# Omega fit to each site after fixing tree and all other parameters.
# Fits compared to null model of omega = 1.
# P-values NOT corrected for multiple testing, so consider Q-values too.
# Q-values computed separately for omega > and < 1 # Will fit different synonymous rate for each site.
#
site	omega	P	dLnL	Q
55	0.000	0.00134	5.141	0.175
84	0.000	0.00993	3.324	0.197
85	0.000	0.00768	3.553	0.197
73	0.000	0.00651	3.701	0.197
72	0.000	0.00913	3.398	0.197
124	0.000	0.0106	3.267	0.197
129	0.000	0.00417	4.104	0.197
45	0.000	0.0185	2.775	0.218
78	0.000	0.0148	2.968	0.218
87	0.000	0.0183	2.781	0.218
10	0.000	0.0155	2.929	0.218
14	0.000	0.0224	2.608	0.219
123	0.000	0.0218	2.632	0.219
24	0.000	0.0236	2.561	0.219
94	0.000	0.0256	2.491	0.221
37	0.000	0.0272	2.439	0.221
47	0.000	0.0338	2.252	0.259
130	0.000	0.0416	2.075	0.301
88	0.000	0.0612	1.752	0.419
46	0.000	0.0999	1.353	0.426
44	0.000	0.0864	1.470	0.426
93	0.000	0.115	1.241	0.426
53	0.000	0.123	1.188	0.426
54	0.000	0.124	1.180	0.426
95	0.000	0.123	1.187	0.426
106	0.000	0.0748	1.588	0.426
89	0.000	0.113	1.259	0.426
48	0.000	0.111	1.268	0.426
111	0.000	0.0857	1.476	0.426
82	0.000	0.0761	1.573	0.426
29	0.000	0.118	1.223	0.426
119	0.000	0.116	1.233	0.426
30	0.000	0.124	1.180	0.426
22	0.000	0.12	1.206	0.426
118	0.000	0.0724	1.614	0.426
26	0.000	0.123	1.187	0.426
126	0.000	0.0888	1.448	0.426
25	0.000	0.114	1.245	0.426
74	0.000	0.128	1.155	0.428
17	0.000	0.134	1.121	0.436
75	0.000	0.138	1.102	0.436
49	0.000	0.15	1.036	0.443
3	0.000	0.149	1.040	0.443
28	0.000	0.149	1.040	0.443
67	0.000	0.16	0.986	0.459
102	0.181	0.162	0.976	0.459
38	0.000	0.194	0.842	0.506
56	0.000	0.183	0.885	0.506
58	0.000	0.195	0.841	0.506
8	0.000	0.188	0.865	0.506
122	0.000	0.971	0.001	1
127	0.453	0.551	0.178	1
121	0.000	0.965	0.001	1
125	0.000	0.964	0.001	1
90	0.000	0.965	0.001	1
120	0.999	0.999	0.000	1
91	0.000	0.965	0.001	1
92	0.000	0.966	0.001	1
128	0.000	0.96	0.001	1
86	0.000	0.961	0.001	1
117	0.000	0.963	0.001	1
97	0.000	0.967	0.001	1
110	0.000	0.969	0.001	1
109	100.000	0.384	0.379	1
108	0.000	0.969	0.001	1
107	0.000	0.962	0.001	1
112	0.000	0.96	0.001	1
105	100.000	0.783	0.038	1
83	0.000	0.966	0.001	1
96	0.000	0.96	0.001	1
103	0.954	0.97	0.001	1
113	0.000	0.965	0.001	1
114	0.000	0.962	0.001	1
100	0.419	0.552	0.177	1
99	0.000	0.963	0.001	1
98	1.382	0.79	0.035	1
115	0.000	0.962	0.001	1
116	0.000	0.96	0.001	1
101	0.948	0.964	0.001	1
104	0.999	0.999	0.000	1
1	0.000	0.957	0.001	1
80	0.000	0.962	0.001	1
34	100.000	0.329	0.476	1
33	0.000	0.967	0.001	1
32	0.000	0.957	0.001	1
31	0.956	0.972	0.001	1
27	0.000	0.964	0.001	1
23	0.000	0.966	0.001	1
21	0.000	0.964	0.001	1
20	0.000	0.971	0.001	1
19	0.000	0.965	0.001	1
18	100.000	0.451	0.284	1
16	0.000	0.96	0.001	1
15	0.000	0.966	0.001	1
13	0.000	0.957	0.001	1
12	0.000	0.971	0.001	1
11	0.000	0.962	0.001	1
9	0.000	0.969	0.001	1
7	0.000	0.965	0.001	1
6	0.000	0.966	0.001	1
5	0.000	0.962	0.001	1
4	0.000	0.971	0.001	1
2	0.000	0.964	0.001	1
35	0.000	0.962	0.001	1
81	0.000	0.962	0.001	1
36	0.000	0.967	0.001	1
40	0.000	0.967	0.001	1
79	1.000	0.999	0.000	1
77	100.000	0.234	0.707	1
76	100.000	0.497	0.231	1
71	0.000	0.966	0.001	1
70	0.000	0.964	0.001	1
69	0.000	0.969	0.001	1
68	0.000	0.969	0.001	1
66	0.000	0.957	0.001	1
64	0.000	0.962	0.001	1
63	0.000	0.96	0.001	1
62	0.000	0.966	0.001	1
61	1.427	0.805	0.030	1
60	0.000	0.961	0.001	1
59	0.000	0.964	0.001	1
57	0.000	0.967	0.001	1
52	100.000	0.466	0.266	1
51	0.000	0.96	0.001	1
50	100.000	0.518	0.209	1
43	0.000	0.957	0.001	1
42	0.000	0.971	0.001	1
41	0.000	0.967	0.001	1
39	0.000	0.966	0.001	1
65	0.388	0.521	0.206	1