README.md
pyproject.toml
setup.cfg
bin/phastSim
phastSim/__init__.py
phastSim/fast_fasta.py
phastSim/phastSim.py
phastSim.egg-info/PKG-INFO
phastSim.egg-info/SOURCES.txt
phastSim.egg-info/dependency_links.txt
phastSim.egg-info/requires.txt
phastSim.egg-info/top_level.txt
phastSim/example/MN908947.3.fasta
phastSim/example/MN908947.3.mod.fasta
phastSim/example/__init__.py
phastSim/example/exampleTree.tree
phastSim/example/example_sarscov2_tree.newick
phastSim/example/sars-cov-2_simulation_output.fasta
phastSim/example/sars-cov-2_simulation_output.info
phastSim/example/sars-cov-2_simulation_output.phy
phastSim/example/sars-cov-2_simulation_output.tree
phastSim/example/sars-cov-2_simulation_output.txt