# Omega fit to each site after fixing tree and all other parameters.
# Fits compared to null model of omega = 1.
# P-values NOT corrected for multiple testing, so consider Q-values too.
# Q-values computed separately for omega > and < 1 # Will fit different synonymous rate for each site.
#
site	omega	P	dLnL	Q
429	0.000	0.000273	6.623	0.154
378	0.000	0.000905	5.507	0.255
277	0.000	0.00392	4.161	0.257
147	0.000	0.00283	4.458	0.257
307	0.000	0.00387	4.173	0.257
452	0.000	0.00276	4.481	0.257
309	0.000	0.00343	4.281	0.257
190	0.000	0.00416	4.105	0.257
37	0.000	0.00527	3.893	0.257
232	0.000	0.00546	3.860	0.257
538	0.000	0.00532	3.883	0.257
459	0.000	0.00475	3.985	0.257
104	0.000	0.00792	3.526	0.282
304	0.000	0.00799	3.518	0.282
122	0.000	0.00793	3.525	0.282
261	0.000	0.00753	3.571	0.282
294	0.000	0.00985	3.331	0.289
216	0.000	0.0123	3.135	0.289
55	0.000	0.0121	3.150	0.289
425	0.000	0.0116	3.187	0.289
362	0.000	0.0106	3.269	0.289
58	0.000	0.0115	3.191	0.289
524	0.000	0.0108	3.252	0.289
549	0.000	0.0104	3.280	0.289
235	0.000	0.0135	3.051	0.293
379	0.000	0.0133	3.066	0.293
415	0.000	0.0182	2.786	0.3
101	0.099	0.0186	2.770	0.3
418	0.000	0.0222	2.615	0.3
115	0.000	0.0217	2.636	0.3
500	0.000	0.0195	2.728	0.3
54	0.000	0.0228	2.593	0.3
270	0.000	0.0219	2.628	0.3
251	0.000	0.0171	2.845	0.3
240	0.000	0.0189	2.756	0.3
238	0.000	0.0196	2.723	0.3
371	0.000	0.0178	2.810	0.3
472	0.000	0.0229	2.588	0.3
125	0.000	0.0219	2.626	0.3
28	0.000	0.0215	2.644	0.3
27	0.000	0.0223	2.610	0.3
468	0.000	0.0151	2.953	0.3
305	0.000	0.0187	2.765	0.3
39	0.000	0.0235	2.565	0.301
509	0.000	0.0267	2.454	0.328
109	0.000	0.0263	2.467	0.328
375	0.000	0.0278	2.420	0.334
334	0.000	0.0294	2.372	0.345
494	0.000	0.0318	2.305	0.366
64	0.000	0.0341	2.246	0.377
137	0.135	0.0341	2.244	0.377
554	0.000	0.0358	2.202	0.389
321	0.000	0.0386	2.139	0.403
135	0.000	0.038	2.153	0.403
227	0.000	0.0404	2.101	0.414
502	0.000	0.0435	2.038	0.416
312	0.000	0.043	2.048	0.416
319	0.000	0.043	2.047	0.416
366	0.000	0.0413	2.082	0.416
346	0.000	0.0454	2.003	0.417
25	0.000	0.0462	1.987	0.417
60	0.000	0.0466	1.980	0.417
266	0.000	0.0452	2.006	0.417
129	0.000	0.0566	1.817	0.427
97	0.000	0.0635	1.722	0.427
328	0.138	0.0637	1.720	0.427
408	0.000	0.0569	1.813	0.427
358	0.000	0.0601	1.767	0.427
75	0.000	0.0629	1.729	0.427
274	0.000	0.0503	1.915	0.427
158	0.000	0.0624	1.736	0.427
368	0.000	0.0587	1.787	0.427
497	0.000	0.0577	1.801	0.427
279	0.000	0.0605	1.761	0.427
