# Omega fit to each site after fixing tree and all other parameters.
# Fits compared to null model of omega = 1.
# P-values NOT corrected for multiple testing, so consider Q-values too.
# Q-values computed separately for omega > and < 1 # Will fit different synonymous rate for each site.
#
site	omega	P	dLnL	Q
98	0.000	2.91e-06	10.938	0.000765
233	0.000	2.58e-05	8.852	0.00339
135	0.000	0.000276	6.612	0.0242
216	0.000	0.000879	5.533	0.0578
158	0.000	0.00218	4.695	0.115
232	0.000	0.00352	4.259	0.132
53	0.000	0.00335	4.304	0.132
87	0.020	0.00487	3.964	0.16
241	0.071	0.00629	3.733	0.184
64	0.000	0.00951	3.362	0.217
236	0.000	0.0101	3.305	0.217
257	0.000	0.0107	3.254	0.217
146	0.000	0.0101	3.310	0.217
219	0.000	0.0118	3.173	0.221
162	0.000	0.0146	2.982	0.256
134	0.000	0.0177	2.810	0.292
78	0.000	0.0929	1.412	0.37
76	0.000	0.0828	1.505	0.37
169	0.000	0.0794	1.539	0.37
70	0.000	0.0413	2.081	0.37
167	0.000	0.0699	1.643	0.37
220	0.000	0.0858	1.475	0.37
182	0.000	0.0794	1.539	0.37
68	0.000	0.0926	1.414	0.37
65	0.000	0.0906	1.432	0.37
147	0.000	0.0712	1.628	0.37
222	0.000	0.0872	1.462	0.37
60	0.000	0.0828	1.505	0.37
225	0.000	0.0638	1.718	0.37
58	0.000	0.0895	1.442	0.37
81	0.000	0.087	1.465	0.37
86	0.000	0.068	1.665	0.37
178	0.000	0.0371	2.173	0.37
90	0.000	0.0844	1.489	0.37
156	0.000	0.0629	1.730	0.37
192	0.000	0.0881	1.455	0.37
123	0.000	0.0275	2.429	0.37
120	0.000	0.0647	1.706	0.37
119	0.000	0.0808	1.524	0.37
118	0.000	0.0808	1.524	0.37
116	0.000	0.0542	1.854	0.37
181	0.000	0.0906	1.432	0.37
112	0.000	0.0794	1.539	0.37
198	0.000	0.037	2.174	0.37
202	0.000	0.0837	1.496	0.37
56	0.000	0.0794	1.539	0.37
97	0.000	0.0555	1.833	0.37
206	0.000	0.0873	1.461	0.37
91	0.000	0.0686	1.658	0.37
149	0.000	0.0808	1.524	0.37
109	0.000	0.0252	2.504	0.37
132	0.000	0.0844	1.489	0.37
164	0.000	0.0542	1.854	0.37
23	0.000	0.0418	2.072	0.37
52	0.000	0.0419	2.070	0.37
237	0.000	0.0499	1.923	0.37
247	0.000	0.0879	1.456	0.37
235	0.000	0.0929	1.412	0.37
251	0.000	0.0883	1.452	0.37
255	0.000	0.0413	2.081	0.37
31	0.066	0.068	1.666	0.37
44	0.075	0.0846	1.487	0.37
42	0.000	0.0808	1.524	0.37
260	0.000	0.0873	1.461	0.37
261	0.043	0.079	1.543	0.37
229	0.000	0.068	1.665	0.37
66	0.000	0.0966	1.381	0.373
26	0.000	0.0966	1.381	0.373
93	0.000	0.115	1.244	0.388
200	0.000	0.113	1.256	0.388
51	0.000	0.115	1.242	0.388
32	0.000	0.113	1.256	0.388
49	0.000	0.112	1.262	0.388
