# Omega fit to each site after fixing tree and all other parameters.
# Fits compared to null model of omega = 1.
# P-values NOT corrected for multiple testing, so consider Q-values too.
# Q-values computed separately for omega > and < 1 # Will fit different synonymous rate for each site.
#
site	omega	P	dLnL	Q
98	0.000	5.69e-06	10.294	0.0015
233	0.000	2.45e-05	8.901	0.00322
135	0.000	0.000364	6.355	0.0319
216	0.000	0.000952	5.460	0.0626
158	0.000	0.0028	4.467	0.123
87	0.024	0.00282	4.462	0.123
232	0.000	0.00458	4.019	0.155
53	0.000	0.00472	3.993	0.155
241	0.065	0.00538	3.873	0.157
236	0.000	0.0112	3.218	0.245
146	0.000	0.0104	3.281	0.245
64	0.000	0.00979	3.336	0.245
257	0.000	0.0137	3.036	0.278
219	0.000	0.0154	2.935	0.289
162	0.000	0.0191	2.748	0.334
134	0.000	0.0228	2.590	0.375
123	0.000	0.0256	2.492	0.396
222	0.000	0.102	1.341	0.398
225	0.000	0.0739	1.597	0.398
65	0.000	0.0814	1.518	0.398
66	0.000	0.105	1.314	0.398
58	0.000	0.102	1.339	0.398
192	0.000	0.102	1.333	0.398
68	0.000	0.104	1.324	0.398
60	0.000	0.0764	1.570	0.398
226	0.000	0.132	1.135	0.398
220	0.000	0.0833	1.500	0.398
224	0.000	0.124	1.185	0.398
132	0.000	0.0784	1.549	0.398
120	0.000	0.0735	1.601	0.398
206	0.000	0.0852	1.481	0.398
93	0.000	0.116	1.234	0.398
91	0.000	0.094	1.403	0.398
90	0.000	0.0784	1.549	0.398
202	0.000	0.0973	1.375	0.398
200	0.000	0.124	1.186	0.398
86	0.000	0.0637	1.719	0.398
198	0.000	0.0433	2.042	0.398
109	0.000	0.0282	2.407	0.398
164	0.000	0.0638	1.718	0.398
82	0.000	0.132	1.135	0.398
81	0.000	0.0875	1.460	0.398
112	0.000	0.0717	1.622	0.398
116	0.000	0.0638	1.718	0.398
78	0.000	0.107	1.297	0.398
194	0.000	0.132	1.135	0.398
76	0.000	0.0764	1.570	0.398
118	0.000	0.0944	1.399	0.398
56	0.000	0.0717	1.622	0.398
70	0.000	0.0481	1.952	0.398
119	0.000	0.0944	1.399	0.398
49	0.000	0.13	1.145	0.398
51	0.000	0.126	1.173	0.398
147	0.000	0.0823	1.510	0.398
149	0.000	0.0924	1.416	0.398
20	0.000	0.131	1.139	0.398
247	0.000	0.082	1.512	0.398
174	0.000	0.124	1.186	0.398
153	0.000	0.122	1.199	0.398
156	0.000	0.0741	1.595	0.398
251	0.000	0.0787	1.546	0.398
170	0.000	0.115	1.240	0.398
169	0.000	0.0717	1.622	0.398
255	0.000	0.0481	1.952	0.398
256	0.000	0.131	1.139	0.398
167	0.000	0.066	1.690	0.398
5	0.000	0.124	1.185	0.398
260	0.000	0.0852	1.481	0.398
261	0.054	0.105	1.317	0.398
2	0.000	0.132	1.135	0.398
52	0.000	0.0391	2.129	0.398
178	0.000	0.0433	2.041	0.398
