# Omega fit to each site after fixing tree and all other parameters.
# Fits compared to null model of omega = 1.
# P-values NOT corrected for multiple testing, so consider Q-values too.
# Q-values computed separately for omega > and < 1 # Will fit different synonymous rate for each site.
#
site	omega	P	dLnL	Q
429	0.000	0.00132	5.154	0.198
378	0.000	0.00122	5.228	0.198
309	0.000	0.00133	5.151	0.198
452	0.000	0.00141	5.099	0.198
307	0.000	0.0023	4.645	0.217
459	0.000	0.00199	4.778	0.217
147	0.000	0.00582	3.802	0.321
294	0.000	0.00717	3.615	0.321
500	0.000	0.00914	3.398	0.321
37	0.000	0.0043	4.077	0.321
379	0.000	0.0051	3.922	0.321
115	0.000	0.0083	3.484	0.321
304	0.000	0.00778	3.542	0.321
277	0.000	0.0077	3.551	0.321
58	0.000	0.00969	3.346	0.321
190	0.000	0.00771	3.550	0.321
122	0.000	0.00855	3.457	0.321
39	0.000	0.0142	3.009	0.326
538	0.000	0.0129	3.091	0.326
366	0.000	0.0168	2.860	0.326
425	0.000	0.0162	2.892	0.326
232	0.000	0.0157	2.916	0.326
27	0.000	0.0149	2.963	0.326
549	0.000	0.0123	3.131	0.326
101	0.095	0.0161	2.895	0.326
509	0.000	0.0106	3.263	0.326
321	0.000	0.0163	2.884	0.326
270	0.000	0.016	2.899	0.326
54	0.000	0.0142	3.006	0.326
371	0.000	0.0186	2.768	0.35
104	0.000	0.0216	2.639	0.366
55	0.000	0.0258	2.485	0.366
375	0.000	0.0251	2.510	0.366
235	0.000	0.0258	2.484	0.366
524	0.000	0.025	2.514	0.366
216	0.000	0.0231	2.581	0.366
251	0.000	0.0233	2.572	0.366
362	0.000	0.0232	2.576	0.366
261	0.000	0.0221	2.619	0.366
472	0.000	0.026	2.478	0.366
135	0.000	0.0288	2.389	0.369
240	0.000	0.0293	2.375	0.369
418	0.000	0.0269	2.450	0.369
334	0.000	0.0285	2.400	0.369
64	0.000	0.0294	2.371	0.369
109	0.000	0.0335	2.260	0.402
554	0.000	0.0329	2.276	0.402
25	0.000	0.0378	2.158	0.428
494	0.000	0.0371	2.173	0.428
238	0.000	0.0379	2.154	0.428
125	0.000	0.0392	2.127	0.433
305	0.000	0.0412	2.084	0.442
468	0.000	0.0415	2.078	0.442
233	0.000	0.108	1.293	0.448
392	0.000	0.0895	1.442	0.448
234	0.000	0.0911	1.428	0.448
495	0.000	0.0953	1.391	0.448
116	0.000	0.0861	1.473	0.448
112	0.144	0.0677	1.668	0.448
408	0.000	0.0452	2.006	0.448
407	0.000	0.106	1.305	0.448
501	0.000	0.0941	1.402	0.448
106	0.000	0.062	1.742	0.448
502	0.000	0.0983	1.366	0.448
492	0.000	0.0864	1.470	0.448
497	0.000	0.105	1.313	0.448
133	0.000	0.0906	1.432	0.448
127	0.000	0.0858	1.476	0.448
451	0.000	0.0562	1.822	0.448
171	0.000	0.11	1.277	0.448
456	0.000	0.0703	1.638	0.448
193	0.000	0.0947	1.397	0.448
439	0.000	0.0773	1.561	0.448
437	0.000	0.0739	1.597	0.448
