b0622	656557	657117	Lipid A palmitoyltransferase	pagP	b0622
potH	b0856	896134	897087	putrescine ABC transporter membrane subunit PotH	potF // potG // potH // potI	b0854 // b0855 // b0856 // b0857
btuE	b1710	1793558	1794109	thioredoxin/glutathione peroxidase	btuD // btuC // btuE	b1709 // b1711 // b1710
yecD	b1867	1950832	1951398	isochorismatase family protein YecD	yecE // yecD	b1868 // b1867
aaeR	b3243	3389520	3390449	LysR-type transcriptional regulator AaeR	aaeR	b3243
accB	b3255	3405436	3405906	biotin carboxyl carrier protein	accB // accC	b3255 // b3256
kup	b3747	3931316	3933184	K<sup>+</sup>:H<sup>+</sup> symporter Kup	kup	b3747
cutA	b4137	4365018	4365356	copper binding protein CutA	cutA	b4137
yajG	b0434	453589	454167	putative lipoprotein YajG	yajG // ampG	b0434 // b0433
csgA	b1042	1104447	1104902	curlin, major subunit	csgB // csgA // csgC	b1041 // b1042 // b1043
acpH	b0404	424337	424918	acyl carrier protein phosphodiesterase	acpH	b0404
bcr	b2182	2278570	2279760	multidrug efflux pump Bcr	bcr	b2182
hisJ	b2309	2426006	2426788	histidine ABC transporter periplasmic binding protein	hisP // hisM // hisQ // hisJ // argT	b2306 // b2307 // b2308 // b2309 // b2310
yjbJ	b4045	4259237	4259446	putative stress response protein YjbJ	yjbJ	b4045
casC	b2758	2881051	2882142	type I-E CRISPR system Cascade subunit CasC	casA // casB // casC // cas2 // cas1 // casE // casD	b2760 // b2759 // b2758 // b2754 // b2755 // b2756 // b2757
acpP	b1094	1151615	1151851	octanoyl-ACP // lipoyl-ACP // <i>cis</i>-&Delta;<sup>5</sup>-dodecenoyl-ACP // <i>trans</i>-&Delta;<sup>2</sup>-cis-&Delta;<sup>5</sup>-dodecenoyl-ACP // succinyl-ACP // <i>cis</i>-&Delta;<SUP>3</SUP>-decenoyl-ACP // 3-oxo-<i>cis</i>-&Delta;<sup>5</sup>-dodecenoyl-ACP // (3<i>R</i>)-hydroxy <i>cis</i> &Delta;<sup>5</sup>-dodecenoyl-ACP // (3<i>R</i>)-3-hydroxypalmitoyl-ACP // (3<i>R</i>)-3-hydroxybutanoyl-ACP // <i>trans</i> oct-2-enoyl-ACP // <i>trans</i>-but-2-enoyl-ACP // (3<i>R</i>)-3-hydroxyoctanoyl-ACP // <i>trans</i>-hexadec-2-enoyl-ACP // holo-[acyl-carrier protein] // acyl carrier protein	yceD // rpmF // fabH // plsX // fabF // fabD // acpP // fabG	b1088 // b1089 // b1091 // b1090 // b1095 // b1092 // b1094 // b1093
codB	b0336	354922	356181	cytosine transporter	codB // codA	b0336 // b0337
yfcG	b2302	2420621	2421268	disulfide reductase	yfcG	b2302
smg	b3284	3431991	3432464	DUF494 domain-containing protein Smg	smg	b3284
symE	b4347	4579499	4579840	toxic protein SymE	symE	b4347
ccmA	b2201	2297021	2297644	cytochrome <i>c</i> maturation protein A	ccmH // ccmG // ccmF // ccmE // ccmD // ccmC // ccmB // ccmA // napC // napB // napH // napG // napA // napD // napF	b2194 // b2195 // b2196 // b2197 // b2198 // b2199 // b2200 // b2201 // b2202 // b2203 // b2204 // b2205 // b2206 // b2207 // b2208
lptC	b3199	3342836	3343411	lipopolysaccharide transport system protein LptC	npr // rapZ // ptsN // hpf // rpoN // kdsD // yrbG // lptC // kdsC // lptB // lptA	b3206 // b3205 // b3204 // b3203 // b3202 // b3197 // b3196 // b3199 // b3198 // b3201 // b3200
msrP	b1971	2039478	2040482	protein-L-methionine sulfoxide reductase catalytic subunit MsrP	msrQ // msrP	b1972 // b1971
yjiC	b4325	4555490	4556320	uncharacterized protein YjiC	yjiC	b4325
umuC	b1184	1231186	1232454	DNA polymerase V catalytic protein	umuD // umuC	b1183 // b1184
yceJ	b1057	1118480	1119046	putative cytochrome b561 YceJ	yceJ // yceI	b1057 // b1056
xanP	b3654	3828945	3830336	xanthine:H+ symporter XanP	xanP	b3654
ibpB	b3686	3866469	3866897	small heat shock protein IbpB	ibpB // ibpA	b3686 // b3687
ygiC	b3038	3180421	3181581	putative acid&mdash;amine ligase YgiC	ygiC // ygiB // tolC	b3038 // b3037 // b3035
dinI	b1061	1121242	1121487	DNA damage-inducible protein I	dinI	b1061
grxA	b0849	890496	890753	oxidized glutaredoxin 1 // reduced glutaredoxin 1	grxA	b0849
yqeG	b2845	2985847	2987076	putative transporter YqeG	yqeG	b2845
psiF	b0384	403281	403601	PsiF family protein	phoA // psiF	b0383 // b0384
yhfL	b3369	3499448	3499615	DUF4223 domain-containing lipoprotein YhfL	yhfL	b3369
recN	b2616	2751795	2753456	DNA repair protein RecN	recN	b2616
grxC	b3610	3784191	3784442	oxidized glutaredoxin 3 // glutaredoxin 3	yibN // secB // gpsA // grxC	b3611 // b3609 // b3608 // b3610
zraS	b4003	4201926	4203323	ZraS-<i>N</i>-phospho-L-histidine // sensor histidine kinase ZraS	zraR // zraS	b4004 // b4003
ytfK	b4217	4439587	4439793	stringent response modulator YtfK	ytfK	b4217
yqiB	b3033	3176858	3177280	DUF1249 domain-containing protein YqiB	nudF // yqiB // cpdA // yqiA // parE	b3034 // b3033 // b3032 // b3031 // b3030
tisB	b4618	3853553	3853642	membrane-depolarizing toxin TisB	tisB	b4618
trxA	b3781	3965761	3966090	oxidized thioredoxin // thioredoxin 1	trxA	b3781
tyrP	b1907	1989681	1990892	tyrosine:H+ symporter	tyrP	b1907
mazG	b2781	2909894	2910685	nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase	relA // mazG // mazF // mazE	b2784 // b2781 // b2782 // b2783
ygeW	b2870	3006262	3007452	putative carbamoyltransferase YgeW	ygeW	b2870
lexA	b4043	4257115	4257723	DNA-binding transcriptional repressor LexA	lexA // dinF	b4043 // b4044
grxB	b1064	1123407	1124054	oxidized glutaredoxin 2 // reduced glutaredoxin 2	grxB	b1064
eutH	b2452	2566881	2568107	putative ethanolamine permease EutH	eutH // eutA	b2452 // b2451
sspB	b3228	3376279	3376776	ClpXP protease specificity-enhancing factor	sspB // sspA	b3228 // b3229
ypjC	b2650	2784529	2785011	DUF5507 domain-containing protein YpjC	ypjC	b2650
yebG	b1848	1930457	1930747	DNA damage-inducible protein YebG	yebG	b1848
trxC	b2582	2718735	2719154	oxidized thioredoxin 2 // reduced thioredoxin 2	trxC	b2582
secD	b0408	427647	429494	Sec translocon accessory complex subunit SecD	secF // secD // yajC // tgt	b0409 // b0408 // b0407 // b0406
phnC	b4106	4324377	4325165	phosphonate/phosphate ABC transporter ATP binding subunit	phnK // phnJ // phnI // phnH // phnG // phnF // phnE // phnD // phnC // phnP // phnO // phnN // phnM // phnL	b4097 // b4098 // b4099 // b4100 // b4101 // b4102 // b4583 // b4105 // b4106 // b4092 // b4093 // b4094 // b4095 // b4096
yfcH	b2304	2421708	2422601	putative NAD-dependent epimerase YfcH	yfcH // folX	b2304 // b2303
uvrD	b3813	3997983	4000145	DNA helicase II	uvrD	b3813
nrdH	b2673	2800723	2800968	glutaredoxin-like protein NrdH	nrdH // nrdI // nrdF // nrdE	b2673 // b2674 // b2676 // b2675
yeeO	b1985	2058203	2059846	FMN/FAD exporter	yeeO	b1985
rspB	b1580	1652896	1653915	putative zinc-binding dehydrogenase RspB	rspA // rspB	b1581 // b1580
yodC	b1957	2028188	2028370	protein YodC	yodC	b1957
ruvA	b1861	1945365	1945976	Holliday junction branch migration complex subunit RuvA	ruvB // ruvA	b1860 // b1861
grxD	b1654	1733754	1734101	glutaredoxin 4	grxD	b1654
secY	b3300	3442766	3444097	Sec translocon subunit SecY	rpmJ // secY // rplO // rpmD // rpsE // rplR // rplF // rpsH // rpsN // rplE // rplX // rplN	b3299 // b3300 // b3301 // b3302 // b3303 // b3304 // b3305 // b3306 // b3307 // b3308 // b3309 // b3310
gpp	b3779	3962745	3964229	guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate phosphatase	gpp	b3779
yniB	b1726	1808697	1809233	uncharacterized protein YniB	yniB	b1726
umuD	b1183	1230767	1231186	DNA polymerase V protein UmuD	umuD // umuC	b1183 // b1184
kdpF	b4513	728732	728821	K<sup>+</sup> transporting P-type ATPase subunit KdpF	kdpF // kdpC // kdpB // kdpA	b4513 // b0696 // b0697 // b0698
ydhK	b1645	1722121	1724133	putative transporter YdhK	ydhK // ydhJ // ydhI	b1645 // b1644 // b1643
ssuE	b0937	996937	997512	NADPH-dependent FMN reductase	ssuB // ssuC // ssuD // ssuA // ssuE	b0933 // b0934 // b0935 // b0936 // b0937
yncG	b1454	1526247	1526864	putative glutathione <i>S</i>-transferase YncG	yncG	b1454
ydjM	b1728	1810211	1810801	inner membrane protein YdjM	ydjM	b1728
ybiR	b0818	853647	854765	putative transporter YbiR	ybiR // mntR	b0818 // b0817
panF	b3258	3407607	3409058	pantothenate:Na+ symporter	yhdT // panF // prmA	b3257 // b3258 // b3259
phoH	b1020	1084992	1086056	ATP-binding protein PhoH	phoH	b1020
ychS	b1228	1286709	1286984	putative uncharacterized protein YchS	ychS	b1228
ssb	b4059	4274125	4274661	ssDNA-binding protein	ssb	b4059
afuC	b0262	277756	278802	CP4-6 prophage; ABC transporter ATP-binding protein AfuC	insA2 // insB2 // insAB2 // afuB // afuC	b0265 // b0264 // b0263 // b0262
safA	b1500	1583762	1583959	two-component system connector SafA	safA // ydeO	b1500 // b1499
spoT	b3650	3822400	3824508	bifunctional (p)ppGpp synthase/hydrolase SpoT	rpoZ // spoT // trmH // recG	b3649 // b3650 // b3651 // b3652
yccU	b0965	1027946	1028359	putative HspQ acetyl donor	yccU	b0965
dinB	b0231	250898	251953	DNA polymerase IV	yafP // yafO // yafN // dinB	b0234 // b0233 // b0232 // b0231
