# Omega fit to each site after fixing tree and all other parameters.
# Fits compared to null model of omega = 1.
# P-values NOT corrected for multiple testing, so consider Q-values too.
# Q-values computed separately for omega > and < 1 # Will fit different synonymous rate for each site.
#
site	omega	P	dLnL	Q
55	0.000	0.000546	5.975	0.071
129	0.000	0.00196	4.794	0.127
85	0.000	0.00397	4.149	0.172
130	0.000	0.0216	2.638	0.216
14	0.000	0.0269	2.448	0.216
24	0.000	0.0283	2.405	0.216
87	0.000	0.0211	2.657	0.216
72	0.000	0.0252	2.505	0.216
37	0.000	0.0213	2.651	0.216
10	0.000	0.0238	2.555	0.216
73	0.000	0.00856	3.456	0.216
124	0.000	0.025	2.513	0.216
45	0.000	0.0194	2.731	0.216
84	0.000	0.0142	3.004	0.216
78	0.000	0.0228	2.590	0.216
123	0.000	0.0257	2.487	0.216
94	0.000	0.0201	2.704	0.216
47	0.000	0.0301	2.352	0.217
118	0.000	0.0447	2.014	0.306
106	0.000	0.0555	1.834	0.361
56	0.000	0.127	1.165	0.402
89	0.000	0.102	1.339	0.402
54	0.000	0.109	1.281	0.402
88	0.000	0.108	1.295	0.402
53	0.000	0.137	1.105	0.402
49	0.000	0.145	1.060	0.402
48	0.000	0.119	1.218	0.402
74	0.000	0.0987	1.363	0.402
46	0.000	0.11	1.274	0.402
75	0.000	0.108	1.292	0.402
44	0.000	0.0857	1.477	0.402
102	0.157	0.128	1.159	0.402
38	0.000	0.141	1.084	0.402
95	0.000	0.115	1.240	0.402
93	0.000	0.0992	1.359	0.402
82	0.000	0.098	1.369	0.402
26	0.000	0.0938	1.404	0.402
17	0.000	0.121	1.199	0.402
3	0.000	0.117	1.225	0.402
126	0.000	0.11	1.278	0.402
22	0.000	0.0962	1.383	0.402
8	0.000	0.145	1.061	0.402
111	0.000	0.109	1.287	0.402
30	0.000	0.109	1.281	0.402
28	0.000	0.117	1.225	0.402
119	0.000	0.145	1.063	0.402
25	0.000	0.142	1.078	0.402
67	0.000	0.155	1.012	0.419
29	0.000	0.164	0.968	0.435
58	0.000	0.187	0.872	0.485
121	1.000	0.999	0.000	1
120	1.000	1	0.000	1
92	0.999	0.999	0.000	1
122	1.000	0.999	0.000	1
125	0.000	0.963	0.001	1
127	0.724	0.804	0.031	1
90	0.000	0.962	0.001	1
128	0.000	0.963	0.001	1
91	0.000	0.959	0.001	1
86	0.000	0.964	0.001	1
117	0.000	0.963	0.001	1
108	1.000	1	0.000	1
115	0.000	0.959	0.001	1
109	100.000	0.318	0.498	1
105	100.000	0.796	0.033	1
83	1.000	1	0.000	1
103	1.012	0.992	0.000	1
110	1.000	1	0.000	1
101	1.731	0.625	0.119	1
112	0.000	0.965	0.001	1
100	0.390	0.519	0.208	1
99	0.000	0.96	0.001	1
98	1.312	0.825	0.024	1
113	0.000	0.959	0.001	1
114	0.000	0.959	0.001	1
97	1.000	0.999	0.000	1
107	0.000	0.959	0.001	1
96	0.000	0.962	0.001	1
116	0.000	0.962	0.001	1
104	1.000	1	0.000	1
1	0.000	0.962	0.001	1
80	0.000	0.959	0.001	1
34	100.000	0.247	0.671	1
33	0.999	0.999	0.000	1
32	0.000	0.962	0.001	1
31	0.992	0.995	0.000	1
27	0.000	0.968	0.001	1
23	0.999	0.999	0.000	1
21	0.000	0.963	0.001	1
20	1.000	1	0.000	1
19	1.000	0.999	0.000	1
18	90.757	0.415	0.332	1
16	0.000	0.963	0.001	1
15	0.999	0.999	0.000	1
13	0.000	0.962	0.001	1
12	1.000	1	0.000	1
11	0.000	0.959	0.001	1
9	1.000	1	0.000	1
7	0.000	0.959	0.001	1
6	0.999	0.999	0.000	1
5	0.000	0.968	0.001	1
4	1.000	0.999	0.000	1
2	0.000	0.971	0.001	1
35	0.000	0.962	0.001	1
81	0.000	0.959	0.001	1
36	0.999	0.999	0.000	1
40	1.000	0.999	0.000	1
79	1.000	1	0.000	1
77	100.000	0.236	0.702	1
76	100.000	0.402	0.352	1
71	1.000	1	0.000	1
70	0.999	0.999	0.000	1
69	1.000	1	0.000	1
68	1.000	1	0.000	1
66	0.000	0.962	0.001	1
64	0.000	0.962	0.001	1
63	0.000	0.962	0.001	1
62	0.000	0.968	0.001	1
61	1.046	0.975	0.000	1
60	0.000	0.966	0.001	1
59	0.000	0.964	0.001	1
57	0.999	0.999	0.000	1
52	100.000	0.417	0.330	1
51	0.000	0.963	0.001	1
50	83.553	0.468	0.263	1
43	0.000	0.962	0.001	1
42	1.000	0.999	0.000	1
41	0.999	0.999	0.000	1
39	1.000	1	0.000	1
65	0.314	0.433	0.307	1