369	0.000	0.0584	1.792	0.427
303	0.000	0.06	1.769	0.427
153	0.000	0.0525	1.879	0.427
342	0.000	0.0496	1.927	0.427
439	0.000	0.0627	1.733	0.427
422	0.000	0.056	1.826	0.427
367	0.000	0.0591	1.782	0.427
416	0.000	0.0627	1.733	0.427
476	0.000	0.0591	1.781	0.427
453	0.000	0.059	1.782	0.427
492	0.000	0.0774	1.560	0.431
106	0.000	0.0728	1.610	0.431
116	0.000	0.0719	1.619	0.431
467	0.000	0.081	1.522	0.431
9	0.000	0.0735	1.602	0.431
560	0.000	0.0789	1.544	0.431
112	0.156	0.0803	1.530	0.431
411	0.000	0.0702	1.639	0.431
495	0.000	0.0804	1.528	0.431
318	0.000	0.0782	1.551	0.431
71	0.000	0.0818	1.514	0.431
44	0.000	0.0696	1.647	0.431
34	0.000	0.0722	1.617	0.431
61	0.000	0.0797	1.536	0.431
382	0.000	0.0722	1.616	0.431
234	0.000	0.0781	1.552	0.431
384	0.000	0.0804	1.529	0.431
519	0.000	0.0797	1.536	0.431
518	0.000	0.0683	1.661	0.431
464	0.000	0.0824	1.508	0.431
463	0.000	0.0807	1.525	0.431
435	0.000	0.0728	1.610	0.431
18	0.000	0.0724	1.614	0.431
553	0.000	0.0733	1.604	0.431
151	0.000	0.0847	1.486	0.434
83	0.000	0.0861	1.473	0.434
360	0.171	0.0862	1.472	0.434
306	0.000	0.084	1.493	0.434
430	0.000	0.0904	1.433	0.437
432	0.000	0.102	1.340	0.437
473	0.000	0.0995	1.357	0.437
470	0.000	0.0998	1.354	0.437
481	0.000	0.0876	1.459	0.437
133	0.000	0.108	1.292	0.437
456	0.000	0.0996	1.356	0.437
193	0.000	0.102	1.335	0.437
127	0.000	0.105	1.317	0.437
437	0.000	0.104	1.320	0.437
451	0.000	0.0933	1.408	0.437
130	0.000	0.108	1.292	0.437
455	0.000	0.109	1.283	0.437
423	0.000	0.105	1.316	0.437
355	0.000	0.103	1.331	0.437
550	0.000	0.108	1.293	0.437
30	0.000	0.108	1.291	0.437
36	0.000	0.101	1.345	0.437
370	0.000	0.104	1.321	0.437
297	0.000	0.0925	1.415	0.437
49	0.000	0.0987	1.363	0.437
291	0.000	0.104	1.319	0.437
424	0.000	0.0909	1.429	0.437
283	0.000	0.1	1.353	0.437
57	0.000	0.109	1.286	0.437
262	0.000	0.0936	1.406	0.437
223	0.145	0.107	1.298	0.437
233	0.000	0.0898	1.439	0.437
253	0.000	0.101	1.348	0.437
409	0.000	0.114	1.250	0.443
171	0.000	0.117	1.229	0.443
407	0.000	0.118	1.224	0.443
512	0.000	0.115	1.239	0.443
534	0.000	0.118	1.223	0.443
395	0.000	0.112	1.266	0.443
286	0.231	0.113	1.257	0.443
284	0.000	0.116	1.234	0.443
392	0.000	0.115	1.242	0.443
80	0.000	0.12	1.210	0.445
275	0.000	0.119	1.215	0.445
197	0.000	0.122	1.193	0.446
440	0.000	0.124	1.183	0.446
300	0.000	0.121	1.202	0.446
11	0.157	0.123	1.192	0.446
69	0.000	0.123	1.187	0.446
505	0.000	0.127	1.165	0.453
372	0.000	0.13	1.146	0.461
4	0.000	0.131	1.141	0.462
475	0.098	0.137	1.106	0.477