ybbP	b0496	520416	522830	putative ABC transporter membrane subunit YbbP	ybbP // ybbA	b0496 // b0495
mtr	b3161	3304573	3305817	tryptophan:H<sup>+</sup> symporter Mtr	mtr	b3161
rspA	b1581	1653927	1655141	mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein RspA	rspA // rspB	b1581 // b1580
yaiY	b0379	399025	399333	DUF2755 domain-containing inner membrane protein YaiY	yaiY	b0379
polB	b0060	63429	65780	DNA polymerase II	polB	b0060
lpoB	b1105	1162638	1163279	outer membrane lipoprotein - activator of MrcB activity	ycfP // nagZ // thiK // lpoB // ycfL // hinT	b1108 // b1107 // b1106 // b1105 // b1104 // b1103
iraM	b1160	1211680	1212003	anti-adaptor protein IraM, inhibitor of &sigma;<sup>S</sup> proteolysis	iraM	b1160
yaaY	b0024	21181	21399	DUF2575 domain-containing protein YaaY		
dinG	b0799	833070	835220	ATP-dependent DNA helicase DinG	dinG // ybiB	b0799 // b0800
malG	b4032	4242626	4243516	maltose ABC transporter membrane subunit MalG	malG // malF // malE	b4032 // b4033 // b4034
slp	b3506	3653961	3654527	starvation lipoprotein	dctR // slp	b3507 // b3506
yriB	b4792	3640643	3640696	protein YriB		
ruvB	b1860	1944346	1945356	Holliday junction branch migration complex subunit RuvB	ruvB // ruvA	b1860 // b1861
amiD	b0867	904913	905743	<i>N</i>-acetylmuramoyl-L-alanine amidase D	amiD // ybjQ	b0867 // b0866
entH	b0597	629300	629713	proofreading thioesterase in enterobactin biosynthesis	entC // entE // entB // entA // entH	b0593 // b0594 // b0595 // b0596 // b0597
mgtT	b4775	1622741	1622845	protein MgtT		
uvrA	b4058	4271049	4273871	excision nuclease subunit A	uvrA	b4058
hycC	b2723	2847415	2849241	formate hydrogenlyase subunit HycC	hycI // hycH // hycG // hycF // hycE // hycD // hycC // hycB // hycA	b2717 // b2718 // b2719 // b2720 // b2721 // b2722 // b2723 // b2724 // b2725
fhuE	b1102	1159362	1161551	ferric coprogen/ferric rhodotorulic acid outer membrane transporter	fhuE	b1102
ynfS	b4750	1642122	1642211	Qin prophage; protein YnfS		
recA	b2699	2822708	2823769	DNA recombination/repair protein RecA	recX // recA	b2698 // b2699
secA	b0098	108279	110984	protein translocation ATPase	mutT // secA // secM	b0099 // b0098 // b0097
ybdG	b0577	603416	604663	miniconductance mechanosensitive channel YbdG	ybdG	b0577
fhuF	b4367	4604875	4605663	hydroxamate siderophore iron reductase	fhuF	b4367
yliM	b4736	850332	850397	protein YliM	yliM // ompX	b4736 // b0814
recX	b2698	2822139	2822639	RecA inhibitor RecX	recX // recA	b2698 // b2699
secB	b3609	3783661	3784128	protein export chaperone SecB	yibN // secB // gpsA // grxC	b3611 // b3609 // b3608 // b3610
ftsX	b3462	3601028	3602086	cell division protein FtsX	ftsX // ftsE // ftsY	b3462 // b3463 // b3464
bfr	b3336	3466249	3466725	bacterioferritin	bfd // bfr	b3337 // b3336
azuC	b4663	1987873	1987959	uncharacterized protein AzuC	azuC	b4663
uvrB	b0779	813526	815547	excision nuclease subunit B	uvrB	b0779
higB	b3083	3234141	3234455	ribosome-dependent mRNA interferase toxin HigB	higB // higA	b3083 // b3082
flhA	b1879	1962972	1965050	flagellar biosynthesis protein FlhA	flhE // flhA // flhB	b1878 // b1879 // b1880
fiu	b0805	839249	841531	iron catecholate outer membrane transporter Fiu	fiu	b0805
ymgI	b4593	1222990	1223163	uncharacterized protein YmgI		
rpnB	b2305	2422649	2423539	recombination-promoting nuclease RpnB	rpnB	b2305
epmB	b4146	4374629	4375657	lysine 2,3-aminomutase	epmB	b4146
entF	b0586	614157	618038	seryl-[EntF peptidyl-carrier protein] // <i>holo</i> [EntF peptidyl-carrier protein] // apo-serine activating enzyme	ybdZ // fes // entF // fepE	b4511 // b0585 // b0586 // b0587
ybdZ	b4511	613942	614160	enterobactin biosynthesis protein YbdZ	ybdZ // fes // entF // fepE	b4511 // b0585 // b0586 // b0587
ycjF	b1322	1385511	1386572	DUF697 domain-containing inner membrane protein YcjF	ycjF // ycjX // tyrR	b1322 // b1321 // b1323
rpnC	b0132	146968	147870	recombination-promoting nuclease RpnC	rpnC	b0132
epmA	b4155	4382643	4383620	EF-P-lysine lysyltransferase	epmA	b4155
pitB	b2987	3134872	3136371	metal phosphate:H<sup>+</sup> symporter PitB	pitB	b2987
fepB	b0592	623554	624510	ferric enterobactin ABC transporter periplasmic binding protein	fepB	b0592
yadL	b0137	151626	152231	putative fimbrial protein YadL	yadK // yadL // yadM // yadC	b0136 // b0137 // b0138 // b0135
tabA	b4252	4474862	4475314	DUF386 domain-containing toxin-antitoxin biofilm protein TabA	tabA	b4252
sgrS	b4577	77367	77593	small regulatory RNA SgrS	sgrT // setA // sgrS	b4662 // b0070 // b4577
cyoA	b0432	450663	451610	cytochrome <i>bo</i><sub>3</sub> ubiquinol oxidase subunit 2	cyoE // cyoD // cyoC // cyoB // cyoA	b0428 // b0429 // b0430 // b0431 // b0432
bfd	b3337	3466797	3466991	bacterioferritin-associated ferredoxin	bfd // bfr	b3337 // b3336
rssA	b1234	1289245	1290150	putative patatin-like phospholipase RssA	rssA // rssB	b1234 // b1235
blr	b4409	1704551	1704676	&beta;-lactam resistance protein	blr	b4409
rdlB	b4422	1269858	1269923	putative antisense regulatory RNA RdlB	rdlB	b4422
gntU	b4476	3575721	3577061	low-affinity gluconate transporter	gntU // gntK // gntR	b4476 // b3437 // b3438
fecE	b4287	4510690	4511457	ferric citrate ABC transporter ATP binding subunit	fecE // fecD // fecC // fecB // fecA	b4287 // b4288 // b4289 // b4290 // b4291
yceI	b1056	1117901	1118476	protein YceI	yceJ // yceI	b1057 // b1056
pdeF	b2503	2626695	2628938	cyclic di-GMP phosphodiesterase PdeF	pdeF	b2503
rdlC	b4424	1270393	1270460	putative antisense regulatory RNA RdlC	rdlC	b4424
atpI	b3739	3922060	3922440	ATP synthase accessory factor AtpI	atpI // atpC // atpD // atpG // atpA // atpH // atpF // atpE // atpB	b3739 // b3731 // b3732 // b3733 // b3734 // b3735 // b3736 // b3737 // b3738
ftnA	b1905	1988716	1989213	ferritin iron storage protein	ftnA	b1905
ybfC	b0704	735650	736219	uncharacterized protein YbfC	ybfC // ybfO	b0704 // b0703
ybaM	b0466	490110	490271	DUF2496 domain-containing protein YbaM	priC // ybaM	b0467 // b0466
sokC	b4413	16952	17006	small regulatory RNA antitoxin SokC	sokC	b4413
adiC	b4115	4335694	4337031	arginine:agmatine antiporter	adiC	b4115
fecA	b4291	4514353	4516677	ferric citrate outer membrane transporter	fecE // fecD // fecC // fecB // fecA	b4287 // b4288 // b4289 // b4290 // b4291
yjgL	b4253	4475437	4477251	protein YjgL	yjgL	b4253
uspD	b3923	4113293	4113721	universal stress protein D	uspD // yiiS	b3923 // b3922
sdhX	b4764	765050	765150	small regulatory RNA SdhX	sdhX // sdhC // sucA // sucB // sucC // sucD // sdhB // sdhA // sdhD	b4764 // b0721 // b0726 // b0727 // b0728 // b0729 // b0724 // b0723 // b0722
xylH	b3568	3733720	3734901	xylose ABC transporter membrane subunit	xylF // xylG // xylH // xylR	b3566 // b3567 // b3568 // b3569
fhuC	b0151	169778	170575	iron(III) hydroxamate ABC transporter ATP binding subunit	fhuA // fhuC // fhuD // fhuB	b0150 // b0151 // b0152 // b0153
yffB	b2471	2591247	2591603	putative reductase YffB	yffB // ypfN // dapE	b2471 // b4547 // b2472
pdeR	b1285	1344757	1346742	cyclic di-GMP phosphodiesterase PdeR	pdeR	b1285
sokB	b4429	1492119	1492174	putative small regulatory RNA antitoxin SokB	sokB	b4429
brnQ	b0401	419591	420910	branched chain amino acid transporter BrnQ	proY // brnQ	b0402 // b0401
ftnB	b1902	1986925	1987428	putative ferritin-like protein	ftnB	b1902
yhdU	b3263	3412621	3412800	DUF2556 domain-containing protein YhdU	yhdU	b3263
loiP	b2936	3081913	3082671	metalloprotease LoiP	loiP	b2936
rdlA	b4420	1269323	1269389	putative antisense regulatory RNA RdlA	rdlA	b4420
nuoL	b2278	2393205	2395046	NADH:quinone oxidoreductase subunit L	nuoL // nuoK // nuoJ // nuoI // nuoH // nuoG // nuoF // nuoE // nuoC // nuoB // nuoA // nuoN // nuoM	b2278 // b2279 // b2280 // b2281 // b2282 // b2283 // b2284 // b2285 // b2286 // b2287 // b2288 // b2276 // b2277
fetA	b0490	515919	516596	putative iron ABC exporter ATP-binding subunit FetA	fetB // fetA	b0491 // b0490
glcG	b2977	3123827	3124231	putative heme-binding protein GlcG	glcG // glcF // glcE // glcD // glcA // glcB	b2977 // b4467 // b4468 // b2979 // b2975 // b2976
acrZ	b0762	794773	794922	multidrug efflux pump accessory protein AcrZ	acrZ	b0762
rdcB	b4110	4329360	4330238	regulator of diguanylate cyclase RdcB	rdcB // rdcA	b4110 // b4109
psuT	b2164	2256085	2257335	putative pseudouridine transporter	psuT	b2164
fepC	b0588	619384	620199	ferric enterobactin ABC transporter ATP binding subunit	fepC // fepG // fepD	b0588 // b0589 // b0590
yqeK	b2849	2989935	2990360	protein YqeK	yqeK	b2849
ybaB	b0471	494076	494405	putative nucleoid-associated protein YbaB	recR // ybaB	b0472 // b0471
yihI	b3866	4051347	4051856	Der GTPase-activating protein YihI	yihI	b3866
yijE	b3943	4136108	4137013	cystine exporter	yijE	b3943
fecB	b4290	4513406	4514308	ferric citrate ABC transporter periplasmic binding protein	fecE // fecD // fecC // fecB // fecA	b4287 // b4288 // b4289 // b4290 // b4291
