# Omega fit to each site after fixing tree and all other parameters.
# Fits compared to null model of omega = 1.
# P-values NOT corrected for multiple testing, so consider Q-values too.
# Q-values computed separately for omega > and < 1 # Will fit different synonymous rate for each site.
#
site	omega	P	dLnL	Q
98	0.000	2.52e-05	8.875	0.00336
233	0.000	2.56e-05	8.861	0.00336
87	0.017	0.000823	5.594	0.0541
135	0.000	0.000701	5.744	0.0541
158	0.000	0.0013	5.170	0.0572
216	0.000	0.0013	5.168	0.0572
232	0.000	0.00567	3.826	0.162
53	0.000	0.00573	3.817	0.162
146	0.000	0.00615	3.753	0.162
64	0.000	0.00616	3.751	0.162
241	0.083	0.0103	3.289	0.247
236	0.000	0.0113	3.207	0.248
134	0.000	0.0125	3.122	0.252
257	0.000	0.0178	2.807	0.314
162	0.000	0.0179	2.803	0.314
219	0.000	0.0197	2.718	0.324
78	0.000	0.0834	1.498	0.421
82	0.000	0.1	1.352	0.421
76	0.000	0.0552	1.838	0.421
132	0.000	0.0561	1.825	0.421
70	0.000	0.0466	1.980	0.421
222	0.000	0.0967	1.380	0.421
86	0.000	0.0661	1.689	0.421
225	0.000	0.0964	1.382	0.421
226	0.000	0.1	1.352	0.421
60	0.000	0.0552	1.838	0.421
56	0.000	0.0931	1.410	0.421
220	0.000	0.0833	1.500	0.421
65	0.000	0.0799	1.533	0.421
206	0.000	0.0841	1.492	0.421
97	0.000	0.0842	1.491	0.421
164	0.000	0.0869	1.466	0.421
169	0.000	0.0931	1.410	0.421
156	0.000	0.09	1.438	0.421
149	0.000	0.0663	1.686	0.421
147	0.000	0.0957	1.388	0.421
181	0.000	0.0799	1.533	0.421
182	0.000	0.0931	1.410	0.421
192	0.000	0.0974	1.374	0.421
123	0.000	0.0323	2.292	0.421
194	0.000	0.1	1.352	0.421
120	0.000	0.0654	1.697	0.421
119	0.000	0.101	1.346	0.421
118	0.000	0.101	1.346	0.421
116	0.000	0.0869	1.466	0.421
112	0.000	0.0931	1.410	0.421
109	0.000	0.0307	2.336	0.421
202	0.000	0.1	1.352	0.421
90	0.000	0.0561	1.825	0.421
52	0.000	0.0557	1.830	0.421
167	0.000	0.0664	1.685	0.421
229	0.000	0.0661	1.689	0.421
2	0.000	0.1	1.352	0.421
260	0.000	0.0841	1.492	0.421
255	0.000	0.0466	1.980	0.421
251	0.000	0.0796	1.536	0.421
247	0.000	0.0621	1.740	0.421
237	0.000	0.0559	1.828	0.421
235	0.000	0.0834	1.498	0.421
42	0.000	0.0663	1.686	0.421
23	0.000	0.0324	2.289	0.421
49	0.000	0.0847	1.486	0.421
44	0.077	0.086	1.474	0.421
234	0.000	0.12	1.207	0.427
93	0.000	0.132	1.135	0.427
207	0.000	0.14	1.088	0.427
26	0.000	0.146	1.056	0.427
100	0.000	0.14	1.088	0.427
200	0.000	0.151	1.031	0.427
51	0.000	0.152	1.024	0.427
20	0.000	0.135	1.117	0.427
19	0.000	0.12	1.209	0.427
