# Omega fit to each site after fixing tree and all other parameters.
# Fits compared to null model of omega = 1.
# P-values NOT corrected for multiple testing, so consider Q-values too.
# Q-values computed separately for omega > and < 1 # Will fit different synonymous rate for each site.
#
site	omega	P	dLnL	Q
248	20.043	0.000567	5.941	0.0745
213	37.250	0.000345	6.404	0.0745
218	95.530	0.00262	4.527	0.23
233	0.000	0.00164	4.956	0.432
139	33.371	0.0112	3.215	0.738
134	0.000	0.0133	3.064	0.875
146	0.000	0.00988	3.328	0.875
87	0.029	0.0102	3.299	0.875
257	0.000	0.0169	2.853	0.889
209	100.000	0.0175	2.823	0.92
105	72.028	0.0286	2.396	0.951
15	100.000	0.0326	2.284	0.951
141	100.000	0.0307	2.334	0.951
46	82.846	0.0218	2.629	0.951
174	0.000	0.536	0.192	1
173	0.682	0.817	0.027	1
172	0.334	0.527	0.200	1
175	0.567	0.733	0.058	1
171	100.000	0.255	0.649	1
176	1.009	0.995	0.000	1
177	100.000	0.101	1.344	1
178	0.000	0.279	0.586	1
181	0.000	0.117	1.231	1
180	0.700	0.822	0.025	1
170	0.000	0.151	1.032	1
182	0.000	0.481	0.249	1
183	1.051	0.982	0.000	1
184	100.000	0.697	0.076	1
185	1.000	1	0.000	1
186	1.000	1	0.000	1
187	100.000	0.31	0.515	1
188	0.606	0.82	0.026	1
189	1.000	1	0.000	1
190	0.303	0.311	0.514	1
191	0.000	0.47	0.261	1
192	0.000	0.486	0.242	1
179	1.129	0.939	0.003	1
169	0.000	0.234	0.708	1
164	0.000	0.172	0.932	1
167	0.000	0.0493	1.932	1
136	0.000	0.971	0.001	1
137	0.999	0.999	0.000	1
138	14.474	0.21	0.786	1
140	100.000	0.531	0.196	1
142	100.000	0.119	1.212	1
143	0.262	0.439	0.299	1
144	1.000	1	0.000	1
145	100.000	0.0539	1.857	1
147	0.000	0.144	1.068	1
148	0.205	0.347	0.442	1
149	0.000	0.108	1.292	1
150	99.547	0.236	0.701	1
151	1.000	1	0.000	1
168	0.000	0.449	0.287	1
152	0.463	0.733	0.058	1
154	1.000	1	0.000	1
155	1.000	1	0.000	1
156	0.000	0.461	0.271	1
157	91.017	0.263	0.627	1
158	0.000	0.63	0.116	1
159	0.824	0.894	0.009	1
160	1.823	0.78	0.039	1
161	100.000	0.695	0.077	1
162	0.000	0.179	0.904	1
163	0.415	0.539	0.189	1
193	1.000	1	0.000	1
165	0.000	0.37	0.402	1
166	0.000	0.957	0.001	1
153	0.000	0.356	0.425	1
194	0.000	0.2	0.820	1
1	100.000	0.332	0.471	1
196	2.515	0.635	0.113	1
232	0.000	0.647	0.105	1
234	0.000	0.316	0.502	1
235	0.000	0.178	0.906	1
236	0.000	0.0483	1.949	1
237	0.000	0.431	0.310	1
238	100.000	0.055	1.841	1
239	100.000	0.176	0.914	1
240	1.046	0.984	0.000	1
241	0.224	0.107	1.301	1
242	0.428	0.616	0.126	1
243	0.000	0.154	1.018	1
244	0.454	0.628	0.118	1
245	0.000	0.949	0.002	1
246	0.451	0.627	0.118	1
247	0.000	0.0869	1.466	1
249	100.000	0.0551	1.840	1
250	0.425	0.651	0.103	1
251	0.000	0.105	1.312	1
252	100.000	0.343	0.449	1
253	0.591	0.752	0.050	1
254	100.000	0.403	0.349	1
255	0.000	0.14	1.089	1
256	0.000	0.336	0.464	1
258	1.154	0.929	0.004	1
259	1.000	0.999	0.000	1
260	0.000	0.137	1.104	1
261	0.066	0.138	1.101	1
231	2.630	0.682	0.084	1
230	0.630	0.774	0.041	1
229	0.000	0.0742	1.593	1
228	0.727	0.827	0.024	1
197	1.000	1	0.000	1
135	0.000	0.0591	1.782	1
199	0.382	0.549	0.180	1
200	0.000	0.307	0.522	1
201	1.000	1	0.000	1
202	0.000	0.0961	1.384	1
203	0.000	0.958	0.001	1
204	1.000	1	0.000	1
205	1.000	0.999	0.000	1
206	0.000	0.303	0.531	1
207	0.000	0.478	0.252	1
208	1.000	1	0.000	1
210	2.718	0.53	0.197	1
195	28.433	0.0738	1.598	1
211	1.000	1	0.000	1
214	0.761	0.75	0.051	1
215	0.553	0.755	0.049	1
216	0.000	0.728	0.060	1