5	0.000	0.113	1.253	0.388
224	0.000	0.113	1.253	0.388
170	0.000	0.114	1.250	0.388
174	0.000	0.113	1.256	0.388
124	0.000	0.112	1.261	0.388
194	0.000	0.134	1.124	0.405
20	0.000	0.131	1.141	0.405
2	0.000	0.134	1.124	0.405
256	0.000	0.131	1.141	0.405
29	0.000	0.131	1.141	0.405
153	0.000	0.123	1.187	0.405
82	0.000	0.134	1.124	0.405
226	0.000	0.134	1.124	0.405
40	0.000	0.123	1.187	0.405
125	0.000	0.143	1.071	0.412
100	0.000	0.143	1.071	0.412
243	0.000	0.144	1.066	0.412
207	0.000	0.143	1.071	0.412
54	0.000	0.142	1.081	0.412
234	0.000	0.158	0.997	0.433
191	0.000	0.157	1.002	0.433
55	0.000	0.158	0.997	0.433
19	0.000	0.155	1.011	0.433
190	0.180	0.174	0.922	0.473
165	0.000	0.189	0.861	0.503
77	0.000	0.189	0.861	0.503
168	0.000	0.206	0.799	0.542
113	0.159	0.259	0.636	0.676
22	0.139	0.289	0.563	0.744
253	0.158	0.305	0.526	0.779
105	0.177	0.319	0.496	0.807
102	0.161	0.341	0.454	0.854
89	0.225	0.357	0.424	0.886
111	0.210	0.372	0.399	0.913
131	0.228	0.4	0.355	0.969
209	0.229	0.401	0.352	0.969
199	0.272	0.417	0.330	0.991
115	0.266	0.418	0.327	0.991
184	100.000	0.705	0.072	1
183	1.134	0.958	0.001	1
252	100.000	0.482	0.247	1
259	0.000	0.958	0.001	1
227	95.521	0.425	0.318	1
180	0.453	0.621	0.122	1
179	0.455	0.622	0.121	1
254	100.000	0.457	0.276	1
177	94.676	0.0968	1.379	1
176	1.008	0.996	0.000	1
221	0.436	0.609	0.131	1
166	0.000	0.956	0.002	1
228	0.750	0.847	0.019	1
175	0.418	0.604	0.134	1
211	0.000	0.959	0.001	1
231	1.241	0.924	0.005	1
185	0.000	0.962	0.001	1
223	1.685	0.723	0.063	1
173	0.682	0.829	0.023	1
172	0.340	0.542	0.186	1
230	0.383	0.57	0.161	1
171	100.000	0.285	0.572	1
258	0.593	0.757	0.048	1
239	100.000	0.209	0.789	1
186	0.000	0.941	0.003	1
242	0.279	0.429	0.312	1
205	0.000	0.96	0.001	1
212	0.586	0.751	0.050	1
213	77.817	0.0202	2.699	1
204	0.000	0.962	0.001	1
203	0.000	0.95	0.002	1
244	0.418	0.604	0.134	1
201	0.000	0.954	0.002	1
214	0.763	0.753	0.049	1
245	0.000	0.941	0.003	1
238	100.000	0.129	1.154	1
197	0.000	0.956	0.002	1
250	0.271	0.546	0.182	1
196	0.501	0.724	0.062	1
195	0.312	0.668	0.092	1
215	0.337	0.53	0.197	1
217	1.297	0.895	0.009	1
193	0.000	0.959	0.001	1
248	10.989	0.00823	3.492	1
218	100.000	0.21	0.785	1
210	0.494	0.673	0.089	1
249	100.000	0.256	0.645	1
208	0.000	0.95	0.002	1
189	0.000	0.95	0.002	1
188	0.475	0.739	0.055	1
187	100.000	0.375	0.394	1
246	0.564	0.731	0.059	1
240	0.367	0.713	0.068	1