463	0.000	0.0957	1.388	0.448
432	0.000	0.0687	1.656	0.448
158	0.000	0.0619	1.743	0.448
430	0.000	0.0672	1.675	0.448
470	0.000	0.0698	1.643	0.448
153	0.000	0.0586	1.788	0.448
151	0.000	0.0799	1.534	0.448
473	0.000	0.104	1.319	0.448
207	0.000	0.0897	1.439	0.448
476	0.000	0.0983	1.367	0.448
424	0.000	0.101	1.348	0.448
423	0.000	0.074	1.596	0.448
481	0.000	0.0938	1.404	0.448
483	0.000	0.102	1.336	0.448
137	0.167	0.0566	1.818	0.448
416	0.000	0.0773	1.561	0.448
415	0.000	0.0466	1.980	0.448
227	0.000	0.0906	1.432	0.448
130	0.000	0.0904	1.433	0.448
129	0.000	0.0946	1.397	0.448
411	0.000	0.0853	1.480	0.448
409	0.000	0.106	1.304	0.448
244	0.000	0.109	1.286	0.448
453	0.000	0.0663	1.686	0.448
97	0.000	0.0792	1.540	0.448
60	0.000	0.0767	1.567	0.448
297	0.000	0.108	1.291	0.448
300	0.000	0.108	1.290	0.448
370	0.000	0.0735	1.601	0.448
303	0.000	0.0602	1.765	0.448
44	0.000	0.0863	1.471	0.448
306	0.000	0.096	1.385	0.448
368	0.000	0.066	1.690	0.448
367	0.000	0.0666	1.683	0.448
312	0.000	0.097	1.377	0.448
61	0.000	0.095	1.393	0.448
30	0.000	0.0733	1.604	0.448
318	0.000	0.0707	1.634	0.448
319	0.000	0.0972	1.375	0.448
550	0.000	0.0905	1.433	0.448
553	0.000	0.0624	1.737	0.448
358	0.000	0.105	1.315	0.448
328	0.138	0.064	1.715	0.448
9	0.000	0.0628	1.730	0.448
560	0.000	0.0708	1.632	0.448
346	0.000	0.0862	1.472	0.448
342	0.000	0.0877	1.458	0.448
28	0.000	0.0456	1.999	0.448
291	0.000	0.069	1.653	0.448
369	0.000	0.0496	1.927	0.448
83	0.000	0.0809	1.523	0.448
284	0.000	0.0901	1.436	0.448
262	0.000	0.0652	1.700	0.448
274	0.000	0.0915	1.424	0.448
80	0.000	0.0949	1.394	0.448
518	0.000	0.048	1.955	0.448
512	0.000	0.11	1.279	0.448
519	0.000	0.095	1.394	0.448
266	0.000	0.101	1.348	0.448
279	0.000	0.109	1.287	0.448
75	0.000	0.11	1.275	0.448
395	0.000	0.0837	1.495	0.448
71	0.000	0.0757	1.577	0.448
253	0.000	0.0675	1.671	0.448
382	0.000	0.0794	1.539	0.448
275	0.000	0.113	1.257	0.449
173	0.000	0.113	1.255	0.449
388	0.149	0.113	1.255	0.449
69	0.000	0.115	1.245	0.452
422	0.000	0.115	1.239	0.452
347	0.000	0.126	1.170	0.459
435	0.000	0.13	1.149	0.459
355	0.000	0.13	1.148	0.459
467	0.000	0.132	1.135	0.459
243	0.159	0.125	1.174	0.459
464	0.000	0.119	1.217	0.459
360	0.218	0.132	1.136	0.459
398	0.000	0.127	1.167	0.459
322	0.000	0.131	1.139	0.459
564	0.000	0.132	1.135	0.459
119	0.000	0.128	1.160	0.459
320	0.000	0.127	1.162	0.459
477	0.157	0.123	1.190	0.459
34	0.000	0.13	1.148	0.459
384	0.000	0.131	1.138	0.459
18	0.000	0.13	1.148	0.459
534	0.000	0.122	1.195	0.459