217	4.613	0.28	0.582	1
219	0.000	0.222	0.744	1
220	0.000	0.203	0.812	1
221	0.864	0.929	0.004	1
222	0.000	0.312	0.512	1
223	4.037	0.383	0.380	1
224	0.000	0.306	0.524	1
225	0.000	0.872	0.013	1
226	0.000	0.244	0.678	1
227	100.000	0.474	0.257	1
212	6.404	0.338	0.460	1
198	0.000	0.132	1.133	1
132	0.000	0.824	0.025	1
262	0.340	0.561	0.169	1
36	1.000	1	0.000	1
37	100.000	0.301	0.535	1
38	86.651	0.735	0.057	1
39	0.000	0.973	0.001	1
40	0.000	0.387	0.375	1
41	1.000	1	0.000	1
42	0.000	0.792	0.035	1
43	0.000	0.953	0.002	1
44	0.152	0.182	0.891	1
45	1.000	1	0.000	1
47	0.000	0.97	0.001	1
48	1.000	1	0.000	1
49	0.000	0.263	0.626	1
35	2.201	0.729	0.060	1
50	100.000	0.0911	1.427	1
52	0.000	0.541	0.187	1
53	0.000	0.0485	1.946	1
54	0.000	0.227	0.729	1
55	0.000	0.267	0.615	1
56	0.000	0.586	0.149	1
57	0.507	0.674	0.088	1
58	0.000	0.278	0.587	1
59	5.061	0.234	0.707	1
60	0.000	0.279	0.587	1
61	0.000	0.958	0.001	1
62	0.575	0.801	0.032	1
63	94.018	0.66	0.097	1
64	0.000	0.0779	1.554	1
51	0.000	0.455	0.280	1
34	1.243	0.879	0.012	1
33	1.761	0.805	0.030	1
32	0.000	0.22	0.754	1
2	0.000	0.184	0.882	1
3	0.316	0.504	0.223	1
4	100.000	0.291	0.557	1
5	0.000	0.197	0.834	1
6	100.000	0.368	0.405	1
7	95.477	0.375	0.394	1
8	0.608	0.755	0.049	1
9	0.000	0.948	0.002	1
10	2.664	0.329	0.476	1
11	2.635	0.498	0.230	1
12	1.000	1	0.000	1
13	0.472	0.624	0.120	1
14	96.092	0.123	1.191	1
16	2.138	0.656	0.099	1
17	1.216	0.904	0.007	1
18	100.000	0.0429	2.049	1
19	0.000	0.258	0.641	1
20	0.000	0.71	0.069	1
21	4.501	0.509	0.218	1
22	0.164	0.317	0.501	1
23	0.000	0.0679	1.667	1
24	93.621	0.352	0.433	1
25	0.000	0.975	0.001	1
26	0.000	0.245	0.677	1
27	100.000	0.277	0.591	1
28	0.000	0.959	0.001	1
29	0.000	0.604	0.135	1
30	2.590	0.886	0.010	1
31	0.140	0.185	0.879	1
65	0.000	0.0905	1.432	1
133	0.239	0.404	0.349	1
66	0.000	0.403	0.350	1
68	0.000	0.415	0.332	1
103	0.000	0.965	0.001	1
104	0.000	0.941	0.003	1
106	1.000	1	0.000	1
107	1.000	1	0.000	1
108	1.030	0.987	0.000	1
109	0.000	0.673	0.089	1
110	0.000	0.969	0.001	1
111	85.538	0.0425	2.058	1
112	0.000	0.298	0.542	1
113	2.588	0.528	0.199	1
114	1.000	1	0.000	1
115	0.340	0.495	0.233	1
116	0.000	0.0986	1.364	1
102	1.304	0.918	0.005	1
117	100.000	0.144	1.069	1
119	0.000	0.766	0.044	1
120	0.000	0.554	0.175	1
121	1.917	0.653	0.101	1
122	0.388	0.556	0.173	1
123	0.000	0.156	1.007	1
124	0.000	0.307	0.523	1
125	0.000	0.161	0.980	1
126	100.000	0.371	0.400	1
127	0.000	0.969	0.001	1
128	100.000	0.438	0.301	1
129	91.410	0.599	0.139	1
130	0.188	0.703	0.073	1
131	86.518	0.289	0.562	1
118	0.000	0.624	0.120	1
101	0.000	0.97	0.001	1
100	0.000	0.594	0.142	1
99	1.002	0.999	0.000	1
69	100.000	0.687	0.081	1
70	0.000	0.0928	1.412	1
71	0.000	0.952	0.002	1
72	1.000	1	0.000	1
73	1.827	0.667	0.093	1
74	100.000	0.466	0.266	1
75	89.899	0.545	0.183	1
76	0.000	0.111	1.270	1
77	0.000	0.395	0.361	1
78	0.000	0.141	1.081	1
79	100.000	0.168	0.949	1
80	1.000	1	0.000	1
81	0.000	0.6	0.137	1
82	0.000	0.779	0.039	1
83	0.000	0.957	0.001	1
84	0.833	0.919	0.005	1
85	0.000	0.948	0.002	1
86	0.000	0.0724	1.614	1
88	0.000	0.962	0.001	1
89	0.295	0.443	0.295	1
90	0.000	0.0651	1.701	1
91	0.000	0.77	0.043	1
92	0.000	0.968	0.001	1
93	0.000	0.46	0.272	1
94	2.046	0.782	0.038	1
95	0.466	0.76	0.047	1
96	0.000	0.96	0.001	1
97	0.000	0.743	0.054	1
98	0.000	0.548	0.181	1
67	0.429	0.719	0.065	1
263	1.000	1	0.000	1