23	0.000	0.0557	1.830	0.398
42	0.000	0.0924	1.416	0.398
124	0.000	0.113	1.256	0.398
229	0.000	0.0637	1.719	0.398
44	0.074	0.0846	1.488	0.398
26	0.000	0.105	1.314	0.398
40	0.000	0.122	1.199	0.398
235	0.000	0.107	1.297	0.398
97	0.000	0.0577	1.801	0.398
182	0.000	0.0717	1.622	0.398
32	0.000	0.124	1.186	0.398
31	0.085	0.0849	1.485	0.398
29	0.000	0.131	1.139	0.398
181	0.000	0.0814	1.518	0.398
237	0.000	0.0462	1.987	0.398
125	0.000	0.144	1.069	0.414
100	0.000	0.144	1.069	0.414
207	0.000	0.144	1.069	0.414
54	0.000	0.141	1.082	0.414
243	0.000	0.145	1.063	0.414
234	0.000	0.158	0.996	0.433
19	0.000	0.154	1.014	0.433
191	0.000	0.157	1.001	0.433
55	0.000	0.158	0.996	0.433
190	0.192	0.176	0.917	0.477
165	0.000	0.18	0.901	0.477
77	0.000	0.18	0.901	0.477
168	0.000	0.198	0.828	0.521
113	0.188	0.239	0.693	0.623
253	0.200	0.283	0.576	0.73
105	0.171	0.292	0.554	0.747
22	0.162	0.301	0.536	0.76
111	0.198	0.336	0.462	0.842
102	0.192	0.358	0.422	0.889
209	0.217	0.366	0.409	0.9
262	0.234	0.392	0.366	0.955
89	0.265	0.397	0.359	0.958
131	0.261	0.41	0.340	0.979
133	0.257	0.421	0.324	0.997
258	0.542	0.702	0.073	1
183	1.119	0.962	0.001	1
240	0.507	0.807	0.030	1
242	0.305	0.5	0.227	1
180	0.442	0.604	0.135	1
179	0.449	0.61	0.130	1
244	0.386	0.553	0.176	1
177	100.000	0.103	1.330	1
245	0.000	0.946	0.002	1
166	0.000	0.959	0.001	1
176	1.096	0.949	0.002	1
246	0.498	0.665	0.094	1
175	0.386	0.553	0.176	1
248	10.466	0.00909	3.402	1
173	0.697	0.828	0.023	1
184	99.246	0.643	0.108	1
249	100.000	0.29	0.559	1
172	0.303	0.482	0.247	1
171	100.000	0.293	0.553	1
259	0.000	0.961	0.001	1
250	0.265	0.494	0.234	1
252	100.000	0.494	0.234	1
254	94.761	0.465	0.267	1
185	0.000	0.964	0.001	1
204	0.000	0.964	0.001	1
239	94.750	0.233	0.711	1
208	0.000	0.953	0.002	1
203	0.000	0.954	0.002	1
201	0.000	0.957	0.001	1
199	0.321	0.466	0.265	1
210	0.453	0.62	0.123	1
211	0.000	0.962	0.001	1
197	0.000	0.959	0.001	1
213	29.318	0.0242	2.539	1
196	0.562	0.771	0.043	1
195	0.307	0.609	0.131	1
214	0.681	0.659	0.097	1
215	0.375	0.544	0.184	1
186	0.000	0.946	0.002	1
217	0.929	0.963	0.001	1
193	0.000	0.962	0.001	1
221	0.436	0.597	0.140	1
223	1.576	0.745	0.053	1
227	100.000	0.446	0.291	1
228	0.762	0.85	0.018	1
230	0.407	0.572	0.159	1
231	1.201	0.934	0.003	1
189	0.000	0.953	0.002	1
188	0.514	0.765	0.045	1
187	89.745	0.398	0.358	1
205	0.000	0.963	0.001	1
238	100.000	0.128	1.156	1