1	100.000	0.326	0.482	1
161	94.032	0.876	0.012	1
37	100.000	0.331	0.472	1
38	96.319	0.661	0.096	1
39	0.000	0.952	0.002	1
41	0.000	0.96	0.001	1
43	0.000	0.941	0.003	1
45	0.000	0.949	0.002	1
46	0.428	0.606	0.133	1
47	0.000	0.96	0.001	1
48	0.000	0.955	0.002	1
36	0.000	0.956	0.002	1
50	100.000	0.145	1.061	1
59	19.171	0.336	0.462	1
61	0.000	0.949	0.002	1
62	0.270	0.462	0.271	1
63	100.000	0.627	0.118	1
67	0.334	0.639	0.110	1
69	1.156	0.973	0.001	1
71	0.000	0.951	0.002	1
72	0.000	0.963	0.001	1
73	1.076	0.96	0.001	1
57	0.273	0.438	0.300	1
35	1.430	0.891	0.009	1
34	1.070	0.963	0.001	1
33	0.940	0.978	0.000	1
3	0.340	0.542	0.186	1
4	100.000	0.367	0.406	1
6	100.000	0.37	0.402	1
7	100.000	0.377	0.390	1
8	0.347	0.538	0.190	1
9	0.000	0.955	0.002	1
10	2.929	0.281	0.581	1
11	1.167	0.914	0.006	1
12	0.000	0.952	0.002	1
13	0.604	0.747	0.052	1
14	93.555	0.168	0.950	1
15	100.000	0.121	1.199	1
16	1.395	0.855	0.017	1
17	0.462	0.662	0.096	1
18	100.000	0.107	1.297	1
21	0.521	0.813	0.028	1
24	99.944	0.482	0.247	1
25	0.000	0.95	0.002	1
27	98.709	0.248	0.667	1
28	0.000	0.949	0.002	1
30	0.787	0.957	0.001	1
74	100.000	0.504	0.223	1
75	78.481	0.524	0.203	1
79	100.000	0.164	0.971	1
80	0.000	0.957	0.001	1
262	0.258	0.442	0.296	1
133	0.289	0.479	0.251	1
136	0.000	0.956	0.002	1
137	0.000	0.961	0.001	1
138	0.289	0.489	0.239	1
139	100.000	0.0271	2.441	1
140	98.417	0.737	0.056	1
141	100.000	0.372	0.399	1
142	100.000	0.366	0.409	1
143	0.294	0.499	0.229	1
144	0.000	0.958	0.001	1
145	93.992	0.444	0.293	1
148	0.300	0.495	0.232	1
150	100.000	0.224	0.740	1
151	0.000	0.944	0.002	1
152	0.434	0.702	0.073	1
154	0.000	0.944	0.002	1
155	0.000	0.951	0.002	1
157	24.116	0.374	0.396	1
159	1.063	0.961	0.001	1
160	1.086	0.965	0.001	1
130	0.123	0.601	0.137	1
163	0.339	0.511	0.216	1
129	95.523	0.647	0.105	1
127	0.000	0.965	0.001	1
83	0.000	0.949	0.002	1
84	0.424	0.716	0.066	1
85	0.000	0.952	0.002	1
88	0.000	0.961	0.001	1
92	0.000	0.941	0.003	1
94	0.403	0.605	0.133	1
95	0.315	0.64	0.109	1
96	0.000	0.952	0.002	1
99	1.070	0.963	0.001	1
101	0.000	0.949	0.002	1
103	0.000	0.951	0.002	1
104	0.000	0.941	0.003	1
106	0.000	0.95	0.002	1
107	0.000	0.947	0.002	1
108	0.418	0.604	0.134	1
110	0.000	0.949	0.002	1
114	0.000	0.958	0.001	1
117	93.687	0.225	0.737	1
121	2.172	0.613	0.128	1
122	0.383	0.557	0.172	1
126	100.000	0.518	0.209	1
128	100.000	0.463	0.269	1
263	0.000	0.962	0.001	1