yphC	b2545	2674700	2675761	putative zinc-binding dehydrogenase YphC	yphC // yphB	b2545 // b2544
ykgM	b0296	312514	312777	50S ribosomal subunit protein L31B	ykgM // ykgO	b0296 // b4506
ymdB	b1045	1105820	1106353	2'-<i>O</i>-acetyl-ADP-ribose deacetylase, regulator of RNase III activity	clsC // ymdA // ymdB	b1046 // b1044 // b1045
torC	b0996	1058084	1059256	cytochrome <i>c</i> menaquinol dehydrogenase TorC	torC // torA // torD	b0996 // b0997 // b0998
fhuD	b0152	170575	171465	iron(III) hydroxamate ABC transporter periplasmic binding protein	fhuA // fhuC // fhuD // fhuB	b0150 // b0151 // b0152 // b0153
yfbO	b2274	2388635	2389057	uncharacterized protein YfbO	yfbO	b2274
micF	b4439	2313084	2313176	small regulatory RNA MicF	micF	b4439
yafN	b0232	252005	252298	antitoxin YafN	yafP // yafO // yafN // dinB	b0234 // b0233 // b0232 // b0231
nuoM	b2277	2391512	2393041	NADH:quinone oxidoreductase subunit M	nuoN // nuoM // nuoL // nuoK // nuoJ // nuoI // nuoH // nuoG // nuoF // nuoE // nuoC // nuoB // nuoA	b2276 // b2277 // b2278 // b2279 // b2280 // b2281 // b2282 // b2283 // b2284 // b2285 // b2286 // b2287 // b2288
nfeF	b3070	3215727	3216491	NADPH-dependent ferric-chelate reductase	nfeF	b3070
yecT	b1877	1961972	1962460	protein YecT	yecT	b1877
uspC	b1895	1979753	1980181	universal stress protein C	uspC	b1895
topAI	b4566	4533796	4534053	KpLE2 phage-like element; toxin of the TopAI-YjhQ toxin-antitoxin system, TopA inhibitor	topAI // yjhQ	b4566 // b4307
nepI	b3662	3840549	3841739	purine ribonucleoside exporter	nepI	b3662
fes	b0585	612737	613939	ferric enterobactin esterase	ybdZ // fes // entF // fepE	b4511 // b0585 // b0586 // b0587
ydiH	b1685	1764934	1765122	uncharacterized protein YdiH	ydiJ // menI // ydiH	b1687 // b1686 // b1685
cspC	b1823	1907226	1907435	CspA family stress protein CspC	yobF // cspC	b1824 // b1823
yjfN	b4188	4416017	4416292	protease activator YjfN	yjfN	b4188
mdlB	b0449	470636	472417	ABC transporter family protein MdlB	mdlB // mdlA	b0449 // b0448
bsmA	b4189	4416441	4416770	DUF1471 domain-containing putative lipoprotein BsmA	bsmA	b4189
insQ	b1432	1503717	1504865	putative insertion element transposase InsQ	insQ	b1432
hicB	b1438	1509508	1509924	antitoxin of the HicA-HicB toxin-antitoxin system /  DNA-binding transcriptional repressor HicB	hicB // hicA	b1438 // b4532
pdeK	b3529	3683630	3685618	c-di-GMP phosphodiesterase PdeK	pdeK	b3529
yhbE	b3184	3331770	3332735	putative transporter YhbE	rpmA // rplU // yhbE // obgE	b3185 // b3186 // b3184 // b3183
ygiN	b3029	3173142	3173456	putative quinol monooxygenase YgiN	ygiN	b3029
ycgJ	b1177	1226600	1226968	PF05666 family protein YcgJ	ycgJ	b1177
dsbA	b3860	4043418	4044044	thiol:disulfide oxidoreductase - DsbA<sub>reduced</sub> // thiol:disulfide oxidoreductase - DsbA<sub>oxidized</sub> // thiol:disulfide oxidoreductase DsbA	dsbA // srkA	b3860 // b3859
pyrI	b4244	4470986	4471447	aspartate carbamoyltransferase, PyrI subunit	pyrL // pyrI // pyrB	b4246 // b4244 // b4245
dsbB	b1185	1232500	1233030	protein thiol:quinone oxidoreductase DsbB<sub>reduced</sub> // protein thiol:quinone oxidoreductase DsbB<sub>oxidized</sub> // protein thiol:quinone oxidoreductase DsbB	dsbB	b1185
yhbO	b3153	3298974	3299492	protein/nucleic acid deglycase 2	yhbO	b3153
ybjS	b0868	905740	906753	putative epimerase YbjS	ybjS	b0868
ybjN	b0853	892957	893433	protein YbjN	nfsA // ybjC // ybjN // rimK	b0851 // b0850 // b0853 // b0852
cyaA	b3806	3991153	3993699	adenylate cyclase	cyaA	b3806
yjiN	b4336	4565966	4567246	DUF445 domain-containing protein YjiN	mdtM // yjiN	b4337 // b4336
dctR	b3507	3654683	3655213	putative DNA-binding transcriptional regulator DctR	dctR // slp	b3507 // b3506
yahF	b0320	336778	338325	putative acyl-CoA synthetase YahF	yahG // yahF // yahD // yahE	b0321 // b0320 // b0318 // b0319
uspE	b1333	1397672	1398622	universal stress protein E	uspE	b1333
rdcA	b4109	4327135	4329363	regulator of diguanylate cyclase RdcA	rdcB // rdcA	b4110 // b4109
wzzE	b3785	3969031	3970077	enterobacterial common antigen polysaccharide co-polymerase	rffM // wzyE // wecF // wzxE // wecE // rffC // rffH // rffG // wecC // wecB // wzzE // rfe	b3794 // b3793 // b4481 // b3792 // b3791 // b3790 // b3789 // b3788 // b3787 // b3786 // b3785 // b3784
yodD	b1953	2024986	2025213	stress-induced protein	yodD	b1953
ydaE	b4526	1417838	1418008	Rac prophage; zinc-binding protein	kilR // ydaE	b1352 // b4526
mreB	b3251	3400044	3401087	dynamic cytoskeletal protein MreB	mreD // mreC // mreB	b3249 // b3250 // b3251
sgrT	b4662	77388	77519	PtsG glucose transporter inhibitor	sgrT // setA // sgrS	b4662 // b0070 // b4577
lpoA	b3147	3293400	3295436	outer membrane lipoprotein - activator of MrcA activity	lpoA	b3147
adiA	b4117	4338254	4340521	arginine decarboxylase, degradative	adiA	b4117
yhgP	b4789	3573679	3573708	protein YhgP		
igaA	b3398	3526469	3528604	inner membrane protein IgaA	igaA	b3398
yacG	b0101	111649	111846	DNA gyrase inhibitor YacG	coaE // zapD // yacG	b0103 // b0102 // b0101
mscL	b3291	3438024	3438434	large conductance mechanosensitive channel	mscL	b3291
asr	b1597	1671376	1671684	acid shock protein	asr	b1597
ymiD	b4772	1344647	1344775	protein YmiD		
yqcG	b4682	2905557	2905697	cell envelope stress response protein YqcG		
ptsN	b3204	3346578	3347069	PtsN-phosphorylated // phosphotransferase system enzyme IIA(Ntr)	kdsD // yrbG // lptC // kdsC // lptB // lptA // rpoN // hpf // ptsN // rapZ // npr	b3197 // b3196 // b3199 // b3198 // b3201 // b3200 // b3202 // b3203 // b3204 // b3205 // b3206
ygbN	b2740	2865101	2866465	putative transporter YgbN	ygbN	b2740
inaA	b2237	2348822	2349472	putative lipopolysaccharide kinase InaA	inaA	b2237
yneP	b4747	1579545	1579667	protein YneP		
zinT	b1973	2041375	2042025	metal-binding protein ZinT	zinT	b1973
eco	b2209	2303905	2304393	serine protease inhibitor ecotin	eco	b2209
cysZ	b2413	2531463	2532224	sulfate:H+ symporter	cysZ	b2413
yceO	b1058	1119307	1119447	DUF2770 domain-containing protein YceO	solA // yceO	b1059 // b1058
ylcJ	b4733	568695	568844	DLP12 prophage; protein YlcJ		
dosP	b1489	1563334	1565733	oxygen-sensing c-di-GMP phosphodiesterase DosP	dosP // dosC	b1489 // b1490
ybhB	b0773	807433	807909	putative kinase inhibitor	ybhB	b0773
trkG	b1363	1423782	1425239	Rac prophage; K<sup>+</sup> transporter TrkG	trkG	b1363
gadA	b3517	3666180	3667580	glutamate decarboxylase A	gadA // gadW // gadX	b3517 // b3515 // b3516
yobI	b4677	1946115	1946180	uncharacterized protein YobI		
uspA	b3495	3640111	3640545	universal stress global stress response regulator	uspA	b3495
cpoB	b0742	779598	780389	cell division coordinator CpoB	cpoB // pal // tolB	b0742 // b0741 // b0740
yfeO	b2389	2509630	2510886	putative transport protein YfeO	yfeO	b2389
yhcN	b3238	3385538	3385801	DUF1471 domain-containing stress-induced protein YhcN	yhcN	b3238
ynfP	b4534	1652728	1652838	protein YnfP	ynfP	b4534
bhsA	b1112	1169073	1169330	DUF1471 domain-containing multiple stress resistance outer membrane protein BhsA	bhsA	b1112
yifB	b3765	3948449	3949969	putative magnesium chelatase YifB	yifB	b3765
sdhB	b0724	757689	758405	succinate:quinone oxidoreductase, iron-sulfur cluster binding protein	sdhX // sdhC // sdhD // sdhA // sdhB // sucA // sucB // sucC // sucD	b4764 // b0721 // b0722 // b0723 // b0724 // b0726 // b0727 // b0728 // b0729
yqgB	b2939	3085920	3086051	acid stress response protein YqgB	yqgB	b2939
yccJ	b1003	1066864	1067091	PF13993 family protein YccJ	wrbA // yccJ	b1004 // b1003
iraP	b0382	401386	401646	anti-adaptor protein for &sigma;<sup>S</sup> stabilization	iraP	b0382
cpdA	b3032	3176006	3176833	cAMP phosphodiesterase	nudF // yqiB // cpdA // yqiA // parE	b3034 // b3033 // b3032 // b3031 // b3030
flhB	b1880	1965043	1966191	flagellar biosynthesis protein FlhB	flhE // flhA // flhB	b1878 // b1879 // b1880
yobF	b1824	1907448	1907591	DUF2527 domain-containing protein YobF	yobF // cspC	b1824 // b1823
yiaT	b3584	3751128	3751868	outer membrane protein YiaT	yiaT	b3584
rapA	b0059	60358	63264	RNA polymerase-binding ATPase and RNAP recycling factor	rluA // rapA	b0058 // b0059
aidB	b4187	4414275	4415900	putative acyl-CoA dehydrogenase AidB	aidB	b4187
potC	b1124	1182826	1183620	spermidine preferential ABC transporter membrane subunit PotC	potD // potC // potB // potA	b1123 // b1124 // b1125 // b1126
gadB	b1493	1570645	1572045	glutamate decarboxylase B	gadB // gadC	b1493 // b1492
yeiP	b2171	2265450	2266022	elongation factor P-like protein YeiP	yeiP	b2171
nrdR	b0413	433002	433451	NrdR transcriptional repressor	ribD // nrdR // pgpA // thiL // nusB // ribE	b0414 // b0413 // b0418 // b0417 // b0416 // b0415
rsxG	b1631	1710204	1710824	SoxR [2Fe-2S] reducing system protein RsxG	nth // rsxE // rsxG // rsxD // rsxC // rsxB // rsxA // ydgK	b1633 // b1632 // b1631 // b1630 // b1629 // b1628 // b1627 // b1626