218	100.000	0.228	0.726	1
212	0.555	0.712	0.068	1
1	92.297	0.352	0.433	1
161	95.977	0.873	0.013	1
37	95.794	0.346	0.444	1
38	96.817	0.639	0.110	1
39	0.000	0.955	0.002	1
41	0.000	0.963	0.001	1
43	0.000	0.946	0.002	1
45	0.000	0.953	0.002	1
46	0.424	0.587	0.148	1
47	0.000	0.963	0.001	1
48	0.000	0.958	0.001	1
36	0.000	0.959	0.001	1
50	100.000	0.161	0.983	1
59	4.391	0.564	0.166	1
61	0.000	0.953	0.002	1
62	0.310	0.476	0.254	1
63	100.000	0.581	0.153	1
67	0.419	0.705	0.072	1
69	1.964	0.893	0.009	1
71	0.000	0.953	0.002	1
72	0.000	0.966	0.001	1
73	1.001	1	0.000	1
57	0.291	0.437	0.302	1
35	1.561	0.882	0.011	1
34	0.984	0.991	0.000	1
33	1.056	0.981	0.000	1
3	0.303	0.482	0.247	1
4	100.000	0.38	0.386	1
6	100.000	0.389	0.370	1
7	100.000	0.408	0.343	1
8	0.411	0.588	0.146	1
9	0.000	0.958	0.001	1
10	2.631	0.336	0.463	1
11	1.089	0.951	0.002	1
12	0.000	0.955	0.002	1
13	0.582	0.721	0.064	1
14	100.000	0.202	0.813	1
15	100.000	0.185	0.878	1
16	1.307	0.873	0.013	1
17	0.493	0.671	0.090	1
18	88.918	0.153	1.021	1
21	0.540	0.829	0.023	1
24	100.000	0.492	0.236	1
25	0.000	0.953	0.002	1
27	100.000	0.261	0.632	1
28	0.000	0.953	0.002	1
30	1.130	0.98	0.000	1
74	95.564	0.534	0.193	1
163	0.397	0.506	0.222	1
75	93.885	0.502	0.226	1
80	0.000	0.96	0.001	1
130	0.210	0.782	0.038	1
136	0.000	0.959	0.001	1
137	0.000	0.964	0.001	1
138	0.265	0.438	0.301	1
139	29.976	0.0339	2.251	1
140	100.000	0.77	0.043	1
141	100.000	0.398	0.357	1
142	100.000	0.378	0.388	1
143	0.268	0.444	0.293	1
129	100.000	0.6	0.137	1
144	0.000	0.961	0.001	1
148	0.330	0.507	0.220	1
150	100.000	0.224	0.740	1
151	0.000	0.947	0.002	1
152	0.457	0.716	0.066	1
154	0.000	0.947	0.002	1
155	0.000	0.955	0.002	1
157	7.646	0.429	0.313	1
159	0.753	0.852	0.017	1
160	1.162	0.933	0.004	1
145	93.796	0.467	0.265	1
128	100.000	0.475	0.255	1
127	0.000	0.966	0.001	1
126	100.000	0.541	0.187	1
83	0.000	0.953	0.002	1
84	0.436	0.709	0.070	1
85	0.000	0.955	0.002	1
88	0.000	0.964	0.001	1
92	0.000	0.946	0.002	1
94	0.445	0.618	0.124	1
95	0.401	0.709	0.070	1
96	0.000	0.955	0.002	1
99	0.984	0.991	0.000	1
101	0.000	0.953	0.002	1
103	0.000	0.955	0.002	1
104	0.000	0.946	0.002	1
106	0.000	0.953	0.002	1
107	0.000	0.95	0.002	1
108	0.386	0.553	0.176	1
110	0.000	0.953	0.002	1
114	0.000	0.961	0.001	1
115	0.319	0.469	0.262	1
117	100.000	0.234	0.707	1
121	1.804	0.68	0.085	1
122	0.374	0.538	0.190	1
79	100.000	0.197	0.831	1
263	0.000	0.964	0.001	1