# Omega fit to each site after fixing tree and all other parameters.
# Fits compared to null model of omega = 1.
# P-values NOT corrected for multiple testing, so consider Q-values too.
# Q-values computed separately for omega > and < 1 # Will fit different synonymous rate for each site.
#
site	omega	P	dLnL	Q
55	0.000	0.000541	5.985	0.0703
129	0.000	0.00196	4.794	0.127
85	0.000	0.00397	4.149	0.172
130	0.000	0.0217	2.637	0.217
14	0.000	0.027	2.445	0.217
24	0.000	0.0284	2.402	0.217
87	0.000	0.0212	2.654	0.217
72	0.000	0.0253	2.501	0.217
37	0.000	0.0213	2.652	0.217
10	0.000	0.0239	2.550	0.217
73	0.000	0.0086	3.452	0.217
124	0.000	0.0251	2.509	0.217
45	0.000	0.0194	2.733	0.217
84	0.000	0.0143	3.000	0.217
78	0.000	0.023	2.586	0.217
123	0.000	0.0257	2.488	0.217
94	0.000	0.02	2.705	0.217
47	0.000	0.0301	2.351	0.218
118	0.000	0.0446	2.016	0.305
106	0.000	0.0555	1.833	0.361
56	0.000	0.128	1.160	0.403
89	0.000	0.102	1.339	0.403
54	0.000	0.109	1.281	0.403
88	0.000	0.108	1.293	0.403
53	0.000	0.137	1.103	0.403
49	0.000	0.146	1.059	0.403
48	0.000	0.119	1.216	0.403
74	0.000	0.0988	1.363	0.403
46	0.000	0.111	1.272	0.403
75	0.000	0.108	1.291	0.403
44	0.000	0.0859	1.475	0.403
102	0.157	0.128	1.160	0.403
38	0.000	0.141	1.085	0.403
95	0.000	0.115	1.240	0.403
93	0.000	0.0991	1.360	0.403
82	0.000	0.0984	1.366	0.403
26	0.000	0.0938	1.404	0.403
17	0.000	0.121	1.200	0.403
3	0.000	0.118	1.225	0.403
126	0.000	0.11	1.279	0.403
22	0.000	0.0963	1.383	0.403
8	0.000	0.145	1.062	0.403
111	0.000	0.109	1.285	0.403
30	0.000	0.109	1.281	0.403
28	0.000	0.118	1.225	0.403
119	0.000	0.145	1.062	0.403
25	0.000	0.142	1.077	0.403
67	0.000	0.155	1.012	0.419
29	0.000	0.164	0.969	0.435
58	0.000	0.188	0.868	0.488
121	1.000	0.999	0.000	1
120	1.000	1	0.000	1
92	0.999	0.999	0.000	1
122	1.000	0.999	0.000	1
125	0.000	0.963	0.001	1
127	0.726	0.805	0.030	1
90	0.000	0.962	0.001	1
128	0.000	0.963	0.001	1
91	0.000	0.959	0.001	1
86	0.000	0.964	0.001	1
117	0.000	0.962	0.001	1
108	1.000	1	0.000	1
115	0.000	0.959	0.001	1
109	100.000	0.318	0.498	1
105	98.202	0.796	0.033	1
83	1.000	1	0.000	1
103	1.015	0.991	0.000	1
110	1.000	1	0.000	1
101	1.736	0.623	0.121	1
112	0.000	0.964	0.001	1
100	0.390	0.519	0.208	1
99	0.000	0.96	0.001	1
98	1.315	0.824	0.025	1
113	0.000	0.959	0.001	1
114	0.000	0.959	0.001	1
97	0.999	0.999	0.000	1
107	0.000	0.959	0.001	1
96	0.000	0.962	0.001	1
116	0.000	0.962	0.001	1
104	1.000	1	0.000	1
1	0.000	0.962	0.001	1
80	0.000	0.959	0.001	1
34	100.000	0.246	0.672	1
33	0.000	0.972	0.001	1
32	0.000	0.962	0.001	1
31	0.994	0.996	0.000	1
27	0.000	0.968	0.001	1
23	0.999	0.999	0.000	1
21	0.000	0.963	0.001	1
20	1.000	1	0.000	1
19	1.000	0.999	0.000	1
18	100.000	0.415	0.333	1
16	0.000	0.963	0.001	1
15	0.999	0.999	0.000	1
13	0.000	0.962	0.001	1
12	1.000	1	0.000	1
11	0.000	0.959	0.001	1
9	1.000	1	0.000	1
7	0.000	0.959	0.001	1
6	0.999	0.999	0.000	1
5	0.000	0.968	0.001	1
4	1.000	0.999	0.000	1
2	0.000	0.971	0.001	1
35	0.000	0.961	0.001	1
81	0.000	0.959	0.001	1
36	0.000	0.972	0.001	1
40	0.999	0.999	0.000	1
79	1.000	1	0.000	1
77	100.000	0.236	0.703	1
76	100.000	0.401	0.353	1
71	1.000	1	0.000	1
70	0.999	0.999	0.000	1
69	1.000	1	0.000	1
68	1.000	1	0.000	1
66	0.000	0.962	0.001	1
64	0.000	0.962	0.001	1
63	0.000	0.962	0.001	1
62	0.000	0.968	0.001	1
61	1.051	0.972	0.001	1
60	0.000	0.966	0.001	1
59	0.000	0.964	0.001	1
57	0.999	0.999	0.000	1
52	96.417	0.416	0.331	1
51	0.000	0.963	0.001	1
50	100.000	0.467	0.264	1
43	0.000	0.962	0.001	1
42	1.000	0.999	0.000	1
41	0.999	0.999	0.000	1
39	1.000	1	0.000	1
65	0.314	0.433	0.307	1