347	0.000	0.137	1.108	0.477
344	0.000	0.141	1.083	0.488
374	0.000	0.143	1.073	0.492
398	0.000	0.145	1.062	0.496
29	0.000	0.148	1.047	0.503
354	0.000	0.15	1.036	0.503
207	0.000	0.151	1.033	0.503
564	0.000	0.15	1.038	0.503
501	0.000	0.154	1.018	0.504
320	0.000	0.154	1.018	0.504
389	0.000	0.153	1.020	0.504
341	0.000	0.155	1.013	0.504
265	0.000	0.158	0.995	0.507
50	0.000	0.158	0.997	0.507
249	0.000	0.161	0.983	0.507
93	0.000	0.16	0.988	0.507
322	0.000	0.16	0.987	0.507
483	0.000	0.161	0.983	0.507
5	0.000	0.165	0.963	0.518
244	0.000	0.167	0.954	0.518
78	0.000	0.167	0.955	0.518
388	0.193	0.169	0.945	0.522
248	0.000	0.173	0.928	0.522
510	0.000	0.173	0.930	0.522
173	0.000	0.17	0.940	0.522
144	0.234	0.171	0.935	0.522
8	0.000	0.181	0.896	0.539
477	0.201	0.181	0.896	0.539
243	0.202	0.182	0.889	0.542
119	0.000	0.184	0.882	0.544
506	0.205	0.186	0.876	0.545
559	0.000	0.194	0.845	0.566
327	0.000	0.202	0.813	0.585
40	0.000	0.202	0.813	0.585
198	0.224	0.209	0.791	0.6
485	0.000	0.211	0.782	0.604
242	0.293	0.241	0.688	0.686
88	0.253	0.247	0.669	0.701
558	0.000	0.264	0.624	0.745
267	0.209	0.265	0.620	0.745
443	0.000	0.269	0.612	0.75
441	0.000	0.274	0.598	0.758
68	0.000	0.274	0.598	0.758
520	0.000	0.279	0.587	0.766
48	0.000	0.289	0.561	0.789
191	0.000	0.289	0.563	0.789
542	0.000	0.294	0.550	0.798
214	0.300	0.311	0.513	0.84
289	0.219	0.313	0.509	0.841
87	0.354	0.317	0.500	0.848
325	0.230	0.324	0.486	0.862
86	0.000	0.339	0.456	0.897
503	0.245	0.34	0.455	0.897
98	0.248	0.346	0.444	0.908
539	0.000	0.363	0.415	0.941
460	0.000	0.363	0.413	0.941
444	0.000	0.364	0.412	0.941
208	0.276	0.38	0.385	0.976
514	0.274	0.381	0.384	0.976
102	0.352	0.383	0.381	0.977
377	0.999	0.999	0.000	1
530	0.999	0.999	0.000	1
529	1.000	1	0.000	1
376	0.999	0.999	0.000	1
528	0.999	0.999	0.000	1
527	0.822	0.89	0.009	1
352	0.999	0.999	0.000	1
548	0.999	0.999	0.000	1
526	0.999	0.999	0.000	1
380	0.999	0.999	0.000	1
381	0.000	0.96	0.001	1
525	0.999	0.999	0.000	1
351	0.999	0.999	0.000	1
383	0.000	0.965	0.001	1
350	0.999	0.999	0.000	1
523	0.000	0.964	0.001	1
349	1.000	0.999	0.000	1
348	0.999	0.999	0.000	1
561	0.000	0.962	0.001	1
562	0.000	0.961	0.001	1
522	0.000	0.972	0.001	1
531	0.999	0.999	0.000	1
532	0.999	0.999	0.000	1
466	100.000	0.132	1.135	1
461	0.999	0.999	0.000	1
363	1.000	1	0.000	1
364	0.999	0.999	0.000	1
547	0.000	0.966	0.001	1
365	0.999	0.999	0.000	1
546	0.999	0.999	0.000	1
361	0.000	0.966	0.001	1
545	1.000	1	0.000	1
544	1.000	1	0.000	1