ariR	b1166	1216369	1216635	putative two-component system connector protein AriR	ymgC // ariR // ymgA // ycgZ	b1167 // b1166 // b1165 // b1164
ybbC	b0498	527581	527949	PF15631 family protein YbbC	ybbD // ylbH // ybbC // rhsD	b0501 // b0499 // b0498 // b0497
rcnR	b2105	2185524	2185796	DNA-binding transcriptional repressor RcnR	rcnR	b2105
ompT	b0565	584680	585633	DLP12 prophage; protease 7	ompT // envY	b0565 // b0566
yagU	b0287	302991	303605	inner membrane protein that contributes to acid resistance	yagU	b0287
mbiA	b0012	10830	11315	uncharacterized protein MbiA	mbiA	b0012
ddpC	b1485	1559014	1559910	putative D,D-dipeptide ABC transporter membrane subunit DdpC	ddpF // ddpD // ddpC // ddpB // ddpA // ddpX	b1483 // b1484 // b1485 // b1486 // b1487 // b1488
yhiM	b3491	3634841	3635893	inner membrane protein YhiM	yhiM	b3491
yjfZ	b4204	4426628	4427422	protein YjfZ	yjfZ	b4204
msbA	b0914	966621	968369	ATP-binding lipopolysaccharide transport protein	ycaQ // lpxK // msbA // ycaI	b0916 // b0915 // b0914 // b0913
cadA	b4131	4356470	4358617	lysine decarboxylase 1	cadA // cadB	b4131 // b4132
yaiA	b0389	406979	407170	protein YaiA	aroL // yaiA // aroM	b0388 // b0389 // b0390
opgC	b1047	1107784	1108941	osmoregulated periplasmic glucans biosynthesis protein C	opgC	b1047
alx	b3088	3238580	3239545	putative membrane-bound redox modulator Alx	alx	b3088
yhcD	b3216	3362807	3365188	putative fimbrial usher protein YhcD	yhcE // yhcD // yhcA	b4569 // b3216 // b3215
lpp	b1677	1757421	1757657	murein lipoprotein	lpp	b1677
grcA	b2579	2716066	2716449	stress-induced alternate pyruvate formate-lyase subunit	grcA	b2579
yghF	b2970	3112054	3113049	putative type II secretion system C-type protein YghF	yghF	b2970
rpoS	b2741	2866559	2867551	RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor	nlpD // rpoS	b2742 // b2741
gsiD	b0832	871890	872801	glutathione ABC transporter membrane subunit GsiD	gsiD // gsiC // gsiB // gsiA // iaaA	b0832 // b0831 // b0830 // b0829 // b0828
mgrB	b1826	1908623	1908766	PhoQ kinase inhibitor	mgrB	b1826
ygdQ	b2832	2970420	2971133	UPF0053 inner membrane protein YgdQ	ygdQ	b2832
era	b2566	2702481	2703386	30S ribosomal subunit maturation GTPase Era	recO // era // rnc // acpS // pdxJ	b2565 // b2566 // b2567 // b2563 // b2564
frmR	b0357	379606	379881	DNA-binding transcriptional repressor FrmR	frmR // frmA // frmB	b0357 // b0356 // b0355
htpX	b1829	1911695	1912576	protease HtpX	htpX	b1829
hdeD	b3511	3656995	3657567	acid-resistance membrane protein	hdeD	b3511
yfgJ	b2510	2635599	2635814	zinc ribbon domain-containing protein YfgJ	yfgJ	b2510
diaA	b3149	3295809	3296399	DnaA initiator-associating factor for replication initiation	diaA	b3149
sgrR	b0069	75644	77299	DNA-binding transcriptional dual regulator SgrR	sgrR // thiB // thiP // thiQ // sroA	b0069 // b0068 // b0067 // b0066 // b4762
fetB	b0491	516583	517362	putative iron ABC exporter membrane subunit FetB	fetB // fetA	b0491 // b0490
hdeB	b3509	3655966	3656292	periplasmic acid stress chaperone HdeB	yhiD // hdeB // hdeA	b3508 // b3509 // b3510
elaA	b2267	2381082	2381543	putative <i>N</i>-acetyltransferase ElaA	elaA	b2267
mltG	b1097	1154112	1155134	endolytic murein transglycosylase	ycfH // holB // tmk // mltG // pabC	b1100 // b1099 // b1098 // b1097 // b1096
sxy	b0959	1021138	1021767	transcriptional coactivator for CRP	sxy	b0959
fruA	b2167	2259719	2261410	fructose-specific PTS multiphosphoryl transfer protein FruA	fruA // fruK // fruB	b2167 // b2168 // b2169
yjaA	b4011	4213234	4213617	stress response protein	yjaA	b4011
yebV	b1836	1921780	1922016	DUF1480 domain-containing protein YebV	yebV	b1836
mukB	b0924	976326	980786	chromosome partitioning protein MukB	mukB // mukE // mukF // cmoM	b0924 // b0923 // b0922 // b0921
gltF	b3214	3361176	3361940	periplasmic protein GltF	gltB // gltD // gltF	b3212 // b3213 // b3214
entB	b0595	627694	628551	<i>holo</i> EntB // enterobactin synthase component B	entC // entE // entB // entA // entH	b0593 // b0594 // b0595 // b0596 // b0597
osmC	b1482	1556625	1557056	osmotically inducible peroxiredoxin OsmC	osmC	b1482
ydhX	b1671	1750345	1751013	putative 4Fe-4S ferredoxin-like protein YdhX	ydhY // ydhV // ydhW // ydhX // ydhU // ydhT	b1674 // b1673 // b1672 // b1671 // b1670 // b1669
ftsE	b3463	3602079	3602747	cell division protein FtsE	ftsX // ftsE // ftsY	b3462 // b3463 // b3464
yfeD	b2399	2518813	2519205	putative DNA-binding transcriptional regulator YfeD	yfeD // yfeC	b2399 // b2398
yhdX	b3269	3420134	3421315	putative ABC transporter membrane subunit YhdX	yhdZ // yhdY // yhdX // yhdW	b3271 // b3270 // b3269 // b3268
yggT	b2952	3095820	3096386	uncharacterized protein YggT	yggU // yggT // yggS // hemW // rdgB	b2953 // b2952 // b2951 // b2955 // b2954
ynbD	b1411	1480909	1482201	phosphatase domain-containing protein YnbD	ynbD // ynbC // ynbB // ynbA	b1411 // b1410 // b1409 // b1408
zapA	b2910	3055612	3055941	cell division protein ZapA	zapA	b2910
yphH	b2550	2682863	2684056	putative DNA-binding transcriptional regulator, NAGC-like	yphH	b2550
cydA	b0733	771458	773026	cytochrome <i>bd</i>-I ubiquinol oxidase subunit I	cydB // cydA	b0734 // b0733
otsA	b1896	1980188	1981612	trehalose-6-phosphate synthase	otsA // otsB	b1896 // b1897
ymgA	b1165	1216068	1216340	putative two-component system connector protein YmgA	ymgC // ariR // ymgA // ycgZ	b1167 // b1166 // b1165 // b1164
rng	b3247	3396326	3397795	RNase G		
higA	b3082	3233728	3234144	antitoxin/DNA-binding transcriptional repressor HigA	higB // higA	b3083 // b3082
ybaL	b0478	501562	503238	putative transporter YbaL	ybaL	b0478
osmY	b4376	4611396	4612001	periplasmic chaperone OsmY	osmY	b4376
ybjM	b0848	890089	890466	putative inner membrane protein	ybjM	b0848
groS	b4142	4370688	4370981	cochaperonin GroES	groS // groL	b4142 // b4143
yddM	b1477	1552398	1552682	DNA-binding transcriptional regulator YddM	yddM	b1477
atpF	b3736	3920418	3920888	ATP synthase F<sub>o</sub> complex subunit b	atpI // atpC // atpD // atpG // atpA // atpH // atpF // atpE // atpB	b3739 // b3731 // b3732 // b3733 // b3734 // b3735 // b3736 // b3737 // b3738
ecnB	b4411	4376553	4376699	bacteriolytic entericidin B lipoprotein	ecnB // ecnA	b4411 // b4410
ykgF	b0307	322338	323765	putative amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain	ykgG // ykgF // ykgE	b0308 // b0307 // b0306
dnaC	b4361	4600238	4600975	DNA replication protein DnaC	yjjA // yjjB // dnaC // dnaT	b4360 // b4363 // b4361 // b4362
sutR	b1434	1506172	1506708	DNA-binding transcriptional dual regulator SutR	sutR	b1434
yhjE	b3523	3674786	3676108	putative transporter YhjE	yhjE	b3523
treA	b1197	1245679	1247376	periplasmic trehalase	treA	b1197
yncL	b4598	1517099	1517194	uncharacterized protein YncL	yncL	b4598
zapE	b3232	3378870	3379997	cell division protein ZapE	zapE	b3232
ssrS	b2911	3055983	3056165	6S RNA	fau // ssrS	b2912 // b2911
galP	b2943	3088284	3089678	galactose:H<sup>+</sup> symporter	galP	b2943
proQ	b1831	1914836	1915534	RNA chaperone ProQ	proQ // prc	b1831 // b1830
yqhJ	b4786	3111266	3111325	protein YqhJ		
zapD	b0102	111856	112599	cell division factor ZapD	coaE // zapD // yacG	b0103 // b0102 // b0101
maoP	b3764	3948086	3948424	macrodomain Ori protein	maoP	b3764
nuoH	b2282	2396465	2397442	NADH:quinone oxidoreductase subunit H	nuoL // nuoK // nuoJ // nuoI // nuoH // nuoG // nuoF // nuoE // nuoC // nuoB // nuoA // nuoN // nuoM	b2278 // b2279 // b2280 // b2281 // b2282 // b2283 // b2284 // b2285 // b2286 // b2287 // b2288 // b2276 // b2277
proV	b2677	2804815	2806017	glycine betaine ABC transporter ATP binding subunit ProV	proX // proW // proV	b2679 // b2678 // b2677
ybiE	b4769	837503	837562	protein YbiE		
slmA	b3641	3814494	3815090	nucleoid occlusion factor SlmA	slmA // dut	b3641 // b3640
ygaV	b2667	2797211	2797510	putative DNA-binding transcriptional regulator YgaV	ygaP // ygaV	b2668 // b2667
yehY	b2130	2217400	2218557	glycine betaine ABC transporter membrane subunit YehY	yehW // yehX // yehY // osmF	b2128 // b2129 // b2130 // b2131
otsB	b1897	1981587	1982387	trehalose-6-phosphate phosphatase	otsA // otsB	b1896 // b1897
yahV	b4730	331802	331876	protein YahV		
nlpD	b2742	2867614	2868753	murein hydrolase activator NlpD	nlpD // rpoS	b2742 // b2741
comR	b1111	1168200	1168832	DNA-binding transcriptional repressor ComR	comR	b1111
opgH	b1049	1110863	1113406	osmoregulated periplasmic glucans (OPGs) biosynthesis protein H	opgH // opgG	b1049 // b1048
betB	b0312	327261	328733	betaine aldehyde dehydrogenase	betA // betB // betI	b0311 // b0312 // b0313
ythA	b4655	4506448	4506573	KpLE2 phage-like element; uncharacterized protein YthA		
xerC	b3811	3996287	3997183	site-specific tyrosine recombinase	yigB // xerC // yigA // dapF // yifL	b3812 // b3811 // b3810 // b3809 // b4558