50	0.000	0.121	1.205	0.459
374	0.000	0.136	1.114	0.466
11	0.167	0.135	1.114	0.466
197	0.000	0.138	1.099	0.473
389	0.000	0.144	1.070	0.482
29	0.000	0.142	1.078	0.482
354	0.000	0.143	1.070	0.482
485	0.000	0.145	1.060	0.485
440	0.000	0.147	1.053	0.487
265	0.000	0.148	1.046	0.488
341	0.000	0.151	1.030	0.49
506	0.178	0.15	1.035	0.49
57	0.000	0.152	1.026	0.49
49	0.000	0.152	1.025	0.49
283	0.000	0.156	1.008	0.491
455	0.000	0.157	1.003	0.491
36	0.000	0.156	1.006	0.491
93	0.000	0.156	1.007	0.491
505	0.000	0.153	1.020	0.491
4	0.000	0.161	0.981	0.501
372	0.000	0.162	0.979	0.501
40	0.000	0.163	0.973	0.502
344	0.000	0.164	0.970	0.502
223	0.198	0.175	0.920	0.533
242	0.242	0.179	0.902	0.542
559	0.000	0.181	0.896	0.542
249	0.000	0.181	0.896	0.542
475	0.131	0.188	0.867	0.561
248	0.000	0.19	0.859	0.561
5	0.000	0.19	0.860	0.561
198	0.213	0.194	0.845	0.569
102	0.227	0.213	0.775	0.623
214	0.236	0.223	0.742	0.649
88	0.239	0.229	0.724	0.662
286	0.332	0.23	0.720	0.662
267	0.183	0.232	0.714	0.664
78	0.000	0.254	0.651	0.723
87	0.309	0.26	0.635	0.737
510	0.000	0.262	0.628	0.74
8	0.000	0.265	0.620	0.745
327	0.000	0.279	0.586	0.779
558	0.000	0.297	0.545	0.824
68	0.000	0.3	0.536	0.83
441	0.000	0.303	0.530	0.83
443	0.000	0.302	0.533	0.83
520	0.000	0.305	0.526	0.831
144	0.347	0.313	0.510	0.847
542	0.000	0.32	0.494	0.865
48	0.000	0.328	0.478	0.873
191	0.000	0.327	0.480	0.873
15	0.231	0.325	0.483	0.873
183	0.405	0.353	0.431	0.936
86	0.000	0.357	0.424	0.941
539	0.000	0.371	0.401	0.965
460	0.000	0.37	0.402	0.965
444	0.000	0.371	0.400	0.965
175	0.272	0.379	0.388	0.979
289	0.274	0.384	0.379	0.988
377	0.000	0.967	0.001	1
528	0.000	0.97	0.001	1
376	0.000	0.972	0.001	1
561	0.000	0.966	0.001	1
381	0.000	0.969	0.001	1
526	0.000	0.972	0.001	1
380	0.999	0.999	0.000	1
525	0.000	0.968	0.001	1
562	0.000	0.966	0.001	1
529	1.000	1	0.000	1
523	0.000	0.961	0.001	1
383	0.000	0.97	0.001	1
522	0.999	0.999	0.000	1
521	0.000	0.967	0.001	1
385	100.000	0.498	0.229	1
527	0.751	0.841	0.020	1
530	0.000	0.967	0.001	1
349	0.000	0.967	0.001	1
373	0.000	0.967	0.001	1
350	0.000	0.965	0.001	1
351	0.000	0.968	0.001	1
352	0.000	0.97	0.001	1
353	0.000	0.967	0.001	1
356	1.000	0.999	0.000	1
557	0.999	0.999	0.000	1
357	0.000	0.969	0.001	1
556	0.000	0.966	0.001	1
359	0.000	0.961	0.001	1
555	0.000	0.969	0.001	1
552	0.000	0.961	0.001	1
551	1.000	0.999	0.000	1
548	0.000	0.97	0.001	1
547	0.000	0.967	0.001	1
361	0.000	0.964	0.001	1
546	0.000	0.966	0.001	1
363	1.000	0.999	0.000	1