124	0.000	0.126	1.168	0.427
125	0.000	0.14	1.088	0.427
191	0.000	0.12	1.206	0.427
55	0.000	0.12	1.207	0.427
256	0.000	0.135	1.117	0.427
178	0.000	0.105	1.312	0.427
153	0.000	0.128	1.160	0.427
174	0.000	0.151	1.031	0.427
54	0.000	0.143	1.073	0.427
5	0.000	0.154	1.015	0.427
170	0.000	0.127	1.162	0.427
261	0.064	0.14	1.088	0.427
91	0.000	0.114	1.251	0.427
29	0.000	0.135	1.117	0.427
198	0.000	0.106	1.306	0.427
224	0.000	0.154	1.015	0.427
58	0.000	0.113	1.258	0.427
243	0.000	0.143	1.072	0.427
32	0.000	0.151	1.031	0.427
40	0.000	0.128	1.160	0.427
31	0.104	0.114	1.251	0.427
68	0.000	0.119	1.217	0.427
66	0.000	0.146	1.056	0.427
81	0.000	0.169	0.948	0.462
190	0.187	0.171	0.938	0.463
165	0.000	0.215	0.769	0.571
77	0.000	0.215	0.769	0.571
168	0.000	0.24	0.690	0.631
253	0.198	0.274	0.599	0.713
111	0.165	0.283	0.577	0.729
262	0.167	0.287	0.566	0.734
22	0.157	0.293	0.554	0.74
102	0.162	0.3	0.538	0.75
138	0.181	0.31	0.516	0.768
113	0.244	0.313	0.508	0.77
133	0.196	0.33	0.474	0.804
143	0.199	0.335	0.465	0.807
105	0.206	0.353	0.432	0.843
209	0.215	0.357	0.424	0.846
3	0.249	0.404	0.348	0.94
172	0.249	0.404	0.348	0.94
8	0.275	0.426	0.317	0.983
94	0.291	0.434	0.306	0.993
185	0.000	0.954	0.002	1
186	0.000	0.949	0.002	1
184	100.000	0.669	0.091	1
183	0.885	0.956	0.002	1
238	100.000	0.0876	1.459	1
221	0.362	0.514	0.213	1
211	0.000	0.963	0.001	1
258	0.789	0.879	0.012	1
179	0.504	0.66	0.097	1
259	0.000	0.967	0.001	1
177	100.000	0.118	1.222	1
176	1.260	0.871	0.013	1
175	0.420	0.585	0.149	1
223	1.686	0.712	0.068	1
173	0.728	0.843	0.020	1
171	100.000	0.26	0.633	1
227	100.000	0.512	0.215	1
231	2.158	0.735	0.057	1
180	0.482	0.64	0.110	1
187	100.000	0.4	0.355	1
252	100.000	0.473	0.257	1
188	0.464	0.717	0.066	1
210	0.666	0.791	0.035	1
244	0.420	0.585	0.149	1
212	0.550	0.708	0.070	1
208	0.000	0.952	0.002	1
214	0.648	0.617	0.125	1
245	0.000	0.949	0.002	1
246	0.412	0.582	0.151	1
205	0.000	0.947	0.002	1
204	0.000	0.954	0.002	1
203	0.000	0.959	0.001	1
228	0.696	0.801	0.032	1
201	0.000	0.952	0.002	1
215	0.430	0.602	0.136	1
254	94.444	0.421	0.324	1
199	0.319	0.471	0.260	1
197	0.000	0.958	0.001	1
248	9.849	0.0106	3.268	1
196	0.725	0.874	0.013	1
240	0.396	0.682	0.084	1
249	100.000	0.345	0.446	1
195	0.422	0.77	0.043	1
250	0.267	0.458	0.276	1
230	0.340	0.491	0.237	1
217	1.404	0.832	0.022	1
218	100.000	0.189	0.862	1
193	0.000	0.963	0.001	1
239	100.000	0.18	0.899	1