puuR	b1299	1361911	1362468	DNA-binding transcriptional repressor PuuR	puuR // puuD // puuE // puuB // puuC	b1299 // b1298 // b1302 // b1301 // b1300
chaA	b1216	1270749	1271849	Na<sup>+</sup>/K<sup>+</sup>:H<sup>+</sup> antiporter ChaA	chaA	b1216
osmB	b1283	1343110	1343328	osmotically-inducible lipoprotein OsmB	osmB	b1283
ymiA	b4522	1335148	1335288	uncharacterized protein YmiA	yciX // ymiA	b4523 // b4522
drpB	b1963	2033119	2033421	cell division protein DrpB	drpB // yedJ	b1963 // b1962
yjhU	b4295	4519338	4520324	KpLE2 phage-like element; putative DNA-binding transcriptional regulator YjhU	yjhU	b4295
yicJ	b3657	3834547	3835929	putative xyloside transporter YicJ	yicI // yicJ	b3656 // b3657
opgG	b1048	1109335	1110870	osmoregulated periplasmic glucans (OPGs) biosynthesis protein G	opgH // opgG	b1049 // b1048
yabQ	b0057	59121	59279	protein YabQ	yabQ // yabP	b0057 // b0056
zapB	b3928	4118515	4118760	cell division factor ZapB	zapB	b3928
cspE	b0623	657292	657501	transcription antiterminator and regulator of RNA stability	cspE	b0623
basS	b4112	4332181	4333272	BasS-<i>N</i>-phospho-L-histidine // sensor histidine kinase BasS	basS // basR	b4112 // b4113
kbp	b2665	2796337	2796786	K<sup>+</sup> binding protein	yqaE // kbp	b2666 // b2665
bcsG	b3538	3698214	3699893	cellulose phosphoethanolamine transferase	bcsG // bcsF // bcsE	b3538 // b3537 // b3536
prlF	b3129	3277002	3277337	antitoxin PrlF	yhaV // prlF	b3130 // b3129
ynfL	b1595	1668699	1669592	putative DNA-binding transcriptional regulator	ynfL	b1595
tatC	b3839	4022736	4023512	twin arginine protein translocation system - TatC protein	tatD // tatC // tatB // tatA	b4483 // b3839 // b3838 // b3836
osmE	b1739	1821918	1822256	osmotically-inducible lipoprotein OsmE	osmE	b1739
yohJ	b2141	2230624	2231022	PF03788 family membrane protein YohJ	yohK // yohJ	b2142 // b2141
zapC	b0946	1005952	1006494	cell division protein ZapC	zapC	b0946
yagP	b0282	297381	297791	putative LysR family substrate binding domain-containing protein YagP	yagP	b0282
appB	b0979	1039296	1040432	cytochrome <i>bd</i>-II ubiquinol oxidase subunit II	appX // appC // appB // appA	b4592 // b0978 // b0979 // b0980
ecnA	b4410	4376317	4376442	entericidin A lipoprotein, antidote to entericidin B	ecnA // ecnB	b4410 // b4411
yciK	b1271	1328354	1329112	putative oxidoreductase	yciK // btuR	b1271 // b1270
ftsP	b3017	3161257	3162669	cell division protein FtsP	ftsP	b3017
mgtL	b4702	4467431	4467484	leader peptide MgtL	mgtL // mgtA	b4702 // b4242
yjfL	b4184	4411979	4412377	DUF350 domain-containing inner membrane protein YjfL	yjfC // yjfM // yjfL // yjfK	b4186 // b4185 // b4184 // b4183
proX	b2679	2807132	2808124	glycine betaine ABC transporter periplasmic binding protein ProX	proX // proW // proV	b2679 // b2678 // b2677
yjaZ	b3989	4189786	4190325	protein YjaZ	yjaZ	b3989
dnaK	b0014	12163	14079	chaperone protein DnaK	tpke11 // dnaK // dnaJ	b0014 // b0015
ygeH	b2852	2992094	2993470	putative transcriptional regulator YgeH	ygeH	b2852
tsgA	b3364	3492568	3493749	putative transporter TsgA	tsgA	b3364
ryhB	b4451	3580922	3581016	small regulatory RNA RyhB	ryhB	b4451
ysgA	b3830	4015354	4016169	putative dienelactone hydrolase	ysgA	b3830
ytfB	b4206	4428079	4428717	cell division protein YtfB	ytfB	b4206
yiaG	b3555	3719478	3719768	putative DNA-binding transcriptional regulator YiaG	yiaG	b3555
yqjA	b3095	3247773	3248435	DedA family protein YqjA	mzrA // yqjA	b3096 // b3095
micA	b4442	2814802	2814874	small regulatory RNA MicA	micA	b4442
rhsC	b0700	729583	733776	rhs element protein RhsC	ybfB // rhsC	b0702 // b0700
nlpI	b3163	3308040	3308924	lipoprotein NlpI	nlpI	b3163
lgoR	b4357	4594937	4595851	putative DNA-binding transcriptional regulator LgoR	lgoR	b4357
yciC	b1255	1312920	1313663	putative inner membrane protein	yciC // yciB	b1255 // b1254
gadY	b4452	3664864	3664969	small regulatory RNA GadY	gadY	b4452
yraR	b3152	3298211	3298846	putative nucleoside-diphosphate-sugar epimerase	yraR	b3152
yihA	b3865	4050133	4050765	GTP-binding protein YihA	yihA	b3865
ytfH	b4212	4434113	4434493	putative transcriptional regulator YtfH	ytfH	b4212
yphD	b2546	2675827	2676825	putative ABC transporter membrane subunit YphD	yphF // yphE // yphD	b2548 // b2547 // b2546
mgrR	b4698	1622817	1622914	small regulatory RNA MgrR	mgrR	b4698
yqgD	b2941	3086399	3086650	DUF2684 domain-containing protein YqgD	yqgD	b2941
dacA	b0632	662752	663963	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase DacA	dacA	b0632
nemR	b1649	1726023	1726622	DNA-binding transcriptional repressor NemR	nemA // nemR // gloA	b1650 // b1649 // b1651
tolR	b0738	775849	776277	Tol-Pal system protein TolR	ybgC // tolQ // tolR // tolA	b0736 // b0737 // b0738 // b0739
mcaS	b4426	1405658	1405751	small regulatory RNA McaS	mcaS	b4426
ygcG	b2778	2905711	2906583	protein YgcG	ygcG	b2778
yraP	b3150	3296409	3296984	divisome-associated lipoprotein YraP	yraP	b3150
ecpR	b0294	310746	311336	DNA-binding transcriptional dual regulator MatA	ecpR	b0294
yfcJ	b2322	2438942	2440120	putative transporter YfcJ	yfcJ	b2322
ohsC	b4608	2700520	2700598	small regulatory RNA OhsC	ohsC	b4608
ypeA	b2434	2551713	2552138	putative acetyltransferase YpeA	ypeA // yfeZ	b2434 // b2433
mukF	b0922	974319	975641	chromosome partitioning protein MukF	mukB // mukE // mukF // cmoM	b0924 // b0923 // b0922 // b0921
rcsC	b2218	2317027	2319876	RcsC-phospho-L-aspartate // RcsC-<i>N</i>-phospho-L-histidine // histidine kinase RcsC	rcsC	b2218
sibA	b4436	2153311	2153454	small RNA SibA	sibA	b4436
yegX	b2102	2182833	2183651	putative glycosyl hydrolase YegX	yegX	b2102
ftsL	b0083	91032	91397	cell division protein FtsL	mraZ // rsmH // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL // lpxC	b0081 // b0082 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083 // b0096
yebQ	b1828	1910276	1911649	putative transporter YebQ	yebQ	b1828
glmZ	b4456	3986432	3986603	small regulatory RNA GlmZ	glmZ	b4456
yoaI	b1788	1874078	1874182	protein YoaI	yoaI	b1788
hslU	b3931	4120416	4121747	ATPase component of the HslVU protease	hslU // hslV	b3931 // b3932
pntA	b1603	1676371	1677903	pyridine nucleotide transhydrogenase subunit &alpha;	pntB // pntA	b1602 // b1603
gcvB	b4443	2942696	2942901	small regulatory RNA GcvB	gcvB	b4443
ydhF	b1647	1724736	1725632	putative oxidoreductase YdhF	ydhF	b1647
sulA	b0958	1020410	1020919	cell division inhibitor SulA	sulA	b0958
rsxB	b1628	1706348	1706926	SoxR [2Fe-2S] reducing system protein RsxB	nth // rsxE // rsxG // rsxD // rsxC // rsxB // rsxA // ydgK	b1633 // b1632 // b1631 // b1630 // b1629 // b1628 // b1627 // b1626
rdlD	b4454	3700136	3700199	antisense regulatory RNA RdlD	rdlD	b4454
ydbH	b1381	1443051	1445690	PF11739 family protein YdbH	ydbL // ynbE // ydbH	b1383 // b1382 // b1381
digH	b1491	1567504	1568823	divisome localized glycosyl hydrolase	digH	b1491
bamC	b2477	2597831	2598865	outer membrane protein assembly factor BamC	bamC // dapA	b2477 // b2478
fnrS	b4699	1409129	1409250	small regulatory RNA FnrS	fnrS	b4699
ycfZ	b1121	1180479	1181267	putative inner membrane protein	ymfA // ycfZ	b1122 // b1121
ftsN	b3933	4122380	4123339	cell division protein FtsN		
uof	b4637	710639	710725	RyhB-regulated <i>fur</i> leader peptide	fldA // uof // fur	b0684 // b4637 // b0683
ydcU	b1442	1513831	1514772	putative ABC transporter membrane subunit YdcU	patD // ydcT // ydcU // ydcV // ydcS	b1444 // b1441 // b1442 // b1443 // b1440
micC	b4427	1437121	1437231	small regulatory RNA MicC	micC	b4427
ybhK	b0780	815739	816647	putative transferase YbhK	ybhK	b0780
ftsQ	b0093	103155	103985	cell division protein FtsQ	mraZ // rsmH // lpxC // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL	b0081 // b0082 // b0096 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083
bluF	b1163	1214264	1215475	blue light- and temperature-regulated antirepressor BluF	bluF	b1163
mraY	b0087	96002	97084	phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide-transferase	mraZ // rsmH // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL // lpxC	b0081 // b0082 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083 // b0096
sibE	b4611	3195097	3195240	small RNA SibE	sibE	b4611
ykgJ	b0288	303853	304182	putative zinc- or iron-chelating domain-containing protein YkgJ	ykgJ	b0288
ymgF	b4520	1218983	1219201	inner membrane protein YmgF	ymgF	b4520
rirA	b4760	3808166	3808238	small regulatory RNA RirA	rirA // waaY // waaJ // waaO // waaB // waaS // waaP // waaG // waaQ // waaU // waaZ	b4760 // b3625 // b3626 // b3627 // b3628 // b3629 // b3630 // b3631 // b3632 // b3623 // b3624
torS	b0993	1053434	1056178	sensory histidine kinase TorS	torS	b0993
sibB	b4437	2153646	2153781	small RNA SibB	sibB	b4437
ytgA	b4800	4486105	4486155	protein YtgA		
prlC	b3498	3643140	3645182	oligopeptidase A	prlC // rsmJ	b3498 // b3497