532	0.999	0.999	0.000	1
533	0.999	0.999	0.000	1
535	0.000	0.968	0.001	1
536	0.000	0.967	0.001	1
537	0.000	0.965	0.001	1
348	0.000	0.97	0.001	1
531	0.000	0.97	0.001	1
540	0.872	0.912	0.006	1
517	0.000	0.967	0.001	1
543	0.000	0.968	0.001	1
544	0.999	0.999	0.000	1
545	1.000	1	0.000	1
365	0.000	0.965	0.001	1
364	0.000	0.972	0.001	1
541	0.999	0.999	0.000	1
386	0.000	0.967	0.001	1
454	0.000	0.964	0.001	1
516	0.000	0.964	0.001	1
431	1.641	0.729	0.060	1
469	0.473	0.603	0.135	1
471	0.000	0.969	0.001	1
474	0.000	0.967	0.001	1
428	0.000	0.964	0.001	1
427	0.000	0.964	0.001	1
466	100.000	0.144	1.069	1
426	0.000	0.968	0.001	1
479	0.000	0.966	0.001	1
480	0.000	0.968	0.001	1
421	0.332	0.451	0.284	1
420	0.000	0.967	0.001	1
419	0.000	0.961	0.001	1
482	0.000	0.968	0.001	1
478	0.000	0.966	0.001	1
417	100.000	0.286	0.568	1
433	0.000	0.97	0.001	1
465	100.000	0.445	0.291	1
450	1.000	1	0.000	1
449	0.000	0.969	0.001	1
448	0.000	0.965	0.001	1
447	100.000	0.469	0.263	1
446	0.000	0.969	0.001	1
445	0.000	0.967	0.001	1
434	1.000	0.999	0.000	1
442	0.000	0.968	0.001	1
457	0.000	0.968	0.001	1
458	0.000	0.969	0.001	1
438	0.000	0.967	0.001	1
461	0.000	0.972	0.001	1
462	0.000	0.967	0.001	1
436	0.000	0.972	0.001	1
345	0.000	0.968	0.001	1
484	0.000	0.967	0.001	1
486	0.000	0.966	0.001	1
414	0.000	0.969	0.001	1
401	0.000	0.961	0.001	1
507	0.000	0.967	0.001	1
400	0.000	0.969	0.001	1
508	0.999	0.999	0.000	1
399	0.000	0.967	0.001	1
397	0.563	0.548	0.181	1
402	0.000	0.969	0.001	1
396	0.999	0.999	0.000	1
393	0.000	0.969	0.001	1
513	0.698	0.777	0.040	1
391	0.000	0.97	0.001	1
390	0.000	0.97	0.001	1
514	0.319	0.436	0.303	1
515	0.000	0.97	0.001	1
394	0.000	0.968	0.001	1
403	0.000	0.969	0.001	1
404	0.999	0.999	0.000	1
504	0.000	0.972	0.001	1
413	0.000	0.969	0.001	1
487	91.526	0.459	0.274	1
412	0.000	0.968	0.001	1
488	100.000	0.505	0.222	1
410	0.000	0.969	0.001	1
489	0.000	0.967	0.001	1
490	0.000	0.966	0.001	1
491	0.000	0.961	0.001	1
493	0.000	0.965	0.001	1
496	0.000	0.969	0.001	1
498	0.000	0.969	0.001	1
499	0.000	0.972	0.001	1
503	0.292	0.401	0.352	1
406	0.000	0.97	0.001	1
405	0.000	0.968	0.001	1
387	0.000	0.97	0.001	1
511	0.000	0.969	0.001	1
1	0.000	0.969	0.001	1
340	0.999	0.999	0.000	1
134	0.000	0.965	0.001	1
132	0.000	0.966	0.001	1
131	0.000	0.967	0.001	1
128	0.000	0.967	0.001	1
126	0.999	0.999	0.000	1
124	0.000	0.968	0.001	1
123	0.999	0.999	0.000	1
121	1.000	1	0.000	1
120	0.999	0.999	0.000	1
118	0.000	0.965	0.001	1
117	1.000	1	0.000	1
114	0.000	0.972	0.001	1