543	0.999	0.999	0.000	1
521	0.000	0.96	0.001	1
541	1.000	1	0.000	1
551	1.000	1	0.000	1
540	1.269	0.846	0.019	1
552	0.000	0.964	0.001	1
537	0.000	0.968	0.001	1
536	1.000	0.999	0.000	1
555	0.000	0.966	0.001	1
535	0.999	0.999	0.000	1
556	0.999	0.999	0.000	1
359	0.000	0.964	0.001	1
557	1.000	0.999	0.000	1
373	0.000	0.963	0.001	1
533	0.000	0.972	0.001	1
357	0.999	0.999	0.000	1
356	1.000	1	0.000	1
353	0.000	0.96	0.001	1
469	0.694	0.799	0.033	1
513	0.670	0.754	0.049	1
386	1.000	0.999	0.000	1
491	0.000	0.964	0.001	1
490	0.999	0.999	0.000	1
489	0.000	0.96	0.001	1
426	0.999	0.999	0.000	1
458	0.000	0.969	0.001	1
427	0.000	0.966	0.001	1
428	0.000	0.966	0.001	1
488	90.205	0.429	0.313	1
487	100.000	0.401	0.353	1
431	1.361	0.829	0.023	1
486	0.999	0.999	0.000	1
433	0.999	0.999	0.000	1
434	1.000	1	0.000	1
484	0.999	0.999	0.000	1
436	0.999	0.999	0.000	1
482	0.999	0.999	0.000	1
438	0.000	0.966	0.001	1
471	0.000	0.966	0.001	1
345	0.999	0.999	0.000	1
454	0.000	0.967	0.001	1
474	0.000	0.96	0.001	1
450	1.000	1	0.000	1
449	0.999	0.999	0.000	1
493	0.000	0.968	0.001	1
448	0.000	0.97	0.001	1
446	0.000	0.966	0.001	1
445	0.000	0.96	0.001	1
442	0.999	0.999	0.000	1
478	0.999	0.999	0.000	1
479	0.999	0.999	0.000	1
480	0.999	0.999	0.000	1
447	94.013	0.509	0.218	1
421	0.426	0.556	0.173	1
420	0.000	0.96	0.001	1
419	0.000	0.964	0.001	1
400	0.000	0.96	0.001	1
399	0.000	0.969	0.001	1
465	98.012	0.482	0.248	1
397	0.465	0.427	0.315	1
396	1.000	0.999	0.000	1
457	0.999	0.999	0.000	1
401	0.000	0.964	0.001	1
394	0.999	0.999	0.000	1
515	0.999	0.999	0.000	1
516	0.000	0.966	0.001	1
391	0.000	0.965	0.001	1
390	0.999	0.999	0.000	1
517	0.000	0.963	0.001	1
387	0.999	0.999	0.000	1
393	0.000	0.969	0.001	1
385	100.000	0.428	0.314	1
402	0.000	0.967	0.001	1
404	0.999	0.999	0.000	1
496	0.000	0.966	0.001	1
417	100.000	0.367	0.407	1
498	0.999	0.999	0.000	1
499	0.999	0.999	0.000	1
414	0.000	0.96	0.001	1
413	0.000	0.967	0.001	1
403	0.999	0.999	0.000	1
412	0.999	0.999	0.000	1
504	0.999	0.999	0.000	1
507	0.000	0.96	0.001	1
508	0.000	0.972	0.001	1
406	0.000	0.965	0.001	1
511	0.000	0.967	0.001	1
405	0.999	0.999	0.000	1
410	0.000	0.96	0.001	1
462	0.000	0.969	0.001	1
1	0.000	0.96	0.001	1
340	0.999	0.999	0.000	1
134	1.000	1	0.000	1
132	0.000	0.961	0.001	1
131	0.000	0.96	0.001	1
128	0.000	0.969	0.001	1
126	0.000	0.972	0.001	1
124	0.000	0.965	0.001	1
123	0.000	0.972	0.001	1
121	1.000	1	0.000	1
120	0.999	0.999	0.000	1
118	0.000	0.97	0.001	1
117	1.000	1	0.000	1