189	0.000	0.952	0.002	1
242	0.365	0.6	0.137	1
213	28.644	0.0236	2.563	1
1	94.905	0.356	0.427	1
163	0.438	0.542	0.186	1
38	100.000	0.737	0.057	1
39	0.000	0.952	0.002	1
41	0.000	0.947	0.002	1
43	0.000	0.949	0.002	1
45	0.000	0.955	0.002	1
46	0.480	0.641	0.109	1
47	0.000	0.947	0.002	1
48	0.000	0.953	0.002	1
50	100.000	0.137	1.104	1
37	100.000	0.352	0.433	1
57	0.461	0.621	0.122	1
61	0.000	0.96	0.001	1
62	0.381	0.566	0.165	1
63	94.142	0.649	0.103	1
67	0.389	0.675	0.088	1
69	32.357	0.797	0.033	1
71	0.000	0.951	0.002	1
72	0.000	0.954	0.002	1
73	1.207	0.889	0.010	1
74	100.000	0.474	0.257	1
59	1.001	0.999	0.000	1
75	100.000	0.544	0.184	1
36	0.000	0.958	0.001	1
34	0.976	0.986	0.000	1
4	100.000	0.344	0.448	1
6	100.000	0.393	0.364	1
7	93.960	0.471	0.259	1
9	0.000	0.953	0.002	1
10	2.157	0.45	0.285	1
11	1.031	0.982	0.000	1
12	0.000	0.952	0.002	1
13	0.502	0.65	0.103	1
14	100.000	0.163	0.972	1
35	100.000	0.693	0.078	1
15	100.000	0.136	1.110	1
17	0.451	0.632	0.115	1
18	64.683	0.153	1.020	1
21	0.690	0.892	0.009	1
24	93.768	0.439	0.300	1
25	0.000	0.952	0.002	1
27	100.000	0.262	0.629	1
28	0.000	0.955	0.002	1
30	3.303	0.882	0.011	1
33	1.095	0.967	0.001	1
16	1.673	0.761	0.046	1
166	0.000	0.958	0.001	1
79	100.000	0.2	0.819	1
83	0.000	0.957	0.001	1
130	0.261	0.828	0.024	1
131	0.365	0.549	0.179	1
136	0.000	0.958	0.001	1
137	0.000	0.963	0.001	1
139	19.987	0.0329	2.276	1
140	100.000	0.77	0.043	1
141	97.775	0.508	0.219	1
142	100.000	0.347	0.443	1
144	0.000	0.967	0.001	1
129	100.000	0.599	0.138	1
145	100.000	0.518	0.209	1
150	100.000	0.221	0.748	1
151	0.000	0.952	0.002	1
152	0.422	0.685	0.082	1
154	0.000	0.952	0.002	1
155	0.000	0.958	0.001	1
157	20.522	0.319	0.497	1
159	0.628	0.775	0.041	1
160	1.118	0.954	0.002	1
161	100.000	0.88	0.011	1
148	0.292	0.461	0.272	1
80	0.000	0.954	0.002	1
128	100.000	0.471	0.260	1
126	99.626	0.553	0.176	1
84	0.532	0.794	0.034	1
85	0.000	0.952	0.002	1
88	0.000	0.963	0.001	1
89	0.330	0.479	0.250	1
92	0.000	0.949	0.002	1
95	0.467	0.752	0.050	1
96	0.000	0.952	0.002	1
99	0.976	0.986	0.000	1
101	0.000	0.96	0.001	1
127	0.000	0.962	0.001	1
103	0.000	0.958	0.001	1
106	0.000	0.952	0.002	1
107	0.000	0.951	0.002	1
108	0.420	0.585	0.149	1
110	0.000	0.96	0.001	1
114	0.000	0.967	0.001	1
115	0.338	0.486	0.242	1
117	100.000	0.252	0.656	1
121	1.742	0.696	0.076	1
122	0.362	0.523	0.203	1
104	0.000	0.949	0.002	1
263	0.000	0.954	0.002	1