rflP	b1707	1791307	1792020	anti-FlhDC factor RflP	rflP	b1707
lepB	b2568	2704335	2705309	signal peptidase I	lepA // lepB	b2569 // b2568
cyaR	b4438	2167114	2167200	small regulatory RNA CyaR	cyaR	b4438
yfiS	b4783	2725925	2725987	protein YfiS		
matP	b0956	1018485	1018937	macrodomain Ter protein	matP	b0956
rydC	b4597	1491442	1491506	small regulatory RNA RydC	rydC	b4597
ybhR	b0792	825002	826108	ABC exporter membrane subunit YbhR	cecR // ybhG // ybhF // ybhS // ybhR	b0796 // b0795 // b0794 // b0793 // b0792
rprA	b4431	1770372	1770477	small regulatory RNA RprA	rprA	b4431
yadX	b4765	175048	175095	protein YadX		
mukE	b0923	975622	976326	chromosome partitioning protein MukE	mukB // mukE // mukF // cmoM	b0924 // b0923 // b0922 // b0921
csrD	b3252	3401392	3403332	regulator of CsrB and CsrC decay	csrD	b3252
glpT	b2240	2351016	2352374	sn-glycerol 3-phosphate:phosphate antiporter	glpT // glpQ	b2240 // b2239
sibD	b4447	3194721	3194865	small RNA SibD	sibD	b4447
ynaM	b4744	1434293	1434406	Rac prophage; protein YnaM		
groL	b4143	4371025	4372671	chaperonin GroEL	groS // groL	b4142 // b4143
glmY	b4441	2691157	2691340	small regulatory RNA GlmY	glmY	b4441
mscK	b0465	486536	489898	potassium dependent, small conductance mechanosensitive channel	mscK	b0465
sibC	b4446	3056851	3056991	small regulatory RNA antitoxin SibC	sibC	b4446
yacM	b4727	113244	113288	protein YacM		
dedD	b2314	2431022	2431684	cell division protein DedD	folC // dedD	b2315 // b2314
pspH	b4758	4263139	4263249	small regulatory RNA PspH		
fhuB	b0153	171462	173444	iron(III) hydroxamate ABC transporter membrane subunit	fhuA // fhuC // fhuD // fhuB	b0150 // b0151 // b0152 // b0153
chpB	b4225	4448692	4449042	endoribonuclease toxin ChpB	chpS // chpB	b4224 // b4225
yibV	b4615	3769345	3769680	PF15596 family protein YibV		
obgE	b3183	3330582	3331754	GTPase ObgE	rpmA // rplU // yhbE // obgE	b3185 // b3186 // b3184 // b3183
suhB	b2533	2663442	2664245	Nus factor SuhB	suhB	b2533
arnE	b4544	2372557	2372892	undecaprenyl-phosphate-&alpha;-L-Ara4N flippase - ArnE subunit	arnF // arnE // arnT // arnD // arnA // arnC // arnB	b2258 // b4544 // b2257 // b2256 // b2255 // b2254 // b2253
rraB	b4255	4478473	4478889	ribonuclease E inhibitor protein B	rraB	b4255
ypjJ	b4548	2776877	2777077	CP4-57 prophage; DUF987 domain-containing protein YpjJ	ypjF // yfjZ // ypjJ // yfjY // yfjX	b2646 // b2645 // b4548 // b2644 // b2643
envC	b3613	3786838	3788097	murein hydrolase activator EnvC	yibQ // envC // gpmM	b3614 // b3613 // b3612
mtfA	b1976	2043651	2044448	Mlc titration factor	mtfA	b1976
dmsB	b0895	943414	944031	dimethyl sulfoxide reductase subunit B	dmsA // dmsB // dmsC	b0894 // b0895 // b0896
apaH	b0049	50380	51222	diadenosine tetraphosphatase	lptD // surA // apaH // apaG // rsmA // pdxA	b0054 // b0053 // b0049 // b0050 // b0051 // b0052
yfiL	b2602	2741360	2741725	DUF2799 domain-containing lipoprotein YfiL	yfiL	b2602
minC	b1176	1225385	1226080	Z-ring positioning protein MinC	minE // minD // minC	b1174 // b1175 // b1176
sdsN	b4719	1996921	1997057	small regulatory RNA SdsN	sdsN	b4719
cstA	b0598	629894	631999	carbon starvation protein A	cstA	b0598
yhaV	b3130	3277337	3277801	ribosome-dependent mRNA interferase toxin YhaV	yhaV // prlF	b3130 // b3129
yhiN	b3492	3636208	3637410	putative oxidoreductase YhiN	yhiN	b3492
mepM	b1856	1940313	1941635	peptidoglycan DD-endopeptidase MepM	mepM	b1856
istR	b4616	3853118	3853257	small regulatory RNA IstR-1 // small RNA IstR-2	istR	b4616
mdtM	b4337	4567287	4568519	multidrug efflux pump / bile salt:H<sup>+</sup> antiporter / Na<sup>+</sup>:H<sup>+</sup> antiporter / K<sup>+</sup>:H<sup>+</sup> antiporter	mdtM // yjiN	b4337 // b4336
rnr	b4179	4406654	4409095	RNase R	rlmB // rnr // nsrR // yjfJ // yjfI	b4180 // b4179 // b4178 // b4182 // b4181
yehF	b2115	2196474	2197298	protein YehF	yehF	b2115
ftsB	b2748	2872509	2872820	cell division protein FtsB	ftsB	b2748
rapZ	b3205	3347115	3347969	RNase adaptor protein RapZ	kdsD // yrbG // lptC // kdsC // lptB // lptA // rpoN // hpf // ptsN // rapZ // npr	b3197 // b3196 // b3199 // b3198 // b3201 // b3200 // b3202 // b3203 // b3204 // b3205 // b3206
atpC	b3731	3915553	3915972	ATP synthase F<sub>1</sub> complex subunit &epsilon;	atpI // atpC // atpD // atpG // atpA // atpH // atpF // atpE // atpB	b3739 // b3731 // b3732 // b3733 // b3734 // b3735 // b3736 // b3737 // b3738
rph	b3643	3815863	3816549	truncated RNase PH	pyrE // rph	b3642 // b3643
yidF	b3674	3855114	3855611	uncharacterized protein YidF	yidH // yidG // yidF	b3676 // b3675 // b3674
tig	b0436	455133	456431	trigger factor	tig	b0436
viaA	b3745	3928152	3929603	protein ViaA	ravA // viaA	b3746 // b3745
ttdT	b3063	3208024	3209487	L-tartrate:succinate antiporter	ttdT // ttdA // ttdB	b3063 // b3061 // b3062
csrB	b4408	2924156	2924524	small regulatory RNA CsrB	csrB	b4408
yjiT	b4342	4572414	4573931	putative uncharacterized protein YjiT	yjiT	b4342
ftsZ	b0095	105305	106456	cell division protein FtsZ	mraZ // rsmH // lpxC // ftsZ // ftsA // ftsQ // ddlB // murC // murG // ftsW // murD // mraY // murF // murE // ftsI // ftsL	b0081 // b0082 // b0096 // b0095 // b0094 // b0093 // b0092 // b0091 // b0090 // b0089 // b0088 // b0087 // b0086 // b0085 // b0084 // b0083
mzrA	b3096	3248439	3248822	modulator protein MzrA	mzrA // yqjA	b3096 // b3095
dtpB	b3496	3640862	3642331	dipeptide/tripeptide:H<sup>+</sup> symporter DtpB	dtpB	b3496
rne	b1084	1141182	1144367	ribonuclease E	rne	b1084
yicR	b3638	3811891	3812559	RadC-like JAB domain-containing protein YicR	yicR // mutM // rpmG // rpmB	b3638 // b3635 // b3636 // b3637
cedA	b1731	1813421	1813663	cell division modulator	cedA	b1731
cpxQ	b4716	4106330	4106387	small regulatory RNA CpxQ	cpxQ // cpxP	b4716 // b4484
nlpE	b0192	215269	215979	sensor lipoprotein NlpE	nlpE // arfB // yaeQ	b0192 // b0191 // b0190
rhlB	b3780	3964365	3965630	ATP-dependent RNA helicase RhlB	rhlB	b3780
yhgN	b3434	3575071	3575664	MarC family putative inner membrane protein YhgN	yhgN	b3434
hslV	b3932	4121757	4122287	peptidase component of the HslVU protease	hslU // hslV	b3931 // b3932
nikB	b3477	3615241	3616185	Ni(2+) ABC transporter membrane subunit NikB	nikR // nikA // nikB // nikC // nikD // nikE	b3481 // b3476 // b3477 // b3478 // b3479 // b3480
rnb	b1286	1346978	1348912	RNase II	rnb	b1286
dedA	b2317	2434082	2434741	DedA family protein DedA	dedA // truA // usg // pdxB	b2317 // b2318 // b2319 // b2320
sdiA	b1916	1996110	1996832	DNA-binding transcriptional dual regulator SdiA	sdiA	b1916
nupC	b2393	2513042	2514244	nucleoside:H<sup>+</sup> symporter NupC	nupC	b2393
ghoS	b4128	4352584	4352880	antitoxin of the GhoTS toxin-antitoxin system	ghoT // ghoS	b4559 // b4128
yhaL	b3107	3255043	3255207	uncharacterized protein YhaL	yhaL // yhaK	b3107 // b3106
spy	b1743	1825140	1825625	ATP-independent periplasmic chaperone	spy	b1743
fieF	b3915	4106469	4107371	Zn<sup>2+</sup>/Fe<sup>2+</sup>/Cd<sup>2+</sup> exporter	fieF	b3915
omrA	b4444	2976102	2976189	small regulatory RNA OmrA	omrA	b4444
yqfA	b2899	3042489	3043148	hemolysin-III family protein YqfA	yqfA	b2899
yedK	b1931	2009821	2010489	genome maintenance protein	yedK	b1931
nfrB	b0569	590941	593178	bacteriophage N4 adsorption protein	nfrA // nfrB	b0568 // b0569
rna	b0611	644197	645003	RNase I	rna	b0611
ygcU	b4463	2897964	2899418	putative FAD-containing dehydrogenase	ygcU	b4463
uspG	b0607	641439	641867	universal stress protein G	uspG	b0607
atoS	b2219	2320043	2321869	sensor histidine kinase AtoS	atoC // atoS	b2220 // b2219
rraA	b3929	4118845	4119330	ribonuclease E inhibitor protein A	menA // rraA	b3930 // b3929
ypeC	b2390	2511001	2511327	DUF2502 domain-containing protein YpeC	ypeC	b2390
rclC	b0301	317726	318319	reactive chlorine species resistance protein C	rclA // rclB // rclC	b0304 // b0303 // b0301
evgS	b2370	2484374	2487967	EvgS-<i>N</i>-phospho-L-histidine-721 // EvgS-phospho-L-aspartate // EvgS-<i>N</i>-phospho-L-histidine-1137 // sensor histidine kinase EvgS	evgS // evgA	b2370 // b2369
pnp	b3164	3309033	3311168	polynucleotide phosphorylase	rpsO // truB // rbfA // infB // nusA // rimP // metY // pnp	b3165 // b3166 // b3167 // b3168 // b3169 // b3170 // b3171 // b3164
yegR	b2085	2167989	2168306	uncharacterized protein YegR	yegZ // yegR	b2083 // b2085
oxyS	b4458	4158278	4158394	small regulatory RNA OxyS	oxyS	b4458
tldD	b3244	3390583	3392028	metalloprotease subunit TldD	tldD	b3244
rhtC	b3823	4007757	4008377	L-threonine exporter	rhtC	b3823
orn	b4162	4391604	4392149	oligoribonuclease	orn	b4162
ynjF	b1758	1840783	1841403	CDP-alcohol phosphatidyltransferase domain-containing protein YnjF	ynjF	b1758
rdgB	b2954	3096681	3097274	dITP/XTP pyrophosphatase	hemW // rdgB // yggU // yggT // yggS	b2955 // b2954 // b2953 // b2952 // b2951