114	0.999	0.999	0.000	1
113	0.000	0.967	0.001	1
111	0.999	0.999	0.000	1
110	100.000	0.121	1.203	1
108	0.999	0.999	0.000	1
107	0.999	0.999	0.000	1
105	94.288	0.507	0.220	1
103	0.000	0.966	0.001	1
100	0.413	0.543	0.185	1
99	0.999	0.999	0.000	1
96	100.000	0.511	0.216	1
95	0.999	0.999	0.000	1
136	0.439	0.533	0.194	1
138	0.000	0.972	0.001	1
139	1.000	1	0.000	1
140	1.000	1	0.000	1
169	1.122	0.925	0.004	1
168	1.781	0.491	0.237	1
167	0.999	0.999	0.000	1
166	1.000	1	0.000	1
165	1.000	1	0.000	1
164	1.138	0.928	0.004	1
163	1.000	1	0.000	1
162	0.000	0.966	0.001	1
161	100.000	0.255	0.647	1
160	0.999	0.999	0.000	1
159	0.999	0.999	0.000	1
94	0.999	0.999	0.000	1
157	100.000	0.502	0.226	1
155	100.000	0.092	1.420	1
154	2.215	0.453	0.281	1
152	0.591	0.713	0.067	1
150	88.091	0.293	0.552	1
149	0.448	0.539	0.188	1
148	0.658	0.769	0.043	1
146	0.000	0.963	0.001	1
145	100.000	0.514	0.213	1
143	1.525	0.71	0.069	1
142	0.999	0.999	0.000	1
141	100.000	0.198	0.830	1
156	99.063	0.222	0.745	1
170	94.970	0.434	0.306	1
92	1.000	1	0.000	1
90	0.486	0.582	0.151	1
38	0.000	0.969	0.001	1
35	0.000	0.965	0.001	1
33	0.000	0.967	0.001	1
32	0.999	0.999	0.000	1
31	0.999	0.999	0.000	1
26	0.000	0.967	0.001	1
24	0.000	0.97	0.001	1
23	0.999	0.999	0.000	1
22	0.999	0.999	0.000	1
21	0.000	0.961	0.001	1
20	0.999	0.999	0.000	1
19	0.000	0.961	0.001	1
17	0.000	0.967	0.001	1
16	0.000	0.966	0.001	1
15	0.403	0.532	0.195	1
14	0.000	0.965	0.001	1
13	0.999	0.999	0.000	1
12	0.563	0.655	0.100	1
10	100.000	0.518	0.209	1
7	1.000	1	0.000	1
6	0.571	0.582	0.151	1
3	100.000	0.312	0.511	1
2	0.724	0.789	0.036	1
41	0.000	0.965	0.001	1
42	0.999	0.999	0.000	1
43	0.000	0.965	0.001	1
45	1.000	0.999	0.000	1
89	100.000	0.307	0.522	1
85	0.460	0.591	0.144	1
84	0.000	0.96	0.001	1
82	100.000	0.509	0.219	1
81	0.999	0.999	0.000	1
79	0.000	0.963	0.001	1
77	0.547	0.674	0.088	1
76	1.000	1	0.000	1
74	1.000	0.999	0.000	1
73	100.000	0.201	0.817	1
72	0.301	0.415	0.333	1
91	0.000	0.972	0.001	1
70	100.000	0.307	0.521	1
66	1.000	1	0.000	1
65	0.999	0.999	0.000	1
63	100.000	0.513	0.214	1
62	0.000	0.963	0.001	1
59	0.816	0.875	0.012	1
56	0.000	0.96	0.001	1
53	0.999	0.999	0.000	1
52	0.452	0.543	0.185	1
51	96.500	0.254	0.652	1
47	0.000	0.967	0.001	1
46	0.472	0.602	0.136	1
67	0.999	0.999	0.000	1
343	0.999	0.999	0.000	1
172	1.929	0.585	0.149	1
175	0.378	0.504	0.223	1
292	0.646	0.759	0.047	1
290	0.999	0.999	0.000	1
288	100.000	0.281	0.581	1
287	31.758	0.928	0.004	1
285	95.673	0.522	0.205	1
563	0.999	0.999	0.000	1
