AUTHORS.rst
LICENSE
README.rst
setup.py
msm_we/__init__.py
msm_we/_logging.py
msm_we/ensembles.py
msm_we/fpt.py
msm_we/msm_we.py
msm_we/nmm.py
msm_we/optimization.py
msm_we/stratified_clustering.py
msm_we/utils.py
msm_we.egg-info/PKG-INFO
msm_we.egg-info/SOURCES.txt
msm_we.egg-info/dependency_links.txt
msm_we.egg-info/entry_points.txt
msm_we.egg-info/not-zip-safe
msm_we.egg-info/requires.txt
msm_we.egg-info/top_level.txt
msm_we/_hamsm/__init__.py
msm_we/_hamsm/_analysis.py
msm_we/_hamsm/_clustering.py
msm_we/_hamsm/_data.py
msm_we/_hamsm/_dimensionality.py
msm_we/_hamsm/_fluxmatrix.py
msm_we/_hamsm/_plotting.py
msm_we/_hamsm/_untested.py
msm_we/westpa_plugins/__init__.py
msm_we/westpa_plugins/augmentation_driver.py
msm_we/westpa_plugins/hamsm_driver.py
msm_we/westpa_plugins/optimization_driver.py
msm_we/westpa_plugins/restart_driver.py