mqsA	b3021	3167851	3168246	antitoxin of the MqsRA toxin-antitoxin system / DNA-binding transcriptional repressor MqsA	mqsR // mqsA	b3022 // b3021
ubiA	b4040	4253016	4253888	4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase	ubiC // ubiA	b4039 // b4040
rppH	b2830	2968447	2968977	RNA pyrophosphohydrolase	rppH // ptsP	b2830 // b2829
ydfI	b1542	1629453	1630913	putative oxidoreductase YdfI	ydfI	b1542
crcB	b0624	657555	657938	F<sup>-</sup> channel	crcB	b0624
fliZ	b1921	2000473	2001024	DNA-binding transcriptional regulator FliZ	fliZ // fliA // tcyJ	b1921 // b1922 // b1920
tatB	b3838	4022218	4022733	twin arginine protein translocation system - TatB protein	tatD // tatC // tatB // tatA	b4483 // b3839 // b3838 // b3836
omrB	b4445	2976304	2976385	small regulatory RNA OmrB	omrB	b4445
ycjX	b1321	1384117	1385514	DUF463 domain-containing protein YcjX	ycjF // ycjX // tyrR	b1322 // b1321 // b1323
yfhM	b2520	2647326	2652287	&alpha;<sub>2</sub>-macroglobulin	yfhM // pbpC	b2520 // b2519
rnk	b0610	643557	643967	nucleoside diphosphate kinase regulator	rnk	b0610
ycaD	b0898	945871	947019	putative transporter YcaD	ycaD	b0898
rnhB	b0183	204493	205089	RNase HII	dnaE // rnhB // lpxB // bamA // lpxA // fabZ // lpxD // skp	b0184 // b0183 // b0182 // b0177 // b0181 // b0180 // b0179 // b0178
ycdU	b1029	1095843	1096829	uncharacterized protein YcdU	ycdU // ymdE	b1029 // b1028
pliG	b1178	1227071	1227472	inhibitor of g-type lysozyme	pliG	b1178
yheO	b3346	3475718	3476440	DNA-binding transcriptional regulator YheO	yheO // tusD // tusC // tusB	b3346 // b3345 // b3344 // b3343
yqiH	b3047	3189881	3190630	putative fimbrial chaperone YqiH	yqiI // yqiH // yqiG // insD5 // insC5 // insCD5	b3048 // b3047 // b3046 // b3045 // b3044
hicA	b4532	1509286	1509462	toxin of the HicA-HicB toxin-antitoxin system	hicB // hicA	b1438 // b4532
ybdR	b0608	642088	643326	putative Zn<sup>2+</sup>-dependent alcohol dehydrogenase YbdR	ybdR	b0608
rclB	b0303	318331	318567	DUF1471 domain-containing protein RclB	rclA // rclB // rclC	b0304 // b0303 // b0301
ravA	b3746	3929597	3931093	regulatory ATPase RavA	ravA // viaA	b3746 // b3745
yajC	b0407	427287	427619	Sec translocon accessory complex subunit YajC	tgt // secF // secD // yajC	b0406 // b0409 // b0408 // b0407
rnc	b2567	2703383	2704063	RNase III	recO // era // rnc // acpS // pdxJ	b2565 // b2566 // b2567 // b2563 // b2564
yafJ	b0223	244327	245094	putative glutamine amidotransferase YafJ	yafJ	b0223
iroK	b4706	2668006	2668071	protein IroK		
rcdA	b0846	887423	887959	DNA-binding transcriptional regulator RcdA	rcdA	b0846
bamB	b2512	2637474	2638652	outer membrane protein assembly factor BamB	der // bamB	b2511 // b2512
valV	b1665	1746435	1746511	tRNA-Val(GAC)	valV // valW	b1665 // b1666
yicU	b4797	3838642	3838701	protein YicU		
yqhD	b3011	3155355	3156518	NADPH-dependent aldehyde reductase YqhD	yqhD // dkgA	b3011 // b3012
yieP	b3755	3940635	3941327	DNA-binding transcriptional regulator YieP	yieP // hsrA	b3755 // b3754
tnaB	b3709	3890236	3891483	tryptophan:H+ symporter TnaB	tnaA // tnaB // tnaC	b3708 // b3709 // b3707
selC	b3658	3836222	3836316	tRNA-Sec(UCA)	selC	b3658
yoaM	b4779	2347350	2347385	protein YoaM		
ygaP	b2668	2797520	2798044	thiosulfate sulfurtransferase YgaP	ygaP // ygaV	b2668 // b2667
yfeC	b2398	2518467	2518811	putative DNA-binding transcriptional regulator YfeC	yfeD // yfeC	b2399 // b2398
yfaV	b2246	2358863	2360152	putative transporter YfaV	yfaX // rhmD // yfaV // yfaU	b2248 // b2247 // b2246 // b2245
leuW	b0672	696963	697047	tRNA-Leu(UAG)	glnU // leuW // metT // glnX // glnV // metU // glnW	b0670 // b0672 // b0673 // b0664 // b0665 // b0666 // b0668
yqhI	b4755	3147597	3147740	protein YqhI		
zraP	b4002	4201263	4201688	signaling pathway modulator ZraP	zraP	b4002
yqeI	b2847	2988502	2989311	putative transcriptional regulator YqeI	yqeJ // yqeI	b2848 // b2847
putP	b1015	1079305	1080813	proline:Na<sup>+</sup> symporter	putP	b1015
glyT	b3978	4175673	4175747	tRNA-Gly(UCC)	tufB // thrU // tyrU // glyT // thrT	b3980 // b3976 // b3977 // b3978 // b3979
ymgM	b4740	1240260	1240463	protein YmgM		
cho	b1741	1823515	1824402	excinuclease Cho	cho	b1741
ylbG	b0502	529645	530016	putative DNA-binding transcriptional regulator YlbG	ylbG	b0502
nimT	b1791	1875673	1876854	2-nitroimidazole exporter	nimT	b1791
asnU	b1986	2059851	2059926	tRNA-Asn(GUU)	asnU	b1986
ykgS	b4688	290510	290638	CP4-6 prophage; protein YkgS		
sseA	b2521	2652494	2653339	3-mercaptopyruvate sulfurtransferase	sseA	b2521
fumE	b2929	3074686	3075195	fumarase E	cmtB // cmtA // yggP // yggF // fumE // yggC	b2934 // b2933 // b4465 // b2930 // b2929 // b2928
phoQ	b1129	1188316	1189776	sensor histidine kinase PhoQ	phoQ // phoP	b1129 // b1130
trhO	b1055	1116807	1117859	tRNA U34 hydroxylase TrhO	trhO	b1055
ypaB	b4605	2344594	2344737	protein YpaB		
rclA	b0304	318676	320001	cupric reductase RclA	rclA // rclB // rclC	b0304 // b0303 // b0301
yfbV	b2295	2412677	2413132	UPF0208 membrane protein YfbV	yfbV	b2295
ydgI	b1605	1679557	1680939	putative arginine:ornithine antiporter	folM // ydgI	b1606 // b1605
yfhL	b2562	2699663	2699923	putative 4Fe-4S cluster-containing protein YfhL	yfhL	b2562
yoeF	b4538	2078575	2078931	CP4-44 prophage; putative uncharacterized protein YoeF	yoeF	b4538
ivy	b0220	240343	240816	periplasmic chaperone, inhibitor of vertebrate C-type lysozyme	ivy	b0220
narX	b1222	1275822	1277618	sensory histidine kinase NarX	narL // narX	b1221 // b1222
tyrV	b1230	1287244	1287328	tRNA-Tyr(GUA)	tpr // tyrV // tyrT	b1229 // b1230 // b1231
ychN	b1219	1273246	1273599	DsrE/F sulfur relay family protein YchN	ychN	b1219
yhbQ	b3155	3299966	3300268	DNA damage response nuclease YhbQ	yhbQ	b3155
ycjP	b1312	1374090	1374932	putative ABC transporter membrane subunit YcjP	ymjB // ycjV // ycjU // ycjT // ycjS // ycjR // ycjQ // ycjP // ycjO // ycjN // ycjM // ompG	b4524 // b1318 // b1317 // b1316 // b1315 // b1314 // b1313 // b1312 // b1311 // b1310 // b1309 // b1319
proK	b3545	3708616	3708692	tRNA-Pro(CGG)	proK	b3545
yccE	b1001	1064036	1065292	uncharacterized protein YccE	yccE	b1001
alaE	b2670	2799164	2799613	L-alanine exporter	alaE	b2670
clcA	b0155	175107	176528	chloride:H<sup>+</sup> antiporter ClcA	clcA	b0155
minE	b1174	1224279	1224545	Z-ring positioning protein MinE	minE // minD // minC	b1174 // b1175 // b1176
leuT	b3798	3982606	3982692	tRNA-Leu(CAG)	argX // hisR // leuT // proM	b3796 // b3797 // b3798 // b3799
yjbL	b4047	4260321	4260575	uncharacterized protein YjbL	yjbM // yjbL	b4048 // b4047
radD	b2184	2280632	2282392	putative DNA repair helicase RadD	radD	b2184
tolC	b3035	3178115	3179596	outer membrane channel TolC	ygiC // ygiB // tolC	b3038 // b3037 // b3035
kefC	b0047	47769	49631	K<sup>+</sup> : H<sup>+</sup> antiporter KefC	kefC // kefF	b0047 // b0046
gltU	b3757	3943435	3943510	tRNA-Glu(UUC)	rrfC // rrlC // gltU // rrsC	b3759 // b3758 // b3757 // b3756
slyX	b3348	3477640	3477858	protein SlyX	slyX	b3348
ompF	b0929	985894	986982	outer membrane porin F	ompF	b0929
zitB	b0752	783882	784823	Zn<sup>2+</sup>/Cd<sup>2+</sup>/Ni<sup>2+</sup>/Cu<sup>2+</sup> exporter	zitB	b0752
argY	b2693	2818198	2818274	tRNA-Arg(ACG)	argZ // argY // argV // serV // argQ	b2692 // b2693 // b2694 // b2695 // b2691
yjiG	b4329	4559539	4560000	Gate family protein YjiG	yjiH // yjiG // iadA	b4330 // b4329 // b4328
ompL	b3875	4063603	4064295	putative outer membrane porin L	ompL	b3875
glpC	b2243	2355521	2356711	anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C	glpA // glpB // glpC	b2241 // b2242 // b2243
trpT	b3761	3946957	3947032	tRNA-Trp(CCA)	trpT	b3761
psiE	b4030	4240325	4240735	putative phosphate starvation-inducible protein PsiE	psiE	b4030
ompG	b1319	1381947	1382852	outer membrane porin G	ymjB // ycjV // ycjU // ycjT // ycjS // ycjR // ycjQ // ycjP // ycjO // ycjN // ycjM // ompG	b4524 // b1318 // b1317 // b1316 // b1315 // b1314 // b1313 // b1312 // b1311 // b1310 // b1309 // b1319
yajR	b0427	445302	446666	putative transport protein YajR	yajR	b0427
metZ	b2814	2947387	2947463	tRNA-initiator Met(CAU)	metZ // metW // metV	b2814 // b2815 // b2816
yhfU	b3378	3507348	3507701	DUF2620 domain-containing protein YhfU	yhfX // yhfW // php // yhfU // yhfT // yhfS	b3381 // b3380 // b3379 // b3378 // b3377 // b3376
chiP	b0681	708334	709740	chitobiose outer membrane channel	chiP // chiQ	b0681 // b0682
fepD	b0590	621185	622189	ferric enterobactin ABC transporter membrane subunit FebD	fepC // fepG // fepD	b0588 // b0589 // b0590
ileX	b3069	3215598	3215673	tRNA-Ile(CAU)	ileX	b3069
yqiJ	b3050	3192208	3192837	DUF1449 domain-containing inner membrane protein YqiJ	yqiK // yqiJ	b3051 // b3050
rhaM	b3901	4093124	4093438	L-rhamnose mutarotase	rhaM	b3901
phoE	b0241	259045	260100	outer membrane porin PhoE	phoE	b0241