113	0.000	0.964	0.001	1
111	0.000	0.968	0.001	1
110	100.000	0.216	0.765	1
108	0.000	0.965	0.001	1
107	0.999	0.999	0.000	1
105	100.000	0.384	0.379	1
103	0.000	0.969	0.001	1
100	0.316	0.432	0.309	1
99	0.000	0.965	0.001	1
98	0.455	0.586	0.148	1
96	100.000	0.41	0.339	1
136	0.525	0.62	0.123	1
138	0.999	0.999	0.000	1
139	1.000	0.999	0.000	1
140	0.000	0.965	0.001	1
169	0.957	0.972	0.001	1
168	1.200	0.831	0.023	1
167	0.000	0.97	0.001	1
166	1.000	1	0.000	1
165	1.000	0.999	0.000	1
164	1.301	0.854	0.017	1
163	1.000	1	0.000	1
162	0.000	0.969	0.001	1
161	100.000	0.169	0.946	1
160	0.999	0.999	0.000	1
159	0.000	0.968	0.001	1
95	0.000	0.97	0.001	1
157	97.294	0.483	0.245	1
155	92.338	0.108	1.292	1
154	1.690	0.629	0.117	1
152	0.575	0.699	0.075	1
150	100.000	0.19	0.860	1
149	0.787	0.849	0.018	1
148	0.687	0.793	0.035	1
146	0.000	0.967	0.001	1
145	100.000	0.383	0.381	1
143	1.066	0.955	0.002	1
142	0.000	0.967	0.001	1
141	100.000	0.209	0.790	1
156	100.000	0.185	0.877	1
170	100.000	0.503	0.224	1
94	0.999	0.999	0.000	1
91	0.999	0.999	0.000	1
41	0.000	0.97	0.001	1
38	0.000	0.969	0.001	1
35	0.000	0.968	0.001	1
33	0.000	0.964	0.001	1
32	0.000	0.968	0.001	1
31	0.000	0.969	0.001	1
26	0.000	0.969	0.001	1
24	0.000	0.967	0.001	1
23	0.999	0.999	0.000	1
22	0.000	0.965	0.001	1
21	0.000	0.966	0.001	1
20	0.000	0.966	0.001	1
19	0.000	0.966	0.001	1
17	0.000	0.964	0.001	1
16	0.000	0.967	0.001	1
14	0.000	0.97	0.001	1
13	0.000	0.967	0.001	1
12	1.016	0.99	0.000	1
10	93.201	0.405	0.346	1
7	1.000	1	0.000	1
6	0.460	0.447	0.289	1
3	100.000	0.27	0.609	1
2	1.229	0.858	0.016	1
42	0.000	0.968	0.001	1
43	0.000	0.97	0.001	1
45	0.999	0.999	0.000	1
46	0.438	0.567	0.164	1
90	0.630	0.719	0.065	1
89	100.000	0.391	0.368	1
85	0.741	0.834	0.022	1
84	0.000	0.967	0.001	1
82	100.000	0.469	0.262	1
81	0.000	0.965	0.001	1
79	0.000	0.967	0.001	1
77	0.476	0.606	0.133	1
76	1.000	0.999	0.000	1
74	0.000	0.967	0.001	1
73	100.000	0.245	0.676	1
92	1.000	0.999	0.000	1
72	0.291	0.401	0.353	1
67	0.999	0.999	0.000	1
66	1.000	1	0.000	1
65	0.000	0.965	0.001	1
63	98.651	0.457	0.276	1
62	0.000	0.967	0.001	1
59	1.365	0.807	0.030	1
56	0.000	0.969	0.001	1
53	0.000	0.967	0.001	1
52	0.456	0.549	0.180	1
51	93.379	0.339	0.456	1
47	0.000	0.969	0.001	1
70	100.000	0.332	0.470	1
343	0.000	0.965	0.001	1
172	2.183	0.515	0.212	1
176	1.000	1	0.000	1
293	0.000	0.969	0.001	1
292	0.575	0.699	0.075	1
290	0.000	0.966	0.001	1
288	100.000	0.379	0.387	1
287	68.220	0.898	0.008	1
285	100.000	0.413	0.335	1