281	0.999	0.999	0.000	1
280	0.999	0.999	0.000	1
278	0.000	0.972	0.001	1
276	100.000	0.189	0.862	1
273	0.000	0.968	0.001	1
272	1.000	1	0.000	1
271	0.000	0.966	0.001	1
269	0.999	0.999	0.000	1
268	1.624	0.67	0.091	1
264	0.000	0.961	0.001	1
263	1.000	1	0.000	1
260	100.000	0.422	0.322	1
259	0.000	0.966	0.001	1
258	0.000	0.969	0.001	1
257	0.999	0.999	0.000	1
256	0.000	0.961	0.001	1
255	0.000	0.961	0.001	1
293	0.000	0.969	0.001	1
295	0.999	0.999	0.000	1
296	0.000	0.965	0.001	1
298	0.582	0.702	0.073	1
339	0.390	0.514	0.213	1
338	1.000	1	0.000	1
337	0.999	0.999	0.000	1
336	0.551	0.678	0.086	1
335	0.000	0.967	0.001	1
333	1.000	1	0.000	1
332	0.000	0.963	0.001	1
331	0.000	0.965	0.001	1
330	0.533	0.661	0.096	1
329	0.000	0.964	0.001	1
326	0.000	0.96	0.001	1
254	100.000	0.499	0.229	1
324	0.000	0.968	0.001	1
317	0.000	0.969	0.001	1
316	0.000	0.963	0.001	1
315	0.000	0.961	0.001	1
314	0.000	0.965	0.001	1
313	0.616	0.735	0.057	1
311	0.999	0.999	0.000	1
310	100.000	0.534	0.194	1
308	1.000	1	0.000	1
302	0.000	0.967	0.001	1
301	0.000	0.961	0.001	1
299	0.000	0.963	0.001	1
323	0.000	0.97	0.001	1
174	0.999	0.999	0.000	1
252	0.421	0.549	0.180	1
247	0.999	0.999	0.000	1
203	0.999	0.999	0.000	1
202	0.767	0.771	0.042	1
201	0.638	0.754	0.049	1
200	100.000	0.589	0.146	1
199	0.000	0.967	0.001	1
196	0.999	0.999	0.000	1
195	0.000	0.97	0.001	1
194	98.886	0.357	0.424	1
192	1.000	1	0.000	1
189	1.000	1	0.000	1
188	0.999	0.999	0.000	1
187	0.000	0.96	0.001	1
186	0.000	0.96	0.001	1
185	0.708	0.735	0.057	1
184	0.591	0.685	0.082	1
183	0.514	0.489	0.240	1
182	0.000	0.967	0.001	1
181	0.472	0.602	0.136	1
180	0.999	0.999	0.000	1
179	1.000	1	0.000	1
178	0.783	0.771	0.042	1
177	100.000	0.227	0.729	1
176	1.000	1	0.000	1
204	0.783	0.803	0.031	1
205	100.000	0.362	0.416	1
206	100.000	0.204	0.806	1
209	95.619	0.323	0.489	1
246	1.000	1	0.000	1
245	0.999	0.999	0.000	1
241	0.000	0.962	0.001	1
239	85.751	0.183	0.887	1
237	100.000	0.0468	1.976	1
236	0.000	0.962	0.001	1
231	100.000	0.211	0.783	1
230	0.763	0.822	0.025	1
229	0.000	0.961	0.001	1
228	0.000	0.96	0.001	1
226	0.999	0.999	0.000	1
250	0.000	0.96	0.001	1
225	0.999	0.999	0.000	1
222	100.000	0.436	0.303	1
221	0.999	0.999	0.000	1
220	100.000	0.491	0.237	1
219	0.000	0.972	0.001	1
218	1.000	0.999	0.000	1
217	100.000	0.274	0.599	1
215	1.000	0.999	0.000	1
213	0.999	0.999	0.000	1
212	0.999	0.999	0.000	1
211	0.000	0.966	0.001	1
210	91.762	0.514	0.213	1
224	97.399	0.564	0.166	1
282	95.344	0.188	0.868	1