dgoT	b3691	3870438	3871730	D-galactonate:H<sup>+</sup> symporter	dgoR // dgoK // dgoA // dgoD // dgoT	b4479 // b3693 // b4477 // b4478 // b3691
glnW	b0668	696756	696830	tRNA-Gln(UUG)	glnX // glnV // metU // glnW // glnU // leuW // metT	b0664 // b0665 // b0666 // b0668 // b0670 // b0672 // b0673
ygeY	b2872	3008764	3009975	putative peptidase YgeY	ygeY	b2872
ulaG	b4192	4418561	4419625	L-ascorbate-6-phosphate lactonase	ulaG	b4192
ompN	b1377	1435760	1436893	outer membrane porin N	ompN // ydbK	b1377 // b1378
dgkA	b4042	4256637	4257005	diacylglycerol kinase	dgkA	b4042
argV	b2694	2818473	2818549	tRNA-Arg(ACG)	argZ // argY // argV // serV // argQ	b2692 // b2693 // b2694 // b2695 // b2691
yqaA	b2689	2816512	2816940	DedA family protein YqaA	yqaB // yqaA	b2690 // b2689
hofM	b3395	3521972	3522751	DNA utilization protein HofM	hofM // hofN // hofO // hofP	b3395 // b3394 // b3393 // b3392
ompW	b1256	1314020	1314658	outer membrane protein W	ompW	b1256
exuT	b3093	3245224	3246522	hexuronate transporter	exuT	b3093
lysZ	b0748	781369	781444	tRNA-Lys(UUU)	lysZ	b0748
yfdF	b2345	2463012	2464070	protein YfdF	yfdF	b2345
hofP	b3392	3520615	3521019	DNA utilization protein HofP	hofM // hofN // hofO // hofP	b3395 // b3394 // b3393 // b3392
ompC	b2215	2311646	2312749	outer membrane porin C	ompC	b2215
chbC	b1737	1819856	1821214	<i>N,N'</i>-diacetylchitobiose-specific PTS enzyme IIC component	chbG // chbF // chbR // chbA // chbC // chbB	b1733 // b1734 // b1735 // b1736 // b1737 // b1738
thrU	b3976	4175388	4175463	tRNA-Thr(UGU)	tufB // thrU // tyrU // glyT // thrT	b3980 // b3976 // b3977 // b3978 // b3979
yodB	b1974	2042368	2042898	putative cytochrome b561 YodB	yodB	b1974
ydgJ	b1624	1703268	1704308	putative oxidoreductase YdgJ	ydgJ	b1624
yncD	b1451	1520963	1523065	putative TonB-dependent outer membrane receptor	yncD	b1451
nanX	b4279	4504058	4505275	sialic acid transporter NanX	nanX // nanY	b4279 // b4280
metU	b0666	696664	696740	tRNA-Met(CAU)	glnX // glnV // metU // glnW // glnU // leuW // metT	b0664 // b0665 // b0666 // b0668 // b0670 // b0672 // b0673
ydjO	b1730	1812329	1813132	protein YdjO	ydjO	b1730
yohF	b2137	2226509	2227270	putative oxidoreductase YohF	yohF	b2137
pgaA	b1024	1089866	1092289	partially deacetylated poly-&beta;-1,6-<i>N</i>-acetyl-D-glucosamine outer membrane porin	pgaD // pgaC // pgaB // pgaA	b1021 // b1022 // b1023 // b1024
ascF	b2715	2839524	2840981	&beta;-glucoside specific PTS enzyme IIBC component	ascF // ascB	b2715 // b2716
ileT	b3852	4037141	4037217	tRNA-Ile(GAU)	alaT // ileT // rrsA // rrfA // rrlA	b3853 // b3852 // b3851 // b3855 // b3854
ydeQ	b1502	1586820	1587734	putative fimbrial adhesin protein YdeQ	ydeQ	b1502
yhgH	b3413	3544882	3545565	DNA utilization protein YhgH	yhgH // nfuA	b3413 // b3414
bglH	b3720	3900604	3902220	carbohydrate-specific outer membrane porin, cryptic	bglH // yieL // yieK	b3720 // b3719 // b3718
ydjE	b1769	1852621	1853979	putative transporter YdjE	ydjE	b1769
alaX	b2396	2518041	2518116	tRNA-Ala(GGC)	alaX // alaW	b2396 // b2397
yncH	b1455	1526940	1527152	DUF5445 domain-containing protein YncH	yncH	b1455
hofO	b3393	3521009	3521449	DNA utilization protein HofO	hofM // hofN // hofO // hofP	b3395 // b3394 // b3393 // b3392
sgcC	b4304	4528930	4530243	putative PTS enzyme IIC component SgcC	sgcX // sgcB // sgcC // sgcQ // sgcA // sgcE // sgcR	b4305 // b4565 // b4304 // b4303 // b4302 // b4301 // b4300
yhhT	b3474	3611865	3612914	putative transporter YhhT	yhhT	b3474
metW	b2815	2947497	2947573	tRNA-initiator Met(CAU)	metZ // metW // metV	b2814 // b2815 // b2816
yciQ	b1268	1324746	1326641	DUF2207 domain-containing protein YciQ	yciQ // yciO // yciV	b1268 // b1267 // b1266
eutD	b2458	2572489	2573505	phosphate acetyltransferase EutD	eutS // eutP // eutQ // eutT // eutD // eutM	b2462 // b2461 // b2460 // b2459 // b2458 // b2457
cmtB	b2934	3078887	3079330	mannitol-specific PTS enzyme IIA component CmtB	cmtB // cmtA // yggP // yggF // yggC // fumE	b2934 // b2933 // b4465 // b2930 // b2928 // b2929
uraA	b2497	2618871	2620160	uracil:H<sup>+</sup> symporter UraA	uraA // upp	b2497 // b2498
serW	b0883	925884	925971	tRNA-Ser(GGA)	infA // serW	b0884 // b0883
cspH	b0989	1050963	1051175	CspA family protein CspH	cspH	b0989
hofQ	b3391	3519465	3520703	DNA utilization protein HofQ	hofQ	b3391
ulaB	b4194	4421393	4421698	L-ascorbate specific PTS enzyme IIB component	ulaF // ulaE // ulaD // ulaC // ulaB // ulaA	b4198 // b4197 // b4196 // b4195 // b4194 // b4193
ccmC	b2199	2295583	2296320	cytochrome <i>c</i> maturation protein C	ccmH // ccmG // ccmF // ccmE // ccmD // ccmC // ccmB // ccmA // napC // napB // napH // napG // napA // napD // napF	b2194 // b2195 // b2196 // b2197 // b2198 // b2199 // b2200 // b2201 // b2202 // b2203 // b2204 // b2205 // b2206 // b2207 // b2208
lysV	b2404	2521253	2521328	tRNA-Lys(UUU)	valU // valX // valY // lysV	b2401 // b2402 // b2403 // b2404
yaiZ	b0380	399593	399805	DUF2754 domain-containing protein YaiZ	yaiZ	b0380
deoD	b4384	4620883	4621602	purine nucleoside phosphorylase	deoC // deoA // deoD // deoB	b4381 // b4382 // b4384 // b4383
fryB	b2387	2507916	2508242	putative PTS enzyme IIB component FryB	fryB // fryC // ypdF // ypdE // fryA	b2387 // b2386 // b2385 // b2384 // b2383
nrfE	b4074	4291512	4293170	putative cytochrome c-type biogenesis protein NrfE	nrfA // nrfB // nrfC // nrfD // nrfE // nrfF // nrfG	b4070 // b4071 // b4072 // b4073 // b4074 // b4075 // b4076
glyX	b4164	4392472	4392547	tRNA-Gly(GCC)	glyV // glyX // glyY	b4163 // b4164 // b4165
yaeR	b0187	211877	212266	VOC domain-containing protein YaeR	yaeR	b0187
yhhX	b3440	3579768	3580805	putative oxidoreductase YhhX	yhhX	b3440
sgcB	b4565	4530255	4530533	putative PTS enzyme IIB component SgcB	sgcX // sgcB // sgcC // sgcQ // sgcA // sgcE // sgcR	b4305 // b4565 // b4304 // b4303 // b4302 // b4301 // b4300
fdoI	b3892	4081225	4081860	formate dehydrogenase O subunit &gamma;	fdhE // fdoI // fdoH // fdoG	b3891 // b3892 // b3893 // b3894
aspV	b0216	236931	237007	tRNA-Asp(GUC)	aspV	b0216
ysaE	b4793	3720400	3720471	protein YsaE		
hofN	b3394	3521433	3521972	DNA utilization protein HofN	hofM // hofN // hofO // hofP	b3395 // b3394 // b3393 // b3392
agaB	b3138	3284170	3284646	galactosamine-specific PTS enzyme IIB component	agaI // agaD // agaC // agaB // kbaY // agaS	b3141 // b3140 // b3139 // b3138 // b3137 // b3136
mdtL	b3710	3891615	3892790	efflux pump MdtL	mdtL	b3710
alaU	b3276	3426958	3427033	tRNA-Ala(UGC)	rrfF // thrV // rrfD // rrlD // alaU // ileU // rrsD	b3272 // b3273 // b3274 // b3275 // b3276 // b3277 // b3278
ynfU	b4776	1640805	1640975	Qin prophage; putative zinc-binding protein YnfU		
agaS	b3136	3281976	3283130	putative galactosamine-6-phosphate deaminase/isomerase	agaI // agaD // agaC // agaB // kbaY // agaS	b3141 // b3140 // b3139 // b3138 // b3137 // b3136
cmtA	b2933	3077471	3078859	mannitol-specific PTS enzyme IICB component CmtA	cmtB // cmtA // yggP // yggF // yggC // fumE	b2934 // b2933 // b4465 // b2930 // b2928 // b2929
ydeE	b1534	1621332	1622519	dipeptide exporter	ydeE	b1534
valW	b1666	1746516	1746592	tRNA-Val(GAC)	valV // valW	b1665 // b1666
yecU	b4752	1995655	1995831	protein YecU		
rlmJ	b3499	3645385	3646227	23S rRNA m<sup>6</sup>A2030 methyltransferase	rlmJ	b3499
ulaC	b4195	4421708	4422172	L-ascorbate specific PTS enzyme IIA component	ulaF // ulaE // ulaD // ulaC // ulaB // ulaA	b4198 // b4197 // b4196 // b4195 // b4194 // b4193
thiP	b0067	72911	74521	thiamine ABC transporter membrane subunit	sgrR // thiB // thiP // thiQ // sroA	b0069 // b0068 // b0067 // b0066 // b4762
serT	b0971	1031625	1031712	tRNA-Ser(UGA)	serT	b0971
ymdG	b4737	1079120	1079146	protein YmdG		
glvB	b3682	3861987	3862472	putative PTS enzyme II component GlvB	glvC // glvB // glvG // ysdC	b3683 // b3682 // b3681 // b4556
yifK	b3795	3980887	3982272	putative transporter YifK	yifK	b3795
leuX	b4270	4496405	4496489	tRNA-Leu(CAA)	leuX	b4270
ykgR	b4671	313141	313242	uncharacterized membrane protein YkgR	ykgR	b4671
agaD	b3140	3285478	3286269	galactosamine-specific PTS enzyme IID component	agaI // agaD // agaC // agaB // kbaY // agaS	b3141 // b3140 // b3139 // b3138 // b3137 // b3136
emrA	b2685	2811427	2812599	multidrug efflux pump membrane fusion protein EmrA	mprA // emrA // emrB	b2684 // b2685 // b2686
glyU	b2864	2998984	2999057	tRNA-Gly(CCC)	glyU	b2864
ymgJ	b4594	1223264	1223449	uncharacterized protein YmgJ		
fryA	b2383	2501990	2504485	putative PTS multiphosphoryl transfer protein FryA	fryB // fryC // ypdF // ypdE // fryA	b2387 // b2386 // b2385 // b2384 // b2383
gspF	b3327	3459817	3461013	Type II secretion system protein GspF	gspO // gspM // gspL // gspK // gspJ // gspI // gspH // gspG // gspF // gspE // gspD // gspC	b3335 // b3334 // b3333 // b3332 // b3331 // b3330 // b3329 // b3328 // b3327 // b3326 // b3325 // b3324