563	0.000	0.966	0.001	1
281	0.000	0.97	0.001	1
280	0.000	0.97	0.001	1
278	0.999	0.999	0.000	1
276	100.000	0.221	0.749	1
273	0.000	0.965	0.001	1
272	1.000	1	0.000	1
271	0.000	0.967	0.001	1
269	0.000	0.967	0.001	1
268	0.960	0.972	0.001	1
264	0.000	0.966	0.001	1
263	1.000	1	0.000	1
260	100.000	0.485	0.244	1
259	0.000	0.967	0.001	1
258	0.000	0.967	0.001	1
257	0.000	0.968	0.001	1
256	0.000	0.966	0.001	1
295	0.999	0.999	0.000	1
296	0.000	0.97	0.001	1
298	0.569	0.692	0.079	1
299	0.000	0.967	0.001	1
339	0.300	0.407	0.344	1
338	0.999	0.999	0.000	1
337	0.000	0.965	0.001	1
336	0.476	0.606	0.133	1
335	0.000	0.969	0.001	1
333	1.000	1	0.000	1
332	0.000	0.967	0.001	1
331	0.000	0.97	0.001	1
330	0.405	0.532	0.196	1
329	0.000	0.961	0.001	1
326	0.000	0.969	0.001	1
255	0.000	0.966	0.001	1
325	0.417	0.548	0.181	1
323	0.000	0.965	0.001	1
317	0.000	0.967	0.001	1
316	0.000	0.967	0.001	1
315	0.000	0.966	0.001	1
314	0.000	0.97	0.001	1
313	0.483	0.613	0.128	1
311	0.000	0.967	0.001	1
310	100.000	0.455	0.279	1
308	0.999	0.999	0.000	1
302	0.000	0.969	0.001	1
301	0.000	0.966	0.001	1
324	0.000	0.965	0.001	1
174	0.000	0.965	0.001	1
254	92.892	0.38	0.385	1
250	0.000	0.967	0.001	1
205	100.000	0.377	0.391	1
204	0.638	0.647	0.105	1
203	0.999	0.999	0.000	1
202	0.484	0.436	0.303	1
201	0.483	0.613	0.128	1
200	95.634	0.555	0.174	1
199	0.000	0.969	0.001	1
196	0.000	0.967	0.001	1
195	0.000	0.967	0.001	1
194	100.000	0.41	0.339	1
192	1.000	0.999	0.000	1
189	0.999	0.999	0.000	1
188	0.000	0.968	0.001	1
187	0.000	0.967	0.001	1
186	0.000	0.969	0.001	1
185	0.464	0.455	0.279	1
184	0.681	0.765	0.045	1
182	0.000	0.969	0.001	1
181	0.514	0.644	0.107	1
180	0.000	0.972	0.001	1
179	0.999	0.999	0.000	1
178	0.499	0.415	0.333	1
177	100.000	0.206	0.800	1
206	94.729	0.185	0.880	1
208	0.369	0.493	0.236	1
209	100.000	0.235	0.705	1
210	100.000	0.483	0.246	1
247	0.000	0.969	0.001	1
246	1.000	0.999	0.000	1
245	0.999	0.999	0.000	1
241	0.000	0.966	0.001	1
239	89.592	0.125	1.180	1
237	100.000	0.0794	1.538	1
236	0.000	0.966	0.001	1
231	100.000	0.176	0.914	1
230	1.209	0.87	0.013	1
229	0.000	0.966	0.001	1
228	0.000	0.967	0.001	1
252	0.477	0.607	0.132	1
226	0.000	0.969	0.001	1
224	100.000	0.455	0.280	1
222	100.000	0.465	0.267	1
221	0.000	0.972	0.001	1
220	97.924	0.512	0.215	1
219	0.999	0.999	0.000	1
218	0.999	0.999	0.000	1
217	100.000	0.322	0.490	1
215	0.999	0.999	0.000	1
213	0.000	0.972	0.001	1
212	0.000	0.967	0.001	1
211	0.000	0.969	0.001	1
225	0.000	0.968	0.001	1
282	98.900	0.197	0.834	1